Single-molecule Michaelis - Menten equations

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 109, Issue 41, 2005, Pages 19068-19081

  Kou, S C ^a   Cherayil, Binny J ^a,b   Min, Wei ^a   English, Brian P ^a   Xie, X Sunney ^a  

^a HARVARD UNIVERSITY   (United States)

^b INDIAN INSTITUTE OF SCIENCE   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DYNAMIC DISORDER; ENZYMATIC REACTIONS; ENZYMATIC TURNOVER; SUBSTRATE CONCENTRATIONS;

CATALYSIS; CONCENTRATION (PROCESS); ENZYME KINETICS; ENZYMES; PROBABILITY; SUBSTRATES;

REACTION KINETICS;

ENZYME;

ALGORITHM; ARTICLE; CHEMICAL MODEL; CHEMISTRY; KINETICS; STATISTICAL MODEL;

ALGORITHMS; ENZYMES; KINETICS; MODELS, CHEMICAL; MODELS, STATISTICAL;

EID: 27544450315     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp051490q     Document Type: Article

References (43)

1. Michaelis, L.; Menten, M. L. Biochem. Z. 1913, 49, 333.
2. Funatsu, T.; Harada, Y.; Tokunaga, M.; Saito, K.; Yanagida, T. Nature 1995, 374, 555.
3. Noji, H.; Yasuda, R.; Yoshida, M.; Kinosita, K. Nature 1997, 386, 299.
4. Lu, H. P.; Xun, L.; Xie, X. S. Science 1998, 282, 1877.
5. Ha, T.; Ting, A. Y.; Liang, J.; Caldwell, W. B.; Deniz, A. A.; Chemla, D. S.; Schultz, P. G.; Weiss, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 893.
6. Edman, L.; Rigler, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 8266.
7. Yasuda, R.; Noji, H.; Yoshida, M.; Kinosita, K.; Itoh, H. Nature 2001, 410, 898.
8. Zhuang, X.; Kim, H.; Pereira, M. J. B.; Babcock, H. P.; Walter, N. G.; Chu, S. Science 2002, 296, 1473.
9. Yildiz, A.; Forkey, J. N.; McKinney, S. A.; Ha, T.; Goldman, Y. E.; Selvin, P. R. Science 2003, 300, 2061.
10. Bustamante, C.; Bryant, Z.; Smith, S. B. Nature 2003, 421, 423.
11. van Oijen, A. M.; Blainey, P. C.; Crampton, D. J.; Richardson, C. C.; Ellenberger, T.; Xie, X. S. Science 2003, 301, 1235.
12. Yang, H.; Luo, G.; Karnchanaphanurach, P.; Louie, T.-M.; Rech, I.; Cova, S.; Xun, L.; Xie, X. S. Science 2003, 302, 262.
13. Tang, J.; Mei, E.; Green, C.; Kaplan, J.; DeGrado, W. F.; Smith, A. B., III; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 15910.
14. Velonia, K.; Flomenbom, O.; Loos, D.; Masuo, S.; Cotlet, M.; Engelborghs, Y.; Hofkens, J.; Rowan, A. E.; Klafter, J.; Nolte, R. J. M.; de Schryver, F. C. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 560.
15. Flomenbom, O.; Velonia, K.; Loos, D.; Masuo, S.; Cotlet, M.; Engelborghs, Y.; Hofkens, J.; Rowan, A. E.; Nolte, R. J. M.; van der Auweraer, M.; de Schryver, F. C.; Klafter, J. Proc. Natl Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 2368.
16. English, B. P.; Min, W.; van Oijen, A. M.; Lee, K. T.; Luo, G.; Sun, H.; Cherayil, B. J.; Kou, S. C.; Xie, X. S. Manuscript in preparation.
17. Xie, X. S. Single Molecule 2001, 4, 229.
18. Frauenfelder, H.; Sligar, S. G.; Wolynes, P. G. Science 1991, 254, 1598.
19. Austin, R.; Beeson, K. W.; Eisenstein, L.; Frauenfelder, H. Biochemistry 1975, 14, 5355.
20. Agmon, N.; Hopfield, J. J. J. Chem. Phys. 1983, 79, 2042.
21. Zwanzig, R. Acc. Chem. Res. 1990, 23, 148.
22. Zwanzig, R. J. Chem. Phys. 1992, 97, 3587.
23. Gehlen, J.; Marchi, M.; Chandler, D. Science 1994, 263, 499.
24. Wang, J.; Wolynes, P. Phys. Rev. Lett. 1995, 74, 4317.
25. Eizenberg, N.; Klafter, J. J. Chem. Phys. 1996, 104, 6796.
26. Bicout, D. J.; Szabo, A. J. Chem. Phys. 1998, 108, 5491.
27. Schenter, G. K.; Lu, H. P.; Xie, X. S. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 10477.
28. Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 11.
29. Yang, S.; Cao, J. S. J. Chem. Phys. 2002, 117, 10996.
30. Qian, H.; Elson, E. L. Biophys. Chem. 2002, 101, 565.
31. Xie, X. S. J. Chem. Phys. 2002, 17, 11024.
32. Barsegov, V.; Shapir, Y.; Mukamel, S. Phys. Rev. E 2003, 68, 011101.
33. Brown, F. L. H. Phys. Rev. Lett. 2003, 90, 028302.
34. Kou, S. C.; Xie, X. S. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 180603.
35. Min, W.; Luo, G.; Cherayil, B. J.; Kou, S. C.; Xie, X. S. Phys. Rev. Lett. 2005, 94, 198302.
36. Asbury, C. L.; Fehr, A. N.; Block, S. M. Science 2003, 302, 2130.
37. Schnitzer, M. J.; Block, S. M. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1995, 60, 793.
38. Svoboda, K.; Mitra, P. P.; Block, S. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 11782.
39. Segel, I. H. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems; Wiley: New York, 1993.
40. Yang, S.; Cao, J. S. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6536.
41. Ninio, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1987, 84, 663.
42. Flomenbom, O.; Klafter, J.; Szabo, A. Biophys. J. 2005, 88, 3780.
43. Schnitzer, M. J.; Block, S. M. Nature 1997, 355, 386.