Simulation of the Raman optical activity of L-alanyl-L-alanine

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 105, Issue 26, 2001, Pages 6362-6368

  Bouř, Petr ^a   Kapitán, Josef ^a,b   Baumruk, Vladimír ^b  

^a INSTITUTE OF ORGANIC CHEMISTRY AND BIOCHEMISTRY   (Czech Republic)

^b CHARLES UNIVERSITY   (Czech Republic)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTER SIMULATION; CONFORMATIONS; CONTINUUM MECHANICS; DNA; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; QUANTUM THEORY; RAMAN SCATTERING; RAMAN SPECTROSCOPY;

RAMAN OPTICAL ACTIVITY (ROA);

POLYPEPTIDES;

EID: 0035812120     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp002572b     Document Type: Article

References (38)

1. Barron, L. D.; Hecht, L. In Circular Dichroism; Nakanishi, K., Berova, N., Woody, R. W., Eds.; VCH Publishers: New York, 1994; pp 179-215.
2. Cuperlovic, M.; Meresi, G. H.; Palke, W. E.; Gerig, J. T. J. Magn. Reson. 2000, 142, 11.
3. Constante, J.; Hecht, L.; Polavarapu, P. L.; Collet, A.; Barron, L. D. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1997, 36, 885.
4. Bouř, P.; Baumruk, V.; Hanzliková, J. Collect. Czech. Chem. Commun. 1997, 9, 1384.
5. Bouř, P. Chem. Phys. Lett. 1998, 288, 363-370.
6. Bouř, P.; Tam, C. N.; Shaharuzzaman, M.; Chickos, J. S.; Keiderling, T. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 15041.
7. Boiř, P.; Keiderling, T. A. J. Am. Chem. Soc. 1993, 15, 9602.
8. Bouř, P.; Kubelka, J.; Keiderling, T. A. Biopolymers 2000, 53, 380.
9. Bouř, P. J. Comput. Chem. 2001, 22, 426.
10. Barron, L. D.; Wilson, G.; Hecht, L.; Blanch, E. W. In Spectroscopy of Biological Molecules: Modem Trends; Carmona, P., Navarro, R., Hernanz, A., Eds ; Kluwer: Dordrecht, The Netherlands, 1997; pp 9-10.
11. Klamt, A.; Schhrmann, G. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1993, 2, 799.
12. Klamt, A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 2224.
13. Barone, V.; Cossi, M.; Tomasi, J. J. Comput. Chem. 1998, 19, 404.
14. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E ; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R ; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S ; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaroni, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzales, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98, revisions A.3 and A.7; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
15. Klamnt, A. In The Encyclopedia of Computatinal Chemistry; Schleyer, P. v. R., Allinger, N. L., Clark, T., Gasteiger, J., Kollman, P. A., Schaefer, H. F., III., Schreiner, P. R., Eds.; John Wiley & Sons: Chichester, U.K., 1998; pp 604-615.
16. Bell, A. F.; Barron, L. D.; Hecht, L. Carbohydr. Res. 1994, 25, 11.
17. Bell, A. F.; Hecht, L.; Barron, L. D. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5820.
18. Barron, L. D.; Gargaro, A. R.; Hecht, L.; Polavarapu, P. L. Spectrochim. Acta 1991, 47A, 1001.
19. Yu, G.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A.; Deng, Z.; Polavarapu, P. L. J. Phys. Chem. 1995, 99, 835.
20. Oboodi, M. R.; Alva, C.; Diem, M. J. Phys. Chem. 1984, 88, 501.
21. Ford, S. J.; Wen, Z. Q.; Hecht, L.; Barron, L. Biopolymers 1994, 34, 303.
22. You, G. S ; Che, D.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biospectroscopy 1995, 1 (2), 113.
23. Deng, Z.; Polavarapu, P. L.; Ford, S. J.; Hecht, L.; Barron, L. D.; Ewig, C. S.; Jalkanen, K. J. Phys. Chem. 1996, 100, 2025.
24. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1998, 38, 3098.
25. Perdew, J. P.; Wang, Y. Phys. Rev. B 1992, 45, 13244.
26. Bouř, P.; McCann, J.; Wieser, H. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 102.
27. Bouř, P.; Sopková, J.; Bednárová, L., Maloň, P.; Keiderling, T. A. J. Comput. Chem. 1997, 18, 646.
28. Gonçalves, P. F. B.; Livotto, P. R. Chem. Phys. Lett. 1999, 304, 438.
29. Bouř, P.; Král, V. Collect. Czech. Chem. Commun. 2000, 65 (5), 631.
30. Bohr, H. G.; Jalkanen, K. J.; Elstner, M.; Frimand, K.; Suhai, S. Chem. Phys. 1999, 246, 13.
31. Freedman, T. B.; Nafie, L. A. J. Chem. Phys. 1983, 78, 27;
32. Freedman, T. B.; Nafie, L. A. J. Chem. Phys. 1983, 79, 1104.
33. Barron, L. D. Molecular Light Scattering and Optical Activity; Cambridge University Press: Cambridge, U.K., 1982.
34. Helgaker, T.; Jensen, H. J. A.; Jørgensen, P.; Olsen, J.; Ruud, K.; Ågren, H.; Andersen, T.; Bak, K. L.; Bakken, V.; Christiansen, O.; Dahle, P.; Dalskov, E. K.; Enevoldsen, T.; Fernandez, B.; Heiberg, H.; Hettema, H.; Jonsson, D.; Kirpekar, S.; Kobayashi, R.; Koch, H.; Mikkelsen, K. V.; Norman, P.; Packer, M. J.; Saue, T.; Taylor, P. R.; Vahtras, O. Dalton, Release 1.0, 1997.
35. Amos, R. D. Cadpac 5, 1990, Darresbuny Laboratory, Darresbury (in-house modified version of the program).
36. Helgaker, T.; Ruud, K.; Bak, K. L.; Jørgensen, P.; Olsen, J. Faraday Discuss. 1995, 99, 121.
37. Mohammady, K. M.; Jalkanen, K. J.; Nardi, F.; Wade, R. C.; Suhai, S. Chem. Phys. 1999, 240, 63.
38. Nielsen, P. A.; Norrby, P. O.; Liljefors, T.; Rega, N.; Barone, V. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3151.