Accurate and effective calculation of amide proton magnetic shieldings in a calcium binding peptide

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 6, Issue 10, 2004, Pages 2557-2562

  Benzi, Caterina ^a   Cossi, Maurizio ^a   Barone, Vincenzo ^a  

^a UNIVERSITY OF NAPLES FEDERICO II   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMIDE; AMINO ACID DERIVATIVE; GLYCINE; PROTEIN; PROTON;

ACCURACY; ARTICLE; CALCIUM BINDING; CALCULATION; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PROTEIN INTERACTION; PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; RADIATION SHIELD;

EID: 3042654984     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b316718f     Document Type: Article

References (31)

1. K. Osapay and D. A. Case, J. Am. Chem. Soc., 1991, 113, 9436.
2. D. S. Wishart, B. D. Sykes and F. M. Richards, J. Mol. Biol., 1991, 222, 311.
3. K. Osapay and D. A. Case, J. Biol. NMR, 1994, 4, 215.
4. T. Asakura, K. Taoka, M. Demura and M. P. Williamson, J. Bio. NMR, 1995, 6, 227.
5. I. D. Kuntz, P. A. Kosen and E. C. Craig, J. Am. Chem. Soc., 1991, 113, 1406.
6. D. S. Wishart, B. D. Sykes and F. M. Richards, Biochem., 1992, 31, 1647.
7. E. Oldfield, Annu. Rev. Phys. Chem., 2002, 53, 349.
8. D. B. Chesnut, Chem. Phys., 1997, 214, 73.
9. D. S. Wishart, B. D. Sykes and F. M. Richards, J. Mol. Biol., 1991, 222, 541.
10. N. Tjandra and A. Bax, J. Am. Chem. Soc., 1997, 119, 8076.
11. M. Tessari, A. A. F. Mulder, R. Boelens and G. W. Vuister, J. Magn. Reson., 1997, 127, 128.
12. Y. Sharma, O. Y. Kwon, B. Brooks and N. Tjandra, J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 327.
13. B. E. Campbell, K. R. Easwaran, G. C. Zanotti, M. A. Staples, E. T. Fossel and E. R. Blout, Biopolymers, 1986, 25, S47.
14. B. Di Blasio, E. Benedetti, V. Pavone, C. Pedone, M. Saviano, G. Zanotti and E. Blout, Biopolymers, 1990, 30, 509.
15. R. Oliva, L. Falcigno, G. D'Auria, G. Zanotti and L. Paolillo, Biopolymers, 2001, 56, 27.
16. M. Svensson, S. Humbel, R. D. J. Froese, T. Matsubara, S. Sieber and K. Morokuma, J. Phys. Chem., 1996, 100, 19357.
17. Gaussian 03, (Revision B. 04), M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, V. G. Zakrzewski, J. A. Montgomery, Jr., K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, R. E. Stratmann, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, S. Iyengar, G. A. Petersson, M. Ehara, K. Toyota, H. Nakatsuji, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Cammi, C. Pomelli, J. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. Gomperts, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, J. L. Andres, C. Gonzalez, M. Head-Gordon, E. S. Replogle and J. A. Pople, Gaussian, Inc., Pittsburgh PA, 2003.
18. C. Adamo and V. Barone, J. Chem. Phys., 1999, 110, 6158.
19. A. D. McLean and G. S. Chandler, J. Chem. Phys., 1980, 72, 5639.
20. R. Ditchfield, W. J. Hehre and J. A. Pople, J. Chem. Phys., 1971, 54, 724.
21. V. Barone, O. Crescenzi and R. Improta, Quant. Struct.- Act Relat., 2002, 21, 105.
22. K. Wolinski, J. F. Hilton and P. Pulay, J. Am. Chem. Soc., 1990, 112, 8251.
23. T. A. Keith and R. F. W. Bader, Chem. Phys. Lett., 1993, 210, 223.
24. F. Maseras and K. Morokuma, J. Comp. Chem., 1995, 16, 1170.
25. D. Bakowies and W. Thiel, J. Phys. Chem., 1996, 100, 10580.
26. M. J. Field, P. A. Bash and M. Karplus, J. Comp. Chem., 1990, 11, 700.
27. Q. Cui and M. Karplus, J. Phys. Chem. B, 2000, 104, 3721.
28. R. Luo, X. Mao, Z. Pan and Q. Luo, Spectrochimica Acta A, 2000, 56, 1675.
29. N. Rega, M. Cossi, G. Scalmani and V. Barone, J. Chem. Phys., 2001, 134, 7550.
30. A. E. Reed, L. A. Curtiss and F. Weinhold, Chem. Rev., 1988, 88, 899.
31. C. Benzi, O. Crescenzi and V. Barone, Magn. Reson. Chem., in press.