Investigations of ultrafast exciton dynamics in allophycocyanin trimer

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 105, Issue 39, 2001, Pages 8878-8891

  Zhang, J M ^a   Shiu, Y J ^a   Hayashi, M ^b   Liang, K K ^b   Chang, C H ^b   Gulbinas, V ^b   Yang, C M ^c   Yang, T S ^c   Wang, H Z ^d   Chen, Yit Tsong ^d   Lin, S H ^e  

^a INSTITUTE OF ATOMIC AND MOLECULAR SCIENCES   (Taiwan)

^b NATIONAL TAIWAN UNIVERSITY   (Taiwan)

^c CENTER FOR PHYSICAL SCIENCES AND TECHNOLOGY   (Lithuania)

^d INSTITUTE OF PLANT AND MICROBIAL BIOLOGY   (Taiwan)

^e SUN YAT SEN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

TRIMERS;

ANISOTROPY; BACTERIA; CHROMOPHORES; ENERGY GAP; EXCITONS; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR VIBRATIONS; RATE CONSTANTS; ULTRAFAST PHENOMENA;

PROTEINS;

EID: 0035807682     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp011266a     Document Type: Article

References (54)

1. Holzworth, A. Quart. Rev. Biophys. 1989, 22, 239.
2. Glazer, A. N. Annu. Rev. Biophys. Chem. 1985, 14, 47.
3. Brejc, K.; Ficner, R.; Huber, R.; Steinbacher, S. J. Mol. Bio. 1995, 249, 424.
4. Edington, M. D.; Riten, R. E.; Beck, W. F. J. Phys. Chem. 1995, 43, 15769.
5. Edington, M. D.; Riter, R. E.; Beck, W. F. J. Phys. Chem. 1996, 700, 14206.
6. Edington, M. D.; Riter, R. E.;Beck, W. F. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 4473.
7. Homoelle, B. J.; Edington, M. D.; Diffey, W. M.; Beck, W. F. J. Phys. Chem. B 1998, 702, 3044.
8. Jimenez, R.; van Mourik, F.; Yu, J. Y.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 7350.
9. Jimenez, R.; Dikshift, S. N.; Bradforth, S. E.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 700, 6825.
10. Bradforth, S. E.; Jimenez, R.; van Mourik, F.; van Grondelle, R.; Fleming, G. R. J. Pliys. Chem. 1995, 99, 16179.
11. (l 1) Jia, Y.; Jonas, D. M.; Joo, T.; Nagasawa, Y.; Lang, M. J.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1995, 99, 6263.
12. Wynne, K.; Haran, G.; Reid, G. D.; Moser, C. C; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M. J. Pliys. Chem. 1996, 700, 5140.
13. Walker, G. C.; Maiti, S.; Cowen, B. R.; Moser, C. C; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M. J. Pliys. Chem. 1994, 98, 5778.
14. Arnett, D. C.; Moser, C. C. Dutton, P. L.; Scherer, N. F. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 2014.
15. Scholes, G. D.; Harcourt, R. D.; Fleming, G. R. J. Pliys. Chem. B 1997,101, 7302.
16. Thompson, M. A.; Zemer, M. C. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 8210.
17. Thompson, M. A.; Zerner, M. C.; Fajer, J. J. Phys. Chem. 1991, 95, 5693.
18. Parson, W. W.; Warshel, A. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 6143.
19. Scherer, P. O. J.; Fischer, S. F. Chem. Phys. 1989, 131, 115.
20. Scherer, P. O. J.; Fischer, S. F.; Lancaster, C. R. D.; Fritzsch, G.; Schmidt, S.; Arlt, T.; Dressler, K.; Zinth, W. Chem. Phys. Lett. 1994, 223, 110.
21. Scherer, P. O. J.; Schamael, C.; Fischer, S. F. Chem. Phys. 1995, 797, 333.
22. Scherer, P. O. J.; Fischer, S. F. Chem. Phys. Lett. 1997, 268, 133.
23. Scherer, P. O. J.; Fischer, S. F. Spectrochim. Ada, Part A 1998, 54, 1191.
24. Yana, T.-S.; Chang, M.-S.; Chang, R.; Hayashi. M.; Lin, S. H.; Vohringer, P. Dietz, W.; Schere, N. F. J. Chem. Phys. 1999, 110, 12070.
25. Zhang, J. M.; Zhao, J, Q.; Jiang, L. J. Photochem. Phtobiol. 1998, 68, 777.
26. Press, W. H.; Teukolsky, S. A.; Vettering, W. T.; Flannery, B. P. Numerical Recipes, 2nd ed.; Cambridge University Press: New York, 1992.
27. Wang, S. S. Computational Methods in Physics and Engineering, 2nd ed.; World Scientific: Singapore, 1997.
28. Naidu, P. S. Modem Spectrum Analysis of Time Series; CRC Press: New York, 1995.
29. Sharkov, A. V.; Kryukov, I. V.; Khoroshilov, E. V.; Kryukov, P. G.; Fischer, H.; Gillbro, T. Biochim. Biophys. Acta 1994, 1188, 349.
30. Lin, S. H.; Hayashi, M.; Alden, R. G.; Suzuki, S.; Gu, X. Z.; Lin, Y. Y. In Femtosecond Chemistry; Mantz, J., Wöste, L., Eds.; VCH: New York, 1995; p.633.
31. Lin, S. H.; Hayashi, M.; Suzuki, S.; Gu, X. Z.; Xiao, W.; Sueawara, M. Chem. Phys. 1995, 197, 433.
32. Lin, S. H. J. Client. Phys. 1971, 54, 1177.
33. Lin, S. H, J. Chem. Phys. 1971, 55, 3546.
34. Born, M.; Huang, K Dynamical Theory of Crystal Lattices; Oxford University Press: Oxford, 1954; Chapter IV.
35. Ballhausen, C. J.; Hansen, A. E. Anna. Rev. Phys. Chem. 1972, 23, 15.
36. Lin, S. H. J. Chem. Phys. 1966, 44, 3759.
37. Mebel, A.; Hayashi, M.; Liang, K. K.; Lin, S. H. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 10674. See Appendix D.
38. Szalontai, B.; Combos, Z.; Gsizmadia, V.; Castorday, K.; Lutz, M. Biochemistry 1989, 28, 6467.
39. Szalontai, B.; Combos, Z.; Gsizmadia, V.; Bugyinka, C.; Lutz, M. Biochemistry 1994, 33, 11823.
40. Lyle, P. A.; Kolaczkowski, S. V.; Small, G. J. J. Phys. Chem. 1993, 97,6924.
41. Chans, C. H.; Hayashi, M.; Chang, R.; Liang, K. K.; Yang, T. S.; Lin, S. H. J. Phys. Chem. B 2001, 705, 1216.
42. Csatorday, K.; MacColI, R.; Csizmadia, V.; Grabowski, J.; Bagyinka, C. Biochemistry 1984, 23, 6466.
43. Chang, C.-H.; Hayashi, M.; Chang, R.; Liang, K. K.; Yang, T.-S.; Lin, S. H. J. Chin. Chem. Soc. 2000, 47, 785.
44. Small, G. J. J. Chem. Phys. 1995, 797, 239.
45. Tang, D.; Jankowiak, R.; Small, G. J.-, Tiede, D. M. Chem. Phys. 1989, 131, 99.
46. Pieper, J.; Voigt, J.; Small, G. J. J. Phys. Chem. B 1999,103,2319.
47. Reddy, N. R. S.; Wu, H.-M.; Jankwoiak, R.; Picorel, R.; Cogdell, R. J.; Small, G. J. Phytosynth. Res. 1996, 4S, 277.
48. Joo, T.; Jia, Y.; Yu, J.-Y.; Lang, M. J.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1996, 104, 6089.
49. Fleming, G. R.; Cho, M. Anna. Rev. Phys. Chem. 1996, 47, 109.
50. Riter, R. E.; Edington, M. D.; Beck, W. F. J. Phys. Chem. 1996, 100, 14198.
51. Wynne, K.; Haran, G.; Reid, G. D.; Moser, C. C.; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. 1996, 700, 5140.
52. Haran, G.; Wynne, G. D.; Moser, C. C.; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. 1996, 700, 5562.
53. Jonas, D. M.; Lang, M. J.; Nagasawa, Y.; Joo, T.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 700, 12660.
54. Arnett, D. C.; Moser, C. C.; Dutton, P. L.; Scherer, N. F. J. 'Phys. Chem. B 1999, 103, 2014.