Vibrational spectrum of bathorhodopsin in the room-temperature rhodopsin photoreaction

Journal of the American Chemical Society

Volumn 119, Issue 51, 1997, Pages 12610-12618

  Jager F ^a   Ujj, L ^a   Atkinson, G H ^a  

^a University of Arizona   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

RHODOPSIN;

ANIMAL TISSUE; ARTICLE; CATTLE; NONHUMAN; PHOTOREACTIVITY; RETINA; SIGNAL NOISE RATIO; TEMPERATURE SENSITIVITY; VIBRATION;

EID: 0344891209     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja9715298     Document Type: Article

References (62)

1. Wald, G. Science 1968, 162, 230.
2. Schoenlein, R. W.; Peteanu, L. A.; Mathies, R. A.; Shank, C. V. Science 1991, 254, 412-415.
3. Wang, Q.; Schoenlein, R. W.; Peteanu, L. A.; Mathies, R. A.; Shank, C. V. Science (Washington, DC) 1994, 266, 422-424.
4. Schick, G. A.; Cooper, T. M.; Holloway, R. A.; Murray, L. P.; Birge, R. R. Biochemistry 1987, 26, 2556.
5. Cooper, A. Nature 1979, 282, 531-533.
6. Koenig, B.; Arendt, A.; McDowell, J. H.; Kahlert, M.; Hargrave, P. A.; Hofmann, K. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 6878-6882.
7. Ovchinnikov, Y. A. FEBS Lett. 1982, 148, 179-191.
8. Kliger, D. S.; Lewis, J. W. Isr. J. Chem. 1995, 35, 289-307.
9. Lewis, J. W.; Kliger, D. S. J. Bioenerg. Biomembr. 1992, 24, 201-210.
10. Kandori, H.; Shichida, Y.; Yoshizawa, T. Biophys. J. 1989, 56, 453-457.
11. Peteanu, L. A.; Schönlein, R. W.; Wang, Q.; Mathies, R. A.; Shank, C. V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 11762-11766.
12. Kochendoerfer, G. G.; Mathies, R. A. Isr. J. Chem. 1995, 35, 211-226.
13. Thorgeirsson, T. E.; Lewis, J. W.; Wallace-Williams, S. E.; Kliger, D. S. Biochemistry 1993, 32, 13861-13872.
14. Lewis, J. W.; Pinkas, I.; Sheves, M.; Ottolenghi, M.; Kliger, D. S. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 918-923.
15. Mathies, R. A.; Smith, S. O.; Palings, I. Determination of retinal chromophore structure in rhodopsins. In Biological Applications of Raman Spectroscopy; Spiro, T. G., Ed.; John Wiley & Sons: New York, 1987; Chapt. 2, pp 59-108.
16. Callender, R. H.; Honig, B. Annu. Rev. Biophys. Bioeng. 1977, 6, 33-55.
17. Popp, A.; Ujj, L.; Atkinson, G. H. Biophys. Chem. 1995, 56, 129-135.
18. Popp, A.; Ujj, L.; Atkinson, G. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 372-376.
19. Siebert, F. Isr. J. Chem. 1995, 35, 309-323.
20. Degrip, W. J.; Gray, D.; Gillespie, J.; Bovee, P. H. M.; van den Berg, E. M. M.; Lugtenburg, J.; Rothschild, K. J. Photochem. Photobiol. 1988, 48, 497-504.
21. Schertler, G. F. X.; Villa, C.; Henderson, R. Nature (London) 1993, 362, 770-772.
22. Han, M.; DeDecker, B. S.; Smith, S. O. Biophys. J. 1993, 65, 899-906.
23. Han, M.; Smith, S. O. Biochemistry 1995, 34, 1425-1432.
24. Fahmy, K.; Jäger, F.; Beck, M.; Zvyaga, T. A.; Sakmar, T. P.; Siebert, F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 10206-10210.
25. Jäger, F.; Fahmy, K.; Sakmar, T. P.; Siebert, F. Biochemistry 1994, 33, 10878-10882.
26. Curry, B.; Broek, A.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. A. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 5274-5286.
27. Eyring, G.; Curry, B.; Broek, A.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. Biochemistry 1982, 21, 384-393.
28. Palings, I.; van den Berg, E. M. M.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. A. Biochemistry 1989, 28, 1498-1507.
29. Palings, I.; Pardoen, J. A.; van den Berg, E. M. M.; Winkel, C.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. A. Biochemistry 1987, 26, 2544-2556.
30. Mizukami, T.; Kandori, H.; Shichida, Y.; Chen, A.-H.; Derguini, F.; Caldwell, C. G.; Bigge, C. F.; Nakanishi, K.; Yoshizawa, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 4072-4076.
31. Nakanishi, K.; Chen, A.-H.; Derguini, F.; Franklin, P.; Hu, S.; Wang, J. Pure Appl. Chem. 1994, 66, 981-988.
32. Kochendoerfer, G. G.; Mathies, R. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 14526-14532.
33. Doukas, A. G.; Junnarkar, M. R.; Alfano, R. R.; Callender, R. H. Biophys. J. 1985, 47, 795-798.
34. Kandori, H.; Katsuta, Y.; Ito, M.; Sasabe, H. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2669-2670.
35. Ujj, L.; Atkinson, G. H. Isr. J. Chem. 1993, 33, 207-214.
36. Ujj, L.; Jäger, F.; Popp, A.; Atkinson, G. H. Chem. Phys. 1996, 212, 421-436.
37. Jäger, F.; Ujj, L.; Atkinson, G. H.; Sheves, M.; Livnah, N.; Ottolenghi, M. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12066-12075.
38. Ujj, L.; Popp, A.; Atkinson, G. H. Chem. Phys. 1994, 188,221-234.
39. Ujj, L.; Volodin, B. L.; Popp, A.; Delaney, J. K.; Atkinson, G. H. Chem. Phys. 1994, 182, 291-311.
40. Weidlich, O.; Ujj, L.; Jäger, F.; Atkinson, G. H. Biophys. J. 1997, 72, 2329-2341.
41. Ujj, L.; Jäger, F.; Atkinson, G. H. Biophys. J. 1997. In press.
42. Ujj, L.; Jäger, F.; Atkinson, G. H., manuscript in preparation.
43. Papermaster, D. S. Methods Enzymol. 1982, 81, 49-52.
44. Deng, H.; Callender, R. H. Biochemistry 1987, 26, 7418-7426.
45. Mathies, R. A.; Oseroff, A. R.; Stryer, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1976, 73, 1-5.
46. Callender, R. H.; Doukas, A. G.; Crouch, R. K.; Nakanishi, K. Biochemistry 1976, 15, 1621-1629.
47. Birge, R. R.; Einterz, C. M.; Knapp, H. M.; Murray, L. P. Biophys. J. 1988, 53, 367-385.
48. Marcus, M. A.; Lewis, A. Photochem. Photobiol 1979, 29,699-702.
49. Popp, A.; Ujj, L.; Atkinson, G. H. J. Phys. Chem. 1995, 99, 10043-10045.
50. Yan, M.; Manor, D.; Weng, G.; Chao, H.; Rothberg, L.; Jedju, T. M.; Alfano, R. R.; Callender, R. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 9809-9812.
51. Curry, B.; Palings, I.; Broek, A.; Pardoen, J. A.; Mulder, P. P. J.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. J. Phys. Chem. 1984, 88, 688-702.
52. Baasov, T.; Friedman, N.; Sheves, M. Biochemistry 1987, 26, 3210-217.
53. Livnah, N.; Sheves, M. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 351-353.
54. Doukas, A. G.; Callender, R. H.; Ebrey, T. G. Biochemistry 1978, 17, 2430-2435.
55. Warshel, A.; Barboy, N. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 1469-1476.
56. Jäger, F.; Jäger, S.; Kräutle, O.; Friedman, N.; Sheves, M.; Hofmann, K. P.; Siebert, F. Biochemistry 1994, 33, 7389-7397.
57. Nakanishi, K.; Crouch, R. K. Isr. J. Chem. 1995, 35, 253-272.
58. Kochendoerfer, G. G.; Verdegem, P. J. E.; van der Hoef, I.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. A. Biochemistry 1996, 35, 16230-16240.
59. Smith, S. O.; Courtin, J. M.; Degroot, H. J. M.; Gebhard, R.; Lugtenburg, J. Biochemistry 1991, 30, 7409-7415.
60. Diller, R.; Maiti, S.; Walker. G. C.; Cowen, B. R.; Pippenger, R.; Bogomolni, R. A.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 1995, 241, 109-115.
61. Birge, R. R. Biochim. Biophys. Acta. 1990, 1016, 293-327.
62. Randall, C. E.; Lewis, J. W.; Hug, S. J.; Björling, S. C.; Eisner-Shanas, I.; Friedman, N.; Ottolenghi, M.; Sheves, M.; Kliger, D. S. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 3473-3485.