Self-splicing and enzymatic activity of an intervening sequence RNA from Tetrahymena

Bioscience Reports

Volumn 24, Issue 4-5, 2004, Pages 362-385

  Cech, Thomas R ^a  

^a UNIVERSITY OF COLORADO   (United States)

Author keywords

Enzymatic activity; RNA; Self splicing

Indexed keywords

CHROMOSOME PROTEIN; GUANOSINE; MESSENGER RNA; PHENOL; RIBONUCLEASE P; RIBOZYME; SELF SPLICING RIBOSOMAL RNA; TRANSFER RNA; OLIGONUCLEOTIDE; RNA;

AUTORADIOGRAPHY; CATALYSIS; CONFERENCE PAPER; COVALENT BOND; DNA FLANKING REGION; DNA SEQUENCE; DNA TEMPLATE; ENZYME ACTIVITY; IN VITRO STUDY; MACRONUCLEUS; MOLECULAR MECHANICS; NONHUMAN; NUCLEOTIDE SEQUENCE; RNA SEQUENCE; RNA SPLICING; RNA STRUCTURE; RNA TRANSCRIPTION; TETRAHYMENA; TRANSCRIPTION INITIATION; ANIMAL; ARTICLE; AWARDS AND PRIZES; CHEMICAL MODEL; CHEMISTRY; CONFORMATION; EXON; GENETIC TRANSCRIPTION; GENETICS; INTRON; METABOLISM; MOLECULAR GENETICS; PHYSIOLOGY; PLASMID; SPLICEOSOME;

TETRAHYMENA;

ANIMALS; BASE SEQUENCE; CATALYSIS; EXONS; INTRONS; MODELS, CHEMICAL; MOLECULAR SEQUENCE DATA; NOBEL PRIZE; NUCLEIC ACID CONFORMATION; OLIGONUCLEOTIDES; PLASMIDS; RNA; RNA SPLICING; SPLICEOSOMES; TETRAHYMENA; TRANSCRIPTION, GENETIC;

EID: 24044532859     PISSN: 01448463     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1007/s10540-005-2738-3     Document Type: Conference Paper

References (101)

1. J. Abelson 1979 Ann. Rev. Biochem 48 1035 1069
2. S. Altman 1989 Adv. Enzym 62 1 36
3. E. T. Barfod T. R. Cech 1989 Mol. Cell. Biol 9 3657 3666
4. B. L. Bass T. R. Cech 1984 Nature 308 820 826
5. B. L. Bass T. R. Cech 1986 Biochemistry 25 4473 4477
6. M. D. Been T. R. Cech 1986 Cell 47 207 216
7. M. D. Been T. R. Cech 1988 Science 239 1412 1416
8. M. Belfort J. Pedersen-Lane D. West K. Ehrenman G. Maley F. Chu F. Maley 1985 Cell 41 375 382
9. M. L. Bender R. J. Bergeron M. Komiyama 1984 The Bioorganic Chemistry of Enzymatic Catalysis John Wiley New York
10. E. Brody J. Abelson 1985 Science 228 963 966
11. J. M. Burke 1988 Gene 73 273 294
12. J. Burke U. L. RajBhandary 1982 Cell 31 509 520
13. M. Carin B. F. Jensen K. D. Jentsch J. C. Leer O. F. Nielson O. Westergaard 1980 Nucleic Acids Res 8 5551 5566
14. T. R. Cech 1986 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83 4360 4363
15. T. R. Cech 1987 Science 236 1532 1539
16. T. R. Cech 1988a Gene 73 259 271
17. T. R. Cech 1988b J. Am. Med. Assoc 260 3030 3034
18. T. R. Cech 1988c Harvey Lect 82 123 144
19. Cech T. R. (1990) Ann. Rev. Biochem. 59 (in press.)
20. T. R. Cech B. L. Bass 1986 Ann. Rev. Biochem 55 599 629
21. T. R. Cech D. C. Rio 1979 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 76 5051 5055
22. T. R. Cech A. J. Zaug P. J. Grabowski 1981 Cell 27 487 496
23. T. R. Cech N. K. Tanner I. Tinoco B. R. Weir M. Zuker P. S. Perlman 1983 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80 3903 3907
24. F. H. C. Crick 1968 J. Mol. Biol 38 372
25. F. Crick 1979 Science 204 264 271
26. J. E. Darnell Jr. 1978 Science 202 1257 1260
27. R. W. Davies R. B. Waring J. A. Ray T. A. Brown C. Scazzocchio 1982 Nature 300 719 724
28. N. Din J. Engberg W. Kaffenberger W. Eckert 1979 Cell 18 525 532
29. J. S. Doudna J. W. Szostak 1989 Nature 339 519 522
30. Downs W. D., and Cech T. R. (1990) Biochemistry 29 (in press)
31. K. Ehrenman J. Pedersen-Lane D. West R. Herman F. Maley M. Belfort 1986 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83 5875 5879
32. M. Eigen 1971 Naturwissenschaften 58 465 523
33. J. Engberg J. R. Nilsson R. E. Pearlman V. Leick 1974 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 71 894 898
34. A. Fersht 1985 Enzyme Structure and Mechanism Freeman New York 2nd edn.
35. A. C. Forster R. H. Symons 1987 Cell 49 211 220
36. G. Fox C. R. Woese 1975 Nature 256 505 507
37. D. Frendeway W. Keller 1985 Cell 42 355 367
38. J. G. Gall 1974 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 71 3078 3081
39. G. Garriga A. M. Lambowitz 1984 Cell 39 631 641
40. J. M. Gott D. A. Shub M. Belfort 1986 Cell 47 81 87
41. P. J. Grabowski A. J. Zaug T. R. Cech 1981 Cell 23 467 476
42. Grabowski, P. J., Brehm, S. L., Zang, A. J., Kruger, K., and Cech, T. R. (1983) In: Gene Expression Vol. 8, (D. H. Hamer and M. J. Rosenberg, eds.), Alan R. Liss, New York, pp. 327-342
43. P. J. Grabowski S. R. Seiler P. A. Sharp 1985 Cell 42 345 353
44. C. A. Grosshans T. R. Cech 1989 Biochemistry 28 6888 6894
45. C. Guerrier-Takada S. Altman 1984 Science 223 285 286
46. C. Guerrier-Takada K. Gardiner T. Marsh N. Pace S. Altman 1983 Cell 35 849 857
47. C. Guerrier-Takada K. Haydock L. Allen S. Altman 1986 Biochemistry 25 1509 1515
48. P. C. Haake F. H. Westheimer 1961 J. Am. Chem. Soc 83 1102 1109
49. Haldane, J. B. S. (1930) Enzymes. Longmans, Green, Co., Great Britain. (1965, M.I.T. Press, Cambridge, Mass.)
50. A. Hampel R. Tritz 1989 Biochemistry 28 4929 4933
51. J. Haseloff W. L. Gerlach 1988 Nature 334 585 591
52. D. Herschlag T. R. Cech 1990 Nature 344 405 409
53. T. Inoue F. X. Sullivan T. R. Cech 1986 J. Mol. Biol 189 143 165
54. A. Jacquier M. Rosbash 1986 Science 234 1099 1104
55. K. A. Jarrell C. L. Peebles R. C. Dietrich S. L. Romiti P. S. Perlman 1988 J. Biol. Chem 263 3432 3439
56. W. P. Jencks 1969 Catalysis in Chemistry and Enzymology McGraw-Hill New York
57. P. S. Kay T. Inoue 1987 Nature 327 343 346
58. A. Klug J. Ladner J. D. Robertus 1974 J. Mol. Biol 89 511 516
59. G. Knapp R. C. Ogden C. L. Peebles J. Abelson 1979 Cell 18 37 45
60. K. Kruger P. J. Grabowski A. J. Zang J. Sands D. E. Gottschling T. R. Ceeh 1982 Cell 31 147 157
61. J. Kumamoto J. R. Cox Jr. F. H. Westheimer 1956 J. Am. Chem. Soc 78 4858 4860
62. M. R. Lerner J. A. Boyle S. M. Mount S. L. Wolin J. A. Steitz 1980 Nature 283 220 224
63. J. A. McSwiggen T. R. Cech 1989 Science 244 679 683
64. T. Maniatis R. Reed 1987 Nature 325 673 678
65. T. L. Marsh N. R. Pace 1985 Science 229 79 81
66. F. Michel B. Dujon 1983 EMBO J 2 33 38
67. F. Michel A. Jacquier B. Dujon 1982 Biochimie 64 867 881
68. F. Michel M. Hanna R. Green D. P. Bartel J. W. Szostak 1989 Nature 342 391 395
69. F. Murphy T. R. Cech 1989 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86 9218 9222
70. H. F. Noller C. R. Woese 1981 Science 212 403 410
71. L. E. Orgel 1986 J. Theor. Biol 123 127 149
72. N. R. Pace T. L. Marsh 1985 Origin Life 16 97 116
73. C. L. Peebles R. C. Ogden G. Knapp J. Abelson 1979 Cell 18 27 35
74. C. L. Peebles P. S. Perlman K. L. Mecklenburg M L. Petrillo J. H. Tabor K. A. Jarrel H.-L. Cheng 1986 Cell 44 213 223
75. J. V. Price J. Engberg T. R. Cech 1987 J. Mol. Biol 196 49 60
76. G. A. Prody J. T. Bakos J. M. Buzayan I. R. Schneider G. Bruening 1986 Science 231 1577 1580
77. J. Rajagopal J. A. Doudna J. W. Szostak 1989 Science 244 692 694
78. J. R. Sampson F. X. Sullivan L. S. Behlen A. B. DiRenzo O. C. Uhlenbeck 1987 Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol LII Cold Spring Harbor New York 267 277
79. P. A. Sharp 1985 Cell 42 397 400
80. N. Sugimoto M. Tomka R. Kierzek P. C. Bevilacqua D. H. Turner 1989 Nucleic Acids Res 17 355 371
81. F. X. Sullivan T. R. Cech 1985 Cell 42 639 648
82. H. F. Tabak G. Van der Horst A. M. J. E. Kamps A. C. Arnberg 1987 Cell 48 101 110
83. G. J. Tobin D. C. Young J. B. Flanegan 1989 Cell 59 511 519
84. O. C. Uhlenbeck 1987 Nature 328 596 600
85. G. Van der Horst H. F. Tabak 1985 Cell 40 759 766
86. R. Van der Veen A. C. Arnberg G. Van der Horst L. Bonen H. F. Tabak L. A. Grivell 1986 Cell 44 225 234
87. R. B. Waring C. Scazzocchio T. A. Brown R. W. Davies 1983 J. Mol. Biol 167 595 605
88. R. B. Waring P. Towner S. J. Minter R. W. Davies 1986 Nature 321 133 139
89. M. A. Wild J. G. Gall 1979 Cell 16 565 573
90. M. A. Wild R. Sommer 1980 Nature 283 693 694
91. Woese, C. (1967) In: The Genetic Code: The Molecular Basis for Genetic Expression. Harper and Row New York, p. 186
92. S. A. Woodson T. R. Cech 1989 Cell 57 335 345
93. M.-C. Yao A. R. Kimmel M. A. Gorovsky 1974 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 71 3082 3086
94. M. Yarus 1988 Science 240 1751 1758
95. A. J. Zaug T. R. Cech 1980 Cell 19 331 338
96. A. J. Zaug T. R. Cech 1982 Nucleic Acids Res 10 2823 2838
97. A. J. Zaug T. R. Cech 1986a Science 231 470 475
98. A. J. Zang T. R. Cech 1986b Biochemistry 25 4478 4482
99. A. J. Zaug P. J. Grabowski T. R. Cech 1983 Nature 301 578 583
100. A. J. Zaug J. R. Kent T. R. Cech 1984 Science 224 574 578
101. A. J. Zaug M. D. Been T. R. Cech 1986 Nature 324 429 433