Photolithographic Synthesis of Peptoids

Journal of the American Chemical Society

Volumn 126, Issue 13, 2004, Pages 4088-4089

  Li, Shuwei ^a   Bowerman, Dawn ^a   Marthandan, Nishanth ^a   Klyza, Stanley ^a   Luebke, Kevin J ^a   Garner, Harold R ^a   Kodadek, Thomas ^a  

^a UNIVERSITY OF TEXAS SOUTHWESTERN MEDICAL CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PEPTOID;

ARTICLE; BINDING AFFINITY; CHEMICAL GENETICS; LIGAND BINDING; OPTICS; PROTEIN BINDING; PROTEOMICS; SYNTHESIS;

EID: 1842502934     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja039565w     Document Type: Article

References (26)

1. Schreiber, S. L. Chem. Eng. News 2003, 81, 51-61.
2. Schreiber, S. L. Biorg. Med. Chem. 1998. 6, 1127-1152.
3. Kodadek, T. Chem. Biol. 2001, 8, 105-115.
4. Kodadek, T. Trends Biochem. Sci. 2002, 27. 295-300.
5. Kuruvilla, F. G.; Shamji, A. F.; Sternson, S. M.; Hergenrother, P. J.; Schreiber, S. L. Nature 2002. 416. 653-657.
6. Lato, K. S.; Salmon, S. E.; Hersh, E. M.; Hruby, V. J.; Kazmierski, W. M.; Knapp, R. J. Nature 1991. 354, 82-84.
7. MacBeath, G.; Koehler, A. N.; Schreiber. S. L. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 7967-7968.
8. Olivos, H. J.; Baccawat-Sikder, K.; Kodadek, T. ChemBiochem 2003, 4, 1242-1245.
9. Ohlmeyer, M. H.; Swanson, R. N.; Dillard, L. W.; Reader, J. C.; Asouline, G.; Kobayashi, R.; Wigler, M.; Still, W. C. Pro. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 10922-10926.
10. Blackwell, H. E.; Perez, L.; Stavenger, R. A.; Tallarico, J. A.; Cope-Eatough, E.; Foley, M. A.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 2001, 8. 1167-1182.
11. Clemons, P. A.; Koehler, A. N.; Wagner, B. K.; Sprinings, T. G.; Spring, D. R.; King, R. W.; Schreiber, S. L.; Foley, M. A. Chem. Biol. 2001, 8, 1183-1195.
12. Nicolaou, K. C.; Pfefferkorn, J. A.; Mitchell, H. J.; Roecker, A. J.; Barluenga, S.; Cao, G.-Q.; Affleck, R. L.; Lillig, J. E. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9954-9967.
13. Scharn, D.; Wenschuh, H.; Reineke, U.; Schneider-Mergener, J.; Germeroth, L. J. Comb. Chem. 2000, 2, 361-369.
14. Lipshutz, R. J.; Fodor, S. P.; Gingeras, T. R.; Lockhart, D. J. Nat. Genet. 1999, 21, 20-24.
15. Fodor, S. P.; Read, J. L.; Pirrung, M. C.; Stryer, L.; Lu, A. T.; Solas. D. Science 1991, 251, 767-773.
16. Alluri, P. G.; Reddy, M. M.; Baccawat-Sikder, K.; Olivos, H. J.; Kodadek, T. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13995-14004.
17. Figliozzi, G. M.; Goldsmith, R.; Ng, S. C.; Banville, S. C.; Zuckermann, R. N. Methods Enzymol. 1996, 267, 437-447.
18. Zuckermann, R. N.; Martin, E. J.; Spellmeyer, D. C.; Stauber, G. B.; Shoemaker, K. R.; Kerr, J. M.; Figliozzi, G. M.; Goff, D. A.; Siani, M. A.; Simon, R. J.; Banville, S. C.; Brown, E. G.; Wang, L.; Richter, L. S.; Moos, W. H. J. Med. Chem. 1994, 37, 2678-2685.
19. Nguyen, J. T.; Porter, M.; Amoui, M.; Miller, W. T.; Zuckermann, R. N.; Lim, W. A. Chem. Biol. 2000, 7, 463-473.
20. Zuckermann, R. N.; Kerr, J. M.; Kent, S. B. H.; Moos;, W. H. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10646-10647.
21. McGall, G. H.; Barone, A. D.; Diggelmann, M.; Fodor, S. P. A.; Gentalen, E.; Ngo, N. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 5081-5090.
22. See Supporting Information.
23. Traditional photolithographic syntheses of biopolymer libraries on glass slides, such as oligonucleotides and peptides, require a set of physical masks. Recently, this process has been revolutionized by the application of a digital light processor (DLP). UV light can be focused onto a synthesis chip in any desired pattern by the DLP, eliminating the requirement of expensive physical masks.
24. Singh-Gasson, S.; Green, R. D.; Yue, Y.; Nelson, C.; Blattner, F.; Sussman, M. R.; Cerrina, F. Nat. Biotechnol. 1999, 17, 974-978.
25. Luebke, K. J.; Balog, R. P.; Mittelman, D.; Garner, H. R. In Advanced Microfabricated Sensors: Kordal, R., Usmani, A.M., Law, W.T. Eds.; American Chemical Society: Washington, DC, 2002.
26. Balog, R. P.; de Souza, Y. E.; Tang, H. M.; DeMasellis, G. M.; Gao, B.; Avila, A.; Gaban, D. J.; Mittelman, D.; Minna, J. D.; Luebke, K. J.; Gamer, H. R. Anal. Biochem.2002, 309, 301-310.