SCOPUS 정보 검색 플랫폼

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 107, Issue 6, 2003, Pages 1395-1402

The effects of internal water molecules on the structure and dynamics of chymotrypsin inhibitor 2

(2) Lei, Hongxing a Smith, Paul E a

a KANSAS STATE UNIVERSITY (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHYMOTRYPSIN INHIBITOR; INTERNAL WATER MOLECULES; STRUCTURE LINKING;

COMPOSITION EFFECTS; COMPUTER SIMULATION; CONFORMATIONS; CRYSTAL STRUCTURE; HYDRATION; HYDROPHILICITY; HYDROPHOBICITY; MOLECULAR DYNAMICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; WATER;

PROTEINS;

EID: 0037434740 PISSN: 10895647 EISSN: None Source Type: Journal
DOI: 10.1021/jp0223105 Document Type: Article

Times cited : (3)

References (69)

1
- 0021273620
- Neurath, H. Science 1984, 224, 350-357.
- (1984) Science , vol.224 , pp. 350-357
- Neurath, H.¹

2
- 0018873523
- Laskowski, M. J.; Kato, I. Annu. Rev. Biochem. 1980, 49, 593-626.
- (1980) Annu. Rev. Biochem. , vol.49 , pp. 593-626
- Laskowski, M.J.¹ Kato, I.²

3
- 0023652256
- McPhalen, C. A.; James, M. N. Biochemistry 1987, 26, 261-269.
- (1987) Biochemistry , vol.26 , pp. 261-269
- McPhalen, C.A.¹ James, M.N.²

4
- 0031552590
- Itzhaki, L. S.; Neira, J. L.; Fersht, A. R. J. Mol. Biol. 1997, 270, 89-98.
- (1997) J. Mol. Biol. , vol.270 , pp. 89-98
- Itzhaki, L.S.¹ Neira, J.L.² Fersht, A.R.³

5
- 0028939504
- Shaw, G. L.; Davis, B.; Keeler, J.; Fersht, A. R. Biochemistry 1995, 34, 2225-2233.
- (1995) Biochemistry , vol.34 , pp. 2225-2233
- Shaw, G.L.¹ Davis, B.² Keeler, J.³ Fersht, A.R.⁴

6
- 0028566709
- Nanzer, A. P.; Poulsen, F. M.; van Gunsteren, W. F.; Torda, A. E. Biochemistry 1994, 33, 14503-14511.
- (1994) Biochemistry , vol.33 , pp. 14503-14511
- Nanzer, A.P.¹ Poulsen, F.M.² Van Gunsteren, W.F.³ Torda, A.E.⁴

7
- 0033386716
- Melacini, G.; Boelens, R.; Kaptein, R. J. Biomol. NMR 1999, 15, 189-201.
- (1999) J. Biomol. NMR , vol.15 , pp. 189-201
- Melacini, G.¹ Boelens, R.² Kaptein, R.³

8
- 0031552596
- Neira, J. L.; Itzhaki, L. S.; Otzen, D. E.; Davi, B.; Fersht, A. R. J. Mol. Biol. 1997, 270, 99-110.
- (1997) J. Mol. Biol. , vol.270 , pp. 99-110
- Neira, J.L.¹ Itzhaki, L.S.² Otzen, D.E.³ Davi, B.⁴ Fersht, A.R.⁵

9
- 0026346980
- Ludvigsen, S.; Shen, H. Y.; Kjaer, M.; Madsen, J. C.; Poulsen, F. M. J. Mol. Biol. 1991, 222, 621-635.
- (1991) J. Mol. Biol. , vol.222 , pp. 621-635
- Ludvigsen, S.¹ Shen, H.Y.² Kjaer, M.³ Madsen, J.C.⁴ Poulsen, F.M.⁵

10
- 0027959459
- Jackson, S. E.; Fersht, A. R. Biochemistry 1994, 33, 13880-13887.
- (1994) Biochemistry , vol.33 , pp. 13880-13887
- Jackson, S.E.¹ Fersht, A.R.²

11
- 0028865428
- Otzen, D. E.; Rheinnecker, M.; Fersht, A. R. Biochemistry 1995, 34, 13051-13058.
- (1995) Biochemistry , vol.34 , pp. 13051-13058
- Otzen, D.E.¹ Rheinnecker, M.² Fersht, A.R.³

12
- 0033009569
- Otzen, D. E.; Fersht, A. R. Protein Eng. 1999, 12, 41-45.
- (1999) Protein Eng. , vol.12 , pp. 41-45
- Otzen, D.E.¹ Fersht, A.R.²

13
- 0032736844
- Roesler, K. R.; Rao, A. G. Protein Eng. 1999, 12, 967-973.
- (1999) Protein Eng. , vol.12 , pp. 967-973
- Roesler, K.R.¹ Rao, A.G.²

14
- 0033810120
- Roesler, K. R.; Rao, A. G. Protein Sci. 2000, 9, 1642-1650.
- (2000) Protein Sci. , vol.9 , pp. 1642-1650
- Roesler, K.R.¹ Rao, A.G.²

15
- 0032878322
- Silow, M.; Tan, Y. J.; Fersht, A. R.; Oliveberg, M. Biochemistry 1999, 38, 13006-13012.
- (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 13006-13012
- Silow, M.¹ Tan, Y.J.² Fersht, A.R.³ Oliveberg, M.⁴

16
- 0032474460
- Otzen, D. E.; Fersht, A. R. Biochemistry 1998, 37, 8139-8146.
- (1998) Biochemistry , vol.37 , pp. 8139-8146
- Otzen, D.E.¹ Fersht, A.R.²

17
- 0029053552
- de Prat, G.; Ruiz-Sanz, J.; Neira, J. L.; Itzhaki, L. S.; Fersht, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 3683-3686.
- (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.92 , pp. 3683-3686
- De Prat, G.¹ Ruiz-Sanz, J.² Neira, J.L.³ Itzhaki, L.S.⁴ Fersht, A.R.⁵

18
- 0028143603
- Li, A.; Daggett, V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 10430-10434.
- (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.91 , pp. 10430-10434
- Li, A.¹ Daggett, V.²

19
- 0029586380
- Li, A.; Daggett, V. Protein Eng. 1995, 8, 1117-1128.
- (1995) Protein Eng. , vol.8 , pp. 1117-1128
- Li, A.¹ Daggett, V.²

20
- 0029963345
- Li, A.; Daggett, V. J. Mol. Biol. 1996, 257, 412-429.
- (1996) J. Mol. Biol. , vol.257 , pp. 412-429
- Li, A.¹ Daggett, V.²

21
- 0031465967
- Lazaridis, T.; Karplus, M. Science 1997, 278, 1928-1931.
- (1997) Science , vol.278 , pp. 1928-1931
- Lazaridis, T.¹ Karplus, M.²

22
- 0034657550
- Ferrara, P.; Apostolakis, J.; Catflisch, A. Proteins 2000, 39, 252-260.
- (2000) Proteins , vol.39 , pp. 252-260
- Ferrara, P.¹ Apostolakis, J.² Catflisch, A.³

23
- 0345281586
- Kurt, N.; Haliloglu, T. Proteins 1999, 37, 454-464.
- (1999) Proteins , vol.37 , pp. 454-464
- Kurt, N.¹ Haliloglu, T.²

24
- 0032555115
- Ladurner, A. G.; Itzhaki, L. S.; Daggett, V.; Fersht, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 8473-8478.
- (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.95 , pp. 8473-8478
- Ladurner, A.G.¹ Itzhaki, L.S.² Daggett, V.³ Fersht, A.R.⁴

25
- 0029981188
- Daggett, V.; Li, A.; Itzhaki, L. S.; Otzen, D. E.; Fersht, A. R. J. Mol. Biol. 1996, 257, 430-440.
- (1996) J. Mol. Biol. , vol.257 , pp. 430-440
- Daggett, V.¹ Li, A.² Itzhaki, L.S.³ Otzen, D.E.⁴ Fersht, A.R.⁵

26
- 0035814880
- Pan, Y.; Daggett, V. Biochemistry 2001, 40, 2723-2731.
- (2001) Biochemistry , vol.40 , pp. 2723-2731
- Pan, Y.¹ Daggett, V.²

27
- 0035818481
- Li, L.; Shakhnovich, E. I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 13014-13018.
- (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.98 , pp. 13014-13018
- Li, L.¹ Shakhnovich, E.I.²

28
- 0035479570
- Baysal, C.; Atilgan, A. R. Proteins 2001, 45, 62-70.
- (2001) Proteins , vol.45 , pp. 62-70
- Baysal, C.¹ Atilgan, A.R.²

29
- 0035029408
- Kurt, N.; Haliloglu, T. J. Biomol. Struct. Dyn. 2001, 18, 713-731.
- (2001) J. Biomol. Struct. Dyn. , vol.18 , pp. 713-731
- Kurt, N.¹ Haliloglu, T.²

30
- 0035830487
- Li, L.; Shakhnovich, E. I. J. Mol. Biol. 2001, 306, 121-132.
- (2001) J. Mol. Biol. , vol.306 , pp. 121-132
- Li, L.¹ Shakhnovich, E.I.²

31
- 0036306054
- De Jong, D.; Riley, R.; Alonso, D. O.; Daggett, V. J. Mol. Biol. 2002, 319, 229-242.
- (2002) J. Mol. Biol. , vol.319 , pp. 229-242
- De Jong, D.¹ Riley, R.² Alonso, D.O.³ Daggett, V.⁴

32
- 0037154980
- Fersht, A. R.; Daggett, V. Cell 2002, 108, 573-582.
- (2002) Cell , vol.108 , pp. 573-582
- Fersht, A.R.¹ Daggett, V.²

33
- 0029867258
- Cai, M.; Huang, Y.; Prakash, O.; Wen, L.; Dunkelbarger, S. P.; Huang, J. K. Biochemistry 1996, 35, 4784-4794.
- (1996) Biochemistry , vol.35 , pp. 4784-4794
- Cai, M.¹ Huang, Y.² Prakash, O.³ Wen, L.⁴ Dunkelbarger, S.P.⁵ Huang, J.K.⁶

34
- 0023729499
- McPhalen, C. A.; James, M. N. Biochemistry 1988, 27, 6582-6598.
- (1988) Biochemistry , vol.27 , pp. 6582-6598
- McPhalen, C.A.¹ James, M.N.²

35
- 0025369318
- Longstaff, C.; Campbell, A. F.; Fersht, A. R. Biochemistry 1990, 29, 7339-7347.
- (1990) Biochemistry , vol.29 , pp. 7339-7347
- Longstaff, C.¹ Campbell, A.F.² Fersht, A.R.³

36
- 0025084616
- Krishnamoorthi, R.; Gong, Y.; Richardson, M. FEBS Lett. 1990, 273, 163-167.
- (1990) FEBS Lett. , vol.273 , pp. 163-167
- Krishnamoorthi, R.¹ Gong, Y.² Richardson, M.³

37
- 0029059477
- Stott, K.; Blackburn, J. M.; Butler, P. J.; Perutz, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 6509-6513.
- (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.92 , pp. 6509-6513
- Stott, K.¹ Blackburn, J.M.² Butler, P.J.³ Perutz, M.⁴

38
- 0017153535
- Bryant, J.; Green, T. R.; Gurusaddaiah, T.; Ryan, C. A. Biochemistry 1976, 15, 3418-3424.
- (1976) Biochemistry , vol.15 , pp. 3418-3424
- Bryant, J.¹ Green, T.R.² Gurusaddaiah, T.³ Ryan, C.A.⁴

39
- 0023398125
- Clore, G. M.; Gronenborn, A. M.; Kjaer, M.; Poulsen, F. M. Protein Eng. 1987, 1, 305-311.
- (1987) Protein Eng. , vol.1 , pp. 305-311
- Clore, G.M.¹ Gronenborn, A.M.² Kjaer, M.³ Poulsen, F.M.⁴

40
- 0023398103
- Clore, G. M.; Gronenborn, A. M.; James, M. N.; Kjaer, M.; McPhalen, C. A.; Poulsen, F. M. Protein Eng. 1987, 1, 313-318.
- (1987) Protein Eng. , vol.1 , pp. 313-318
- Clore, G.M.¹ Gronenborn, A.M.² James, M.N.³ Kjaer, M.⁴ McPhalen, C.A.⁵ Poulsen, F.M.⁶

41
- 0008819754
- Scott, W.; Hunenberger, P. H.; Tironi, I. G.; Mark, A. E.; Billeter, S. R.; Fennen, J.; Torda, A. E.; Huber, T.; Kruger, P.; van Gunsteren, W. F. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 3596-3607.
- (1999) J. Phys. Chem. A , vol.103 , pp. 3596-3607
- Scott, W.¹ Hunenberger, P.H.² Tironi, I.G.³ Mark, A.E.⁴ Billeter, S.R.⁵ Fennen, J.⁶ Torda, A.E.⁷ Huber, T.⁸ Kruger, P.⁹ Van Gunsteren, W.F.¹⁰

42
- 33646940952
- Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341.
- (1977) J. Comput. Phys. , vol.23 , pp. 327-341
- Ryckaert, J.P.¹ Ciccotti, G.² Berendsen, H.J.C.³

43
- 4544369164
- Tironi, I. G.; Sperb, R.; Smith, P. E.; van Gunsteren, W. F. J. Chem. Phys. 1995, 102, 5451-5459.
- (1995) J. Chem. Phys. , vol.102 , pp. 5451-5459
- Tironi, I.G.¹ Sperb, R.² Smith, P.E.³ Van Gunsteren, W.F.⁴

44
- 2242491482
- Smith, P. E.; van Gunsteren, W. F. J. Chem. Phys. 1994, 100, 3169-3174.
- (1994) J. Chem. Phys. , vol.100 , pp. 3169-3174
- Smith, P.E.¹ Van Gunsteren, W.F.²

45
- 2142813682
- van Gunsteren, W. F.; Berendsen, H. J. C. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1990, 29, 992-1023.
- (1990) Angew. Chem., Int. Ed. Engl. , vol.29 , pp. 992-1023
- Van Gunsteren, W.F.¹ Berendsen, H.J.C.²

46
- 0000279972
- Henry, E. R.; Szabo, A. J. Chem. Phys. 1985, 82, 4753-4761.
- (1985) J. Chem. Phys. , vol.82 , pp. 4753-4761
- Henry, E.R.¹ Szabo, A.²

47
- 0028986918
- Smith, P. E.; van Schaik, R. C.; Szyperski, T.; Wuethrich, K.; Van Gunsteren, W. F. J. Mol. Biol. 1995, 246, 356-365.
- (1995) J. Mol. Biol. , vol.246 , pp. 356-365
- Smith, P.E.¹ Van Schaik, R.C.² Szyperski, T.³ Wuethrich, K.⁴ Van Gunsteren, W.F.⁵

48
- 0026684043
- Chandrasekhar, I.; Clore, G. M.; Szabo, A. J. Mol. Biol. 1992, 226, 239-250.
- (1992) J. Mol. Biol. , vol.226 , pp. 239-250
- Chandrasekhar, I.¹ Clore, G.M.² Szabo, A.³

49
- 0015222647
- Lee, B.; Richards, F. M. J. Mol. Biol. 1971, 55, 379-400.
- (1971) J. Mol. Biol. , vol.55 , pp. 379-400
- Lee, B.¹ Richards, F.M.²

50
- 33646719091
- Lipari, G.; Szabo, A. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 4546-4559.
- (1982) J. Am. Chem. Soc. , vol.104 , pp. 4546-4559
- Lipari, G.¹ Szabo, A.²

51
- 0027333332
- Eriksson, M. A.; Berglund, H.; Hard, T.; Nilsson, L. Proteins 1993, 17, 375-390.
- (1993) Proteins , vol.17 , pp. 375-390
- Eriksson, M.A.¹ Berglund, H.² Hard, T.³ Nilsson, L.⁴

52
- 0030877076
- Philippopoulos, M.; Mandel, A. M.; Palmer, A. G.; Lim, C. Proteins 1997, 28, 481-493.
- (1997) Proteins , vol.28 , pp. 481-493
- Philippopoulos, M.¹ Mandel, A.M.² Palmer, A.G.³ Lim, C.⁴

53
- 0029162947
- Smith, L. J.; Mark, A. E.; Dobson, C. M.; van Gunsteren, W. F. Biochemistry 1995, 34, 10918-10931.
- (1995) Biochemistry , vol.34 , pp. 10918-10931
- Smith, L.J.¹ Mark, A.E.² Dobson, C.M.³ Van Gunsteren, W.F.⁴

54
- 0033979148
- Horita, D. A.; Zhang, W.; Smithgall, T. E.; Gmeiner, W. H.; Byrd, R. A. Protein Sci. 2000, 9, 95-103.
- (2000) Protein Sci. , vol.9 , pp. 95-103
- Horita, D.A.¹ Zhang, W.² Smithgall, T.E.³ Gmeiner, W.H.⁴ Byrd, R.A.⁵

55
- 0029562951
- Philippopoulos, M.; Lim, C. J. Mol. Biol. 1995, 254, 771-792.
- (1995) J. Mol. Biol. , vol.254 , pp. 771-792
- Philippopoulos, M.¹ Lim, C.²

56
- 0034142113
- Wrabl, J. O.; Shortle, D.; Woolf, T. B. Proteins 2000, 38, 123-133.
- (2000) Proteins , vol.38 , pp. 123-133
- Wrabl, J.O.¹ Shortle, D.² Woolf, T.B.³

57
- 0034823221
- Pfeiffer, S.; Fushman, D.; Cowburn, D. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3021-3036.
- (2001) J. Am. Chem. Soc. , vol.123 , pp. 3021-3036
- Pfeiffer, S.¹ Fushman, D.² Cowburn, D.³

58
- 0037071963
- Dvorsky, R.; Hornak, V.; Sevcik, J.; Tyrrell, G. P.; Caves, L. S. D.; Verma, C. S. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 6038-6048.
- (2002) J. Phys. Chem. B , vol.106 , pp. 6038-6048
- Dvorsky, R.¹ Hornak, V.² Sevcik, J.³ Tyrrell, G.P.⁴ Caves, L.S.D.⁵ Verma, C.S.⁶

59
- 0035425883
- Schuler, L. D.; Daura, X.; van Gunsteren, W. F. J. Comput. Chem. 2001, 22, 1205-1218.
- (2001) J. Comput. Chem. , vol.22 , pp. 1205-1218
- Schuler, L.D.¹ Daura, X.² Van Gunsteren, W.F.³

60
- 1242346370
- Berendsen, H. J.; Grigera, J. R.; Straatsma, T. P. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6269-6271.
- (1987) J. Phys. Chem. , vol.91 , pp. 6269-6271
- Berendsen, H.J.¹ Grigera, J.R.² Straatsma, T.P.³

61
- 0030040589
- Parkin, S.; Rupp, B.; Hope, H. Acta Crystallogr. D 1996, 52, 18-31.
- (1996) Acta Crystallogr. D , vol.52 , pp. 18-31
- Parkin, S.¹ Rupp, B.² Hope, H.³

62
- 84959579073
- Wlodawer, A.; Walter, J.; Huber, R.; Sjolin, L. J. Mol. Biol. 1984, 180, 329.
- (1984) J. Mol. Biol. , vol.180 , pp. 329
- Wlodawer, A.¹ Walter, J.² Huber, R.³ Sjolin, L.⁴

63
- 0027304152
- Brunne, R. M.; Liepinsh, E.; Otting, G.; Wuethrich, K.; van Gunsteren, W. F. J. Mol. Biol. 1993, 231, 1040-1048.
- (1993) J. Mol. Biol. , vol.231 , pp. 1040-1048
- Brunne, R.M.¹ Liepinsh, E.² Otting, G.³ Wuethrich, K.⁴ Van Gunsteren, W.F.⁵

64
- 0027983623
- Schiffer, C. A.; Huber, R.; Wuethrich, K.; van Gunsteren, W. F. J. Mol. Biol. 1994, 241, 588-599.
- (1994) J. Mol. Biol. , vol.241 , pp. 588-599
- Schiffer, C.A.¹ Huber, R.² Wuethrich, K.³ Van Gunsteren, W.F.⁴

65
- 0029633167
- Levitt, M.; Hirshberg, M.; Sharon, R.; Daggett, V. Comput. Phys. Commun. 1995, 91, 215-231.
- (1995) Comput. Phys. Commun. , vol.91 , pp. 215-231
- Levitt, M.¹ Hirshberg, M.² Sharon, R.³ Daggett, V.⁴

66
- 0001751804
- Daura, X.; Mark, A. E.; van Gunsteren, W. F. J. Comput. Chem. 1998, 19, 535-547.
- (1998) J. Comput. Chem. , vol.19 , pp. 535-547
- Daura, X.¹ Mark, A.E.² Van Gunsteren, W.F.³

67
- 0032584783
- Daura, X.; Jaun, B.; Seebach, D.; van Gunsteren, W. F.; Mark, A. E. J. Mol. Biol. 1998, 280, 925-932.
- (1998) J. Mol. Biol. , vol.280 , pp. 925-932
- Daura, X.¹ Jaun, B.² Seebach, D.³ Van Gunsteren, W.F.⁴ Mark, A.E.⁵

68
- 0032475912
- Bonvin, A. M.; Sunnerhagen, M.; Otting, G.; van Gunsteren, W. F. J. Mol. Biol. 1998, 282, 859-873.
- (1998) J. Mol. Biol. , vol.282 , pp. 859-873
- Bonvin, A.M.¹ Sunnerhagen, M.² Otting, G.³ Van Gunsteren, W.F.⁴

69
- 0028294214
- Smith, P. E.; van Gunsteren, W. F. J. Mol. Biol. 1994, 236, 629-636.
- (1994) J. Mol. Biol. , vol.236 , pp. 629-636
- Smith, P.E.¹ Van Gunsteren, W.F.²

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.