Intrinsic folding of small peptide chains: Spectroscopic evidence for the formation of β-turns in the gas phase

Journal of the American Chemical Society

Volumn 127, Issue 2, 2005, Pages 707-712

  Chin, Wutharath ^a   Dognon, Jean Pierre ^a   Piuzzi, François ^a   Tardivel, Benjamin ^a   Dimicoli, Iliana ^a   Mons, Michel ^a  

^a Centre National de la Recherche Scientifique   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHARACTERIZATION; DESORPTION; INFRARED SPECTROSCOPY; LASERS;

GAS-PHASE PEPTIDE CHAINS; LASER DESORPTION; PEPTIDES;

PROTEINS;

GLYCINE; PHENYLALANINE;

ARTICLE; CALCULATION; CHEMICAL STRUCTURE; INFRARED SPECTROSCOPY; SPECTROSCOPY; THEORETICAL STUDY;

DIPEPTIDES; GASES; GLYCINE; PHENYLALANINE; PROTEIN FOLDING; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; SPECTROPHOTOMETRY, INFRARED; SPECTROPHOTOMETRY, ULTRAVIOLET;

EID: 12944309307     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja045251c     Document Type: Article

References (47)

1. Chou, P. Y.; Fasman, G. D. J. Mol. Biol. 1977, 115, 135.
2. Smith, J. A.; Pease, L. G. CRC Crit. Rev. Biochem. 1980, 8, 314 and references therein.
3. Toniolo, C. CRC Crit. Rev. Biochem. 1980, 9, 1.
4. Richardson, J. S. Adv. Protein Chem. 1981, 34, 167.
5. Hutchinson, E. G.; Thornton, J. M. Protein Sci. 1994, 3, 2209 and references therein.
6. Chou, K. Anal. Biochem. 2000, 286, 1 and references therein.
7. Rose, G. D.; Gierasch, L. M.; Smith, J. A. Adv. Protein Chem. 1985, 37, 1 and references therein.
8. Boussard, G.; Marraud, M. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 1825 and references therein.
9. Liang, G.-B.; Rito, C. J.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4440 and references therein.
10. Vass, E.; Hollosi, M.; Besson, F.; Buchet, R. Chem. Rev. 2003, 103, 1917 and references therein.
11. Zwier, T. S. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 8827 and references therein.
12. Robertson, E. G.; Simons, J. P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 1 and references therein.
13. Cable, J. R.; Tubergen, M. J.; Levy, D. H. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 9032.
14. Piuzzi, F.; Dimicoli, I.; Mons, M.; Tardivel, B.; Zhao, Q. Chem. Phys. Lett. 2000, 320, 282.
15. Cohen, R.; Brauer, B.; Nir, E.; Grace, L.; de Vries, M. S. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 6351.
16. Dian, B. C.; Longarte, A.; Mercier, S.; Evans, D. A.; Wales, D. J.; Zwier, T. S. J. Chem. Phys. 2002, 117, 10688.
17. Dian, B. C.; Longarte, A.; Zwier, T. S. Science 2002, 296, 2369.
18. Mons, M.; Dimicoli, I.; Piuzzi, F.; Tardivel, B.; Elhanine, M. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 5088.
19. Dong, F.; Miller, R. E. Science 2002, 298, 1227.
20. Unterberg, C.; Gerlach, A.; Schrader, T.; Gerhards, M. J. Chem. Phys. 2003, 118, 8296 and references therein.
21. Chin, W.; Mons, M.; Dognon, J.-P.; Piuzzi, F.; Tardivel, B.; Dimicoli, I. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2700.
22. Gerhards, M.; Unterberg, C.; Gerlach, A.; Jansen, A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2682.
23. Dian, B. C.; Clarkson, J. R.; Zwier, T. S. Science 2004, 303, 1169.
24. Jockusch, R. A.; Kroemer, R. T.; Talbot, F. O.; Snoek, L. C.; Çarçabal, P.; Simons, J. P.; Havenith, M.; Bakker, J. M.; Compagnon, I.; Meijer, G.; von Helden, G. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5709 and references therein.
25. Perczel, A.; Csizmadia, I. G. Int. Rev. Phys. Chem. 1995, 14, 127.
26. Perczel, A.; Farkas, O.; Csaszar, A. G.; Csizmadia, I. G. Can. J. Chem. 1997, 75, 1120.
27. Endredi, G.; Perczel, A.; Farkas, O.; McAllister, M. A.; Csonka, G. I.; Ladik, J.; Csizmadia, I. G. J. Mol. Struct.: THEOCHEM 1997, 391, 15.
28. Möhle, K.; Gussmann, M.; Hofmann, H. J. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1415 and references therein.
29. Möhle, K.; Gussmann, M.; Rost, A.; Cimiraglia, R.; Hofmann, H. J. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 8571 and references therein.
30. Möhle, K.; Hofmann, H. J. J. Mol. Model. 1998, 4, 53 and references therein.
31. Csaszar, A. G.; Perczel, A. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1999, 71, 243.
32. Elstner, M.; Jalkanen, K. J.; Knapp-Mohammady, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S. Chem. Phys. 2001, 263, 203 and references therein.
33. Hudaky, P.; Jakli, I.; Csaszar, A. G.; Perczel, A. J. Comput. Chem. 2001, 22, 732.
34. Perczel, A.; Jakli, I.; McAllister, M. A.; Csizmadia, I. G. Chem. - Eur. J. 2003, 9, 2551 and references therein.
35. Perczel, A.; Jakli, I.; Csizmadia, I. G. Chem. - Eur. J. 2003, 9, 5332 and references therein.
36. Pribble, R. N.; Zwier, T. S. Science 1994, 265, 75 and references therein.
37. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179.
38. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replosle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98, Revision A7; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
39. Robertson, E. G.; Hockridge, M. R.; Jelfs, P. D.; Simons, J. P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 786.
40. Nakanaga, T.; Ito, F. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 5440.
41. Chass, G. A.; Lovas, S.; Murphy, R. F.; Csizmadia, I. G. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 481.
42. Chin, W.; Mons, M.; Dognon, J.-P.; Mirasol, R.; Chass, G. A.; Dimicoli, I.; Piuzzi, F.; Butz, P.; Tardivel, B.; Compagnon, I.; von Helden, G.; Meijer, G. Submitted for publication.
43. Lavrich, R. J.; Plusquellic, D. F.; Suenram, R. D.; Fraser, G. T.; Walker, A. R. H.; Tubergen, M. J. J. Chem. Phys. 2003, 118, 1253.
44. Pal, D.; Chakrabarti, P. J. Mol. Biol. 1999, 294, 271.
45. Milner-White, E. J. J. Mol. Biol. 1990, 216, 385.
46. Chin, W.; Dognon, J.-P.; Canuel, C.; Piuzzi, F.; Dimicoli, I.; Mons, M.; Compagnon, I.; von Helden, G.; Meijer, G. J. Chem. Phys., in press.
47. Guruprasad, K.; Rajkumar, S. J. Biosci. 2000, 25, 143.