Stabilization of excess charge in isolated adenosine 5′-triphosphate and adenosine 5′-diphosphate multiply and singly charged anions

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 109, Issue 43, 2005, Pages 9775-9785

  Burke, Ruth M ^a   Pearce, Julie K ^a   Boxford, William E ^a   Bruckmann, Angelika ^a   Dessent, Caroline E H ^a  

^a UNIVERSITY OF YORK   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

HYDROGEN BONDS; IONIZATION; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR DYNAMICS; NEGATIVE IONS; PHOSPHATES; SOLVENTS; SPRAYING;

IONIC FRAGMENTATION; MOLECULAR CLUSTERS; MULTIPLY CHARGED ANIONS (MCA); REPULSIVE COULOMBIC BARRIERS (RCB);

NUCLEIC ACIDS;

ADENOSINE DIPHOSPHATE; ADENOSINE TRIPHOSPHATE; ANION;

ARTICLE; CHEMICAL MODEL; CHEMISTRY; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; HYDROGEN BOND;

ADENOSINE DIPHOSPHATE; ADENOSINE TRIPHOSPHATE; ANIONS; HYDROGEN BONDING; MODELS, CHEMICAL; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION;

EID: 27744431921     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp052937y     Document Type: Article

References (56)

1. Schauer, S. N.; Williams, P.; Compton, R. N. Phys. Rev. Lett. 1990, 65, 625.
2. Wang, X. B.; Yang, X.; Wang, L. S. Int. Rev. Phys. Chem. 2002, 21, 473.
3. Schröder, D. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 1329.
4. Dreuw, A.; Cederbaum, L. S. Chem. Rev. 2002, 102, 181.
5. Scheller, M. K.; Compton, R. N.; Cederbaum, L. S. Science 1995, 270, 116.
6. Boldyrev, A. I.; Gutowski, M.; Simons, J. Acc. Chem. Res. 1996, 29, 497.
7. Blades, A. T.; Kebarle, P. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 10761.
8. Compton, R. N.; Tuinman, A. A.; Klots, C. E.; Pederson, M. R.; Patton, D. C. Phys. Rev. Lett. 1997, 78, 4367.
9. Boxford, W. E.; Pearce, J. K.; Dessent, C. E. H. Chem. Phys. Lett. 2004, 399, 465.
10. Ehrler, O. T.; Furche, F.; Weber, J. M.; Kappes, M. M. J. Chem. Phys. 2005, 122, 94321.
11. Boltalina, O. V.; Streletskii, A. V.; Ioffe, I. N.; Hvelplund, P.; Liu, B.; Nielsen, S. B.; Tomita, S. J. Chem. Phys. 2005, 122, 21102.
12. Friedrich, J.; Gilb, S.; Ehrler, O. T.; Behrendt, A.; Kappes, M. M. J. Chem. Phys. 2002, 117, 2635.
13. Wong, R. L.; Williams, E. R. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 10976.
14. Wang, X. B.; Nicholas, J. B.; Wang, L. S. J. Chem. Phys. 2000, 113, 10837.
15. Ding, C. F.; Wang, X. B.; Wang, L. S. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 8633.
16. Dessent, C. E. H.; Rigby, C. Chem. Phys. Lett. 2003, 370, 52.
17. Kambalapalli, S.; Ortiz, J. V. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 10360.
18. Wang, X. B.; Ding, C. F.; Nicholas, J. B.; Dixon, D. A.; L. S. Wang, J. Phys. Chem. A 1999, 103, 3423.
19. Vandenbosch, R.; Will, D. I.; Cooper, C.; Henry, B.; Liang, J. F. Chem. Phys. Lett. 1997, 274, 112.
20. Dreuw, A.; Cederbaum, L. S. J. Chem. Phys. 1999, 111, 1467.
21. March, R. E.; Todd, J. F. Practical Aspects of Ion-Trap Mass Spectrometry; CRC Press: Boca Raton, FL, 1995; Vols. 1 and 2.
22. Westheimer, F. H. Science 1987, 235, 1173.
23. Rees, D. C.; Howard, J. B. J. Mol. Biol. 1999, 293, 343.
24. Simons, J. P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, E7.
25. Wyttenbach, T.; Bowers, M. T. Top. Curr. Chem. 2003, 225, 207.
26. McLafferty, F. W.; Fridriksson, E. K.; Horn, D. M. Science 1999, 284, 1289.
27. Jarrold, M. F. Acc. Chem. Res. 1999, 32, 360.
28. Xu, S. J.; Zheng, W. J.; Radisic, D.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 2005, 122, 091103.
29. Srebalus Barnes, C. A.; Clemmer, D. E. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 10566.
30. Wang, X.; Levy, D. H.; Rubin, M. B. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 6558.
31. Porath, D.; Bezryadin, A.; de Vries, S.; Dekker, C. Nature 2000, 403, 635.
32. Ullrich, S.; Tarczay, G.; Tong, X.; Dessent, C. E. H.; Müller-Dethlefs, K. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 5450.
33. Fricke, H.; Gerlach, A.; Unterberg, C.; Rzepecki, P.; Schrader, T.; Gerhards, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 4636.
34. Desfrancois, C.; Abdoul-Carime, H.; Schermann, J. P. J. Chem. Phys. 1996, 104, 7792.
35. Julian, R. R.; Beauchamp J. L. Int. J. Mass Spectrom. 2003, 227, 147.
36. Blades, A. T.; Ho, Y.; Kebarle, P. J. Phys. Chem. 1996, 100, 2443.
37. Davies, J. S. J. Pept. Sci. 2003, 9, 471.
38. Splendore, M.; Londry, F. A.; March, R. E.; Morrison, R. J. S.; Perrier, P.; André, J. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1996, 156, 11.
39. Armentrout, P. B. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2002, 13, 419.
40. Colorado, A.; Brodbelt, J. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1996, 7, 1116.
41. a) Ince, M. P.; Perera, B. A.; Van Stipdonk, M. J. Int. J. Mass. Spectrom. 2001, 207, 41.
42. (b) Vachet, R. W.; Callahan, J. H, J. Mass Spectrom. 2000, 35, 311.
43. Satterfield, M.; Brodbelt, J. S. Inorg. Chem. 2001, 40, 5393.
44. Deppmeier, B. J.; Driessen, A. J.; Hehre, T. S.; Hehre, W. J.; Johnson, J. A.; Klunzinger, P. E.; Leonard, J. M.; Ohlinger, W. S.; Pham, I. N.; Pietro, W. J.; Yu, J. PC Spartan Pro; Wavefunction, Inc.: Irvine, CA, 2000.
45. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Kiene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision C.01; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
46. 46 We define typical hydrogen bonds as having bond lengths <3 Å and angles of 180 ± 25°, with loose "hydrogen-bond- like" interactions having bond lengths <3.5 Å and angles of 180 ±65°. It should be noted that a hydrogen bond typically has a length of ∼2 Å and an angle of 180°.
47. Liu, D.; Wyttenbach, T.; Carpenter, C. J.; Bowers, M. T. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3261.
48. Wang, X. B.; Vorpagel, E. R.; Yang, X.; Wang, L. S. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 10468.
49. Loo, J. A.; Udesth, H. R.; Smith, R. D. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1988, 2, 207.
50. McLuckey, S. A.; Van Berkel, G. J.; Glish, G. L. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1992, 3, 60.
51. McLuckey, S. A.; Habibi-Goudarzi, S. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 12085.
52. Boxford, W. E.; Dessent, C. E. H. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 5836.
53. Gross, D. S.; Rodriguez-Cruz, S. E.; Bock, S.; Williams, E. R. J. Phys. Chem. A 1995, 99, 4034.
54. Gross, D. S.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 883.
55. Rodgers, M. T.; Campbell, S.; Marzluff, E. M.; Beauchamp, J. L. Int. J. Mass. Spectrom. Ion Processes 1994, 137, 121.
56. Bruni, R.; Gianfranceschi, G.; Koch, G. J. Pept. Sci. 2005, 11, 225.