메뉴 건너뛰기
ChemBioChem
Volumn 3, Issue 7, 2002, Pages 604-617
Close-range electrostatic interactions in proteins
Author keywords

Electrostatic interactions; Flexibility; Protein folding protein structures; Salt bridges
Indexed keywords

BACTERIAL ENZYME; GLUTAMATE DEHYDROGENASE; RIBONUCLEASE H;
EID: 0036902235     PISSN: 14394227     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/1439-7633(20020703)3:7<604::AID-CBIC604>3.0.CO;2-X     Document Type: Review
Times cited : (462)
References (161)
  • 1
    • 0021112481 scopus 로고
    • a) D. J. Barlow, J. M. Thornton, J. Mol. Biol. 1983, 168, 867-885; b) V. Lounnas, R. C. Wade, Biochemistry 1997, 36, 5402-5417.
    • (1983) J. Mol. Biol. , vol.168 , pp. 867-885
    • Barlow, D.J.1    Thornton, J.M.2
  • 2
    • 0030917740 scopus 로고    scopus 로고
    • a) D. J. Barlow, J. M. Thornton, J. Mol. Biol. 1983, 168, 867-885; b) V. Lounnas, R. C. Wade, Biochemistry 1997, 36, 5402-5417.
    • (1997) Biochemistry , vol.36 , pp. 5402-5417
    • Lounnas, V.1    Wade, R.C.2
  • 3
    • 0033550299 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Kumar, R. Nussinov, J. Mol. Biol. 1999, 293, 1241-1255; b) S. Kumar, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 47, 485-497; c) S. Kumar, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 43, 433-454.
    • (1999) J. Mol. Biol. , vol.293 , pp. 1241-1255
    • Kumar, S.1    Nussinov, R.2
  • 4
    • 0034561026 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Kumar, R. Nussinov, J. Mol. Biol. 1999, 293, 1241-1255; b) S. Kumar, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 47, 485-497; c) S. Kumar, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 43, 433-454.
    • (2000) Proteins: Struct. Funct. Genet. , vol.47 , pp. 485-497
    • Kumar, S.1    Nussinov, R.2
  • 5
    • 0035371061 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Kumar, R. Nussinov, J. Mol. Biol. 1999, 293, 1241-1255; b) S. Kumar, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 47, 485-497; c) S. Kumar, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 43, 433-454.
    • (2001) Proteins: Struct. Funct. Genet. , vol.43 , pp. 433-454
    • Kumar, S.1    Nussinov, R.2
  • 6
    • 0034685838 scopus 로고    scopus 로고
    • a) E. A. Permyakov, L. J. Berliner, FEBS Lett. 2000, 473, 269-274; b) P. E. Wright, H. J. Dyson, J. Mol. Biol. 1999, 293, 321-331; c) Y. Y. Sham, B. Ma, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 2001, 70, 135-148.
    • (2000) FEBS Lett. , vol.473 , pp. 269-274
    • Permyakov, E.A.1    Berliner, L.J.2
  • 7
    • 0032749078 scopus 로고    scopus 로고
    • a) E. A. Permyakov, L. J. Berliner, FEBS Lett. 2000, 473, 269-274; b) P. E. Wright, H. J. Dyson, J. Mol. Biol. 1999, 293, 321-331; c) Y. Y. Sham, B. Ma, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 2001, 70, 135-148.
    • (1999) J. Mol. Biol. , vol.293 , pp. 321-331
    • Wright, P.E.1    Dyson, H.J.2
  • 8
    • 0012034250 scopus 로고    scopus 로고
    • a) E. A. Permyakov, L. J. Berliner, FEBS Lett. 2000, 473, 269-274; b) P. E. Wright, H. J. Dyson, J. Mol. Biol. 1999, 293, 321-331; c) Y. Y. Sham, B. Ma, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 2001, 70, 135-148.
    • (2001) Protein Sci. , vol.70 , pp. 135-148
    • Sham, Y.Y.1    Ma, B.2    Tsai, C.J.3    Nussinov, R.4
  • 9
    • 0032972986 scopus 로고    scopus 로고
    • a) R. L. Baldwin, G. D. Rose, Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 26-33; b) R. L. Baldwin, G. D. Rose, Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 77-84.
    • (1999) Trends Biochem. Sci. , vol.24 , pp. 26-33
    • Baldwin, R.L.1    Rose, G.D.2
  • 10
    • 0033080081 scopus 로고    scopus 로고
    • a) R. L. Baldwin, G. D. Rose, Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 26-33; b) R. L. Baldwin, G. D. Rose, Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 77-84.
    • (1999) Trends Biochem. Sci. , vol.24 , pp. 77-84
    • Baldwin, R.L.1    Rose, G.D.2
  • 11
    • 0032101291 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Kumar, M. Bansal, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 37, 460-76; b) "Geometry and Sequence Correlation Studies on α-Helices in Globular Proteins": S. Kumar, PhD thesis, Indian Institute of Science, Bangalore, India, 1997; c) D. Gandini, L. Gogioso, M. Bolognesi, D. Bordo, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1996, 24, 439-449.
    • (1998) Proteins: Struct. Funct. Genet. , vol.37 , pp. 460-476
    • Kumar, S.1    Bansal, M.2
  • 12
    • 0012067123 scopus 로고    scopus 로고
    • S. Kumar, PhD thesis, Indian Institute of Science, Bangalore, India
    • a) S. Kumar, M. Bansal, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 37, 460-76; b) "Geometry and Sequence Correlation Studies on α-Helices in Globular Proteins": S. Kumar, PhD thesis, Indian Institute of Science, Bangalore, India, 1997; c) D. Gandini, L. Gogioso, M. Bolognesi, D. Bordo, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1996, 24, 439-449.
    • (1997) Geometry and Sequence Correlation Studies on α-Helices in Globular Proteins
  • 13
    • 0029986003 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Kumar, M. Bansal, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 37, 460-76; b) "Geometry and Sequence Correlation Studies on α-Helices in Globular Proteins": S. Kumar, PhD thesis, Indian Institute of Science, Bangalore, India, 1997; c) D. Gandini, L. Gogioso, M. Bolognesi, D. Bordo, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1996, 24, 439-449.
    • (1996) Proteins: Struct. Funct. Genet. , vol.24 , pp. 439-449
    • Gandini, D.1    Gogioso, L.2    Bolognesi, M.3    Bordo, D.4
  • 15
    • 0029773921 scopus 로고    scopus 로고
    • a) M. Sundaralingam, Y. C. Sekharudu, N. Yathindra, V. Ravichandran, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1987, 2, 64-71; b) D. Walther, P. Argos, Protein Eng. 1996, 9, 471-478.
    • (1996) Protein Eng. , vol.9 , pp. 471-478
    • Walther, D.1    Argos, P.2
  • 16
    • 0026565486 scopus 로고
    • a) P. C. Lyu, P. J. Gans, N. R. Kallenbach, J. Mol. Biol. 1992, 223, 343-350; b) M. J. Bodkin, J. M. Goodfellow, Protein Sci. 1995, 4, 603-612; c) S. Marqusee, R. L. Baldwin, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1987, 84, 8898-8902; d) C. A. Olson, E. J. Spek, Z. Shi, A. Vologodskii, N. R. Kallenbach, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 44, 123-132.
    • (1992) J. Mol. Biol. , vol.223 , pp. 343-350
    • Lyu, P.C.1    Gans, P.J.2    Kallenbach, N.R.3
  • 17
    • 0028898004 scopus 로고
    • a) P. C. Lyu, P. J. Gans, N. R. Kallenbach, J. Mol. Biol. 1992, 223, 343-350; b) M. J. Bodkin, J. M. Goodfellow, Protein Sci. 1995, 4, 603-612; c) S. Marqusee, R. L. Baldwin, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1987, 84, 8898-8902; d) C. A. Olson, E. J. Spek, Z. Shi, A. Vologodskii, N. R. Kallenbach, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 44, 123-132.
    • (1995) Protein Sci. , vol.4 , pp. 603-612
    • Bodkin, M.J.1    Goodfellow, J.M.2
  • 18
    • 0023461350 scopus 로고
    • a) P. C. Lyu, P. J. Gans, N. R. Kallenbach, J. Mol. Biol. 1992, 223, 343-350; b) M. J. Bodkin, J. M. Goodfellow, Protein Sci. 1995, 4, 603-612; c) S. Marqusee, R. L. Baldwin, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1987, 84, 8898-8902; d) C. A. Olson, E. J. Spek, Z. Shi, A. Vologodskii, N. R. Kallenbach, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 44, 123-132.
    • (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.84 , pp. 8898-8902
    • Marqusee, S.1    Baldwin, R.L.2
  • 19
    • 0035427308 scopus 로고    scopus 로고
    • a) P. C. Lyu, P. J. Gans, N. R. Kallenbach, J. Mol. Biol. 1992, 223, 343-350; b) M. J. Bodkin, J. M. Goodfellow, Protein Sci. 1995, 4, 603-612; c) S. Marqusee, R. L. Baldwin, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1987, 84, 8898-8902; d) C. A. Olson, E. J. Spek, Z. Shi, A. Vologodskii, N. R. Kallenbach, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 44, 123-132.
    • (2001) Proteins: Struct. Funct. Genet. , vol.44 , pp. 123-132
    • Olson, C.A.1    Spek, E.J.2    Shi, Z.3    Vologodskii, A.4    Kallenbach, N.R.5
  • 20
    • 0012034251 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. A. Blaise, J. M. Berg, Biochemistry 1997, 36, 6218-6222; b) J. S. Merkel, J. M. Sturtevant, L. Regan, Structure 1999, 7, 1333-1343.
    • (1997) Biochemistry , vol.36 , pp. 6218-6222
    • Blaise, C.A.1    Berg, J.M.2
  • 23
    • 0032824529 scopus 로고    scopus 로고
    • a) M. T Oliva, J. Moult, Protein Eng. 1999, 12, 727-735; b) V. Z. Spassov, B. P. Atanasov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1994, 19, 222-229.
    • (1999) Protein Eng. , vol.12 , pp. 727-735
    • Oliva, M.T.1    Moult, J.2
  • 26
    • 0029670343 scopus 로고    scopus 로고
    • a) M. Oliveberg, A. R. Fersht, Biochemistry 1996, 35, 2726-2737; b) M. Oliveberg, A. R. Fersht, Biochemistry 1996, 35, 6795-6805.
    • (1996) Biochemistry , vol.35 , pp. 2726-2737
    • Oliveberg, M.1    Fersht, A.R.2
  • 27
    • 0029943662 scopus 로고    scopus 로고
    • a) M. Oliveberg, A. R. Fersht, Biochemistry 1996, 3S, 2726-2737; b) M. Oliveberg, A. R. Fersht, Biochemistry 1996, 35, 6795-6805.
    • (1996) Biochemistry , vol.35 , pp. 6795-6805
    • Oliveberg, M.1    Fersht, A.R.2
  • 31
    • 0031012563 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 24-42; b) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 1426-1437; c) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1591-1604; d) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 12038-12043; e) S. Kumar, Y. Y. Sham, C. J. Tsai, R. Nussinov, Biophys. J. 2001, 80, 2439-2454; f) C. J. Tsai, B. Ma, S. Kumar, H. Wolfson, R. Nussinov, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2001, 36, 399-433.
    • (1997) Protein Sci. , vol.6 , pp. 24-42
    • Tsai, C.J.1    Nussinov, R.2
  • 32
    • 0030756203 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 24-42; b) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 1426-1437; c) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1591-1604; d) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 12038-12043; e) S. Kumar, Y. Y. Sham, C. J. Tsai, R. Nussinov, Biophys. J. 2001, 80, 2439-2454; f) C. J. Tsai, B. Ma, S. Kumar, H. Wolfson, R. Nussinov, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2001, 36, 399-433.
    • (1997) Protein Sci. , vol.6 , pp. 1426-1437
    • Tsai, C.J.1    Nussinov, R.2
  • 33
    • 0032777204 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 24-42; b) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 1426-1437; c) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1591-1604; d) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 12038-12043; e) S. Kumar, Y. Y. Sham, C. J. Tsai, R. Nussinov, Biophys. J. 2001, 80, 2439-2454; f) C. J. Tsai, B. Ma, S. Kumar, H. Wolfson, R. Nussinov, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2001, 36, 399-433.
    • (1999) Protein Sci. , vol.8 , pp. 1591-1604
    • Tsai, C.J.1    Maizel, J.V.2    Nussinov, R.3
  • 34
    • 0034710871 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 24-42; b) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 1426-1437; c) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1591-1604; d) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 12038-12043; e) S. Kumar, Y. Y. Sham, C. J. Tsai, R. Nussinov, Biophys. J. 2001, 80, 2439-2454; f) C. J. Tsai, B. Ma, S. Kumar, H. Wolfson, R. Nussinov, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2001, 36, 399-433.
    • (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.97 , pp. 12038-12043
    • Tsai, C.J.1    Maizel, J.V.2    Nussinov, R.3
  • 35
    • 20644438446 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 24-42; b) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 1426-1437; c) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1591-1604; d) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 12038-12043; e) S. Kumar, Y. Y. Sham, C. J. Tsai, R. Nussinov, Biophys. J. 2001, 80, 2439-2454; f) C. J. Tsai, B. Ma, S. Kumar, H. Wolfson, R. Nussinov, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2001, 36, 399-433.
    • (2001) Biophys. J. , vol.80 , pp. 2439-2454
    • Kumar, S.1    Sham, Y.Y.2    Tsai, C.J.3    Nussinov, R.4
  • 36
    • 0001450617 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 24-42; b) C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 1426-1437; c) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1591-1604; d) C. J. Tsai, J. V. Maizel, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 12038-12043; e) S. Kumar, Y. Y. Sham, C. J. Tsai, R. Nussinov, Biophys. J. 2001, 80, 2439-2454; f) C. J. Tsai, B. Ma, S. Kumar, H. Wolfson, R. Nussinov, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2001, 36, 399-433.
    • (2001) Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. , vol.36 , pp. 399-433
    • Tsai, C.J.1    Ma, B.2    Kumar, S.3    Wolfson, H.4    Nussinov, R.5
  • 37
    • 0035327482 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Kumar, H. Wolfson, R. Nussinov, IBM J. Res. Dev. 2001, 45(3/4), 513-523; b) N. Sinha, S. Kumar, R. Nussinov, Structure 2001, 9, 1165-1181.
    • (2001) Res. Dev. , vol.45 , Issue.3-4 , pp. 513-523
    • Kumar, S.1    Wolfson, H.2    Nussinov, R.3    Ibm, J.4
  • 38
    • 0035659482 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Kumar, H. Wolfson, R. Nussinov, IBM J. Res. Dev. 2001, 45(3/4), 513-523; b) N. Sinha, S. Kumar, R. Nussinov, Structure 2001, 9, 1165-1181.
    • (2001) Structure , vol.9 , pp. 1165-1181
    • Sinha, N.1    Kumar, S.2    Nussinov, R.3
  • 39
    • 0031868211 scopus 로고    scopus 로고
    • a) D. Xu, C. J. Tsai, R. Nussinov, Folding Des. 1998, 3, R71-R80; b) C. J. Tsai, S. Kumar, B. Ma, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1181-1190; c) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 1999, 12, 713-720; d) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, H. Wolfson, R. Nussinov, Cell Biochem. Biophys. 1999, 31, 141-164; e) C. J. Tsai, B. Ma, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 9970-9972; f) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, N. Sinha, R. Nussinov, Protein Sci. 2000, 9, 10-19; g) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, Z. Hu, R. Nussinov, J. Theor. Biol. 2000, 203, 383-387; h) N. Sinha, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 3139-3144.
    • (1998) Folding Des. , vol.3
    • Xu, D.1    Tsai, C.J.2    Nussinov, R.3
  • 40
    • 0033056708 scopus 로고    scopus 로고
    • a) D. Xu, C. J. Tsai, R. Nussinov, Folding Des. 1998, 3, R71-R80; b) C. J. Tsai, S. Kumar, B. Ma, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1181-1190; c) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 1999, 12, 713-720; d) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, H. Wolfson, R. Nussinov, Cell Biochem. Biophys. 1999, 31, 141-164; e) C. J. Tsai, B. Ma, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 9970-9972; f) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, N. Sinha, R. Nussinov, Protein Sci. 2000, 9, 10-19; g) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, Z. Hu, R. Nussinov, J. Theor. Biol. 2000, 203, 383-387; h) N. Sinha, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 3139-3144.
    • (1999) Protein Sci. , vol.8 , pp. 1181-1190
    • Tsai, C.J.1    Kumar, S.2    Ma, B.3    Nussinov, R.4
  • 41
    • 0032824805 scopus 로고    scopus 로고
    • a) D. Xu, C. J. Tsai, R. Nussinov, Folding Des. 1998, 3, R71-R80; b) C. J. Tsai, S. Kumar, B. Ma, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1181-1190; c) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 1999, 12, 713-720; d) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, H. Wolfson, R. Nussinov, Cell Biochem. Biophys. 1999, 31, 141-164; e) C. J. Tsai, B. Ma, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 9970-9972; f) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, N. Sinha, R. Nussinov, Protein Sci. 2000, 9, 10-19; g) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, Z. Hu, R. Nussinov, J. Theor. Biol. 2000, 203, 383-387; h) N. Sinha, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 3139-3144.
    • (1999) Protein Eng. , vol.12 , pp. 713-720
    • Ma, B.1    Kumar, S.2    Tsai, C.J.3    Nussinov, R.4
  • 42
    • 0032614825 scopus 로고    scopus 로고
    • a) D. Xu, C. J. Tsai, R. Nussinov, Folding Des. 1998, 3, R71-R80; b) C. J. Tsai, S. Kumar, B. Ma, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1181-1190; c) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 1999, 12, 713-720; d) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, H. Wolfson, R. Nussinov, Cell Biochem. Biophys. 1999, 31, 141-164; e) C. J. Tsai, B. Ma, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 9970-9972; f) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, N. Sinha, R. Nussinov, Protein Sci. 2000, 9, 10-19; g) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, Z. Hu, R. Nussinov, J. Theor. Biol. 2000, 203, 383-387; h) N. Sinha, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 3139-3144.
    • (1999) Cell Biochem. Biophys. , vol.31 , pp. 141-164
    • Kumar, S.1    Ma, B.2    Tsai, C.J.3    Wolfson, H.4    Nussinov, R.5
  • 43
    • 0033621104 scopus 로고    scopus 로고
    • a) D. Xu, C. J. Tsai, R. Nussinov, Folding Des. 1998, 3, R71-R80; b) C. J. Tsai, S. Kumar, B. Ma, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1181-1190; c) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 1999, 12, 713-720; d) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, H. Wolfson, R. Nussinov, Cell Biochem. Biophys. 1999, 31, 141-164; e) C. J. Tsai, B. Ma, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 9970-9972; f) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, N. Sinha, R. Nussinov, Protein Sci. 2000, 9, 10-19; g) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, Z. Hu, R. Nussinov, J. Theor. Biol. 2000, 203, 383-387; h) N. Sinha, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 3139-3144.
    • (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.96 , pp. 9970-9972
    • Tsai, C.J.1    Ma, B.2    Nussinov, R.3
  • 44
    • 0033970020 scopus 로고    scopus 로고
    • a) D. Xu, C. J. Tsai, R. Nussinov, Folding Des. 1998, 3, R71-R80; b) C. J. Tsai, S. Kumar, B. Ma, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1181-1190; c) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 1999, 12, 713-720; d) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, H. Wolfson, R. Nussinov, Cell Biochem. Biophys. 1999, 31, 141-164; e) C. J. Tsai, B. Ma, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 9970-9972; f) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, N. Sinha, R. Nussinov, Protein Sci. 2000, 9, 10-19; g) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, Z. Hu, R. Nussinov, J. Theor. Biol. 2000, 203, 383-387; h) N. Sinha, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 3139-3144.
    • (2000) Protein Sci. , vol.9 , pp. 10-19
    • Kumar, S.1    Ma, B.2    Tsai, C.J.3    Sinha, N.4    Nussinov, R.5
  • 45
    • 0034696766 scopus 로고    scopus 로고
    • a) D. Xu, C. J. Tsai, R. Nussinov, Folding Des. 1998, 3, R71-R80; b) C. J. Tsai, S. Kumar, B. Ma, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1181-1190; c) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 1999, 12, 713-720; d) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, H. Wolfson, R. Nussinov, Cell Biochem. Biophys. 1999, 31, 141-164; e) C. J. Tsai, B. Ma, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 9970-9972; f) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, N. Sinha, R. Nussinov, Protein Sci. 2000, 9, 10-19; g) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, Z. Hu, R. Nussinov, J. Theor. Biol. 2000, 203, 383-387; h) N. Sinha, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 3139-3144.
    • (2000) J. Theor. Biol. , vol.203 , pp. 383-387
    • Ma, B.1    Kumar, S.2    Tsai, C.J.3    Hu, Z.4    Nussinov, R.5
  • 46
    • 0035853126 scopus 로고    scopus 로고
    • a) D. Xu, C. J. Tsai, R. Nussinov, Folding Des. 1998, 3, R71-R80; b) C. J. Tsai, S. Kumar, B. Ma, R. Nussinov, Protein Sci. 1999, 8, 1181-1190; c) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 1999, 12, 713-720; d) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, H. Wolfson, R. Nussinov, Cell Biochem. Biophys. 1999, 31, 141-164; e) C. J. Tsai, B. Ma, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 9970-9972; f) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, N. Sinha, R. Nussinov, Protein Sci. 2000, 9, 10-19; g) B. Ma, S. Kumar, C. J. Tsai, Z. Hu, R. Nussinov, J. Theor. Biol. 2000, 203, 383-387; h) N. Sinha, R. Nussinov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 3139-3144.
    • (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.98 , pp. 3139-3144
    • Sinha, N.1    Nussinov, R.2
  • 47
    • 1842405464 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. J. Tsai, S. L. Lin, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 53-64; b) C. J. Tsai, S. L. Lin, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 1996, 31, 127-152; c) C. J. Tsai, S. L. Lin, H. J. Wolfson, R. Nussinov, J. Mol. Biol. 1996, 260, 604-620.
    • (1997) Protein Sci. , vol.6 , pp. 53-64
    • Tsai, C.J.1    Lin, S.L.2    Wolfson, H.J.3    Nussinov, R.4
  • 48
    • 0029988383 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. J. Tsai, S. L. Lin, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 53-64; b) C. J. Tsai, S. L. Lin, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 1996, 31, 127-152; c) C. J. Tsai, S. L. Lin, H. J. Wolfson, R. Nussinov, J. Mol. Biol. 1996, 260, 604-620.
    • (1996) Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. , vol.31 , pp. 127-152
    • Tsai, C.J.1    Lin, S.L.2    Wolfson, H.J.3    Nussinov, R.4
  • 49
    • 0030602896 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. J. Tsai, S. L. Lin, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Protein Sci. 1997, 6, 53-64; b) C. J. Tsai, S. L. Lin, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 1996, 31, 127-152; c) C. J. Tsai, S. L. Lin, H. J. Wolfson, R. Nussinov, J. Mol. Biol. 1996, 260, 604-620.
    • (1996) J. Mol. Biol. , vol.260 , pp. 604-620
    • Tsai, C.J.1    Lin, S.L.2    Wolfson, H.J.3    Nussinov, R.4
  • 50
    • 0031450506 scopus 로고    scopus 로고
    • a) D. Xu, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 1997, 10, 999-1012; b) D. Xu, S. L. Lin, R. Nussinov, J. Mol. Biol. 1997, 265, 68-84.
    • (1997) Protein Eng. , vol.10 , pp. 999-1012
    • Xu, D.1    Tsai, C.J.2    Nussinov, R.3
  • 51
    • 0031561809 scopus 로고    scopus 로고
    • a) D. Xu, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 1997, 10, 999-1012; b) D. Xu, S. L. Lin, R. Nussinov, J. Mol. Biol. 1997, 265, 68-84.
    • (1997) J. Mol. Biol. , vol.265 , pp. 68-84
    • Xu, D.1    Lin, S.L.2    Nussinov, R.3
  • 52
    • 0028916599 scopus 로고
    • a) T. Clackson, J. A. Wells, Science 1995, 267, 383-386; b) A. A. Bogan, K. S. Thorn, J. Mol. Biol. 1998, 280, 1-9; c) Z. Hu, B. Ma, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 331-342; d) B. Ma, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 364-369.
    • (1995) Science , vol.267 , pp. 383-386
    • Clackson, T.1    Wells, J.A.2
  • 53
    • 0032479179 scopus 로고    scopus 로고
    • a) T. Clackson, J. A. Wells, Science 1995, 267, 383-386; b) A. A. Bogan, K. S. Thorn, J. Mol. Biol. 1998, 280, 1-9; c) Z. Hu, B. Ma, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 331-342; d) B. Ma, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 364-369.
    • (1998) J. Mol. Biol. , vol.280 , pp. 1-9
    • Bogan, A.A.1    Thorn, K.S.2
  • 54
    • 0034213559 scopus 로고    scopus 로고
    • a) T. Clackson, J. A. Wells, Science 1995, 267, 383-386; b) A. A. Bogan, K. S. Thorn, J. Mol. Biol. 1998, 280, 1-9; c) Z. Hu, B. Ma, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 331-342; d) B. Ma, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 364-369.
    • (2000) Proteins: Struct. Funct. Genet. , vol.39 , pp. 331-342
    • Hu, Z.1    Ma, B.2    Wolfson, H.J.3    Nussinov, R.4
  • 55
    • 0035366379 scopus 로고    scopus 로고
    • a) T. Clackson, J. A. Wells, Science 1995, 267, 383-386; b) A. A. Bogan, K. S. Thorn, J. Mol. Biol. 1998, 280, 1-9; c) Z. Hu, B. Ma, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 331-342; d) B. Ma, H. J. Wolfson, R. Nussinov, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 364-369.
    • (2001) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.11 , pp. 364-369
    • Ma, B.1    Wolfson, H.J.2    Nussinov, R.3
  • 56
    • 0032789936 scopus 로고    scopus 로고
    • a) Z. S. Hendsch, B. Tidor, Protein Sci. 1999, 8, 1381-1392; b) L.-P. Lee, B. Tidor, Protein Sci. 2001, 10, 362-377; c) A. J. McCoy, V. C. Epa, P. M. Colman, J. Mol. Biol. 1997, 268, 570-S84; d) M. Vijaykumar, K.-Y. Wong, G. Schreiber, A. R. Fersht, A. Szabo, H.-X. Zhou, J. Mol. Biol. 1998, 278, 1015-1024; e) F. B. Sheinerman, R. Norel, B. Honig, Curr. Opin. Struct. Biol. 2000, 10, 153-159.
    • (1999) Protein Sci. , vol.8 , pp. 1381-1392
    • Hendsch, Z.S.1    Tidor, B.2
  • 57
    • 0035107570 scopus 로고    scopus 로고
    • a) Z. S. Hendsch, B. Tidor, Protein Sci. 1999, 8, 1381-1392; b) L.-P. Lee, B. Tidor, Protein Sci. 2001, 10, 362-377; c) A. J. McCoy, V. C. Epa, P. M. Colman, J. Mol. Biol. 1997, 268, 570-S84; d) M. Vijaykumar, K.-Y. Wong, G. Schreiber, A. R. Fersht, A. Szabo, H.-X. Zhou, J. Mol. Biol. 1998, 278, 1015-1024; e) F. B. Sheinerman, R. Norel, B. Honig, Curr. Opin. Struct. Biol. 2000, 10, 153-159.
    • (2001) Protein Sci. , vol.10 , pp. 362-377
    • Lee, L.-P.1    Tidor, B.2
  • 58
    • 0031547966 scopus 로고    scopus 로고
    • a) Z. S. Hendsch, B. Tidor, Protein Sci. 1999, 8, 1381-1392; b) L.-P. Lee, B. Tidor, Protein Sci. 2001, 10, 362-377; c) A. J. McCoy, V. C. Epa, P. M. Colman, J. Mol. Biol. 1997, 268, 570-S84; d) M. Vijaykumar, K.-Y. Wong, G. Schreiber, A. R. Fersht, A. Szabo, H.-X. Zhou, J. Mol. Biol. 1998, 278, 1015-1024; e) F. B. Sheinerman, R. Norel, B. Honig, Curr. Opin. Struct. Biol. 2000, 10, 153-159.
    • (1997) J. Mol. Biol. , vol.268 , pp. 570-584
    • McCoy, A.J.1    Epa, V.C.2    Colman, P.M.3
  • 59
    • 0032557503 scopus 로고    scopus 로고
    • a) Z. S. Hendsch, B. Tidor, Protein Sci. 1999, 8, 1381-1392; b) L.-P. Lee, B. Tidor, Protein Sci. 2001, 10, 362-377; c) A. J. McCoy, V. C. Epa, P. M. Colman, J. Mol. Biol. 1997, 268, 570-S84; d) M. Vijaykumar, K.-Y. Wong, G. Schreiber, A. R. Fersht, A. Szabo, H.-X. Zhou, J. Mol. Biol. 1998, 278, 1015-1024; e) F. B. Sheinerman, R. Norel, B. Honig, Curr. Opin. Struct. Biol. 2000, 10, 153-159.
    • (1998) J. Mol. Biol. , vol.278 , pp. 1015-1024
    • Vijaykumar, M.1    Wong, K.-Y.2    Schreiber, G.3    Fersht, A.R.4    Szabo, A.5    Zhou, H.-X.6
  • 60
    • 0034039797 scopus 로고    scopus 로고
    • a) Z. S. Hendsch, B. Tidor, Protein Sci. 1999, 8, 1381-1392; b) L.-P. Lee, B. Tidor, Protein Sci. 2001, 10, 362-377; c) A. J. McCoy, V. C. Epa, P. M. Colman, J. Mol. Biol. 1997, 268, 570-S84; d) M. Vijaykumar, K.-Y. Wong, G. Schreiber, A. R. Fersht, A. Szabo, H.-X. Zhou, J. Mol. Biol. 1998, 278, 1015-1024; e) F. B. Sheinerman, R. Norel, B. Honig, Curr. Opin. Struct. Biol. 2000, 10, 153-159.
    • (2000) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.10 , pp. 153-159
    • Sheinerman, F.B.1    Norel, R.2    Honig, B.3
  • 62
    • 0034769223 scopus 로고    scopus 로고
    • a) J. G. Mandell, V. A. Roberts, M. E. Pique, V. Kotlovyi, J. C. Mitchell, E. Nelson, I. Tsigelny, L. F. Ten Eyck, Protein Eng. 2001, 14, 105-113; b) R. Norel, F. Sheinerman, D. Petrey, B. Honig, Protein Sci. 2001, 10, 2147-2161.
    • (2001) Protein Sci. , vol.10 , pp. 2147-2161
    • Norel, R.1    Sheinerman, F.2    Petrey, D.3    Honig, B.4
  • 63
  • 66
    • 0029094684 scopus 로고
    • a) E. M. Storch, V. Daggett, Biochemistry 1995, 34, 9682-9693; b) E. M. Storch, V. Daggett, Biochemistry 1996, 35, 11596-11604; c) E. M. Storch, V. Daggett, W.M. Atkins, Biochemistry 1999, 38, 5054-5064; d) E. M. Storch, J. S. Grinstead, A. P. Campbell, V. Daggett, W. M. Atkins, Biochemistry 1999, 38, 5065-5075.
    • (1995) Biochemistry , vol.34 , pp. 9682-9693
    • Storch, E.M.1    Daggett, V.2
  • 67
    • 0029811571 scopus 로고    scopus 로고
    • a) E. M. Storch, V. Daggett, Biochemistry 1995, 34, 9682-9693; b) E. M. Storch, V. Daggett, Biochemistry 1996, 35, 11596-11604; c) E. M. Storch, V. Daggett, W.M. Atkins, Biochemistry 1999, 38, 5054-5064; d) E. M. Storch, J. S. Grinstead, A. P. Campbell, V. Daggett, W. M. Atkins, Biochemistry 1999, 38, 5065-5075.
    • (1996) Biochemistry , vol.35 , pp. 11596-11604
    • Storch, E.M.1    Daggett, V.2
  • 68
    • 0033586716 scopus 로고    scopus 로고
    • a) E. M. Storch, V. Daggett, Biochemistry 1995, 34, 9682-9693; b) E. M. Storch, V. Daggett, Biochemistry 1996, 35, 11596-11604; c) E. M. Storch, V. Daggett, W.M. Atkins, Biochemistry 1999, 38, 5054-5064; d) E. M. Storch, J. S. Grinstead, A. P. Campbell, V. Daggett, W. M. Atkins, Biochemistry 1999, 38, 5065-5075.
    • (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 5054-5064
    • Storch, E.M.1    Daggett, V.2    Atkins, W.M.3
  • 69
    • 0033586730 scopus 로고    scopus 로고
    • a) E. M. Storch, V. Daggett, Biochemistry 1995, 34, 9682-9693; b) E. M. Storch, V. Daggett, Biochemistry 1996, 35, 11596-11604; c) E. M. Storch, V. Daggett, W.M. Atkins, Biochemistry 1999, 38, 5054-5064; d) E. M. Storch, J. S. Grinstead, A. P. Campbell, V. Daggett, W. M. Atkins, Biochemistry 1999, 38, 5065-5075.
    • (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 5065-5075
    • Storch, E.M.1    Grinstead, J.S.2    Campbell, A.P.3    Daggett, V.4    Atkins, W.M.5
  • 70
    • 84892166712 scopus 로고
    • a) E. Fischer, Ber. Dtsch. Chem. Ges. 1894, 27, 2985-2991; b) D. E. Koshland, Jr., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1958, 44, 98-123.
    • (1894) Ber. Dtsch. Chem. Ges. , vol.27 , pp. 2985-2991
    • Fischer, E.1
  • 72
    • 0035933729 scopus 로고    scopus 로고
    • a) M. Shiroishi, A. Yokata, K. Tsumoto, H. Kondo, Y. Nishimiya, K. Horii, M. Matsushima, K. Ogasahara, K. Yutani, I. Kumagai, J. Biol. Chem. 2001, 276, 23042-23050; b) S.J. Smith-Gill, T. B. Lavoie, C. R. Mainhart, J. Immunol. 1984, 133, 384-393; c) L. N. W. Kam-Morgan, S. J. Smith-Gill, M. G. Taylor, L. Zhang, A. C. Wilson, J. F. Kirsch, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 90, 3958-3962; d) E. A. Padlan, E. W. Silverton, S. Sheriff, G. H. Cohen, S. J. Smith-Gill, D. R. Davies, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989, 86, 5938-5942.
    • (2001) J. Biol. Chem. , vol.276 , pp. 23042-23050
    • Shiroishi, M.1    Yokata, A.2    Tsumoto, K.3    Kondo, H.4    Nishimiya, Y.5    Horii, K.6    Matsushima, M.7    Ogasahara, K.8    Yutani, K.9    Kumagai, I.10
  • 73
    • 0021238906 scopus 로고
    • a) M. Shiroishi, A. Yokata, K. Tsumoto, H. Kondo, Y. Nishimiya, K. Horii, M. Matsushima, K. Ogasahara, K. Yutani, I. Kumagai, J. Biol. Chem. 2001, 276, 23042-23050; b) S.J. Smith-Gill, T. B. Lavoie, C. R. Mainhart, J. Immunol. 1984, 133, 384-393; c) L. N. W. Kam-Morgan, S. J. Smith-Gill, M. G. Taylor, L. Zhang, A. C. Wilson, J. F. Kirsch, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 90, 3958-3962; d) E. A. Padlan, E. W. Silverton, S. Sheriff, G. H. Cohen, S. J. Smith-Gill, D. R. Davies, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989, 86, 5938-5942.
    • (1984) J. Immunol. , vol.133 , pp. 384-393
    • Smith-Gill, S.J.1    Lavoie, T.B.2    Mainhart, C.R.3
  • 74
    • 0027153296 scopus 로고
    • a) M. Shiroishi, A. Yokata, K. Tsumoto, H. Kondo, Y. Nishimiya, K. Horii, M. Matsushima, K. Ogasahara, K. Yutani, I. Kumagai, J. Biol. Chem. 2001, 276, 23042-23050; b) S.J. Smith-Gill, T. B. Lavoie, C. R. Mainhart, J. Immunol. 1984, 133, 384-393; c) L. N. W. Kam-Morgan, S. J. Smith-Gill, M. G. Taylor, L. Zhang, A. C. Wilson, J. F. Kirsch, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 90, 3958-3962; d) E. A. Padlan, E. W. Silverton, S. Sheriff, G. H. Cohen, S. J. Smith-Gill, D. R. Davies, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989, 86, 5938-5942.
    • (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.90 , pp. 3958-3962
    • Kam-Morgan, L.N.W.1    Smith-Gill, S.J.2    Taylor, M.G.3    Zhang, L.4    Wilson, A.C.5    Kirsch, J.F.6
  • 75
    • 0343055582 scopus 로고
    • a) M. Shiroishi, A. Yokata, K. Tsumoto, H. Kondo, Y. Nishimiya, K. Horii, M. Matsushima, K. Ogasahara, K. Yutani, I. Kumagai, J. Biol. Chem. 2001, 276, 23042-23050; b) S.J. Smith-Gill, T. B. Lavoie, C. R. Mainhart, J. Immunol. 1984, 133, 384-393; c) L. N. W. Kam-Morgan, S. J. Smith-Gill, M. G. Taylor, L. Zhang, A. C. Wilson, J. F. Kirsch, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 90, 3958-3962; d) E. A. Padlan, E. W. Silverton, S. Sheriff, G. H. Cohen, S. J. Smith-Gill, D. R. Davies, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989, 86, 5938-5942.
    • (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.86 , pp. 5938-5942
    • Padlan, E.A.1    Silverton, E.W.2    Sheriff, S.3    Cohen, G.H.4    Smith-Gill, S.J.5    Davies, D.R.6
  • 78
    • 0034017055 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 2000, 13, 3, 179-191; b) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 38, 4, 368-383; c) S. Kumar, R. Nussinov, Cell. Mol. Life Sci. 2001, 58, 9, 1216-1233; d) S. Kumar, R. Nussinov, unpublished results.
    • (2000) Protein Eng. , vol.13 , Issue.3 , pp. 179-191
    • Kumar, S.1    Tsai, C.J.2    Nussinov, R.3
  • 79
    • 0033994586 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 2000, 13, 3, 179-191; b) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 38, 4, 368-383; c) S. Kumar, R. Nussinov, Cell. Mol. Life Sci. 2001, 58, 9, 1216-1233; d) S. Kumar, R. Nussinov, unpublished results.
    • (2000) Proteins: Struct. Funct. Genet. , vol.38 , Issue.4 , pp. 368-383
    • Kumar, S.1    Ma, B.2    Tsai, C.J.3    Nussinov, R.4
  • 80
    • 0034855858 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 2000, 13, 3, 179-191; b) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 38, 4, 368-383; c) S. Kumar, R. Nussinov, Cell. Mol. Life Sci. 2001, 58, 9, 1216-1233; d) S. Kumar, R. Nussinov, unpublished results.
    • (2001) Cell. Mol. Life Sci. , vol.58 , Issue.9 , pp. 1216-1233
    • Kumar, S.1    Nussinov, R.2
  • 81
    • 0034017055 scopus 로고    scopus 로고
    • unpublished results
    • a) S. Kumar, C. J. Tsai, R. Nussinov, Protein Eng. 2000, 13, 3, 179-191; b) S. Kumar, B. Ma, C. J. Tsai, R. Nussinov, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 38, 4, 368-383; c) S. Kumar, R. Nussinov, Cell. Mol. Life Sci. 2001, 58, 9, 1216-1233; d) S. Kumar, R. Nussinov, unpublished results.
    • Kumar, S.1    Nussinov, R.2
  • 82
    • 0032054517 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Warshel, A. Papazyan, Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 211-217; b) D. J. Tobias, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 253-261; c) T. Simonson, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 243-252; d) Y.Y. Sham, I. Muegge, A. Warshel, Biophys. J. 1998, 74, 1744-1753.
    • (1998) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.8 , pp. 211-217
    • Warshel, A.1    Papazyan, A.2
  • 83
    • 0035312897 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Warshel, A. Papazyan, Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 211-217; b) D. J. Tobias, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 253-261; c) T. Simonson, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 243-252; d) Y.Y. Sham, I. Muegge, A. Warshel, Biophys. J. 1998, 74, 1744-1753.
    • (2001) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.11 , pp. 253-261
    • Tobias, D.J.1
  • 84
    • 0035312551 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Warshel, A. Papazyan, Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 211-217; b) D. J. Tobias, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 253-261; c) T. Simonson, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 243-252; d) Y.Y. Sham, I. Muegge, A. Warshel, Biophys. J. 1998, 74, 1744-1753.
    • (2001) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.11 , pp. 243-252
    • Simonson, T.1
  • 85
    • 0010624785 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Warshel, A. Papazyan, Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 211-217; b) D. J. Tobias, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 253-261; c) T. Simonson, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 243-252; d) Y.Y. Sham, I. Muegge, A. Warshel, Biophys. J. 1998, 74, 1744-1753.
    • (1998) Biophys. J. , vol.74 , pp. 1744-1753
    • Sham, Y.Y.1    Muegge, I.2    Warshel, A.3
  • 86
    • 0002446568 scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393 -407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1989) Chem. Scr. , vol.29 A , pp. 75-83
    • Warshel, A.1    Aqvist, J.2
  • 87
    • 0025891413 scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393 -407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1991) Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. , vol.20 , pp. 267-298
    • Warshel, A.1    Aqvist, J.2
  • 88
    • 0346496058 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393 -407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1996) Struct. Chem. , vol.7 , pp. 131-138
    • Madura, J.D.1    Nakajima, Y.2    Hamilton, R.M.3    Wierzbicki, A.4    Warshel, A.5
  • 89
    • 0026596911 scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393 -407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1992) Protein Eng. , vol.5 , pp. 215-228
    • Lee, F.S.1    Chu, Z.-T.2    Bolger, M.B.3    Warshel, A.4
  • 90
    • 0342321950 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393 -407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (2000) Proteins: Struct. Funct. Genet. , vol.39 , pp. 393-407
    • Sham, Y.Y.1    Chu, Z.T.2    Tao, H.3    Warshel, A.4
  • 91
    • 0000728542 scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393-407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1993) J. Comp. Chem. , vol.14 , pp. 161-185
    • Lee, F.S.1    Chu, Z.T.2    Warshel, A.3
  • 92
    • 0031404601 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393-407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1997) Protein Eng. , vol.10 , pp. 1363-1372
    • Muegge, I.1    Tao, H.2    Warshel, A.3
  • 93
    • 0032031405 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393-407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1998) Proteins: Struct. Funct. Genet. , vol.30 , pp. 407-423
    • Muegge, I.1    Schweins, T.2    Warshel, A.3
  • 94
    • 22844456329 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393-407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1999) Theor. Chem. Acc. , vol.103 , pp. 77-80
    • Fan, Z.Z.1    Hwang, J.K.2    Warshel, A.3
  • 95
    • 0035451052 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393-407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (2001) Proteins: Struct. Funct. Genet. , pp. 400-417
    • Schutz, C.N.1    Warshel, A.2
  • 96
    • 0021476470 scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393-407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1984) Q. Rev. Biophys. , vol.17 , pp. 283-421
    • Warshel, A.1    Russell, S.T.2
  • 97
    • 0019889036 scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393-407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1981) Biochemistry , vol.20 , pp. 3167-3177
    • Warshel, A.1
  • 98
    • 0021480222 scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393-407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.81 , pp. 4785-4789
    • Warshel, A.1    Russell, S.T.2    Churg, A.K.3
  • 99
    • 0024293878 scopus 로고
    • a) A. Warshel, J. Aqvist, Chem. Scr. 1989, 29A, 75-83; b) A. Warshel, J. Aqvist, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 267-298; c) J. D. Madura, Y. Nakajima, R.M. Hamilton, A. Wierzbicki, A. Warshel, Struct. Chem. 1996, 7, 131-138; d) F. S. Lee, Z.-T. Chu, M. B. Bolger, A. Warshel, Protein Eng. 1992, 5, 215-228; e) Y. Y. Sham, Z. T. Chu, H. Tao, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2000, 39, 393-407; f) F. S. Lee, Z. T. Chu, A. Warshel, J. Comp. Chem. 1993, 14, 161-185; g) I. Muegge, H. Tao, A. Warshel, Protein Eng. 1997, 10, 1363-1372; h) I. Muegge, T. Schweins, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 30, 407-423; i) Z. Z. Fan, J. K. Hwang, A. Warshel, Theor. Chem. Acc. 1999, 103, 77-80; j) C. N. Schutz, A. Warshel, Proteins: Struct. Funct. Genet. 2001, 400-417; k) A. Warshel, S. T. Russell, Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283-421; l) A. Warshel, Biochemistry 1981, 20, 3167-3177; m) A. Warshel, S. T. Russell, A. K. Churg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 4785-4789; n) J. K. Hwang, A. Warshel, Nature 1988, 334, 270-272.
    • (1988) Nature , vol.334 , pp. 270-272
    • Hwang, J.K.1    Warshel, A.2
  • 100
    • 0031779284 scopus 로고    scopus 로고
    • a) R. Luo, M. S. Head, J. Moult, M. K. Gilson, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6138-6146; b) J. Antosiewicz, J. A. McCammon, M. K. Gilson, Biochemistry 1996, 35, 7819-7833; c) A. H. Elcock, J. A. McCammon, J. Mol. Biol. 1998, 280, 731-748; d) P. H. Hunenberger, V. Helms, N. Narayana, S. S. Taylor, J.A. McCammon, Biochemistry 1999, 38, 2358-2366; e)J. Lamotte-Brasseur, A. Dubus, R. C. Wade, Proteins 2000, 40, 23-28; f) N. Froloff, A. Windemuth, B. Honig, Protein Sci. 1997, 6, 1293-1301; g) C. J. Gibas, P. Jambeck, S. Subramaniam, Methods (San Diego) 2000, 20, 292-309; h) E. G. Alexov, M. R. Gunner, Biophys. J. 1997, 74, 2075-2093; i) E.G. Alexov, M. R. Gunner, Biochemistry 1999, 38, 8253-8270.
    • (1998) J. Am. Chem. Soc. , vol.120 , pp. 6138-6146
    • Luo, R.1    Head, M.S.2    Moult, J.3    Gilson, M.K.4
  • 101
    • 0029665693 scopus 로고    scopus 로고
    • a) R. Luo, M. S. Head, J. Moult, M. K. Gilson, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6138-6146; b) J. Antosiewicz, J. A. McCammon, M. K. Gilson, Biochemistry 1996, 35, 7819-7833; c) A. H. Elcock, J. A. McCammon, J. Mol. Biol. 1998, 280, 731-748; d) P. H. Hunenberger, V. Helms, N. Narayana, S. S. Taylor, J.A. McCammon, Biochemistry 1999, 38, 2358-2366; e)J. Lamotte-Brasseur, A. Dubus, R. C. Wade, Proteins 2000, 40, 23-28; f) N. Froloff, A. Windemuth, B. Honig, Protein Sci. 1997, 6, 1293-1301; g) C. J. Gibas, P. Jambeck, S. Subramaniam, Methods (San Diego) 2000, 20, 292-309; h) E. G. Alexov, M. R. Gunner, Biophys. J. 1997, 74, 2075-2093; i) E.G. Alexov, M. R. Gunner, Biochemistry 1999, 38, 8253-8270.
    • (1996) Biochemistry , vol.35 , pp. 7819-7833
    • Antosiewicz, J.1    McCammon, J.A.2    Gilson, M.K.3
  • 102
    • 0032563113 scopus 로고    scopus 로고
    • a) R. Luo, M. S. Head, J. Moult, M. K. Gilson, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6138-6146; b) J. Antosiewicz, J. A. McCammon, M. K. Gilson, Biochemistry 1996, 35, 7819-7833; c) A. H. Elcock, J. A. McCammon, J. Mol. Biol. 1998, 280, 731-748; d) P. H. Hunenberger, V. Helms, N. Narayana, S. S. Taylor, J.A. McCammon, Biochemistry 1999, 38, 2358-2366; e)J. Lamotte-Brasseur, A. Dubus, R. C. Wade, Proteins 2000, 40, 23-28; f) N. Froloff, A. Windemuth, B. Honig, Protein Sci. 1997, 6, 1293-1301; g) C. J. Gibas, P. Jambeck, S. Subramaniam, Methods (San Diego) 2000, 20, 292-309; h) E. G. Alexov, M. R. Gunner, Biophys. J. 1997, 74, 2075-2093; i) E.G. Alexov, M. R. Gunner, Biochemistry 1999, 38, 8253-8270.
    • (1998) J. Mol. Biol. , vol.280 , pp. 731-748
    • Elcock, A.H.1    McCammon, J.A.2
  • 103
    • 0038833031 scopus 로고    scopus 로고
    • a) R. Luo, M. S. Head, J. Moult, M. K. Gilson, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6138-6146; b) J. Antosiewicz, J. A. McCammon, M. K. Gilson, Biochemistry 1996, 35, 7819-7833; c) A. H. Elcock, J. A. McCammon, J. Mol. Biol. 1998, 280, 731-748; d) P. H. Hunenberger, V. Helms, N. Narayana, S. S. Taylor, J.A. McCammon, Biochemistry 1999, 38, 2358-2366; e)J. Lamotte-Brasseur, A. Dubus, R. C. Wade, Proteins 2000, 40, 23-28; f) N. Froloff, A. Windemuth, B. Honig, Protein Sci. 1997, 6, 1293-1301; g) C. J. Gibas, P. Jambeck, S. Subramaniam, Methods (San Diego) 2000, 20, 292-309; h) E. G. Alexov, M. R. Gunner, Biophys. J. 1997, 74, 2075-2093; i) E.G. Alexov, M. R. Gunner, Biochemistry 1999, 38, 8253-8270.
    • (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 2358-2366
    • Hunenberger, P.H.1    Helms, V.2    Narayana, N.3    Taylor, S.S.4    McCammon, J.A.5
  • 104
    • 0034237282 scopus 로고    scopus 로고
    • a) R. Luo, M. S. Head, J. Moult, M. K. Gilson, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6138-6146; b) J. Antosiewicz, J. A. McCammon, M. K. Gilson, Biochemistry 1996, 35, 7819-7833; c) A. H. Elcock, J. A. McCammon, J. Mol. Biol. 1998, 280, 731-748; d) P. H. Hunenberger, V. Helms, N. Narayana, S. S. Taylor, J.A. McCammon, Biochemistry 1999, 38, 2358-2366; e)J. Lamotte-Brasseur, A. Dubus, R. C. Wade, Proteins 2000, 40, 23-28; f) N. Froloff, A. Windemuth, B. Honig, Protein Sci. 1997, 6, 1293-1301; g) C. J. Gibas, P. Jambeck, S. Subramaniam, Methods (San Diego) 2000, 20, 292-309; h) E. G. Alexov, M. R. Gunner, Biophys. J. 1997, 74, 2075-2093; i) E.G. Alexov, M. R. Gunner, Biochemistry 1999, 38, 8253-8270.
    • (2000) Proteins , vol.40 , pp. 23-28
    • Lamotte-Brasseur, J.1    Dubus, A.2    Wade, R.C.3
  • 105
    • 0031008575 scopus 로고    scopus 로고
    • a) R. Luo, M. S. Head, J. Moult, M. K. Gilson, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6138-6146; b) J. Antosiewicz, J. A. McCammon, M. K. Gilson, Biochemistry 1996, 35, 7819-7833; c) A. H. Elcock, J. A. McCammon, J. Mol. Biol. 1998, 280, 731-748; d) P. H. Hunenberger, V. Helms, N. Narayana, S. S. Taylor, J.A. McCammon, Biochemistry 1999, 38, 2358-2366; e)J. Lamotte-Brasseur, A. Dubus, R. C. Wade, Proteins 2000, 40, 23-28; f) N. Froloff, A. Windemuth, B. Honig, Protein Sci. 1997, 6, 1293-1301; g) C. J. Gibas, P. Jambeck, S. Subramaniam, Methods (San Diego) 2000, 20, 292-309; h) E. G. Alexov, M. R. Gunner, Biophys. J. 1997, 74, 2075-2093; i) E.G. Alexov, M. R. Gunner, Biochemistry 1999, 38, 8253-8270.
    • (1997) Protein Sci. , vol.6 , pp. 1293-1301
    • Froloff, N.1    Windemuth, A.2    Honig, B.3
  • 106
    • 0034426864 scopus 로고    scopus 로고
    • a) R. Luo, M. S. Head, J. Moult, M. K. Gilson, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6138-6146; b) J. Antosiewicz, J. A. McCammon, M. K. Gilson, Biochemistry 1996, 35, 7819-7833; c) A. H. Elcock, J. A. McCammon, J. Mol. Biol. 1998, 280, 731-748; d) P. H. Hunenberger, V. Helms, N. Narayana, S. S. Taylor, J.A. McCammon, Biochemistry 1999, 38, 2358-2366; e)J. Lamotte-Brasseur, A. Dubus, R. C. Wade, Proteins 2000, 40, 23-28; f) N. Froloff, A. Windemuth, B. Honig, Protein Sci. 1997, 6, 1293-1301; g) C. J. Gibas, P. Jambeck, S. Subramaniam, Methods (San Diego) 2000, 20, 292-309; h) E. G. Alexov, M. R. Gunner, Biophys. J. 1997, 74, 2075-2093; i) E.G. Alexov, M. R. Gunner, Biochemistry 1999, 38, 8253-8270.
    • (2000) Methods (San Diego) , vol.20 , pp. 292-309
    • Gibas, C.J.1    Jambeck, P.2    Subramaniam, S.3
  • 107
    • 0030945495 scopus 로고    scopus 로고
    • a) R. Luo, M. S. Head, J. Moult, M. K. Gilson, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6138-6146; b) J. Antosiewicz, J. A. McCammon, M. K. Gilson, Biochemistry 1996, 35, 7819-7833; c) A. H. Elcock, J. A. McCammon, J. Mol. Biol. 1998, 280, 731-748; d) P. H. Hunenberger, V. Helms, N. Narayana, S. S. Taylor, J.A. McCammon, Biochemistry 1999, 38, 2358-2366; e)J. Lamotte-Brasseur, A. Dubus, R. C. Wade, Proteins 2000, 40, 23-28; f) N. Froloff, A. Windemuth, B. Honig, Protein Sci. 1997, 6, 1293-1301; g) C. J. Gibas, P. Jambeck, S. Subramaniam, Methods (San Diego) 2000, 20, 292-309; h) E. G. Alexov, M. R. Gunner, Biophys. J. 1997, 74, 2075-2093; i) E.G. Alexov, M. R. Gunner, Biochemistry 1999, 38, 8253-8270.
    • (1997) Biophys. J. , vol.74 , pp. 2075-2093
    • Alexov, E.G.1    Gunner, M.R.2
  • 108
    • 0033614791 scopus 로고    scopus 로고
    • a) R. Luo, M. S. Head, J. Moult, M. K. Gilson, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6138-6146; b) J. Antosiewicz, J. A. McCammon, M. K. Gilson, Biochemistry 1996, 35, 7819-7833; c) A. H. Elcock, J. A. McCammon, J. Mol. Biol. 1998, 280, 731-748; d) P. H. Hunenberger, V. Helms, N. Narayana, S. S. Taylor, J.A. McCammon, Biochemistry 1999, 38, 2358-2366; e)J. Lamotte-Brasseur, A. Dubus, R. C. Wade, Proteins 2000, 40, 23-28; f) N. Froloff, A. Windemuth, B. Honig, Protein Sci. 1997, 6, 1293-1301; g) C. J. Gibas, P. Jambeck, S. Subramaniam, Methods (San Diego) 2000, 20, 292-309; h) E. G. Alexov, M. R. Gunner, Biophys. J. 1997, 74, 2075-2093; i) E.G. Alexov, M. R. Gunner, Biochemistry 1999, 38, 8253-8270.
    • (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 8253-8270
    • Alexov, E.G.1    Gunner, M.R.2
  • 111
    • 0026587310 scopus 로고
    • a) A. Horovitz, A.R. Fersht, J. Mol. Biol. 1992, 224, 733-740; b) S. Marqusee, R. T. Sauer, Protein Sci. 1994, 3, 2217-2225; c) K. Pervushin, M. Billeter, G. Siegal, K. Wüthrich, J. Mol. Biol. 1996, 264, 1002-1012; d) L. Xiao, B. Honig, J. Mol. Biol. 1999, 289, 1435-1444; e) S. Dao-Pin, U. Sauer, H. Nicholson, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 7142-7153; f) S. Dao-Pin, D. E. Anderson, W. A. Baase, F. W. Dahlquist, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 11521-11529; g) C. D. Waldburger, J. F. Schildbach, R. T. Sauer, Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 122-128; h) B. H. Honig, W. L. Hubell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 5412-5416.
    • (1992) J. Mol. Biol. , vol.224 , pp. 733-740
    • Horovitz, A.1    Fersht, A.R.2
  • 112
    • 0028574137 scopus 로고
    • a) A. Horovitz, A.R. Fersht, J. Mol. Biol. 1992, 224, 733-740; b) S. Marqusee, R. T. Sauer, Protein Sci. 1994, 3, 2217-2225; c) K. Pervushin, M. Billeter, G. Siegal, K. Wüthrich, J. Mol. Biol. 1996, 264, 1002-1012; d) L. Xiao, B. Honig, J. Mol. Biol. 1999, 289, 1435-1444; e) S. Dao-Pin, U. Sauer, H. Nicholson, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 7142-7153; f) S. Dao-Pin, D. E. Anderson, W. A. Baase, F. W. Dahlquist, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 11521-11529; g) C. D. Waldburger, J. F. Schildbach, R. T. Sauer, Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 122-128; h) B. H. Honig, W. L. Hubell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 5412-5416.
    • (1994) Protein Sci. , vol.3 , pp. 2217-2225
    • Marqusee, S.1    Sauer, R.T.2
  • 113
    • 0030596082 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Horovitz, A.R. Fersht, J. Mol. Biol. 1992, 224, 733-740; b) S. Marqusee, R. T. Sauer, Protein Sci. 1994, 3, 2217-2225; c) K. Pervushin, M. Billeter, G. Siegal, K. Wüthrich, J. Mol. Biol. 1996, 264, 1002-1012; d) L. Xiao, B. Honig, J. Mol. Biol. 1999, 289, 1435-1444; e) S. Dao-Pin, U. Sauer, H. Nicholson, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 7142-7153; f) S. Dao-Pin, D. E. Anderson, W. A. Baase, F. W. Dahlquist, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 11521-11529; g) C. D. Waldburger, J. F. Schildbach, R. T. Sauer, Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 122-128; h) B. H. Honig, W. L. Hubell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 5412-5416.
    • (1996) J. Mol. Biol. , vol.264 , pp. 1002-1012
    • Pervushin, K.1    Billeter, M.2    Siegal, G.3    Wüthrich, K.4
  • 114
    • 0033603392 scopus 로고    scopus 로고
    • a) A. Horovitz, A.R. Fersht, J. Mol. Biol. 1992, 224, 733-740; b) S. Marqusee, R. T. Sauer, Protein Sci. 1994, 3, 2217-2225; c) K. Pervushin, M. Billeter, G. Siegal, K. Wüthrich, J. Mol. Biol. 1996, 264, 1002-1012; d) L. Xiao, B. Honig, J. Mol. Biol. 1999, 289, 1435-1444; e) S. Dao-Pin, U. Sauer, H. Nicholson, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 7142-7153; f) S. Dao-Pin, D. E. Anderson, W. A. Baase, F. W. Dahlquist, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 11521-11529; g) C. D. Waldburger, J. F. Schildbach, R. T. Sauer, Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 122-128; h) B. H. Honig, W. L. Hubell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 5412-5416.
    • (1999) J. Mol. Biol. , vol.289 , pp. 1435-1444
    • Xiao, L.1    Honig, B.2
  • 115
    • 0025718955 scopus 로고
    • a) A. Horovitz, A.R. Fersht, J. Mol. Biol. 1992, 224, 733-740; b) S. Marqusee, R. T. Sauer, Protein Sci. 1994, 3, 2217-2225; c) K. Pervushin, M. Billeter, G. Siegal, K. Wüthrich, J. Mol. Biol. 1996, 264, 1002-1012; d) L. Xiao, B. Honig, J. Mol. Biol. 1999, 289, 1435-1444; e) S. Dao-Pin, U. Sauer, H. Nicholson, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 7142-7153; f) S. Dao-Pin, D. E. Anderson, W. A. Baase, F. W. Dahlquist, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 11521-11529; g) C. D. Waldburger, J. F. Schildbach, R. T. Sauer, Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 122-128; h) B. H. Honig, W. L. Hubell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 5412-5416.
    • (1991) Biochemistry , vol.30 , pp. 7142-7153
    • Dao-Pin, S.1    Sauer, U.2    Nicholson, H.3    Matthews, B.W.4
  • 116
    • 0026345864 scopus 로고
    • a) A. Horovitz, A.R. Fersht, J. Mol. Biol. 1992, 224, 733-740; b) S. Marqusee, R. T. Sauer, Protein Sci. 1994, 3, 2217-2225; c) K. Pervushin, M. Billeter, G. Siegal, K. Wüthrich, J. Mol. Biol. 1996, 264, 1002-1012; d) L. Xiao, B. Honig, J. Mol. Biol. 1999, 289, 1435-1444; e) S. Dao-Pin, U. Sauer, H. Nicholson, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 7142-7153; f) S. Dao-Pin, D. E. Anderson, W. A. Baase, F. W. Dahlquist, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 11521-11529; g) C. D. Waldburger, J. F. Schildbach, R. T. Sauer, Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 122-128; h) B. H. Honig, W. L. Hubell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 5412-5416.
    • (1991) Biochemistry , vol.30 , pp. 11521-11529
    • Dao-Pin, S.1    Anderson, D.E.2    Baase, W.A.3    Dahlquist, F.W.4    Matthews, B.W.5
  • 117
    • 0029564595 scopus 로고
    • a) A. Horovitz, A.R. Fersht, J. Mol. Biol. 1992, 224, 733-740; b) S. Marqusee, R. T. Sauer, Protein Sci. 1994, 3, 2217-2225; c) K. Pervushin, M. Billeter, G. Siegal, K. Wüthrich, J. Mol. Biol. 1996, 264, 1002-1012; d) L. Xiao, B. Honig, J. Mol. Biol. 1999, 289, 1435-1444; e) S. Dao-Pin, U. Sauer, H. Nicholson, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 7142-7153; f) S. Dao-Pin, D. E. Anderson, W. A. Baase, F. W. Dahlquist, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 11521-11529; g) C. D. Waldburger, J. F. Schildbach, R. T. Sauer, Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 122-128; h) B. H. Honig, W. L. Hubell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 5412-5416.
    • (1995) Nat. Struct. Biol. , vol.2 , pp. 122-128
    • Waldburger, C.D.1    Schildbach, J.F.2    Sauer, R.T.3
  • 118
    • 0000176654 scopus 로고
    • a) A. Horovitz, A.R. Fersht, J. Mol. Biol. 1992, 224, 733-740; b) S. Marqusee, R. T. Sauer, Protein Sci. 1994, 3, 2217-2225; c) K. Pervushin, M. Billeter, G. Siegal, K. Wüthrich, J. Mol. Biol. 1996, 264, 1002-1012; d) L. Xiao, B. Honig, J. Mol. Biol. 1999, 289, 1435-1444; e) S. Dao-Pin, U. Sauer, H. Nicholson, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 7142-7153; f) S. Dao-Pin, D. E. Anderson, W. A. Baase, F. W. Dahlquist, B. W. Matthews, Biochemistry 1991, 30, 11521-11529; g) C. D. Waldburger, J. F. Schildbach, R. T. Sauer, Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 122-128; h) B. H. Honig, W. L. Hubell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 5412-5416.
    • (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.81 , pp. 5412-5416
    • Honig, B.H.1    Hubell, W.L.2
  • 119
    • 84962348955 scopus 로고    scopus 로고
    • a) X. Barril, C. Aleman, M. Orozco, F. J. Luque, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 32, 67-79; b) U. C. Singh, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1988, 85, 4280-4284; c) L. Serrano, A. Horovitz, B. Avron, M. Bycroft, A. R. Fersht, Biochemistry 1990, 29, 9343-9352; d) E. J. Spek, A. H. Bui, M. Lu, N. R. Kallenbach, Protein Sci. 1998, 7, 2431-2437.
    • (1998) Proteins: Struct. Funct. Genet. , vol.32 , pp. 67-79
    • Barril, X.1    Aleman, C.2    Orozco, M.3    Luque, F.J.4
  • 120
    • 0024026370 scopus 로고
    • a) X. Barril, C. Aleman, M. Orozco, F. J. Luque, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 32, 67-79; b) U. C. Singh, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1988, 85, 4280-4284; c) L. Serrano, A. Horovitz, B. Avron, M. Bycroft, A. R. Fersht, Biochemistry 1990, 29, 9343-9352; d) E. J. Spek, A. H. Bui, M. Lu, N. R. Kallenbach, Protein Sci. 1998, 7, 2431-2437.
    • (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.85 , pp. 4280-4284
    • Singh, U.C.1
  • 121
    • 0025093185 scopus 로고
    • a) X. Barril, C. Aleman, M. Orozco, F. J. Luque, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 32, 67-79; b) U. C. Singh, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1988, 85, 4280-4284; c) L. Serrano, A. Horovitz, B. Avron, M. Bycroft, A. R. Fersht, Biochemistry 1990, 29, 9343-9352; d) E. J. Spek, A. H. Bui, M. Lu, N. R. Kallenbach, Protein Sci. 1998, 7, 2431-2437.
    • (1990) Biochemistry , vol.29 , pp. 9343-9352
    • Serrano, L.1    Horovitz, A.2    Avron, B.3    Bycroft, M.4    Fersht, A.R.5
  • 122
    • 0031764838 scopus 로고    scopus 로고
    • a) X. Barril, C. Aleman, M. Orozco, F. J. Luque, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1998, 32, 67-79; b) U. C. Singh, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1988, 85, 4280-4284; c) L. Serrano, A. Horovitz, B. Avron, M. Bycroft, A. R. Fersht, Biochemistry 1990, 29, 9343-9352; d) E. J. Spek, A. H. Bui, M. Lu, N. R. Kallenbach, Protein Sci. 1998, 7, 2431-2437.
    • (1998) Protein Sci. , vol.7 , pp. 2431-2437
    • Spek, E.J.1    Bui, A.H.2    Lu, M.3    Kallenbach, N.R.4
  • 124
    • 0021813940 scopus 로고
    • a) M. K. Gilson, A. Rashin, R. Fine, B. H. Honig, J. Mol. Biol. 1985, 183, 503-516; b) M. K. Gilson, K. A. Sharp, B. H. Honig, J. Comput. Chem. 1988, 9, 327-335; c) M. K. Gilson, B. H. Honig, Nature 1987, 330, 84-86; d) M. K. Gilson, B. H. Honig, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1988, 4, 7-18; e) K. A. Sharp, B. H. Honig, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1990, 19, 301-332; f) B. H. Honig, K. A. Sharp, A. Yang, J. Phys. Chem. 1993, 97, 1101-1109.
    • (1985) J. Mol. Biol. , vol.183 , pp. 503-516
    • Gilson, M.K.1    Rashin, A.2    Fine, R.3    Honig, B.H.4
  • 125
    • 84988087911 scopus 로고
    • a) M. K. Gilson, A. Rashin, R. Fine, B. H. Honig, J. Mol. Biol. 1985, 183, 503-516; b) M. K. Gilson, K. A. Sharp, B. H. Honig, J. Comput. Chem. 1988, 9, 327-335; c) M. K. Gilson, B. H. Honig, Nature 1987, 330, 84-86; d) M. K. Gilson, B. H. Honig, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1988, 4, 7-18; e) K. A. Sharp, B. H. Honig, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1990, 19, 301-332; f) B. H. Honig, K. A. Sharp, A. Yang, J. Phys. Chem. 1993, 97, 1101-1109.
    • (1988) J. Comput. Chem. , vol.9 , pp. 327-335
    • Gilson, M.K.1    Sharp, K.A.2    Honig, B.H.3
  • 126
    • 0023280069 scopus 로고
    • a) M. K. Gilson, A. Rashin, R. Fine, B. H. Honig, J. Mol. Biol. 1985, 183, 503-516; b) M. K. Gilson, K. A. Sharp, B. H. Honig, J. Comput. Chem.
    • (1987) Nature , vol.330 , pp. 84-86
    • Gilson, M.K.1    Honig, B.H.2
  • 127
    • 0023779259 scopus 로고
    • a) M. K. Gilson, A. Rashin, R. Fine, B. H. Honig, J. Mol. Biol. 1985, 183, 503-516; b) M. K. Gilson, K. A. Sharp, B. H. Honig, J. Comput. Chem. 1988, 9, 327-335; c) M. K. Gilson, B. H. Honig, Nature 1987, 330, 84-86; d) M. K. Gilson, B. H. Honig, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1988, 4, 7-18; e) K. A. Sharp, B. H. Honig, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1990, 19, 301-332; f) B. H. Honig, K. A. Sharp, A. Yang, J. Phys. Chem. 1993, 97, 1101-1109.
    • (1988) Proteins: Struct. Funct. Genet. , vol.4 , pp. 7-18
    • Gilson, M.K.1    Honig, B.H.2
  • 128
    • 0025283002 scopus 로고
    • a) M. K. Gilson, A. Rashin, R. Fine, B. H. Honig, J. Mol. Biol. 1985, 183, 503-516; b) M. K. Gilson, K. A. Sharp, B. H. Honig, J. Comput. Chem. 1988, 9, 327-335; c) M. K. Gilson, B. H. Honig, Nature 1987, 330, 84-86; d) M. K. Gilson, B. H. Honig, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1988, 4, 7-18; e) K. A. Sharp, B. H. Honig, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1990, 19, 301-332; f) B. H. Honig, K. A. Sharp, A. Yang, J. Phys. Chem. 1993, 97, 1101-1109.
    • (1990) Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. , vol.19 , pp. 301-332
    • Sharp, K.A.1    Honig, B.H.2
  • 129
    • 33751385054 scopus 로고
    • a) M. K. Gilson, A. Rashin, R. Fine, B. H. Honig, J. Mol. Biol. 1985, 183, 503-516; b) M. K. Gilson, K. A. Sharp, B. H. Honig, J. Comput. Chem. 1988, 9, 327-335; c) M. K. Gilson, B. H. Honig, Nature 1987, 330, 84-86; d) M. K. Gilson, B. H. Honig, Proteins: Struct. Funct. Genet. 1988, 4, 7-18; e) K. A. Sharp, B. H. Honig, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1990, 19, 301-332; f) B. H. Honig, K. A. Sharp, A. Yang, J. Phys. Chem. 1993, 97, 1101-1109.
    • (1993) J. Phys. Chem. , vol.97 , pp. 1101-1109
    • Honig, B.H.1    Sharp, K.A.2    Yang, A.3
  • 131
    • 33845280446 scopus 로고
    • a) D. Sitkoff, K. A. Sharp, B. H. Honig, J. Phys. Chem. 1994, 98, 1978-1988; b) A. Radzicka, R. Wolfenden, Biochemistry 1988, 27, 1664-1670.
    • (1988) Biochemistry , vol.27 , pp. 1664-1670
    • Radzicka, A.1    Wolfenden, R.2
  • 134
  • 135
    • 0023645203 scopus 로고
    • a) W. C. Wimley, K. Gawrisch, T. P. Creamer, S. H. White, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 2985-2990; b) S. Miller, J. Janin, A. M. Lesk, C. Chothia, J. Mol. Biol. 1987, 196, 641-656; c) D. Eisenberg, A. D. McLachlan, Nature 1986, 319, 199-203.
    • (1987) J. Mol. Biol. , vol.196 , pp. 641-656
    • Miller, S.1    Janin, J.2    Lesk, A.M.3    Chothia, C.4
  • 136
    • 0022596727 scopus 로고
    • a) W. C. Wimley, K. Gawrisch, T. P. Creamer, S. H. White, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 2985-2990; b) S. Miller, J. Janin, A. M. Lesk, C. Chothia, J. Mol. Biol. 1987, 196, 641-656; c) D. Eisenberg, A. D. McLachlan, Nature 1986, 319, 199-203.
    • (1986) Nature , vol.319 , pp. 199-203
    • Eisenberg, D.1    McLachlan, A.D.2
  • 138
    • 0000230329 scopus 로고
    • a) T. Kajander, P. C. Kahn, S. H. Passila, D. C. Cohen, L. Lehtio, W. Adolfsen, J. Warwicker, U. Schell, A. Goldman, Structure 2000, 8, 1203-1214; b) A. Warshel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1978, 75, 5250-5254; c) A. Giletto, C. N. Pace, Biochemistry 1999, 38, 13379-13384.
    • (1978) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.75 , pp. 5250-5254
    • Warshel, A.1
  • 139
    • 0032856161 scopus 로고    scopus 로고
    • a) T. Kajander, P. C. Kahn, S. H. Passila, D. C. Cohen, L. Lehtio, W. Adolfsen, J. Warwicker, U. Schell, A. Goldman, Structure 2000, 8, 1203-1214; b) A. Warshel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1978, 75, 5250-5254; c) A. Giletto, C. N. Pace, Biochemistry 1999, 38, 13379-13384.
    • (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 13379-13384
    • Giletto, A.1    Pace, C.N.2
  • 144
    • 0023442217 scopus 로고
    • a) W. Becktel, J. A. Schellman, Biopolymers 1987, 26, 1859-1877; b) P. L. Privalov, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 1990, 25, 281-305.
    • (1987) Biopolymers , vol.26 , pp. 1859-1877
    • Becktel, W.1    Schellman, J.A.2
  • 147
    • 0034693042 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. Cambillau, J.-M. Claverie, J. Biol. Chem. 2000, 275, 32383-32386; b) S. Chakravarty, R. Varadarajan, FEBS Lett. 2000, 470, 65-69; c) P. J. Haney, J. H. Badger, G. L. Buldak, C. I. Reich, C. R. Woese, G. J. Olsen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 3578-3583.
    • (2000) J. Biol. Chem. , vol.275 , pp. 32383-32386
    • Cambillau, C.1    Claverie, J.-M.2
  • 148
    • 0034677790 scopus 로고    scopus 로고
    • a) C. Cambillau, J.-M. Claverie, J. Biol. Chem. 2000, 275, 32383-32386; b) S. Chakravarty, R. Varadarajan, FEBS Lett. 2000, 470, 65-69; c) P. J. Haney, J. H. Badger, G. L. Buldak, C. I. Reich, C. R. Woese, G. J. Olsen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 3578-3583.
    • (2000) FEBS Lett. , vol.470 , pp. 65-69
    • Chakravarty, S.1    Varadarajan, R.2
  • 150
    • 0034620528 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Spector, M. Wang, S. A. Carp, J. Robblee, Z. S. Hendsch, R. Fairman, B. Tidor, D. P. Raleigh, Biochemistry 2000, 39, 872-879; b) G. R. Grimsley, K. L. Shaw, L. R. Fee, R. W. Alston, B. M. Huyghues-Despointes, R. L. Thurlkil, J. M. Scholtz, C. N. Pace, Protein Sci. 1999, 8, 1843-1849; c) V. V. Loladze, B. Ibarra-olero, J. M. Sanchez-Ruiz, G. I. Makhatadze, Biochemistry 1999, 38, 16419-16423; d) J. M. Sanchez-Ruiz, G. I. I. Makhatadze, Trends Biotechnol. 2001, 19, 132-135.
    • (2000) Biochemistry , vol.39 , pp. 872-879
    • Spector, S.1    Wang, M.2    Carp, S.A.3    Robblee, J.4    Hendsch, Z.S.5    Fairman, R.6    Tidor, B.7    Raleigh, D.P.8
  • 151
    • 0032872888 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Spector, M. Wang, S. A. Carp, J. Robblee, Z. S. Hendsch, R. Fairman, B. Tidor, D. P. Raleigh, Biochemistry 2000, 39, 872-879; b) G. R. Grimsley, K. L. Shaw, L. R. Fee, R. W. Alston, B. M. Huyghues-Despointes, R. L. Thurlkil, J. M. Scholtz, C. N. Pace, Protein Sci. 1999, 8, 1843-1849; c) V. V. Loladze, B. Ibarra-olero, J. M. Sanchez-Ruiz, G. I. Makhatadze, Biochemistry 1999, 38, 16419-16423; d) J. M. Sanchez-Ruiz, G. I. I. Makhatadze, Trends Biotechnol. 2001, 19, 132-135.
    • (1999) Protein Sci. , vol.8 , pp. 1843-1849
    • Grimsley, G.R.1    Shaw, K.L.2    Fee, L.R.3    Alston, R.W.4    Huyghues-Despointes, B.M.5    Thurlkil, R.L.6    Scholtz, J.M.7    Pace, C.N.8
  • 152
    • 0033554840 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Spector, M. Wang, S. A. Carp, J. Robblee, Z. S. Hendsch, R. Fairman, B. Tidor, D. P. Raleigh, Biochemistry 2000, 39, 872-879; b) G. R. Grimsley, K. L. Shaw, L. R. Fee, R. W. Alston, B. M. Huyghues-Despointes, R. L. Thurlkil, J. M. Scholtz, C. N. Pace, Protein Sci. 1999, 8, 1843-1849; c) V. V. Loladze, B. Ibarra-olero, J. M. Sanchez-Ruiz, G. I. Makhatadze, Biochemistry 1999, 38, 16419-16423; d) J. M. Sanchez-Ruiz, G. I. I. Makhatadze, Trends Biotechnol. 2001, 19, 132-135.
    • (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 16419-16423
    • Loladze, V.V.1    Ibarra-Olero, B.2    Sanchez-Ruiz, J.M.3    Makhatadze, G.I.4
  • 153
    • 0035313828 scopus 로고    scopus 로고
    • a) S. Spector, M. Wang, S. A. Carp, J. Robblee, Z. S. Hendsch, R. Fairman, B. Tidor, D. P. Raleigh, Biochemistry 2000, 39, 872-879; b) G. R. Grimsley, K. L. Shaw, L. R. Fee, R. W. Alston, B. M. Huyghues-Despointes, R. L. Thurlkil, J. M. Scholtz, C. N. Pace, Protein Sci. 1999, 8, 1843-1849; c) V. V. Loladze, B. Ibarra-olero, J. M. Sanchez-Ruiz, G. I. Makhatadze, Biochemistry 1999, 38, 16419-16423; d) J. M. Sanchez-Ruiz, G. I. I. Makhatadze, Trends Biotechnol. 2001, 19, 132-135.
    • (2001) Trends Biotechnol. , vol.19 , pp. 132-135
    • Sanchez-Ruiz, J.M.1    Makhatadze, G.I.I.2
  • 158
    • 0033596902 scopus 로고    scopus 로고
    • a) J. Hollien, S. Marqusee, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 13674-13678; b) J. Hollien, S. Marqusee, Biochemistry 1999, 38, 3831-3836.
    • (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 3831-3836
    • Hollien, J.1    Marqusee, S.2

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.