The DNA-porphyrin interactions studied by vibrational and electronic circular dichroism spectroscopy

Collection of Czechoslovak Chemical Communications

Volumn 70, Issue 11, 2005, Pages 1799-1810

  Nový, Jakub ^a   Urbanová, Marie ^a   Volka, Karel ^a  

^a INSTITUTE OF CHEMICAL TECHNOLOGY   (Czech Republic)

Author keywords

CD; DNA porphyrin interactions; Electronic circular dichroism spectroscopy; Intercalation; Porphyrins; VCD; Vibrational circular dichroism spectroscopy

Indexed keywords

EID: 33644670722     PISSN: 00100765     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1135/cccc20051799     Document Type: Article

References (39)

1. Fiel R. J., Howard J. C., Mark E. H., Gupta N. D.: Nucleic Acids Res. 1979, 6, 3093.
2. Pasternack R. F.: Chirality 2003, 15, 329.
3. Bütje K., Nakamoto K.: Inorg. Chim. Acta 1990, 167, 97.
4. Fiel R. J., Munson B. R.: Nucleic Acids Res. 1980, 8, 2835.
5. Ford K. G., Neidle S.: Bioorg. Med. Chem. 1995, 3, 671.
6. Kruglik S. G., Mojzeš P., Mizutani Y., Kitagawa T., Turpin P.-Y.: J. Phys. Chem. B 2001, 105, 5018.
7. Lee S., Jeon S. H., Kim B. J., Han S. W., Jang H. G., Kim S. K.: Biophys. Chem. 2001, 92, 35.
8. Lipscomb L. A., Zhou F. X., Presnell S. R., Woo R. J., Peek M. E., Plaskon R. R., Williams L. D.: Biochemistry 1996, 35, 2818.
9. Lugo-Ponce P., McMillin D. R.: Coord. Chem. Rev. 2000, 208, 169.
10. Mojzeš P., Kruglik S. G., Baumruk V., Turpin P.-Y.: J. Phys. Chem. B 2003, 107, 7532.
11. Pasternack R. F., Gibbs E. J., Villafranca J. J.: Biochemistry 1983, 22, 2406.
12. Pasternack R. F., Ewen S., Rao A., Meyer A. S., Freedman M. A., Collings P. J., Frey S. L., Ranen M. C.: Inorg. Chim. Acta 2001, 317, 59.
13. Pasternack R. F., Antebi A., Ehrlich B., Sidney D., Gibbs E. J., Bassner S. L., Depoy L. M.: J. Mol. Catal. 1984, 23, 235.
14. Shvedko A. G., Kruglik S. G., Ermolenkov V. V., Orlovich V. A., Turpin P.-Y., Greve J., Otto C.: J. Roman Spectrosc. 1999, 30, 677.
15. Devlin F. J., Stephens P. J., Cheeseman J. R., Frisch M. J.: J. Phys. Chem. 1997, 101, 6322.
16. Nafie L. A., Keiderling T. A., Stephens P. J.: J. Am. Chem. Soc. 1976, 98, 2715.
17. Keiderling T. A. in: Practical Fourier Transform Infrared Spectroscopy (J. R. Ferraro and K. Krishnan, Eds), p. 203. Academic Press, San Diego 1990.
18. Nafie L. A., Freedman T. B.: Enantiomer 1998, 3, 283.
19. Nafie L. A., Freedman T. B. in: Circular Dichroism: Principles and Applications (N. Berova, K. Nakanishi and R. W. Woody, Eds), 2nd ed., p. 97. Wiley, New York 2000.
20. Polavarapu P. L., Zhao C.: Anal. Bioanal. Chem. 2000, 366, 727.
21. Bouř P., Navrátilová H., Setnička V., Urbanová M., Volka K.: J. Org. Chem. 2002, 67, 161.
22. Setnička V., Urbanová M., Bouř P., Král V., Volka K.: J. Phys. Chem. 2001, 105, 8931.
23. Keiderling T. A. in: Circular Dichroism: Principles and Applications (N. Berova, K. Nakanishi and R. W. Woody, Eds), 2nd ed., p. 621. Wiley, New York 2000.
24. Urbanová M., Setnička V., Král V., Volka K.: Biopolymers 2001, 60, 307.
25. Andrushchenko V., van de Sande J. H., Wieser H.: Biopolymers 2003, 72, 374.
26. Andrushchenko V., Leonenko Z., Cramb D., van de Sande J. H., Wieser H.: Biopolymers 2001, 61, 243.
27. Nový J., Urbanová M., Volka K.: J. Mol. Struct. 2005, 748, 17.
28. Tsankov D., Kalisch B., van de Sande J. H., Wieser H.: Biopolymers 2003, 72, 490.
29. Wang L., Yang L., Keiderling T. A.: Biophys. J. 1994, 67, 2460.
30. Wang L., Pančoška P., Keiderling T. A.: Biochemistry 1994, 33, 8428.
31. Gandini S. C. M., Borissevitch I. E., Perussi J. R., Imasato H., Tabak M.: J. Luminescence 1998, 78, 53.
32. Gandini S. C. M., Vidoto E. A., Nascimento O. R., Tabak M.: J. Inorg. Biochem. 2003, 94, 127.
33. Pasternack R. F., Spiro E. G., Teach M.: J. Inorg. Nucl. Chem. 1974, 36, 599.
34. Urbanová M., Setnička V., Volka K.: Chirality 2000, 12, 199.
35. Johnson W. C. in: Circular Dichroism: Principles and Applications (N. Berova, K. Nakanishi and R. W. Woody, Eds), 2nd ed., p. 703. Wiley, New York 2000.
36. Yazbeck D. R., Min K.-L., Damha M. J.: Nucleic Acids Res. 2002, 30, 3015.
37. Banyay M., Sarkar M., Graslund A.: Biophys. Chem. 2003, 104, 477.
38. Tong Z., Shichi T., Takagi K.: J. Phys. Chem. B 2002, 106, 13306.
39. Wang L., Keiderling T. A.: Biochemistry 1992, 31, 10265.