Amide III mode φ, ψ dependence in peptides: A vibrational frequency map

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 106, Issue 14, 2002, Pages 3391-3394

  Mirkin, Noemi G ^a   Krimm, Samuel ^a  

^a UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALANINE DIPEPTIDE; PEPTIDES; POTENTIAL ENERGY DISTRIBUTION; VIBRATIONAL FREQUENCY MAP;

CONFORMATIONS; FOURIER TRANSFORMS; HYDROGEN BONDS; MOLECULAR SPECTROSCOPY; MOLECULAR VIBRATIONS; POTENTIAL ENERGY;

POLYPEPTIDES;

EID: 0037061954     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp012324v     Document Type: Article

References (30)

1. Sutherland, G. B. B. M. Adv. Protein Chem. 1952, 7, 291-318.
2. Shimanouchi, T.; Koyama, Y.; Itoh, K. Prog. Polym. Sci. Jpn. 1974, 7, 273-368.
3. Krimm, S.; Bandekar, J. Adv. Protein Chem. 1986, 38, 181-364.
4. Krimm, S. Infrared Analysis of Peptides and Proteins: Principles and Applications; Singh, B. R., Ed.; American Chemical Society: Washington, D.C., 2000, 750, 38-53.
5. Tasumi, M.; Krimm, S. J. Chem. Phys. 1967, 46, 755-766.
6. Krimm, S.; Abe, Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U S.A. 1972, 69, 2788-2792.
7. Moore, W. H.; Krimm, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1975, 72, 4933-4935.
8. Cheam, T. C.; Krimm, S. Chem. Phys. Lett. 1984, 107, 613-616.
9. Lee, S.-H.; Krimm, S. Chem. Phys. 1998, 230, 277-295.
10. Torii, H.; Tasumi, M. J. Chem. Phys. 1992, 96, 3379-3387.
11. Hamm, P.; Lim, M.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 6123-6138.
12. Brauner, J. W.; Dugan, C.; Mendelsohn, R. J. Am. Chem. Soc. 20000, 122, 677-683.
13. Lee, S.-H.; Krimm, S. Biopolymers 1998, 46, 283-317.
14. Palmo, K.: Pietila, L.-O.; Krimm, S. J. Comput. Chem. 1991, 12, 385-390.
15. Palmo, K.; Mirkin, N. G.; Pietila, L.-O.; Krimm, S. Macromolecules 1993, 26, 6831-6840.
16. Palmo, K.; Mirkin, N. G.; Krimm, S. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 6448-6456.
17. Mannfors, B.; Sundius, T.; Palmo, K.; Pietila, L.-O.; Krimm, S. J. Mol. Struct. 2000, 521, 49-75.
18. Lord, R. C. Appl. Spectrosc. 1977, 31, 187-194.
19. Hsu, S. L.; Moore, W. H.; Krimm, S. Biopolymers 1976, 15, 1513-1528.
20. Cheam, T. C.; Krimm, S. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 1990, 206, 173-203.
21. Mirkin, N. G.; Krimm, S. to be published.
22. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, J. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Baboul, A. G.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Gonzalez, C.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98, revision A.9; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
23. Mirkin, N. G.; Krimm, S. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 1995, 334, 1-6.
24. Mirkin, N. G.; Krimm, S. J. Mol. Struct. 1991, 242, 143-160.
25. Smith, P. E. J. Chem. Phys. 1999, 111, 5568-5579.
26. Miyazawa, T.; Shimanouchi, T.; Mizushima, S. J. Chem. Phys. 1956, 24, 408-418.
27. Miyazawa, T.; Shimanouchi, T.; Mizushima, S. J. J. Chem. Phys. 1958, 29, 611-616.
28. Weaver, J. L.; Williams, R. W. Biopolymers 1990, 30, 593-597.
29. Song, S.; Asher, S. A.; Krimm, S.; Bandekar, J. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 8547-8548.
30. Ramek, M.; Yu, C. H.; Schäfer, L. Can. J. Chem. 1998, 76, 566-575.