Cross examination of the conformational spaces of a set of peptide chains: Study of oligopeptidase action

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 60, Issue 8, 1996, Pages 1815-1827

  Jacchieri, S G ^a   Gomes, M ^b   Camargo, A C M ^b   Juliano, L ^c  

^a INSTITUTO ADOLFO LUTZ   (Brazil)

^b INSTITUTO BUTANTAN   (Brazil)

^c Unversidade Federal de Sao Paulo   (Brazil)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0344350439     PISSN: 00207608     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(SICI)1097-461X(1996)60:8<1815::AID-QUA9>3.0.CO;2-0     Document Type: Article

References (33)

1. A. C. M. Camargo, M. D. Gomes, A. P. Reichl, E. S. Ferro, S. G. Jacchieri, and L. Juliano, submitted.
2. A. C. M. Camargo, M. D. Gomes, O. Toffoletto, M. J. R. Ribeiro, E. S. Ferro, B. L. Fernandes, K. Suzuki, Y. Sasaki, and L. Juliano, Neuropeptides 26, 281 (1994).
3. C. Branden and J. Tooze, Introduction to Protein Structure (Garland, New York, 1991).
4. M. G. Rossman and P. Argos, J. Mol. Biol. 105, 75 (1976).
5. M. G. Rossman and P. Argos, J. Mol. Biol. 109, 99 (1977).
6. G. E. Schulz, J. Mol. Evol. 9, 339 (1977).
7. O. B. Ptitsyn and A. V. Filkelstein, Quater. Rev. Biophys. 13, 339 (1980).
8. J. S. Richardson, Adv. Prot. Chem. 34, 167 (1981).
9. M.-H. Hao and H. A. Scheraga, J. Phys. Chem. 98, 9882 (1994).
10. J. E. Straub and Ji-Kyung Choi, J. Phys. Chem. 98, 10978 (1994).
11. A. Sali, E. Shakhnovich, and M. Karplus, J. Mol. Biol. 235, 1614 (1994).
12. S. G. Jacchieri, Int. J. Quant. Chem: Quant. Biol. Symp. 19, 255 (1992).
13. S. G. Jacchieri, submitted.
14. S. G. Jacchieri and A. S. Ito, Int. J. Quantum Chem. 53, 335 (1995).
15. R. L. Henrickson and S. C. Meredith, Ann. Biochem. 436, 65 (1984).
16. M. J. Glucksman and J. L. Roberts, in Methods in Neurosciences-Peptidases Neuropeptide Processing, Ian Smith, Ed. (Academic Press, 1995), p. 281.
17. S. G. Jacchieri and R. L. Jernigan, Biopolymers 32, 1327 (1992).
18. J. W. Ponder and F. M. Richards, J. Mol. Biol. 193, 775 (1987).
19. K. Gibson and H. A. Scheraga, J. Comput. Chem. 8, 826 (1987).
20. J. E. Mayer and M. G. Mayer, Statistical Mechanics (Wiley, New York, 1940).
21. D. J. Covell and R. L. Jernigan, Biochemistry 29, 3287 (1990).
22. R. J. Weinkam and E. J. Jorgensen, J. Am. Chem. Soc. 93, 7038 (1971).
23. R. R. Smeby, K. Arakawa, F. M. Bumpus, and M. M. Marsh, Biochim. Biophys. Acta 28, 550 (1962).
24. L. C. Craig, E. J. Harfenist, and A. C. Paladini, Biochemistry 3, 764 (1964).
25. Young Ah Shin and Sung-eun Yoo, Biopolymers 38, 183 (1996).
26. M-P. Joseph, B. Maigret, and H. A. Sheraga, Int. J. Pept. Prot. Res. 46, 514 (1995).
27. K. L. Spear, M. S. Brown, E. J. McMahon, G. M. Olins, M. A. Palomo, and D. R. Patton, J. Med. Chem. 33, 1935 (1990).
28. G. V. Nikiforovich, J. L.-F. Kao, K. Plucinska, W. J. Zhang, and G. R. Marshal, Biochemistry 33, 359 (1994).
29. M. Doi, T. Ishida, M. Inoue, T. Fujiware, K. Tomita, T. Kimura, and S. Sakakibara, FEBS Lett. 170, 229 (1984).
30. M. Doi, M. Tanaka, T. Ishida, M. Inoue, T. Fujiware, K. Tomita, T. Kimura, S. Sakakibara, and G. M. Sheldrick, J. Biochem. 101, 485 (1987).
31. J. F. Griffin, D. A. Langs, G. D. Smith, T. L. Blundell, I. J. Tickle, and S. Bedarkar, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83, 3272 (1986).
32. G. D. Smith and J. F. Griffin, Science 199, 1214 (1978).
33. J. R. Deschamps, C. George, J. L. Flippen-Anderson, Biopolymers 40, 121 (1996).