-
4
-
-
0030862276
-
-
Young, M. A.; Ravishanker, G.; Beveridge, D. L. Biophys J 1997, 73, 2313.
-
(1997)
Biophys J
, vol.73
, pp. 2313
-
-
Young, M.A.1
Ravishanker, G.2
Beveridge, D.L.3
-
5
-
-
0030965411
-
-
Kovacs, H.; Mark, A. E.; van Gunsteren, W. F. Proteins 1997, 27, 395.
-
(1997)
Proteins
, vol.27
, pp. 395
-
-
Kovacs, H.1
Mark, A.E.2
Van Gunsteren, W.F.3
-
6
-
-
0032475964
-
-
Sunnerhagen, M.; Denisov, V. P.; Venu, K.; Bonvin, A. M. J. J.; Carey, J.; Halle, B.; Otting, G. J Mol Biol 1998, 282, 847.
-
(1998)
J Mol Biol
, vol.282
, pp. 847
-
-
Sunnerhagen, M.1
Denisov, V.P.2
Venu, K.3
Bonvin, A.M.J.J.4
Carey, J.5
Halle, B.6
Otting, G.7
-
7
-
-
0033636839
-
-
Makarov, V. A.; Andrews, B. K.; Smith, P. E.; Pettitt, B. M. Biophys J 2000, 79, 2966.
-
(2000)
Biophys J
, vol.79
, pp. 2966
-
-
Makarov, V.A.1
Andrews, B.K.2
Smith, P.E.3
Pettitt, B.M.4
-
8
-
-
0029856410
-
-
Fields, B. A.; Goldbaum, F. A.; Acqua, W. D.; Malchiodi, E. L.; Cauerhff, A.; Schwarz, F. P.; Ysern, X.; Poljak, R. J.; Mariuzza, R. A. Biochemistry 1996, 35, 15494.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 15494
-
-
Fields, B.A.1
Goldbaum, F.A.2
Acqua, W.D.3
Malchiodi, E.L.4
Cauerhff, A.5
Schwarz, F.P.6
Ysern, X.7
Poljak, R.J.8
Mariuzza, R.A.9
-
9
-
-
0029822931
-
-
Wang, Y. X.; Freedberg, D. I.; Grzesiek, S.; Torchia, D. A.; Wingfield, P. T.; Kaufman, J. D.; Stahl, S. J.; Chang, C. H.; Hodge, C. N. Biochemistry 1996, 35, 12694.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 12694
-
-
Wang, Y.X.1
Freedberg, D.I.2
Grzesiek, S.3
Torchia, D.A.4
Wingfield, P.T.5
Kaufman, J.D.6
Stahl, S.J.7
Chang, C.H.8
Hodge, C.N.9
-
11
-
-
0030805890
-
-
Kostzin, D.; Bishop, T. C.; Schulten, K. Biophys J 1997, 73, 557.
-
(1997)
Biophys J
, vol.73
, pp. 557
-
-
Kostzin, D.1
Bishop, T.C.2
Schulten, K.3
-
14
-
-
0029706920
-
-
Goldbaum, F. A.; Schwarz, F. P.; Eisenstein, E.; Cauerhff, A.; Mariuzza, R. A.; Poljak, R. J. J Mol Recognit 1996, 9, 6.
-
(1996)
J Mol Recognit
, vol.9
, pp. 6
-
-
Goldbaum, F.A.1
Schwarz, F.P.2
Eisenstein, E.3
Cauerhff, A.4
Mariuzza, R.A.5
Poljak, R.J.6
-
18
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J Chem Phys 1983, 79, 926.
-
(1983)
J Chem Phys
, vol.79
, pp. 926
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
19
-
-
1242346370
-
-
Berendsen, H. J. C.; Grigera, J. R.; Straatsma, T. P. J Phys Chem 1987, 91, 6269.
-
(1987)
J Phys Chem
, vol.91
, pp. 6269
-
-
Berendsen, H.J.C.1
Grigera, J.R.2
Straatsma, T.P.3
-
20
-
-
33751385054
-
-
Honig, B.; Sharp, K.; Yang, A. J Phys Chem 1993, 97, 1101.
-
(1993)
J Phys Chem
, vol.97
, pp. 1101
-
-
Honig, B.1
Sharp, K.2
Yang, A.3
-
22
-
-
0034227821
-
-
Hassan, S. A.; Guarnieri, F.; Mehler, E. L. J Phys Chem B 2000, 104, 6478.
-
(2000)
J Phys Chem B
, vol.104
, pp. 6478
-
-
Hassan, S.A.1
Guarnieri, F.2
Mehler, E.L.3
-
23
-
-
0037375367
-
-
Hassan, S. A.; Mehler, E. L.; Zhang, D.; Weinstein, H. Proteins 2003, 51, 109.
-
(2003)
Proteins
, vol.51
, pp. 109
-
-
Hassan, S.A.1
Mehler, E.L.2
Zhang, D.3
Weinstein, H.4
-
24
-
-
4043171970
-
-
Qiu, D.; Shenkin, P. S.; Hollinger, F. P.; Still, W. C. J Phys Chem A 1997, 101, 3005.
-
(1997)
J Phys Chem A
, vol.101
, pp. 3005
-
-
Qiu, D.1
Shenkin, P.S.2
Hollinger, F.P.3
Still, W.C.4
-
30
-
-
0000728542
-
-
Lee, F. S.; Chu, Z. T.; Warshel, A. J Comput Chem 1993, 14, 161.
-
(1993)
J Comput Chem
, vol.14
, pp. 161
-
-
Lee, F.S.1
Chu, Z.T.2
Warshel, A.3
-
31
-
-
22844456329
-
-
Fan, Z. Z.; Hwang, J. K.; Warshel, A. Theor Chem Acc 1999,103, 77.
-
(1999)
Theor Chem Acc
, vol.103
, pp. 77
-
-
Fan, Z.Z.1
Hwang, J.K.2
Warshel, A.3
-
33
-
-
19944380329
-
-
Kiefhaber, T.; Buchner, J., Eds.; Wiley: New York
-
Braun-Sand, S.; Warshel, A. In Protein Folding Handbook; Kiefhaber, T.; Buchner, J., Eds.; Wiley: New York, 2003.
-
(2003)
Protein Folding Handbook
-
-
Braun-Sand, S.1
Warshel, A.2
-
34
-
-
41349089274
-
-
Ramirez, R.; Gebauer, R.; Mareschal, M.; Borgis, D. Phys Rev E 2002, 66, 031206.
-
(2002)
Phys Rev E
, vol.66
, pp. 031206
-
-
Ramirez, R.1
Gebauer, R.2
Mareschal, M.3
Borgis, D.4
-
35
-
-
0000574454
-
-
Pettitt, B. M.; Karplus, M.; Rossky, P. J. J Phys Chem 1986, 90, 6335.
-
(1986)
J Phys Chem
, vol.90
, pp. 6335
-
-
Pettitt, B.M.1
Karplus, M.2
Rossky, P.J.3
-
43
-
-
0042880954
-
-
Borgis, D.; Levy, N.; Marchi, M. J Chem Phys 2003, 119, 3516.
-
(2003)
J Chem Phys
, vol.119
, pp. 3516
-
-
Borgis, D.1
Levy, N.2
Marchi, M.3
-
44
-
-
0037043433
-
-
Ha-Duong, T.; Phan, S.; Marchi, M.; Borgis, D. J Chem Phys 2002, 117, 541.
-
(2002)
J Chem Phys
, vol.117
, pp. 541
-
-
Ha-Duong, T.1
Phan, S.2
Marchi, M.3
Borgis, D.4
-
45
-
-
0035825993
-
-
Marchi, M.; Borgis, D.; Levy, N.; Ballone, P. J Chem Phys 2001, 114, 4377.
-
(2001)
J Chem Phys
, vol.114
, pp. 4377
-
-
Marchi, M.1
Borgis, D.2
Levy, N.3
Ballone, P.4
-
47
-
-
0009989494
-
-
Kharkats, Y. I.; Kornyshev, A. A.; Vorotyntsev, M. A. J Chem Soc Faraday Trans II 1976, 72, 361.
-
(1976)
J Chem Soc Faraday Trans II
, vol.72
, pp. 361
-
-
Kharkats, Y.I.1
Kornyshev, A.A.2
Vorotyntsev, M.A.3
-
48
-
-
0010262629
-
-
Procacci, P.; Darden, T. A.; Paci, E.; Marchi, M. J Comput Chem 1997, 18, 1848.
-
(1997)
J Comput Chem
, vol.18
, pp. 1848
-
-
Procacci, P.1
Darden, T.A.2
Paci, E.3
Marchi, M.4
-
49
-
-
0000504254
-
-
Humphreys, D. D.; Friesner, R. A.; Berne, B. J. J Phys Chem 1994, 98, 6885.
-
(1994)
J Phys Chem
, vol.98
, pp. 6885
-
-
Humphreys, D.D.1
Friesner, R.A.2
Berne, B.J.3
-
52
-
-
33646940952
-
-
Rychaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J Comput Chem 1977, 23, 327.
-
(1977)
J Comput Chem
, vol.23
, pp. 327
-
-
Rychaert, J.P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, H.J.C.3
-
53
-
-
0041784950
-
-
Mackerell, A. D.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evaseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Sträub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J Phys Chem B 1998, 102, 3586.
-
(1998)
J Phys Chem B
, vol.102
, pp. 3586
-
-
Mackerell, A.D.1
Bashford, D.2
Bellott, M.3
Dunbrack, R.L.4
Evaseck, J.D.5
Field, M.J.6
Fischer, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Joseph-McCarthy, D.11
Kuchnir, L.12
Kuczera, K.13
Lau, F.T.K.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
Reiher, W.E.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.C.23
Stote, R.24
Sträub, J.25
Watanabe, M.26
Wiorkiewicz-Kuczera, J.27
Yin, D.28
Karplus, M.29
more..
-
54
-
-
0029011701
-
-
Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M., Jr.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J Am Chem Soc 1995, 117, 5179.
-
(1995)
J Am Chem Soc
, vol.117
, pp. 5179
-
-
Cornell, W.D.1
Cieplak, P.2
Bayly, C.I.3
Gould, I.R.4
Merz Jr., K.M.5
Ferguson, D.M.6
Spellmeyer, D.C.7
Fox, T.8
Caldwell, J.W.9
Kollman, P.A.10
-
55
-
-
34250928962
-
-
Born, M. Z Phys 1920, 1, 45.
-
(1920)
Z Phys
, vol.1
, pp. 45
-
-
Born, M.1
-
56
-
-
0000307978
-
-
Berkowitz, M.; Karim, O. A.; McCammon, J. A.; Rossky, P. J. Chem Phys Lett 1984, 105, 577.
-
(1984)
Chem Phys Lett
, vol.105
, pp. 577
-
-
Berkowitz, M.1
Karim, O.A.2
McCammon, J.A.3
Rossky, P.J.4
-
57
-
-
85045821269
-
-
Dang, L. X.; Rice, J. E.; Kollman, P. A. J Chem Phys 1990, 93, 7528.
-
(1990)
J Chem Phys
, vol.93
, pp. 7528
-
-
Dang, L.X.1
Rice, J.E.2
Kollman, P.A.3
-
58
-
-
26644438864
-
-
Guardia, E.; Rey, R.; Padro, J. A. Chem Phys 1991, 155, 187.
-
(1991)
Chem Phys
, vol.155
, pp. 187
-
-
Guardia, E.1
Rey, R.2
Padro, J.A.3
-
62
-
-
0033954256
-
-
Berman, H. M.; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T. N.; Weissig, H.; Shindyalov, I. N.; Bourne, P. E. Nucleic Acids Res 2000, 28, 235.
-
(2000)
Nucleic Acids Res
, vol.28
, pp. 235
-
-
Berman, H.M.1
Westbrook, J.2
Feng, Z.3
Gilliland, G.4
Bhat, T.N.5
Weissig, H.6
Shindyalov, I.N.7
Bourne, P.E.8
-
63
-
-
0030917539
-
-
Leonidas, D. D.; Shapiro, R.; Irons, L. I.; Russo, N.; Acharya, K. R. Biochemistry 1997, 36, 5578.
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 5578
-
-
Leonidas, D.D.1
Shapiro, R.2
Irons, L.I.3
Russo, N.4
Acharya, K.R.5
-
64
-
-
0030040589
-
-
Parkin, S.; Rupp, B.; Hope, H. Acta Crystallogr D 1996, 52, 18.
-
(1996)
Acta Crystallogr D
, vol.52
, pp. 18
-
-
Parkin, S.1
Rupp, B.2
Hope, H.3
-
65
-
-
0028354429
-
-
Gallagher, T.; Alexander, P.; Bryan, P.; Gilliland, G. L. Biochemistry 1994, 33, 4721.
-
(1994)
Biochemistry
, vol.33
, pp. 4721
-
-
Gallagher, T.1
Alexander, P.2
Bryan, P.3
Gilliland, G.L.4
-
67
-
-
0343005873
-
-
Weber, W.; Hunenberger, P. H.; McCammon, J. A. J Phys Chem 2000, 104, 3668.
-
(2000)
J Phys Chem
, vol.104
, pp. 3668
-
-
Weber, W.1
Hunenberger, P.H.2
McCammon, J.A.3
-
68
-
-
0023122030
-
-
Shoemaker, K. R.; Kim, P. S.; York, E. J.; Stewart, J. M.; Baldwin, R. L. Nature 1987, 326, 563.
-
(1987)
Nature
, vol.326
, pp. 563
-
-
Shoemaker, K.R.1
Kim, P.S.2
York, E.J.3
Stewart, J.M.4
Baldwin, R.L.5
-
69
-
-
0024472052
-
-
Osterhout, J. J., Jr.; Baldwin, R. L.; York, E. J.; Stewart, J. M.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Biochemistry 1989, 28, 7059.
-
(1989)
Biochemistry
, vol.28
, pp. 7059
-
-
Osterhout Jr., J.J.1
Baldwin, R.L.2
York, E.J.3
Stewart, J.M.4
Dyson, H.J.5
Wright, P.E.6
-
70
-
-
0025196527
-
-
Fairman, R.; Shoemaker, K. R.; York, E. J.; Stewart, J. M.; Baldwin, R. L. Biophys Chem 1990, 37, 107.
-
(1990)
Biophys Chem
, vol.37
, pp. 107
-
-
Fairman, R.1
Shoemaker, K.R.2
York, E.J.3
Stewart, J.M.4
Baldwin, R.L.5
-
73
-
-
0032484151
-
-
Schaefer, M.; Bartels, C.; Karplus, M. J Mol Biol 1998, 284, 835.
-
(1998)
J Mol Biol
, vol.284
, pp. 835
-
-
Schaefer, M.1
Bartels, C.2
Karplus, M.3
-
74
-
-
0027732618
-
-
Hayward, S.; Kitao, A.; Hirata, F.; Go, N. J Mol Biol 1993, 234, 1207.
-
(1993)
J Mol Biol
, vol.234
, pp. 1207
-
-
Hayward, S.1
Kitao, A.2
Hirata, F.3
Go, N.4
-
75
-
-
0028986918
-
-
Smith, P. E.; van Schaik, R. C.; Szyperski, T.; Wuthrich, K.; van Gunsteren, W. F. J Mol Biol 1995, 246, 356.
-
(1995)
J Mol Biol
, vol.246
, pp. 356
-
-
Smith, P.E.1
Van Schaik, R.C.2
Szyperski, T.3
Wuthrich, K.4
Van Gunsteren, W.F.5
-
77
-
-
0344791680
-
-
Schneider, T. R.; Brnger, A. T.; Nilges, M. J Mol Biol 1999, 285, 727.
-
(1999)
J Mol Biol
, vol.285
, pp. 727
-
-
Schneider, T.R.1
Brnger, A.T.2
Nilges, M.3
-
78
-
-
0028301327
-
-
Blanco, F. J.; Jimenez, M. A.; Pineda, A.; Rico, M.; Santoro, J.; Nieto, J. L. Biochemistry 1994, 33, 6004.
-
(1994)
Biochemistry
, vol.33
, pp. 6004
-
-
Blanco, F.J.1
Jimenez, M.A.2
Pineda, A.3
Rico, M.4
Santoro, J.5
Nieto, J.L.6
-
81
-
-
0028787226
-
-
Frank, M. K.; Clore, G. M.; Gronenbron, A. M. Protein Sci 1995, 4, 2605.
-
(1995)
Protein Sci
, vol.4
, pp. 2605
-
-
Frank, M.K.1
Clore, G.M.2
Gronenbron, A.M.3
-
82
-
-
0034733005
-
-
Kobayashi, N.; Honda, S.; Yoshii, H.; Munekata, E. Biochemistry 2000, 39, 6564.
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 6564
-
-
Kobayashi, N.1
Honda, S.2
Yoshii, H.3
Munekata, E.4
-
84
-
-
0028805413
-
-
Pan, H.; Barbar, E.; Barany, G.; Woodward, C. Biochemistry 1995, 34, 13974.
-
(1995)
Biochemistry
, vol.34
, pp. 13974
-
-
Pan, H.1
Barbar, E.2
Barany, G.3
Woodward, C.4
-
85
-
-
0034636847
-
-
Carulla, N.; Woodward, C.; Barany, G. Biochemistry 2000, 39, 7927.
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 7927
-
-
Carulla, N.1
Woodward, C.2
Barany, G.3
-
87
-
-
0028090760
-
-
Barshi, J. J.; Grasberger, B.; Gronenborn, A.; Clore, G. Protein Sci 1994, 3, 15.
-
(1994)
Protein Sci
, vol.3
, pp. 15
-
-
Barshi, J.J.1
Grasberger, B.2
Gronenborn, A.3
Clore, G.4
|