A multi-state empirical valence bond model for weak acid dissociation in aqueous solution

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 105, Issue 12, 2001, Pages 2814-2823

  Čuma, Martin ^a   Schmitt, Udo W ^a   Voth, Gregory A ^a  

^a UNIVERSITY OF UTAH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACID DISSOCIATION;

ACIDS; CHEMICAL BONDS; COMPUTER SIMULATION; DISSOCIATION; FREE ENERGY; MOLECULES;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 0035967378     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0038207     Document Type: Article

References (46)

1. Bell, R. P. The Proton in Chemistry, 2nd ed.; Cornell University Press: Ithaca, NY, 1973.
2. Caldin, E. F., Gold, V., Eds. In Proton-Transfer Reactions; Chapman and Hall: London, 1975.
3. Bountis, T., Ed. In Proton Transfer in Hydrogen-Bonded Systems; Plenum: New York, 1993.
4. Muller, A., Ratajczak, H., Junge, W., Diemann, E., Eds. In Electron and Proton Transfer in Chemistry and Biology; Elsevier: New York, 1992.
5. Allen, M. P.; Tildesley, D. J. Computer Simulation of Liquids; Clarendon Press: Oxford, 1987.
6. Warshel, A. Computer Modeling of Chemical Reactions in Enzymes and Solutions; J. Wiley and Sons: New York, 1991.
7. Ceperley, D. M. In Simulations in Condensed-Matter Physics and Chemistry; Binder, K., Ciccotti, G., Eds.; Editrice Compositori: Rome, 1996.
8. Cournoyer, M. E.; Jorgensen, W. L. Mol. Phys. 1984, 51, 119.
9. Jedlovszky, P.; Vallauri, R. Mol. Phys. 1998, 93, 15.
10. Car, R.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1985, 55, 2471.
11. Laasonen, K.; Klein, M. L. Mol. Phys. 1996, 88, 135- -142.
12. Coulson, C. A.; Danielsson, U. Ark. Fysik 1954, 8, 239.
13. Mulliken, R. S. J. Chim. Phys. (Paris) 1964, 61, 20.
14. Warshel, A.; Weiss, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 6218.
15. Åqvist, J.; Warshel, A. Chem. Rev. 1993, 93, 2523.
16. Schmitt, U. W.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 5547.
17. Schmitt, U. W.; Voth, G. A, J. Chem. Phys. 1999, 111, 9361.
18. Schmitt, U. W.; Voth, G. A. Isr. J. Chem. 1999, 39, 483.
19. Čuma, M.; Schmitt, U. W.; Voth, G. A. Chem. Phys. 2000, 258, 187.
20. Vuilleumier, R.; Borgis, D. J. Mol. Struct. 1997, 436, 555.
21. Vuilleumier, R.; Borgis, D. Chem. Phys. Lett. 1998, 284, 71.
22. Vuilleumier, R.; Borgis, D. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 4261.
23. Vuilleumier, R.; Borgis, D. J. Chem. Phys. 1999, 111, 4251.
24. Rashin, A. A.; Rabinowitz, J. R.; Banfelder, J. R. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 4133.
25. Nagy, P. I.; Durant, G. J.; Smith, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 2912.
26. Topol, I. A.; Tawa, G. J.; Burt, S. K.; Rashin, A. A. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 10075.
27. Ho, L. L.; A. D. MacKerell, J.; Bash, P. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 4466.
28. Bash, P. A.; Ho, L. L.; A. D. MacKerell, J.; Levine, D.; Hallstrom, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 3698.
29. Hummer, G.; Pratt, L. R.; Garcia, A. E. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 7885.
30. Christianson, D. W.; Fierke, C. A. Acc. Chem. Res. 1996, 29, 331.
31. Lu, D.; Voth, G. A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4006.
32. Lu, D.; Voth, G. A. Proteins 1998, 33, 119.
33. MacKerell, A. D. J.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L. J.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E., I.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Workiewicz-Kuczera, J.; Yinb, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 103, 3586.
34. Besler, B. H.; Merz, K. M.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1990, 11, 431.
35. Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187.
36. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pornelli, C; Adamo, C; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
37. Pavese, M.; Chawla, S.; Lu, D.; Lobaugh, J.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1997, 107, 7428.
38. Sadhukhan, S.; Munoz, D.; Adamo, C.; Scuseria, G. Chem. Phys. Lett. 1999, 306, 83.
39. Scheiner, S. Acc. Chem. Res. 1985, 18, 174.
40. Miertuš, S.; Tomasi, J. Chem. Phys. 1982, 65, 239.
41. Hummer, G.; Pratt, L. R.; Garcia, A. E. J. Phys. Chem. 1996, 100, 1206.
42. Patey, G. N.; Valeau, J. P. J. Chem. Phys. 1975, 63, 2334.
43. Pangali, C.; Rao, M.; Berne, B. J. Chem. Phys. 1979, 71, 2975.
44. Kast, S. M.; Nicklas, K.; Bär, H.-J.; Brickmann, J. J. Chem. Phys. 1994, 100, 566.
45. Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A.; Rosenberg, J. M. J. Comput. Chem. 1992, 13(8), 1011.
46. Roux, B. Comput. Phys. Comm. 1995, 91, 275.