Resonance Raman characterization of proteorhodopsin's chromophore environment

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 107, Issue 31, 2003, Pages 7877-7883

  Krebs, Richard A ^a   Dunmire, David ^a   Partha, Ranga ^a   Braiman, Mark S ^a  

^a SYRACUSE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ISOMERS; MOLECULAR VIBRATIONS; PROTONS; RESONANCE;

RAMAN CELL;

CHROMOPHORES;

EID: 0042233486     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp034574c     Document Type: Article

References (38)

1. Béjà, O.; Aravind, L.; Koonin, E. V.; Suzuki, M. T.; Hadd, A.; Nguyen, L. P.; Jovanovich, S. B.; Gates, C. M.; Feldman, R. A.; Spudich, J. L.; Spudich, E. N.; DeLong, E. F. Science 2000, 289, 1902-1906.
2. Béjà, O.; Spudich, E. N.; Spudich, J. L.; Leclerc, M.; DeLong, E. F. Nature 2001, 411, 786-789.
3. Krebs, R. A.; Alexiev, U.; Partha, R.; DeVita, A. M.; Braiman, M. S. BMC Physiol. 2002, 2, 5.
4. Rothschild, K. J.; Argade, P. V.; Earnest, T. N.; Huang, K.-S.; London, E.; Liao, M.-J.; Bayley, H.; Khorana, H. G.; Herzfeld, J. J. Biol. Chem. 1982, 257, 8592-8595.
5. Braiman, M. S.; Mogi, T.; Marti, T.; Stern, L. J.; Khorana, H. G.; Rothschild, K. J. Biochemistry 1988, 27, 8516-8520.
6. Stern, L. J.; Khorana, H. G. J. Biol. Chem. 1989, 264, 14202-14208.
7. de Groot, H. J. M.; Harbison, G. S.; Herzfeld, J.; Griffin, R. G. Biochemistry 1989, 28, 3346-3353.
8. Dioumaev, A. K.; Brown, L. S.; Shih, J.; Spudich, E. N.; Spudich, J. L.; Lanyi, J. K. Biochemistry 2002, 41, 5348-5358.
9. Freidrich, T.; Geibel, S.; Kalmbach, R.; Chizhov, I.; Ataka, K.; Heberle, J.; Engelhard, M.; Bamberg, E. J. Mol. Biol. 2002, 321, 821-838.
10. Ames, J. B.; Raap, J.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. A. Biochemistry 1992, 31, 12546-12554.
11. Hildebrandt, P.; Stockburger, M. Biochemistry 1984, 23, 5539-5548.
12. Braiman, M. S.; Mathies, R. Methods Enzymol. 1982, 88, 648-659.
13. Stockburger, M.; Klusman, W.; Gattermann, H.; Massig, G.; Peters, R. Biochemistry 1979, 18, 4886-4900.
14. Terner, J.; Hsieh, C.-L.; Burns, A. R.; El-Sayed, M. A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1979, 76, 3046-3050.
15. Braiman, M. S.; Mathies, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1982, 79, 403-407.
16. Braiman, M. S.; Mathies, R. Biochemistry 1980, 19, 5421-5428.
17. Smith, S. O.; Pardoen, J. A.; Mulder, P. P. J.; Curry, B.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. Biochemistry 1983, 22, 6141-6148.
18. Smith, S. O.; Mathies, R. A. Biophys. J. 1985, 47, 251-254.
19. Doukas, A. G.; Aton, B.; Callender, R. H.; Ebrey, T. G. Biochemistry 1978, 17, 2430-2435.
20. Smith, S. O.; Braiman, M. S.; Myers, A. B.; Pardoen, J. A.; Courtin, J. M. L.; Winkel, C.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. A. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 3108-3125.
21. Smith, S. O.; Pardoen, J. A.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. A. J. Phys. Chem. 1987, 91, 804-819.
22. Metz, G.; Siebert, F.; Engelhard, M. FEBS Lett. 1992, 303, 237-241.
23. Balashov, S. P.; Govindjee, R.; Kono, M.; Imasheva, E.; Lukashev, E.; Ebrey, T. G.; Crouch, R. K.; Menick, D. R.; Feng, Y. Biochemistry 1993, 32, 10331-10343.
24. Partha, R.; Krebs, R. A.; Caterino, T. L.; Braiman, M. S. Submitted.
25. Khorana, H. G. J. Biol. Chem. 1988, 263, 7439-7442.
26. Henderson, R.; Baldwin, J. M.; Ceska, T. A.; Zemlin, F.; Beckmann, E.; Downing, K. H. J. Mol. Biol. 1990, 213, 899-929.
27. Blatz, P. E.; Mohler, J. H. Biochemistry 1975, 14, 2304-2309.
28. Harbison, G. S.; Herzfeld, J.; Griffin, R. G. Biochemistry 1983, 22, 1-5.
29. Lin, S. W.; Fodor, S. P. A.; Miercke, L. J. W.; Shand, R. F.; Betlach, M. C.; Stroud, R. M.; Mathies, R. A. Photochem. Pkotobiol. 1991, 53, 341-346.
30. Spudich, J. L.; McCain, D. A.; Nakanishi, K.; Okabe, M.; Shimizu, N.; Rodman, H.; Honig, B.; Bogomolni, R. A. Biophys. J. 1986, 49, 479-483.
31. Baasov, T.; Sheves, M. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 7524-7533.
32. London, E.; Khorana, H. G. J. Biol. Chem. 1982, 257, 7003-7011.
33. Rodman-Gilson, H. S.; Honig, B. H.; Croteau, A.; Zarrilli, G.; Nakanishi, K. Biophys. J. 1988, 53, 261-269.
34. Ren, L.; Martin, C. H.; Wise, K. J.; Gillespie, N. B.; Luecke, H.; Lanyi, J. K.; Spudich, J. L.; Birge, R. R. Biochemistry 2001, 40, 13906-13914.
35. Gellini, C.; Lüttenberg, B.; Sydor, J.; Engelhard, M.; Hildebrandt, P. FEBS Lett. 2000, 472, 263-266.
36. Pande, C.; Lanyi, J. K.; Callender, R. H. Biophys. J. 1989, 55, 425-431.
37. Lanyi, J. K.; Duschl, A.; Varo, G.; Zimányi, L. FEBS Lett. 1990. 265, 1-6.
38. Schobert, B.; Lanyi, J. K. Biochemistry 1986, 25, 4163-4167.