The ternary complex of cytochrome f and cytochrome c: Identification of a second binding site and competition for plastocyanin binding

ChemBioChem

Volumn 3, Issue 6, 2002, Pages 526-533

  Crowley, Peter B ^a   Rabe, Kersten S ^a   Worrall, Jonathan A R ^a   Canters, Gerard W ^a   Ubbink, Marcellus ^a  

^a LEIDEN UNIVERSITY   (Netherlands)

Author keywords

Cytochromes; Electron transport; Metalloproteins; NMR spectroscopy; Protein docking

Indexed keywords

CYTOCHROME C; CYTOCHROME F; IRON SULFUR PROTEIN; PLASTOCYANIN;

ARTICLE; BINDING SITE; CYANOBACTERIUM; ELECTRON TRANSPORT; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN BINDING; PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE;

AMIDES; BINDING SITES; BINDING, COMPETITIVE; COMPUTER SIMULATION; CYANOBACTERIA; CYTOCHROME C GROUP; CYTOCHROMES; CYTOCHROMES F; ELECTROSTATICS; KINETICS; MODELS, MOLECULAR; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR; PLASTOCYANIN; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION;

PHORMIDIUM LAMINOSUM;

EID: 0036903969     PISSN: 14394227     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/1439-7633(20020603)3:6<526::AID-CBIC526>3.0.CO;2-N     Document Type: Article

References (47)

1. D. S. Bendall in Protein Electron Transfer (Ed.: D. S. Bendall), Bios Scientific, Oxford, 1996, pp. 43-68.
2. a) L. Chen, R. C. Durley, B. J. Poliks, K. Hamada, Z. Chen, F. S. Mathews, V. L. Davidson, Y. Satow, E. Huizinga, F. M. Vellieux, Biochemistry 1992, 31, 4959-4964;
3. b) H. Pelletier, J. Kraut, Science 1992, 258, 1748-1755;
4. c) L. Chen, R. C. Durley, F. S. Mathews, V. L. Davidson, Science 1994, 264, 86-90;
5. d) I. F. Sevrioukova, H. Li, H. Zhang, J. A. Peterson, T. Poulos, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 1863-1868;
6. e) G. Kurisu, M. Kusunoki, E. Katoh, T. Yamazaki, K. Teshima, Y. Onda, Y. Kimata-Ariga, T. Hase, Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 117-121;
7. f) J. J. M̈ller, A. Lapko, G. Bourenkov, K. Ruckpaul, U. Heinemann, J. Biol. Chem. 2001, 276, 2786-2789.
8. E. R. P. Zuiderweg, Biochemistry 2002, 41, 1-7.
9. W. A. Cramer, G. M. Soriano, M. Ponamarev, D. Huang, H. Zhang, S. E. Martinez, J. L. Smith, Annu. Rev. Plant Phys. 1996, 47, 477-508.
10. S. E. Martinez, D. Huang, A. Szczepaniak, W. A. Cramer, J. L. Smith, Structure 1994, 2, 95-105.
11. C. J. Carrell, B. G. Schlarb, D. S. Bendall, C. J. Howe, W. A. Cramer, J. L. Smith, Biochemistry 1999, 38, 9590-9599.
12. Y. I. Chi, L. S. Huang, Z. L. Zhang, J. G. Fernandez-Velasco, E. A. Berry, Biochemistry 2001, 40, 7689-7701.
13. S. E. Martinez, D. Huang, M. Ponamarev, W. A. Cramer, J. L. Smith, Protein Sci. 1996, 5, 1081-1092.
14. G. Sainz, C. J. Carrell, M. V. Ponamarev, G. M. Soriano, W. A. Cramer, J. L. Smith, Biochemistry 2000, 39, 9164-9173.
15. C. S. Bond, D. S. Bendall, H.C. Freeman, J. M. Guss, C. J. Howe, M. J. Wagner, M. C. J. Wilce, Acta Crytallogr. Sect. D 1999, 55, 414-421.
16. E. L. Gross in Oxygenic Photosynthesis: The Light Reactions (Eds.: D. R. Ort, C. F. Yocum), Kluwer Academic, Dordrecht, 1996, pp. 413-429.
17. K. Sigfridsson, Photosynth. Res. 1998, 57, 1-28.
18. M. Ubbink, M. Ejdeback, B. G. Karlsson, D. S. Bendall, Structure 1998, 6, 323-335.
19. P. B. Crowley, G. Otting, B. G. Schlarb-Ridley, G. W. Canters, M. Ubbink, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 10444-10453.
20. F. De Rienzo, R. R. Gabdoulline, M. C. Menziani, R. C. Wade, Protein Sci. 2000, 9, 1439-1454.
21. M. Ubbink, D. S. Bendall, Biochemistry 1997, 36, 6326-6335.
22. G. V. Louie, G. D. Brayer, J. Mol. Biol. 1990, 214, 527-555.
23. A. Nicholls, K. Sharp, B. Honig, Prot. Struc. Funct. Genet. 1991, 11, 281-296.
24. a) http://www.dq.fct.unl.pt/bioin/chemera/;
25. b) P. N. Palma, L. Krippahl, J. E. Wampler, J. J. G. Moura, Proteins 2000, 39, 372-384.
26. X. Morelli, A. Dolla, M. Czjzek, P. N. Palma, F. Blasco, L. Krippahl, J. J. G. Moura, F. Guerlesquin, Biochemistry 2000, 39, 2530-2537.
27. P. N. Palma, I. Moura, J. Le Gall, J. van Beeumen, J. E. Wampler, J. J. G. Moura, Biochemistry 1994, 33, 6394-6407.
28. M. R. Mauk, J. C. Ferrer, A. G. Mauk, Biochemistry 1994, 33, 12609-12614.
29. R. M. Keller, K. Ẅtrich, Biochim. Biophys. Acta. 1978, 553, 195-208.
30. A. J. Wand, D. L. DiStefano, Y. Q. Feng, H. Roder, S. W. Englander, Biochemistry 1989, 28, 186-194.
31. Y. Gao, J. Boyd, R. J. P. Williams, G. J. Pielak, Biochemistry 1990, 29, 6994-7003.
32. S. E. J. Rigby, G. R. Moore, J. C. Gray, P. M. A. Gadsby, S. J. George, A. J. Thompson, Biochem, J. 1988, 256, 571-577.
33. P. J. Kraulis, Appl. Crystallogr. 1991, 24, 946-950.
34. M. J. Wagner, J. C. L. Packer, C. J. Howe, D. S. Bendall, BBA-Bioenergetics 1996, 1276, 246-252.
35. L. Lo Conte, C. Chothia, J. Janin, J. Mol. Biol. 1999, 285, 2177-2198.
36. C. J. Carrell, H. Zhang, W. A. Cramer, J. L. Smith, Structure 1997, 5, 1613-1625.
37. B. Schoepp, E. Chabaud, C. Breyton, A. Vermeglio, J. L. Popot, J. Biol. Chem. 2000, 275, 5275-5283.
38. J. A. R. Worrall, U. Kolczak, G. W. Canters, M. Ubbink, Biochemistry 2001, 40, 7069-7076.
39. G. M. Soriano, M. V. Ponamarev, R. A. Piskorowski, W. A. Cramer, Biochemistry 1998, 37, 15120-15128.
40. L. Qin, N. M. Kostić, Biochemistry 1996, 35, 3379-3386.
41. C. Frazao, C. M. Soares, M. A. Carrondo, E. Pohl, Z. Dauter, K. S. Wilson, M. Hervas, J. A. Navarro, M. A. De la Rosa, G. M. Sheldrick, Structure 1995, 3, 1159-1169.
42. M. Hervas, J. A. Navarro, F. P. Molina-Heredia, M. A. De la Rosa, Photosynth. Res. 1998, 57, 93-100.
43. W. B. R. Pollock, F. I. Rosell, M. B. Twitchett, M. E. Dumont, A. G. Mauk, Biochemistry 1998, 37, 6124-6131.
44. A. S. Morar, D. Kakouras, G. B. Young, J. Boyd, G. J. Peilak, J. Biol. Inorg. Chem. 1999, 4, 220-222.
45. B. G. Schlarb, M. J. Wagner, E. Vijgenboom, M. Ubbink, D. S. Bendall, C. J. Howe, Gene 1999, 234, 275-283.
46. P. Andersson, B. Gsell, B. Wipf, H. Senn, G. Otting, J. Biomol. NMR 1998, 11, 279-288.
47. C. Bartels, T.-H. Xia, M. Billeter, P. G̈ntert, K. Ẅthrich, J. Biomol. NMR 1995, 5, 1-10.