Sensitivity of hydrogen bond lifetime dynamics to the presence of ethanol at the interface of a phospholipid bilayer

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 8, 2006, Pages 3791-3797

  Chanda, Jnanojjal ^a   Chakraborty, Sudip ^a   Bandyopadhyay, Sanjoy ^a  

^a INDIAN INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPOSITION; ETHANOL; HYDRATION; HYDROGEN BONDS; LIQUID CRYSTALS; MOLECULAR DYNAMICS; SENSITIVITY ANALYSIS;

ATOMISTIC MOLECULAR DYNAMICS; LAMELLAR PHASE; LIFETIME DYNAMICS;

PHOSPHOLIPIDS;

EID: 33644880009     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp054275i     Document Type: Article

References (66)

1. Eisenberg, D.; Kauzmann, W. The Structure and Properties of Water; Oxford University Press: New York, 1969.
2. Correlations and Connectivity, Geometric Aspects of Physics, Chemistry and Biology; Stanley, H. E., Ostrowzky, N., Eds.; Kluwer Academic: Dordrecht, The Netherlands, 1990.
3. Teixeira, J. J. Phys. IV C1 1993, 3, 162.
4. Stillinger, F. H. Science 1980, 209, 451.
5. Stillinger, F. H. Adv. Chem. Phys. 1975, 31, 1.
6. Luzar, A.; Chandler, D. Nature 1996, 397, 55.
7. Luzar, A.; Chandler, D. Phys. Rev. Lett. 1996, 76, 928.
8. Luzar, A. J. Chem. Phys. 2000, 113, 10663.
9. Luzar, A. Chem. Phys. 2000, 258, 267.
10. Chen, S. H.; Teixeira, J. Adv. Chem. Phys. 1986, 64, 1.
11. Hydrogen-Bonded Liquids; Dore, J. C., Teixeira, J., Eds.; Kluwer Academic: Dordrecht, The Netherlands, 1991.
12. Blumberg, R. L.; Stanley, H. E. J. Chem. Phys. 1984, 80, 5230.
13. Sciortino, F.; Poole, P. H.; Stanley, H. E.; Havlin, S. Phys. Rev. Lett. 1990, 64, 1686.
14. Ohmine, I.; Tanaka, H. Chem. Rev. 1993, 93, 2545.
15. Ohmine, I.; Saito, S. Acc. Chem. Res. 1999, 32, 741.
16. Xu, H.; Stern, H. A.; Berne, B. J. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 2054.
17. Laenen, R.; Rauscher, C.; Laubereau, A. Phys. Rev. Lett. 1998, 80, 2622.
18. Neinhuys, H. K.; Woutersen, S.; van Santen, R. A.; Bakker, H. J. J. Chem. Phys. 1999, 111, 1494.
19. Woutersen, S.; Emmerichs, U.; Bakker, H. J. Science 1997, 278, 658.
20. Kropman, M. F.; Bakker, H. J. Science 2001, 201, 2118.
21. Kropman, M. F.; Bakker, H. J. J. Chem. Phys. 2001, 115, 8942.
22. Gale, G. M.; Gallot, G.; Hache, F.; Lascoux, N.; Bratos, S.; Leickman, J. C. Phys. Rev. Lett. 1999, 82, 1068.
23. Danninger, W.; Zundel, G. J. Chem. Phys. 1981, 74, 2769.
24. Walrafen, G. E. J. Phys. Chem. 1990, 94, 2237.
25. Rousset, J. L.; Duval, E.; Boukenter, A. J. Chem. Phys. 1990, 92, 2150.
26. Steinel, T.; Asbury, J. B.; Zheng, J.; Fayer, M. D. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 10957.
27. Rapaport, D. C. Mol. Phys. 1983, 50, 1151.
28. Belch, A. C.; Rice, S. A. J. Chem. Phys. 1987, 86, 5676.
29. Zichi, D. A.; Rossky, P. J. J. Chem. Phys. 1986, 84, 2814.
30. Chandra, A. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 768.
31. Chandra, A. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 3899.
32. Luzar, A.; Chandler, D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 8160.
33. Starr, F. W.; Nielsen, J. K.; Stanley, H. E. Phys. Rev. Lett. 1999, 82, 2294.
34. Starr, F. W.; Nielsen, J. K.; Stanley, H. E. Phys. Rev. E 2000, 62, 579.
35. Luzar, A. Faraday Discuss. 1996, 103, 29.
36. Balasubramanian, S.; Pal, S.; Bagchi, B. Phys. Rev. Lett. 2002, 89, 115505.
37. Pal, S.; Balasubramanian, S.; Bagchi, B. Phys. Rev. E 2003, 67, 061502.
38. Damodaran, K. V.; Merz, K. M. Biophys. J. 1994, 66, 1076.
39. Tu, K.; Tobias, D. J.; Klein, M. L. Biophys. J. 1995, 69, 2558.
40. Tu, K.; Tobias, D. J.; Blasie, J. K.; Klein, M. L. Biophys. J. 1996, 70, 595.
41. Gierula, M. P.; Takaoka, Y.; Miyagawa, H.; Kitamura, K.; Kusumi, A. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 3677.
42. Gierula, M. P.; Takaoka, Y.; Miyagawa, H.; Kitamura, K.; Kusumi, A. Biophys. J. 1999, 76, 1228.
43. Lopez, C. F.; Nielsen, S. O.; Klein, M. L.; Moore, P. B. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 6603.
44. Shinoda, W.; Shimizu, M.; Okazaki, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 6647.
45. Saiz, L.; Klein, M. L. Biophys. J. 2001, 81, 204.
46. Moore, P. B.; Lopez, C. F.; Klein, M. L. Biophys. J. 2001, 81, 2484.
47. Tu, K.; Tarek, M.; Klein, M. L.; Scharf, D. Biophys. J. 1998, 75, 2123.
48. Tu, K.; Klein, M. L.; Tobias, D. J. Biophys. J. 1998, 75, 2147.
49. Koubi, L.; Tarek, M.; Klein, M. L.; Scharf, D. Biophys. J. 2000, 78, 800.
50. Koubi, L.; Saiz, L.; Tarek, M.; Scharf, D.; Klein, M. L. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 14500.
51. Chanda, J.; Bandyopadhyay, S. Chem. Phys. Lett. 2004, 392, 249.
52. Chanda, J.; Bandyopadhyay, S. Unpublished work.
53. Petrache, H. I.; Nagle, S. T.; Nagle, J. F. Chem. Phys. Lipids 1998, 95, 83.
54. Martyna, G. J.; Tuckerman, M. E.; Tobias, D. J.; Klein, M. L. Mol. Phys. 1996, 87, 1117.
55. Tuckerman, M. E.; Yarne, D. A.; Samuelson, S. O.; Hughs, A. L.; Martyna, G. J. Comput. Phys. Commun. 2000, 125, 333.
56. Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089.
57. Procacci, P.; Darden, T.; Marchi, M. J. Phys. Chem. 1996, 100, 10464.
58. Procacci, P.; Marchi, M.; Martyna, G. J. J. Chem. Phys. 1998, 108, 8799.
59. Allen, M. P.; Tildesley, D. J. Computer Simulation of Liquids; Clarendon: Oxford, U. K., 1987.
60. Schlenkrich, M.; Brickmann, J.; MacKerell, A. D.; Karplus, M. Empirical Potential Energy Function for Phospholipids: Criteria for Parameter Optimization and Applications. In Biological Membranes: A Molecular Perspective from Computation and Experiment; Birkhauser: Boston, MA, 1996.
61. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926.
62. Mezei, M.; Beveridge, D. L. J. Chem. Phys. 1981, 74, 622.
63. Stillinger, F. H.; Rahman, A. J. Chem. Phys. 1974, 60, 1545.
64. Chanda, J.; Chakraborty, S.; Bandyopadhyay, S. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 471.
65. Xu, H.; Berne, B. J. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 11929.
66. Paul, S.; Chandra, A. Chem. Phys. Lett. 2004, 386, 218.