Molecular mechanisms of mammalian global genome nucleotide excision repair

Chemical Reviews

Volumn 106, Issue 2, 2006, Pages 253-276

  Gillet, Ludovic C J ^a   Schärer, Orlando D ^a,b  

^a UNIVERSITY OF ZURICH   (Switzerland)

^b STONY BROOK UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOSYNTHESIS; GENES; IRRADIATION; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR STRUCTURE; PROTEINS; ULTRAVIOLET RADIATION;

GLOBAL GENOME; MOLECULAR MECHANISMS; NUCLEOTIDE EXCISION REPAIR (NER);

DNA;

DNA BINDING PROTEIN;

ANIMAL; CONFORMATION; DNA ADDUCT; DNA DAMAGE; DNA REPAIR; GENETICS; GENOME; HUMAN; METABOLISM; PROTEIN BINDING; REVIEW;

ANIMALS; DNA ADDUCTS; DNA DAMAGE; DNA REPAIR; DNA-BINDING PROTEINS; GENOME; HUMANS; NUCLEIC ACID CONFORMATION; PROTEIN BINDING;

EID: 32644450616     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr040483f     Document Type: Review

References (369)

1. Williams, M. The New York Times 1997, May 14.
2. Osborne, L. The New York Times 2001, September 16.
3. Preston, M. The Times 2002, July 13.
4. Friedberg, E. C.; Walker, G. C.; Siede, W. DNA Repair and Mutagenesis; ASM Press: Washington, DC, 1995.
5. Sarasin, A. Mutat. Res. 2003, 544, 99.
6. Lindahl, T.; Wood, R. D. Science 1999, 286, 1897.
7. Schärer, O. D. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 2946.
8. Setlow, R. B.; Carrier, W. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1964, 51, 226.
9. Boyce, R. P.; Howard-Flanders, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1964, 51, 2093.
10. Pettijohn, D.; Hanawalt, P. J. Mol. Biol. 1964, 93, 395.
11. Rasmussen, R. E.; Painter, R. B. Nature 1964, 203, 1360.
12. Cleaver, J. E. Nature 1968, 218, 652.
13. von Hebra, F.; Kaposi, M. In On Diseases of the Skin, Including the Exanthemata; Tay, W. t., Ed.; New Sydenham Society: London, 1874; Vol. 3.
14. Bootsma, D.; Kraemer, K. H.; Cleaver, J.; Hoeijimakers, J. H. J. In The Metabolic Basis of Inherited Disease; Scriver, C. R., Beaudet, A. L., Sly, W. S., Valle, D., Eds.; McGraw-Hill Book Co.: New York, 1997.
15. Cockayne, E. A. Arch. Dis. Child. 1936, 11, 1.
16. Svejstrup, J. Q. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2002, 3, 21.
17. van Gool, A. J.; Citterio, E.; Rademakers, S.; van Os, R.; Vermeulen, W.; Constantinou, A.; Egly, J. M.; Bootsma, D.; Hoeijmakers, J. H. EMBO J. 1997, 16, 5955.
18. Price, V. H.; Odom, R. B.: Ward, W. H.; Jones, F. T. Arch. Dermatol. 1980, 116, 1375.
19. de Boer, J.; Hoeijmakers, J. H. J. J. Carcinogenesis 2000, 21, 453.
20. Bergmann, E.; Egly, J. M. Trends Genet. 2001, 117, 279.
21. Cleaver, J. E. DNA Rep. 2005, 4, 635.
22. de Weerd-Kastelein, E. A.; Keijzer, W.; Bootsma, D. Nat. New Biol. 1972, 238, 80.
23. Cleaver, J. E. J. Invest. Dermatol. 1972, 58, 1113.
24. Lehmann, A. R.; Kirk-Bell, S.; Arlett, C. F.; Paterson, M. C.; Lohman, P. H. M.; de Weerd-Kastelein, E. A.; Bootsma, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1975, 72, 219.
25. Masutani, C.; Kusumoto, R.; Yamada, A.; Dohmae, N.; Yokoi, M.; Yuasa, M.; Araki, M.; Iwai, S.; Takio, K.; Hanaoka, F. Nature 1999, 399, 700.
26. Thompson, L. H. Bioessays 1998, 20, 589.
27. Bootsma, D. Mutat. Res. 2001, 485, 37.
28. Busch, D.; Greiner, C.; Lewis, K.; Ford, R.; Adair, G.; Thompson, L. Mutagenesis 1989, 4, 349.
29. Westerveld, A.; Hoeijmakers, J. H. J. Nature 1984, 310, 425.
30. Weber, C. A.; Salazar, E. P.; Stewart, S. A.; Thompson, L. H. Mol. Cell. Biol. 1988, 8, 1137.
31. Weeda, G.; van Ham, R. C. A.; Masurel, R.; Westerveld, A.; Odijk, H.; de Wit, J.; Bootsma, D.; van der Eb, A. J.; Hoeijmakers, J. H. J. Mol. Cell. Biol. 1990, 10, 2570.
32. Thompson, L. H.; Brookman, K. W.; Weber, C. A.; Salazar, E. P.; Reardon, J. T.; Sancar, A.; Deng, Z.; Siciliano, M. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 6855.
33. Troelstra, C.; Odijk, H.; de Wit, J.; Westerveld, A.; Thompson, L. H.; Bootsma, D.; Hoeijmakers, J. H. Mol. Cell. Biol. 1990, 10, 5806.
34. Tanaka, K.; Satokata, I.; Ogita, Z.; Uchida, T.; Okada, Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 5512.
35. Tanaka, K.; Miura, N.; Satokata, I.; Miyamoto, I.; Yoshida, M. C.; Satoh, Y.; Kondo, S.; Yasui, A.; Okayama, H.; Okada, Y. Nature 1990, 348, 73.
36. Legerski, R.; Peterson, C. Nature 1992, 359, 70.
37. Henning, K. A.; Li, L.; Iyer, N.; McDaniel, L. D.; Reagan, M. S.; Legerski, R.; Schultz, R. A.; Stefanini, M.; Lehmann, A. R.; Mayne, L. V.; Friedberg, E. C. Cell 1995, 82, 555.
38. MacInnes, M. A.; Dickson, J. A.; Hernandez, R. R.; Learmont, D.; Lin, G. Y.; Mudgett, J. S.; Park, M. S.; Schauer, S.; Reynolds, R. J.; Strniste, G. F.; Yu, J. Y. Mol. Cell. Biol. 1993, 13, 6393.
39. Scherly, D.; Nouspikel, T.; Corlet, J.; Ucla, C.; Bairoch, A.; Clarkson, S. G. Nature 1993, 363, 182.
40. Sijbers, A. M.; de Laat, W. L.; Ariza, R. R.; Biggerstaff, M.; Wei, Y. F.; Moggs, J. G.; Carter, K. C.; Shell, B. K.; Evans, E.; de Jong, M. C.; Rademakers, S.; de Rooij, J.; Jaspers, N. G.; Hoeijmakers, J. H.; Wood, R. D. Cell 1996, 86, 811.
41. Brookman, K. W.; Lamerdin, J. E.; Thelen, M. P.; Hwang, M.; Reardon, J. T.; Sancar, A.; Zhou, Z.-Q.; Walter, C. A.; Parris, C. N.; Thompson, L. H. Mol. Cell. Biol. 1996, 16, 6553.
42. Masutani, C.; Sugasawa, K.; Yanagisawa, J.; Sonoyama, T.; Ui, M.; Enomoto, T.; Takio, K.; Tanaka, K.; van der Spek, P. J.; Bootsma, D.; et al. EMBO, J. 1994, 13, 1831.
43. Giglia-Mari, G.; Coin, F.; Ranish, J. A.; Hoogstraten, D.; Theil, A.; Wijgers, N.; Jaspers, N. G.; Raams, A.; Argentini, M.; van der Spek, P. J.; Botta, E.; Stefanini, M.; Egly, J. M.; Aebersold, R.; Hoeijmakers, J. H.; Vermeulen, W. Nat. Genet. 2004, 36, 714.
44. Clarkson, S. G. Biochimie 2003, 85, 1113.
45. O'Donovan, A.; Wood, R. D. Nature 1993, 363, 185.
46. Chu, G.; Chang, E. Science 1988, 242, 564.
47. Takao, M.; Abramic, M.; Moos, M., Jr.; Otrin, V. R.; Wootton, J. C.; McLenigan, M.; Levine, A. S.; Protic, M. Nucleic Acids Res. 1993, 21, 4111.
48. Dualan, R.; Brody, T.; Keeney, S.; Nichols, A. F.; Admon, A.; Linn, S. Genomics 1995, 29, 62.
49. He, Z. G.; Henricksen, L. A.; Wold, M. S.; Ingles, C. J. Nature 1995, 374, 566.
50. Li, L.; Lu, X. Y.; Peterson, C. A.; Legerski, R. J. Mol. Cell. Biol. 1995, 15, 5396.
51. Burns, J. L.; Guzder, S. N.; Sung, P.; Prakash, S.; Prakash, L. J. Biol. Chem. 1996, 271, 11607.
52. Shivji, M. K. K.; Eker, A. P. M.; Wood, R. D. J. Biol. Chem. 1994, 269, 22749.
53. Keeney, S.; Chang, G. J.; Linn, S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 21293.
54. Reardon, J. T.; Nichols, A. F.; Keeney, S.; Smith, C. A.; Taylor, J. S.; Linn, S.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1993, 268, 21301.
55. Schaeffer, L.; Roy, R.; Humbert, S.; Moncollin, V.; Vermeulen, W.; Hoeijmakers, J. H.; Chambon, P.; Egly, J. M. Science 1993, 260, 58.
56. Schaeffer, L.; Moncollin, V.; Roy, R.; Staub, A.; Mezzina, M.; Sarasin, A.; Weeda, G.; Hoeijmakers, J. H.; Egly, J. M. EMBO J. 1994, 13, 2388.
57. Drapkin, R.; Reardon, J. T.; Ansari, A.; Huang, J. C.; Zawel, L.; Ahn, K.; Sancar, A.; Reinberg, D. Nature 1994, 368, 769.
58. Bardwell, A. J.; Bardwell, L.; Tomkinson, A. E.; Friedberg, E. C. Science 1994, 265, 2082.
59. O'Donovan, A.; Davies, A. A.; Moggs, J. G.; West, S. C.; Wood, R. D. Nature 1994, 371, 432.
60. Wood, R. D.; Robins, P.; Lindahl, T. Cell 1988, 53, 97.
61. Wood, R. D.; Biggerstaff, M.; Shivji, M. K. K. Methods 1995, 7, 163.
62. Huang, J. C.; Svoboda, D. L.; Reardon, J. T.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 3664.
63. Huang, J. C.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1994, 269, 19034.
64. Shivji, M. K.; Moggs, J. G.; Kuraoka, I.; Wood, R. D. Methods Mol. Biol. 1999, 113, 373.
65. Shivji, K. K.; Kenny, M. K.; Wood, R. D. Cell 1992, 69, 367.
66. Coverley, D.; Kenny, M. K.; Munn, M.; Rupp, W. D.; Lane, D. P.; Wood, R. D. Nature 1991, 349, 538.
67. Aboussekhra, A.; Biggerstaff, M.; Shivji, M. K.; Vilpo, J. A.; Moncollin, V.; Podust, V. N.; Protic, M.; Hubscher, U.; Egly, J. M.; Wood, R. D. Cell 1995, 80, 859.
68. Mu, D.; Park, C. H.; Matsunaga, T.; Hsu, D. S.; Reardon, J. T.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1995, 270, 2415.
69. Araujo, S. J.; Tirode, F.; Coin, F.; Pospiech, H.; Syvaoja, J. E.; Stucki, M.; Hubscher, U.; Egly, J. M.; Wood, R. D. Genes Dev. 2000, 14, 349.
70. Araki, M.; Masutani, C.; Maekawa, T.; Watanabe, Y.; Yamada, A.; Kusumoto, R.; Sakai, D.; Sugasawa, K.; Ohkuma, Y.; Hanaoka, F. Mutat. Res. 2000, 459, 147.
71. Gilchrest, B. A. Photodamage; Blackwell Science, Inc.: Cambridge, MA, 1995.
72. Sancar, A. Chem. Rev. 2003, 103, 2203.
73. Mitchell, D. L. Photochem. Photobiol. 1988, 48, 51.
74. Ravanat, J.-L.; Douki, T.; Cadet, J. J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 2001, 63, 88.
75. Kim, J. K.; Patel, D.; Choi, B. S. Photochem. Photobiol. 1995, 62, 44.
76. McAteer, K.; Jing, Y.; Kao, J.; Taylor, J. S.; Kennedy, M. A. J. Mol. Biol. 1998, 282, 1013.
77. Lee, J. H.; Park, C. J.; Shin, J. S.; Ikegami, T.; Akutsu, H.; Choi, B. S. Nucleic Acids Res. 2004, 32, 2474.
78. Kim, J. K.; Choi, B. S. Eur. J. Biochem. 1995, 228, 849.
79. Szymkowski, D. E.; Lawrence, C. W.; Wood, R. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 9823.
80. Kusumoto, R.; Masutani, C.; Sugasawa, K.; Iwai, S.; Araki, M.; Uchida, A.; Mizukoshi, T.; Hanaoka, F. Mutat. Res. 2001, 485, 219.
81. Sugasawa, K.; Okamoto, T.; Shimizu, Y.; Masutani, C.; Iwai, S.; Hanaoka, F. Genes Dev. 2001, 15, 507.
82. Reardon, J. T.; Sancar, A. Genes Dev. 2003, 17, 2539.
83. Humphreys, W. G.; Kadlubar, F. F.; Guengerich, F. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 8278.
84. McClelland, R. A.; Ahmad, A.; Dicks, A. P.; Licence, V. E. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 3303.
85. Jamieson, E. R.; Lippard, S. J. Chem. Rev. 1999, 99, 2467.
86. Kartalou, M.; Essigmann, J. M. Mutat. Res. 2001, 478, 1.
87. Szymkowski, D. E.; Yarema, K.; Essigmann, J. M.; Lippard, S. J.; Wood, R. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 10772.
88. Huang, J. C.; Zamble, D. B.; Reardon, J. T.; Lippard, S. J.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 10394.
89. Zamble, D. B.; Mu, D.; Reardon, J. T.; Sancar, A.; Lippard, S. J. Biochemistry 1996, 35, 10004.
90. Schärer, O. D. ChemBioChem 2005, 6, 27.
91. Conney, A. H. Cancer Res. 1982, 42, 4875.
92. Beije, B.; Moller, L. Mutat. Res. 1988, 196, 177.
93. Harvey, R. G. Polycyclic Aromatic Hydrocarbons: Chemistry and Carcinogenicity; University Press: Cambridge, 1991.
94. Geacintov, N. E.; Cosman, M.; Hingerty, B. E.; Amin, S.; Broyde, S.; Patel, D. J. Chem. Res. Toxicol, 1997, 10, 111.
95. Heflich, R. H.; Neft, R. E. Mutat. Res. 1994, 318, 73.
96. Tureski, R. J. Drug Metab. Rev. 2002, 34, 625.
97. Belguise-Valladier, P.; Fuchs, R. P. Biochemistry 1991, 30, 10091.
98. Veaute, X.; Fuchs, R. P. Nucleic Acids Res. 1991, 19, 5603.
99. Belguise-Valladier, P.; Fuchs, R. P. J. Mol. Biol. 1995, 249, 903.
100. Eckel, L. M.; Krugh, T. R. Biochemistry 1994, 33, 13611.
101. Eckel, L. M.; Krugh, T. R. Nat. Struct. Biol. 1994, 1, 89.
102. Mao, B.; Hingerty, B. E.; Broyde, S.; Patel, D. J. Biochemistry 1998, 37, 81.
103. Mao, B.; Hingerty, B. E.; Broyde, S.; Patel, D. J. Biochemistry 1998, 37, 95.
104. Mu, D.; Bertrand-Burggraf, E.; Huang, J. C.; Fuchs, R. P.; Sancar, A.; Fuchs, B. P. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 4869.
105. Gillet, L. C. J.; Alzeer, J.; Schärer, O. D. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 1961.
106. Gunz, D.; Hess, M. T.; Naegeli, H. J. Biol. Chem. 1996, 271, 25089.
107. Hess, M. T.; Schwitter, U.; Petretta, M.; Giese, B.; Naegeli, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 6664.
108. Hess, M. T.; Schwitter, U.; Petretta, M.; Giese, B.; Naegeli, H. Chem. Biol. 1996, 3, 121.
109. Hess, M. T.; Gunz, D.; Luneva, N.; Geacintov, N. E.; Naegeli, H. Mol. Cell. Biol. 1997, 17, 7069.
110. Buterin, T.; Hess, M. T.; Luneva, N.; Geacintov, N. E.; Amin, S.; Kroth, H.; Seidel, A.; Naegeli, H. Cancer Res. 2000, 60, 1849.
111. Yan, S.; Wu, M.; Buterin, T.; Naegeli, H.; Geacintov, N. E.; Broyde, S. Biochemistry 2003, 42, 2339.
112. Geacintov, N. E.; Broyde, S.; Buterin, T.; Naegeli, H.; Wu, M.; Yan, S.; Patel, D. J. Biopolymers 2002, 65, 202.
113. Isaacs, R. J.; Spielmann, H. P. DNA Rep. 2004, 3, 455.
114. Buterin, T.; Hess, M. T.; Gunz, D.; Nicholas, G. E.; Mullenders, L. H.; Naegeli, H. Cancer Res. 2002, 62, 4229.
115. Svejstrup, J. Q.; Wang, Z.; Feaver, W. J.; Wu, X.; Bushnell, D. A.; Donahue, T. F.; Friedberg, E. C.; Kornberg, R. D. Cell 1995, 80, 21.
116. Rodriguez, K.; Talamantez, J.; Huang, W.; Reed, S. H.; Wang, Z.; Chen, L.; Feaver, W. J.; Friedberg, E. C.; Tomkinson, A. E. J. Biol. Chem. 1998, 273, 34180.
117. Kong, S. E.; Svejstrup, J. Q. DNA Rep. 2002, 1, 731.
118. He, Z.; Ingles, C. J. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 1136.
119. Guzder, S. N.; Sung, P.; Prakash, L.; Prakash, S. J. Biol. Chem. 1996, 271, 8903.
120. Mu, D.; Wakasugi, M.; Hsu, D. S.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1997, 272, 28971.
121. Wakasugi, M.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 6669.
122. Houtsmuller, A. B.; Rademakers, S.; Nigg, A. L.; Hoogstraten, D.; Hoeijmakers, J. H.; Vermeulen, W. Science 1999, 284, 958.
123. Hoogstraten, D.; Nigg, A. L.; Heath, H.; Mullenders, L. H. F.; van Driel, R.; Hoeijmakers, J. H. J.; Vermeulen, W.; Houtsmuller, A. B. Mol. Cell 2002, 10, 1163.
124. Rademakers, S.; Volker, M.; Hoogstraten, D.; Nigg, A. L.; Mone, M. J.; Van Zeeland, A. A.; Hoeijmakers, J. H. J.; Houtsmuller, A. B.; Vermeulen, W. Mol. Cell. Biol. 2003, 23, 5755.
125. Fujiwara, Y.; Masutani, C.; Mizukoshi, T.; Kondo, J.; Hanaoka, F.; Iwai, S. J. Biol. Chem. 1999, 274, 20027.
126. Sugasawa, K.; Ng, J. M. Y.; Masutani, C.; Iwai, S.; van der Spek, P. J.; Eker, A. P. M.; Hanaoka, F.; Bootsma, D.; Hoeijmakers, J. H. J. Mol. Cell 1998, 2, 223.
127. Batty, D.; Rapić-Otrin, V.; Levine, A. S.; Wood, R. D. J. Mol. Biol. 2000, 300, 275.
128. Hey, T.; Lipps, G.; Sugasawa, K.; Iwai, S.; Hanaoka, F.; Krauss, G. Biochemistry 2002, 41, 6583.
129. Jones, C. J.; Wood, R. D. Biochemistry 1993, 32, 12096.
130. Buschta-Hedayat, N.; Buterin, T.; Hess, M. T.; Missura, M.; Naegeli, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 6090.
131. Schweizer, U.; Hey, T.; Lipps, G.; Krauss, G. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 3183.
132. Wakasugi, M.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1999, 274, 18759.
133. Evans, E.; Moggs, J. G.; Hwang, J. R.; Egly, J. M.; Wood, R. D. EMBO J. 1997, 16, 6559.
134. Volker, M.; Mone, M. J.; Karmakar, P.; van Hoffen, A.; Schul, W.; Vermeulen, W.; Hoeijmakers, J. H.; van Driel, R.; van Zeeland, A. A.; Mullenders, L. H. Mol. Cell 2001, 8, 213.
135. Mone, M. J.; Volker, M.; Nikaido, O.; Mullenders, L. H.; van Zeeland, A. A.; Verschure, P. J.; Manders, E. M.; van Driel, R. EMBO Rep. 2001, 2, 1013.
136. Katsumi, S.; Kobayashi, N.; Imoto, K.; Nakagawa, A.; Yamashina, Y.; Muramatsu, T.; Shirai, T.; Miyagawa, S.; Sugiura, S.; Hanaoka, F.; Matsunaga, T.; Nikaido, O.; Mori, T. J. Invest. Dermatol. 2001, 117, 1156.
137. Riedl, T.; Hanaoka, F.; Egly, J. M. EMBO J. 2003, 22, 5293.
138. Tapias, A.; Auriol, J.; Forget, D.; Enzlin, J. H.; Schärer, O. D.; Coin, F.; Coulombe, B.; Egly, J. M. J. Blol. Chem. 2004, 279, 19074.
139. Araki, M.; Masutani, C.; Takemura, M.; Uchida, A.; Sugasawa, K.; Kondoh, J.; Ohkuma, Y.; Hanaoka, F. J. Biol. Chem. 2001, 276, 18665.
140. Ng, J. M. Y.; Vermeulen, W.; van der Horst, G. T. J.; Bergink, S.; Sugasawa, K.; Vrieling, H.; Hoeijmakers, J. H. J. Genes Dev. 2003, 17, 1630.
141. van der Spek, P. J.; Eker, A.; Rademakers, S.; Visser, C.; Sugasawa, K.; Masutani, C.; Hanaoka, F.; Bootsma, D.; Hoeijmakers, J. H. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 2551.
142. Uchida, A.; Sugasawa, K.; Masutani, C.; Dohmae, N.; Araki, M.; Yokoi, M.; Ohkuma, Y.; Hanaoka, F. DNA Rep. 2002, 1, 449.
143. Nishi, R.; Okada, Y.; Watanabe, E.; Mori, T.; Iwai, S.; Masutani, C.; Sugasawa, K.; Hanaoka, F. Mol. Cell. Biol. 2005, 25, 5664.
144. Sugasawa, K.; Masutani, C.; Uchida, A.; Maekawa, T.; van der Spek, P. J.; Bootsma, D.; Hoeijmakers, J. H.; Hanaoka, F. Mol. Cell. Biol. 1996, 16, 4852.
145. Guzder, S. N.; Sung, P.; Prakash, L.; Prakash, S. J. Biol. Chem. 1998, 273, 31541.
146. Masutani, C.; Araki, M.; Sugasawa, K.; van der Spek, P. J.; Yamada, A.; Uchida, A.; Maekawa, T.; Bootsma, D.; Hoeijmakers, J. H. J.; Hanaoka, F. Mol. Cell. Biol. 1997, 17, 6915.
147. You, J. S.; Wang, M.; Lee, S. H. J. Biol. Chem. 2003, 278, 7476.
148. Ortolan, T. G.; Tongaonkar, P.; Lambertson, D.; Chen, L.; Schauber, C.; Madura, K. Nat. Cell Biol. 2000, 2, 601.
149. Adimoolam, S.; Ford, J. M. Proc. Natl. Acad Sci. U.S.A. 2002, 99, 12985.
150. Amundson, S. A.; Patterson, A.; Do, K. T.; Fornace, A. J., Jr. Cancer Biol. Ther. 2002, 1, 145.
151. Fitch, M. E.; Cross, I. V.; Ford, J. M. Carcinogenesis 2003, 24, 843.
152. Sugasawa, K.; Shimizu, Y.; Iwai, S.; Hanaoka, F. DNA Rep. 2002, 1, 95.
153. Wakasugi, M.; Kawashima, A.; Morioka, H.; Linn, S.; Sancar, A.; Mori, T.; Nikaido, O.; Matsunaga, T. J. Biol. Chem. 2002, 277, 1637.
154. Fitch, M. E.; Nakajima, S.; Yasui, A.; Ford, J. M. J. Biol. Chem. 2003, 278, 46906.
155. Janicijevic, A.; Sugasawa, K.; Shimizu, Y.; Hanaoka, F.; Wijgers, N.; Djurica, M.; Hoeijmakers, J. H. J.; Wyman, C. DNA Rep. 2003, 2, 325.
156. Yokoi, M.; Masutani, C.; Maekawa, T.; Sugasawa, K.; Ohkuma, Y.; Hanaoka, F. J. Biol. Chem. 2000, 275, 9870.
157. Schultz, P.; Fribourg, S.; Poterszman, A.; Mallouh, V.; Moras, D.; Egly, J. M. Cell 2000, 102, 599.
158. Gerard, M.; Fischer, L.; Moncollin, V.; Chipoulet, J. M.; Chambon, P.; Egly, J. M. J. Biol. Chem. 1991, 266, 20940.
159. Iben, S.; Tschochner, H.; Bier, M.; Hoogstraten, D.; Hozak, P.; Egly, J. M.; Grummt, I. Cell 2002, 109, 297.
160. Coin, F.; Bergmann, E.; Tremeau-Bravard, A.; Egly, J. M. EMBO J. 1999, 18, 1357.
161. Mu, D.; Hsu, D. S.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1996, 271, 8285.
162. Araujo, S. J.; Nigg, E. A.; Wood, R. D. Mol. Cell. Biol. 2001, 21, 2281.
163. Holstege, F. C.; van der Vliet, P. C.; Timmers, H. T. EMBO J. 1996, 15, 1666.
164. Evans, E.; Fellows, J.; Coffer, A.; Wood, R. D. EMBO J. 1997, 16, 625.
165. Hwang, J. R.; Moncollin, V.; Vermeulen, W.; Seroz, T.; van Vuuren, H.; Hoeijimakers, J. H. J.; Egly, J. M. J. Biol. Chem. 1996, 271, 15898.
166. Winkler, G. S.; Araujo, S. J.; Fiedler, U.; Vermeulen, W.; Coin, F.; Egly, J. M.; Hoeijmakers, J. H.; Wood, R. D.; Timmers, H. T.; Weeda, G. J. Biol. Chem. 2000, 275, 4258.
167. Tirode, F.; Busso, D.; Coin, F.; Egly, J. M. Mol. Cell 1999, 3, 87.
168. Chen, J.; Larochelle, S.; Li, X.; Suter, B. Nature 2003, 424, 228.
169. Reardon, J. T.; Sancar, A. Cell Cycle 2004, 3, 141.
170. Wood, R. D. Biochimie 1999, 81, 39.
171. Dip, R.; Camenisch, U.; Naegeli, H. DNA Rep. 2004, 3, 1409.
172. Naegeli, H.; Modrich, P.; Friedberg, E. C. J. Biol. Chem. 1993, 268, 10386.
173. Reardon, J. T.; Sancar, A. Mol. Cell. Biol. 2002, 22, 5938.
174. Henricksen, L. A.; Umbricht. C. B.: Wold, M. S. J. Biol. Chem. 1994, 269, 11121.
175. Bochkarev, A.; Bochkareva, E. Curr. Opin. Struct. Biol. 2004, 14, 36.
176. Wold, M. S. Annu. Rev. Biochem. 1997, 66, 61.
177. Coverley, D.; Kenny, M. K: Lane, D. P.; Wood, R. D. Nucleic Acids Res. 1992, 20, 3873.
178. Guzder, S. N.; Habraken, Y.; Sung, P.; Prakash, L.; Prakash, S. J. Biol. Chem. 1995, 270, 12973.
179. Shivji, M. K.; Podust. V. N.; Hubscher, U.; Wood, R. D. Biochemistry 1995, 34, 5011.
180. Kim, C. S.; Snyder, R. O.; Wold, M. S. Mol. Cell. Biol. 1992, 12, 3050.
181. Kim, C. S.; Paulus, B. F.; Wold, M. S. Biochemistry 1994, 33, 14197.
182. Blackwell, L. J.; Borowiec, J. A. Mol. Cell. Biol. 1994, 14, 3993.
183. Blackwell, L. J.; Borowiec, J. A.; Masrangelo, I. A. Mol. Cell. Biol. 1996, 16, 4798.
184. Bochkarev, A.; Pfuetzner, R. A.: Edwards. A. M.: Frappier, L. Nature 1997, 385, 176.
185. de Laat, W. L.; Appeldoorn, E.; Sugasawa, K.; Weterings, E.; Jaspers, N. G. J.; Hoeijmakers, J. H. J. Genes Dev. 1998, 12, 2598.
186. Clugston, C. K.; McLaughlin, K.; Kenny, M. K.; Brown, R. Cancer Res. 1992, 52, 6375.
187. Lao, Y.; Gomes, X. V.; Ren, Y.; Taylor, J. S.; Wold, M. S. Biochemistry 2000, 39, 850.
188. Hermanson-Miller, I. L.; Turchi, J. J. Biochemistry 2002, 41, 2402.
189. Segers-Nolten, G. M. J.; Wyman, C.; Wijgers, N.; Vermeulen, W.; Lenferink, A. T. M.; Hoeijmakers, J. H. J.; Greve, J.; Otto, C. Nucleic Acids Res. 2002, 30, 4720.
190. Ikegami, T.; Kuraoka, I.: Saijo, M.; Kodo, N.; Kyogoku, Y.; Morikawa, K.; Tanaka, K.; Shirakawa, M. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 701.
191. Asahina, H.; Kuraoka, I.: Shirakawa, M.; Morita, E. H.; Miura, N.; Miyamoto, I.: Ohtsuka, E.; Okada, Y.; Tanaka, K. Mutat. Res. 1994, 315, 229.
192. Kuraoka, L; Morita, E. H.; Saijo, M.; Matsuda, T.; Morikawa, K.; Shirakawa, M.; Tanaka, K. Mutat. Res. 1996, 362, 87.
193. Missura, M.; Buterin, T.; Hindges, R.; Hubscher, U.; Kasparkova, J.; Brabec, V.; Naegeli, H. EMBO J. 2001, 20, 3554.
194. Lieber, M. R. Bioessays 1997, 19, 233.
195. Hohl, M.; Thorel, F.; Clarkson, S. G.; Schärer, O. D. J. Biol. Chem. 2003, 278, 19500.
196. Hosfield, D. J.; Mol, C. D.; Shen, B.; Tainer, J. A. Cell 1998, 95, 135.
197. Hwang, K. Y.; Back, K.; Kim, H. Y.; Cho, Y. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 707.
198. Iyer, N.; Reagan, M. S.; Wu, K. J.; Canagarajah, B.; Friedberg, E. C. Biochemistry 1996, 35, 2157.
199. Thorel, F.; Constantinou, A.; Dunand-Sauthier, L; Nouspikel, T.; Lalle, P.; Raams, A.; Jaspers, N. G.; Vermeulen, W.; Shivji, M. K.; Wood, R. D.; Clarkson, S. G. Mol. Cell. Biol. 2004, 24, 10670.
200. Dunand-Sauthier, I.; Hohl, M.; Thorel, F.; Jaquier-Gubler, P.; Clarkson. S. G.; Scharer, O. D. J. Biol. Chem. 2005, 280, 7030.
201. Matsunaga, T.; Park, C. H.; Bessho, T.; Mu, D.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1996, 271, 11047.
202. Wakasugi, M.; Reardon, J. T.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1997, 272, 16030.
203. Constantinou, A.; Gunz, D.; Evans, E.; Lalle, P.; Bates, P. A.; Wood, R. D.; Clarkson, S. G. J. Biol. Chem. 1999, 274, 5637.
204. Saijo, M.; Kuraoka, I.; Masutani, C.; Hanaoka, F.; Tanaka, K. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 4719.
205. Park, C. H.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 5017.
206. Nagai, A.; Saijo, M.; Kuraoka, I.; Matsuda, T.; Kodo, N.; Nakatsu, Y.; Mimaki, T.; Mino, M.; Biggerstaff, M.; Wood, R. D.; et al. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1995, 211, 960.
207. Li, L.; Elledge, S. J.; Peterson, C. A.; Bales, E. S.; Legerski, R. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 5012.
208. Biggerstaff, M.; Szymkowski, D. E.. Wood, R. D. EMBO J. 1993, 12, 3685.
209. van Vuuren, A. J.; Appeldoorn, E.; Odijk, H.; Yasui, A.; Jaspers, N. G.; Bootsma, D.; Hoeijmakers, J. H. EMBO J. 1993, 12, 3693.
210. de Laat, W. L.; Sijbers, A. M.; Odijk, H.; Jaspers, N. G. J.; Hoeijmakers, J. H. J. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 4146.
211. Matsunaga, T.; Mu, D.; Park, C. H.; Reardon, J. T.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1995, 270, 20862.
212. Aravind, L.; Walker, D. R.; Koonin, E. V. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 1223.
213. Enzlin, J. H.; Schärer, O. D. EMBO J. 2002, 21, 2045.
214. Nishino, T.; Komori, K.; Ishino, Y.; Morikawa, K. Structure 2003, 11, 445.
215. Nishino, T.; Komori, K.; Tsuchiya, D.; Ishino, Y.; Morikawa, K. Structure 2005, 13, 143.
216. Newman, M.; Murray-Rust, J.; Lally, J.; Rudolf, J.; Fadden, A.; Knowles, P. P.; White, M. F.; McDonald, N. Q. EMBO J. 2005, 24, 895.
217. Tsodikov, O. V.; Enzlin, J. H.; Scharer, O. D.; Ellenberger, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 11236.
218. Moggs, J. G.; Yarema, K. J.; Essigmann, J. M.; Wood, R. D. J. Biol. Chem. 1996, 271, 7177.
219. Nichols, A. F.; Sancar, A. Nucleic Acids Res. 1992, 20, 3559.
220. Aboussekhra, A.; Wood, R. D. Exp. Cell Res. 1995, 221, 326.
221. Nishida, C.; Reinhard, P.; Linn, S. J. Biol. Chem. 1988, 263, 501.
222. Hunting, D. J.; Gowans. B. J.; Dresler, S. L. Biochem. Cell Biol. 1991, 69, 303.
223. Podust, V. N.; Georgaki, A.; Strack, B.; Hubscher, U. Nucleic Acids Res. 1992, 20, 4159.
224. Zeng, X.-R.; Jiang, Y.; Zhang, S.-J.; Hao, H.; Lee, M. Y. W. T. J. Biol. Chem. 1994, 269, 13748.
225. Yuzhakov, A.; Kelman, Z.; Hurwitz, J.; O'Donnell, M. EMBO J. 1999, 18, 6189.
226. Zhou, J. Q.; He, H.; Tan, C. K.; Downey, K. M.; So, A. G. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 1094.
227. Zhang, P.; Mo, J. Y.; Perez, A.; Leon, A.; Liu, L.; Mazioum, N.; Xu, H.; Lee, M. Y. J. Biol. Chem. 1999, 274, 26647.
228. Shivji, M. K. K.; Podust, V. N.; Hubscher, U.; Wood, R. D. Biochemistry 1995, 34, 5011.
229. Waga, S.; Stillman, B. Annu. Rev. Biochem. 1998, 67, 721.
230. Hubscher, U.; Seo, Y. S. Mol. Cell 2001, 12, 149.
231. Hubscher, U.; Maga, G.; Spadari, S. Annu. Rev. Biochem. 2002, 71, 133.
232. Alberts, B. Nature 2003, 421, 431.
233. Gulbis, J. M.; Kelman, Z.; Hurwitz, J.; O'Donnell, M.; Kuriyan, J. Cell 1996, 87, 297.
234. Gomes, X. V.; Burgers, P. M. J. Biol. Chem. 2001, 276, 34768.
235. Miura, N.; Nakamura, S.; Sasaki, T.; Takasaki, Y.; Shiomi, T.; Yamaizumi, M. Exp. Cell Res. 1996, 226, 126.
236. Gary, R.; Dale, L. L.; Cornelius, H. L.; MacInnes, M. A.; Park, M. S. J. Biol. Chem. 1997, 272, 24522.
237. Sancar, A.; Lindsey-Boltz, L. A.; Unsal-Kacmaz, K.; Linn, S. Annu. Rev. Biochem. 2004, 73, 39.
238. Stauffer, M. E.; Chazin, W. J. J. Biol. Chem. 2004, 279, 30915.
239. Ariza, R. R.; Keyse, S. M.; Moggs, J. G.; Wood, R. D. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 433.
240. Coin, F.; Auriol, J.; Tapias, A.; Clivio, P.; Vermeulen, W.; Egly, J. M. EMBO J. 2004, 23, 4835.
241. Luger, K.; Mader, A. W.; Richmond, R. K.; Sargent, D. F.; Richmond, T. J. Nature 1997, 389, 251.
242. Kornberg, R. D.; Lorch, Y. Cell 1999, 98, 285.
243. Thoma, F. EMBO J. 1999, 18, 6585.
244. Smerdon, M. J.; Lieberman, M. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1978, 75, 4238.
245. Smerdon, M. J. Curr. Opin. Cell. Biol. 1991, 3, 422.
246. Gontijo, A. M.; Green, C. M.; Almouzni, G. Biochimie 2003, 85, 1133.
247. Wang, C. I.; Taylor, J. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 9072.
248. Sugasawa, K.; Masutani, C.; Hanaoka, F. J. Biol. Chem. 1993, 268, 9098.
249. Hara, R.; Mo, J.; Sancar, A. Mol. Cell. Biol. 2000, 20, 9173.
250. Ura, K.; Araki, M.; Saeki, H.; Masutani, C.; Ito, T.; Iwai, S.; Mizukoshi, T.; Kaneda, Y.; Hanaoka, F. EMBO J. 2001, 20, 2004.
251. Ramanathan, B.; Smerdon, M. J. Carcinogenesis 1986, 7, 1087.
252. Smerdon, M. J.; Lan, S. Y.; Calza, R. E.; Reeves, R. J. Biol. Chem. 1982, 257, 13441.
253. Dresler, S. L. Biochemistry 1985, 24, 6861.
254. Ramanathan, B.; Smerdon, M. J. J. Biol. Chem. 1989, 264, 11026.
255. Martinez, E.; Palhan, V. B.; Tjernberg, A.; Lymar, E. S.; Gamper, A. M.; Kundu, T. K.; Chait, B. T.; Roeder, R. G. Mol. Cell. Biol. 2001, 21, 6782.
256. Teng, Y.; Yu, Y.; Waters, R. J. Mol. Biol. 2002, 316, 489.
257. Brand, M.; Moggs, J. G.; Oulad-Abdelghani, M.; Lejeune, F.; Dilworth, F. J.; Stevenin, J.; Almouzni, G.; Tora, L. EMBO J. 2001, 20, 3187.
258. Datta, A.; Bagchi, S.; Nag, A.; Shiyanov, P.; Adami, G. R.; Yoon, T.; Raychaudhuri, P. Mutat. Res. 2001, 486, 89.
259. Rapic-Otrin, V.; McLenigan, M. P.; Bisi, D. C.: Gonzalez, M.; Levine, A. S. Nucleic Acids Res. 2002, 30, 2588.
260. Rubbi, C. P.; Milner, J. EMBO J. 2003, 22, 975.
261. Liu, X.; Smerdon, M. J. J. Biol. Chem. 2000, 275, 23729.
262. Hara, R.; Sancar, A. Mol. Cell. Biol. 2002, 22, 6779.
263. Hara, R.; Sancar, A. Mol. Cell. Biol. 2003, 23, 4121.
264. Yasuda, T.; Sugasawa, K.; Shimizu, Y.; Iwai, S.; Shiomi, T.; Hanaoka, F. DNA Rep. 2005, 4, 389.
265. Baxter, B. K.; Smerdon, M. J. J. Biol. Chem. 1998, 273, 17517.
266. Smerdon, M. J.; Conconi, A. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 1999, 62, 227.
267. Tang, J.; Chu, G. DNA Rep. 2002, 1, 601.
268. Nichols, A. F.; Ong, P.; Linn, S. J. Biol. Chem. 1996, 271, 24317.
269. Hwang, B. J.; Toering, S.; Francke, U.; Chu, G. Mol. Cell. Biol. 1998, 18, 4391.
270. Itoh, T.; Mori, T.; Ohkubo, H.; Yamaizumi, M. J. Invest. Dermatol. 1999, 113, 251.
271. Rapic-Otrin, V.; Navazza, V.; Nardo, T.; Botta, E.; McLenigan, M.; Bisi, D. C.; Levine, A. S.; Stefanini, M. Hum. Mol. Genet. 2003, 12, 1507.
272. Hwang, B. J.; Ford, J. M.; Hanawalt, P. C.; Chu, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 424.
273. Tang, J. Y.; Hwang, B. J.; Ford, J. M.; Hanawalt, P. C.; Chu, G. Mol. Cell 2000, 5, 737.
274. Bohr, V. A.; Smith, C. A.; Okumoto, D. S.; Hanawalt, P. C. Cell 1985, 40, 359.
275. Mellon, I.; Spivak, G.; Hanawalt, P. C. Cell 1987, 51, 241.
276. Wakasugi, M.; Shimizu, M.; Morioka, H.; Linn, S.; Nikaido, O.; Matsunaga, T. J. Biol. Chem. 2001, 276, 15434.
277. Sugasawa, K.; Okuda, Y.; Saijo, M.; Nishi, R.; Matsuda, N.; Chu, G.; Mori, T.; Iwai, S.; Tanaka, K.; Hanaoka, F. Cell 2005, 121, 387.
278. Rapic Otrin, V. R.; McLenigan, M.; Takao, M.; Levine, A. S.; Protic, M. J. Cell Sci. 1997, 110, 1159.
279. Rapic Otrin, V.; Kuraoka, I.; Nardo, T.; McLenigan, M.; Eker, A. P.; Stefanini, M.: Levine, A. S.; Wood, R. D. Mol. Cell. Biol. 1998, 18, 3182.
280. Groisman, R.; Polanowska, J.; Kuraoka, I.; Sawada, J.; Saijo, M.; Drapkin, R.; Kisselev, A. F.; Tanaka, K.; Nakatani, Y. Cell 2003, 113, 357.
281. Shiyanov, P.; Nag, A.; Raychaudburi, P. J. Biol. Chem. 1999, 274, 35309.
282. Nag, A.; Bondar, T.; Shiv, S.; Raychaudhuri, P. Mol. Cell. Biol. 2001, 21, 6738.
283. Hunting, D. J.; Dresler, S. L.; Lieberman, M. W. Biochemistry 1985, 24, 3219.
284. Smerdon, M. J. J. Biol. Chem. 1986, 261, 244.
285. Chafin, D. R.; Vitolo, J. M.; Henricksen, L. A.; Bambara, R. A.; Hayes, J. J. EMBO J. 2000, 19, 5492.
286. Kosmoski, J. V.; Ackerman, E. J.: Smerdon, M. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 10113.
287. Gaillard, P. H.; Martini, E. M.; Kaufman, P. D.; Stillman, B.; Moustacchi, E.; Almouzni, G. Cell 1996, 86, 887.
288. Gaillard, P. H.; Moggs, J. G.; Roche, D. M.; Quivy, J. P.; Becker, P. B.; Wood, R. D.; Almouzni, G. EMBO J. 1997, 16, 6281.
289. Moggs, J. G.; Almouzni, G. Biochimie 1999, 81, 45.
290. Green, C. M.; Almouzni, G. EMBO J. 2003, 22, 5163.
291. Martini, E.; Roche, D. M.; Marheineke, K.; Verreault, A.; Almouzni, G. J. Cell. Biol. 1998, 143, 563.
292. Moggs, J. G.; Grandi, P.; Quivy, J. P.; Jonsson, Z. O.; Hubscher, U.; Becker, P. B.; Almouzni, G. Mol. Cell. Biol. 2000, 20, 1206.
293. Friedberg, E. C. Nature 2001, 1, 22.
294. de Boer, J.; Hoeijmakers, J. H. Biochimie 1999. 81, 127.
295. de Boer, J.; Andressoo, J. O.; de Wit, J.; Huijmans, J.; Beems, R. B.; van Steeg, H.; Weeda, G.; van der Horst, G. T.; van Leeuwen, W.; Themmen, A. P.; Meradji, M.; Hoeijmakers, J. H. Science 2002, 296, 1276.
296. Lombard, D. B.; Chua, K. F.; Mostoslavsky, R.; Franco, S.; Gostissa, M.; Alt, F. W. Cell 2005, 120, 497.
297. Yu, J. J.; Mu, C.; Lee, K. B.; Okamoto, A.; Reed, E. L.; Bostick-Bruton, F.; Mitchell, K. C.; Reed, E. Mutat. Res. 1997, 382, 13.
298. Yu, J. J.; Lee, K. B.; Mu, C.; Li, Q.; Abernathy, T. V.; Bostick-Bruton, F.; Reed, E. Int. J. Oncol. 2000, 16, 555.
299. Broughton, B. C.; Steingrimsdottir, H.; Lehmann, A. R. Mutat. Res. 1996, 362, 209.
300. Khan, S. G.; Metter, E. J.; Tarone, R. E.; Bohr, V. A.; Grossman, L.; Hedayati, M.; Bale, S. J.; Emmert, S.; Kraemer, K. H. Carcinogenesis 2000, 21, 1821.
301. Millikan, R. C.; Hummer, A.; Begg, C.; Player, J.; de Cotret, A. R.; Winkel, S.; Mohreweiser, H.; Thomas, N.; Armstrong, B.; Kricker, A.; Marrett, L. D.; Gruber, S. B.; Anton Culver, H.; Zanetti, R.; Gallagher, R. P.; Dwyer, T.; Rebbeck, T.; Busam, K.; From, L.; Mujumdar, U.; Berwick, M.; and for the GEM Study Group. Carcinogenesis, published online October 29, 2005; http://dx.doi.org/10.1093/carcin/bgi252.
302. Winsey, S. L.; Haldar, N. A.; Marsh, H. P.; Bunce, M.; Marshall, S. E.; Harris, A. L.; Wojnarowska, F.; Welsh, K. I. Cancer Res. 2000, 60, 5612.
303. Emmert, S.; Schneider, T. D.; Khan, S. G.; Kraemer, K. H. Nucleic Acids Res. 2001, 29, 1443.
304. Mellon, I.; Hock, T.; Reid, R.; Porter, P. C.; States, J. C. DNA Rep. 2002, 1, 531.
305. Benhamou, S.; Sarasin, A. Mutagenesis 2002, 17, 463.
306. Clarkson, S. G.; Wood, R. D. DNA Rep. 2005, 4, 1068.
307. Blankenburg, S.; Konig, I. R.; Moessner, R.; Laspe, P.; Thoms, K. M.; Krueger, U.; Khan, S. G.; Westphal, G.; Volkenandt, M.; Neumann, C.; Ziegler, A.; Kraemer, K. H.; Reich, K.; Emmert, S. Eur. J. Hum. Genet. 2005, 13, 253.
308. Shen, H.; Sturgis, E. M.; Khan, S. G.; Qiao, Y.; Shahlavi, T.; Eicher, S. A.; Xu, Y.; Wang, X.; Strom, S. S.; Spitz, M. R.; Kraemer, K. H.; Wei, Q. Cancer Res. 2001, 61, 3321.
309. Qiao, Y.; Spitz, M. R.; Shen, H.; Guo, Z.; Shete, S.; Hedayati, M.; Grossman, L.; Mohrenweiser, H.; Wei, Q. Carcinogenesis 2002, 23, 295.
310. Vodicka, P.; Kumar, R.; Stetina, R.; Sanyal, S.; Soucek, P.; Haufroid, V.; Dusinska, M.; Kuricova, M.; Zamecnikova, M.; Musak, L.; Buchancova, J.; Norppa, H.; Hirvonen, A.; Vodickova, L.; Naccarati, A.; Matousu, Z.; Hemminki, K. Carcinogenesis 2004, 25, 757.
311. Kumar, R.; Hoglund, L.; Zhao, C.; Forsti, A.; Snellman, E.; Hemminki, K. Int. J. Cancer 2003, 103, 671.
312. Blankenburg, S.; Konig, I. R.; Moessner, R.; Laspe, P.; Thoms, K. M.; Krueger, U.; Khan, S. G.; Westphal, G.; Berking, C.; Volkenandt, M.; Reich, K.; Neumann, C.; Ziegler, A.; Kraemer, K. H.; Emmert, S. Carcinogenesis 2005, 26, 1085.
313. Viguier, J.; Boige, V.; Miquel, C.; Pocard, M.; Giraudeau, B.; Sabourin, J. C.; Ducreux, M.; Sarasin, A.; Praz, F. Clin. Cancer Res. 2005, 11, 6212.
314. Gu, J.; Zhao, H.; Dinney, C. P.; Zhu, Y.; Leibovici, D.; Bermejo, C. E.; Grossman, H. B.; Wu, X. Clin. Cancer Res. 2005, 11, 1408.
315. Husain, I.; Griffith, J.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 2558.
316. Park, H.; Zhang, K.; Ren, Y.; Nadji, S.; Sinha, N.; Taylor, J. S.; Kang, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 15965.
317. Rice, J. A.; Crothers, D. M.; Pinto, A. L.; Lippard, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 4158.
318. Farrell, N.; Appleton, T. G.; Qu, Y.; Roberts, J. D.; Fontes, A. P.; Skov, K. A.; Wu, P.; Zou, Y. Biochemistry 1995, 34, 145480.
319. Takahara, P. M.; Rosenzweig, A. C.; Frederick, C. A.; Lippard, S. J. Nature 1995, 377, 649.
320. Bellon, S. F.; Coleman, J. H.; Lippard, S. J. Biochemistry 1991, 30, 8026.
321. Gelasco, A.; Lippard, S. J. Biochemistry 1998, 37, 9230.
322. Anin, M. F.; Leng, M. Nucleic Acids Res. 1990, 18, 4395.
323. Bellon, S. F.; Lippard, S. J. Biophys. Chem. 1990, 35, 179.
324. van Garderen, C. J.; van Houte, L. P. Eur. J. Biochem. 1994, 225, 1169.
325. Hansson, J.; Wood, R. D. Nucleic Acids Res. 1989, 17, 8073.
326. Kasparkova, J.; Mellish, K. J.; Qu, Y.; Brabec, V.; Farrell, N. Biochemistry 1996, 35, 16705.
327. Cosman, M.; de los Santos, C.; Fiala, R.; Hingerty, B. E.; Singh, S. B.; Ibanez, V.; Margulis, L. A.; Live, D.; Geacintov, N. E.; Broyde, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 1914.
328. de los Santos, C.; Cosman, M.; Hingerty, B. E.; Ibanez, V.; Margulis, L. A.; Geacintov, N. E.; Broyde, S.; Patel, D. J. Biochemistry 1992, 31, 5245.
329. Cosman, M.; Fiala, R.; Hingerty, B. E.; Amin, S.; Geacintov, N. E.; Broyde, S.; Patel, D. J. Biochemistry 1994, 33, 11507.
330. Feng, B.; Gorin, A.; Kolbanovskiy, A.; Hingerty, B. E.; Geacintov, N. E.; Broyde, S.; Patel, D. J. Biochemistry 1997, 36, 13780.
331. Cosman, M.; de los Santos, C.; Fiala, R.; Hingerty, B. E.; Ibanez, V.; Luna, E.; Harvey, R.; Geacintov, N. E.; Broyde, S.; Patel, D. J. Biochemistry 1993, 32, 4145.
332. Cosman, M.; Hingerty, B. E.; Luneva, N.; Amin, S.; Geacintov, N. E.; Broyde, S.; Patel, D. J. Biochemistry 1996, 35, 9850.
333. Cosman, M.; Fiala, R.; Hingerty, B. E.; Amin, S.; Geacintov, N. E.; Broyde, S.; Patel, D. J. Biochemistry 1994, 33, 11518.
334. Mao, B.; Go, Z.; Gorin, A.; Chen, J.; Hingerty, B. E.; Amin, S.; Broyde, S.; Geacintov, N. E.; Patel, D. J. Biochemistry 1999, 38, 10831.
335. Volk, D. E.; Rice, J. S.; Luxon, B. A.; Yeh, H. J.; Liang, C.; Xie, G.; Sayer, J. M.; Jerina, D. M.; Gorenstein, D. G. Biochemistry 2000, 39, 14040.
336. Zegar, I. S.; Kim, S. J.; Johansen, T. N.; Horton, P. J.; Harris, C. M.; Harris, T. M.; Stone, M. P. Biochemistry 1996, 35, 6212.
337. Lin, C. H.; Huang, X.; Kolbanovskii, A.; Hingerty, B. E.; Amin, S.; Broyde, S.; Geacintov, N. E.; Patel, D. J. J. Mol. Biol. 2001, 306, 1059.
338. Cosman, M.; Fiala, R.; Hingerty, B. E.; Laryea, A.; Lee, H.; Harvey, R. G.; Amin, S.; Geacintov, N. E.; Broyde, S.; Patel, D. Biochemistry 1993, 32, 12488.
339. Cosman, M.; Laryea, A.; Fiala, R.; Hingerty, B. E.; Amin, S.; Geacintov, N. E.; Broyde, S.; Patel, D. J. Biochemistry 1995, 34, 1295.
340. O'Handley, S. F.; Sanford, D. G.; Xu, R.; Lester, C. C.; Hingerty, B. E.; Broyde, S.; Krugh, T. R. Biochemistry 1993, 32, 2481.
341. van Oosterwijk, M. F.; Filon, R.; Kalle, W. H.; Mullenders, L. H.; van Zeeland, A. A. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 4653.
342. Mao, B.; Cosman, M.; Hingerty, B. E.; Broyde, S.; Patel, D. Biochemistry 1995, 34, 6226.
343. Mao, B.; Hingerty, B. E.; Broyde, S.; Patel, D. J. Biochemistry 1995, 34, 16641.
344. Mao, B.; Gorin, A.; Gu, Z.; Hingerty, B. E.; Broyde, S.; Patel, D. Biochemistry 1997, 36, 14479.
345. Brown, K.; Hingerty, B. E.; Guenther, E. A.; Krishnan, V. V.; Broyde, S.; Turteltaub, K. W.; Cosman, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 8507.
346. Wu, X.; Shapiro, R.; Broyde, S. Chem. Res. Toxicol. 1999, 12, 895.
347. Mao, B.; Vyas, R. R.; Hingerty, B. E.; Broyde, S.; Basu, A. K.; Patel, D. J. Biochemistry 1996, 35, 12659.
348. Shapiro, R.; Ellis, S.; Hingerty, B. E.; Broyde, S. Chem. Res. Toxicol. 1998, 11, 335.
349. Cho, B. P.; Beland, F. A.; Marques, M. M. Biochemistry 1992, 31, 9587.
350. Gomez-Pinto, R.; Cubero, E.; Kalko, S. G.; Monaco, V.; van der Marel, G.; van Boom, J. H.; Orozco, M.; Gonzales, C. J. Biol. Chem. 2004, 279, 24552.
351. Spielmann, H. P.; Dwyer, T. J.; Sastry, S. S.; Hearst, J. E.; Wemmer, D. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 2345.
352. Spielmann, H. P.; Dwyer, T. J.; Hearst, J. E.; Wemmer, D. E. Biochemistry 1995, 34, 12937.
353. Hansson, J.; Munn, M.; Rupp, W. D.; Kahn, R.; Wood, R. D. J. Biol. Chem. 1989, 264, 21788.
354. Matsuda, T.; Saijo, M.; Kuraoka, I., Kobayashi, T.; Nakatsu, Y.; Nagai, A.; Enjoji, T.; Masutani, C.; Sugasawa, K.; Hanaoka, F.; et al. J. Biol. Chem. 1995, 270, 4152.
355. Park, C. H.; Mu, D.; Reardon, J. T.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1995, 270, 4896.
356. Li, R. Y.; Calsou, P.; Jones, C. J.; Salles, B. J. Mol. Biol. 1998, 281, 211.
357. Li, L.; Peterson, C. A.; Lu, X.; Legerski, R. J. Mol. Cell. Biol. 1995, 15, 1993.
358. Winkler, G. S.; Sugasawa, K.; Eker, A. P.; de Laat, W. L.; Hoeijmakers, J. H. Biochemistry 2001, 40, 160.
359. Nocentini, S.; Coin, F.; Saijo, M.; Tanaka, K.; Egly, J. M. J. Biol. Chem. 1997, 272, 22991.
360. Habraken, Y.; Sung, P.; Prakash, S.; Prakash, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 10718.
361. Gervais, V.; Lamour, V.; Jawhari, A.; Frindel, F.; Wasielewski, E.; Dubaele, S.; Egly, J. M.; Thierry, J. C.; Kieffer, B.; Poterszman, A. Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 616.
362. Dionne, I.; Nookala, R. K.; Jackson, S. P.; Doherty, A. J.; Bell, S. D. Mol. Cell 2003, 11, 275.
363. Mossi, R.; Hubscher, U. Eur. J. Biochem. 1998, 254, 209.
364. Montecucco, A.; Rossi, R.; Levin, D. S.; Gary, R.; Park, M. S.; Motycka, T. A.; Ciarrocchi, G.; Villa, A.; Biamonti, G.; Tomkinson, A. E. EMBO J. 1998, 17, 3786.
365. Biggerstaff, M.; Robins, P.; Coverley, D.; Wood, R. D. Mutat. Res. 1991, 254, 217.
366. Heiger-Bernays, W. J.; Essigmann, J. M.; Lippard, S. J. Biochemistry 1990, 29, 8461.
367. Koehl, P.; Burnouf, D.; Fuchs, R. P. J. Mol. Biol. 1989, 207, 355.
368. Taylor, J. S.; Cohrs, M. P. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 2834.
369. Hoffmann, G. R.; Fuchs, R. P. Chem. Res. Toxicol. 1997, 10, 347.