Molecular dynamics simulation of the sodium octanoate micelle in aqueous solution: Comparison of force field parameters and molecular topology effects on the micellar structure

Brazilian Journal of Physics

Volumn 34, Issue 1, 2004, Pages 64-72

  De Moura, André Farias ^a   Gomide Freitas, Luiz Carlos ^a  

^a FEDERAL UNIVERSITY OF SÃO CARLOS   (Brazil)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 2442624548     PISSN: 01039733     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1590/s0103-97332004000100010     Document Type: Article

References (45)

1. B. Jönsson, O. Edholm, and O. Teleman, J. Chem. Phys. 85, 2259 (1986).
2. K. Watanabe, M. Ferrario, and M. L. Klein, J. Phys. Chem. 92, 819 (1988).
3. K. Watanabe and M. L. Klein, J. Phys. Chem. 93, 6897 (1989).
4. J. Shelley, K. Watanabe, and M. L. Klein, Electrochimica Acta 36, 1729 (1991).
5. J. Shelley, M. Sprik, and M. L. Klein, Langmuir 9, 916 (1993).
6. H. Kuhn and H. Rehage, Ber. Bunsenges. Phys. Chem. 101, 1485 (1997).
7. H. Kuhn and H. Rehage, Ber. Bunsenges. Phys. Chem. 101, 1493 (1997).
8. H. Khun, B. Breitzke, and H. Rehage, Colloid Polym. Sci. 276, 824 (1998).
9. L. Laaksonen and J. B. Rosenholm, Chem. Phys. Lett. 216, 429 (1993).
10. K. Watanabe and M. L. Klein, J. Phys. Chem. 95, 4158 (1991).
11. J. C. Shelley, M. Sprik, and M. L. Klein, Progr. Colloid Polym. Sci. 103, 146 (1997).
12. H. J. C. Berendsen, J. P. M. Postma, W. F. van Gusteren, and J. Hermans, in Intermolecular Forces, B. Pullman, Ed., Reidel, Dordrecht, 1981.
13. W. L. Jorgensen, J. Am. Chem. Soc. 103, 335 (1981).
14. J. Chandrasekhar, D. C. Spellmeyer, and W. L. Jorgensen, J. Am. Chem. Soc. 106, 903 (1984).
15. H. J. C. Berendsen, J. R. Grigera, and T. P. Straatsma, J. Phys. Chem. 91, 6269 (1987).
16. P. K. Weiner and P. A. Kollmann, J. Comp. Chem. 2, 287 (1981).
17. S. J. Weiner, P. A. Kollmann, D. A. Case, U. C. Singh, C. Ghio, G. Alagona, S. Profeta, and P. Weiner, J. Am. Chem. Soc. 106, 765 (1984).
18. S. J. Weiner, P. A. Kollmann, D. T. Nguyen, and D. A. Case, J. Comp. Chem. 7, 230 (1986).
19. B. R. Brooks, R. E. Bruccoleri, B. D. Olafson, D. J. States, S. Swaminathan, and M. Karplus, J. Comp. Chem. 4, 187 (1983).
20. W. L. Jorgensen, J. Chandrasekhar, J. Madura, R. W. Impey, and M. L. Klein, J. Chem. Phys. 79, 926 (1983).
21. S. Bogusz, R. M. Venable, and R. W. Pastor, J. Phys. Chem. B 104, 5462 (2000).
22. T. Wymore, X. F. Gao, and T. C. Wong, Journal of Molecular Structure 485-486, 195 (1999).
23. D. P. Tieleman, D. van der Spoel, and H. J. C. Berendsen, J. Phys. Chem. B 104, 6380 (2000).
24. S. J. Marrink, D. P. Tieleman, and A. E. Mark, J. Phys. Chem. B 104, 12165 (2000).
25. J. J. Wendoloski, S. J. Kimatian, C. E. Schutt, and F. R. Salemme, Science 243, 636 (1989).
26. S. Balasubramanian and B. Bagchi, J. Phys. Chem. B 106, 3668 (2002).
27. J. Shelley, K. Watanabe, and M. L. Klein, Int. J. Quantum Chem., Quantum Biol. Symp. 17, 103 (1990).
28. A. D. MacKerell Jr., J. Phys. Chem. 99, 1846 (1995).
29. M. Tarek, S. Bandyopadhyay, and M. L. Klein, Journal of Molecular Liquids 78, 1 (1998).
30. T. Bast and R. Henttschke, J. Phys. Chem. B 100, 12162 (1996).
31. J. Åqvist, J. Phys. Chem. 94, 8021 (1990).
32. H. J. C. Berendsen, D. van der Spoel, and R. van Drunen, Comp. Phys. Comm. 91, 43 (1995).
33. E. Lindahl, B. Hess, and D. van der Spoel, J. Mol. Mod. 7, 306 (2001).
34. H. J. C. Berendsen, J. P. M. Postma, W. F. van Gusteren, A. Dinola, and J. R. Haak, J. Phys. Chem. 81, 3684 (1984).
35. W. L. Jorgensen, D. S. Maxwell, and J. Tirado-Rives, J. Am. Chem. Soc. 118, 11225 (1996).
36. B. Hess, H. Bekker, H. J. C. Berendsen, and J. G. E. M. Fraaije, J. Comput. Chem. 18, 1463 (1997).
37. S. Miyamoto and P. A. Kollmann, J. Comput. Chem. 13, 952 (1992).
38. T. Darden, D. York, and L. Pedersen, J. Chem. Phys. 98, 10089 (1993).
39. U. Essmann, L. Perera, M. L. Berkowitz, T. Darden, H. Lee, and L. G. Pedersen, J. Chem. Phys. 103, 8577 (1995).
40. P. Ekwall, H. Eikrem, and L. Mandell, Acta. Chem. Scand. 17, 111 (1963).
41. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, V. G. Zakrzewski, J. A. Montgomery, Jr., R. E. Stratmann, J. C. Burant, S. Dapprich, J. M. Millam, A. D. Daniels, K. N. Kudin, M. C. Strain, O. Farkas, J. Tomasi, V. Barone, M. Cossi, R. Cammi, B. Mennucci, C. Pomelli, C. Adamo, S. Clifford, J. Ochterski, G. A. Petersson, P. Y. Ayala, Q. Cui, K. Morokuma, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. Cioslowski, J. V. Ortiz, A. G. Baboul, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. Gomperts, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, C. Gonzalez, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, J. L. Andres, C. Gonzalez, M. Head-Gordon, E. S. Replogle, and J. A. Pople, Gaussian 98, Revision A.7, Gaussian, Inc., Pittsburgh PA, 1998.
42. nd Ed., Academic Press Limited, London, 1995.
43. J. B. Hayter and T. Zemb, Chem. Phys. Lett. 93, 91 (1982).
44. T. Zemb, M. Drifford, M. Hayoun, and A. Jehanno, J. Phys. Chem. 87, 4524 (1983).
45. R. Friman and J. B. Rosenholm, Colloid & Polymer Sci. 260, 545 (1982).