Solution solution: Using NMR models for molecular replacement

Acta Crystallographica - Section D Biological Crystallography

Volumn 57, Issue 10, 2001, Pages 1457-1461

  Chen, Yu Wai ^a  

^a UNIVERSITY OF CAMBRIDGE   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHF1 PROTEIN, ZEA MAYS; RIBOSOMAL PROTEIN L30; RIBOSOME PROTEIN; VEGETABLE PROTEIN;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; COMPUTER PROGRAM; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; MODELS, MOLECULAR; PLANT PROTEINS; RIBOSOMAL PROTEINS; SOFTWARE;

ZEA MAYS;

EID: 0035788132     PISSN: 09074449     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1107/S0907444901010824     Document Type: Article

References (48)

1. Anderson, D. H., Weiss, M. S. & Eisenberg, D. (1996). Acta Cryst. D52, 469-480.
2. Baldwin, E. T., Weber, I. T., St Charles, R., Xuan, J.-C., Appella, E., Yamada, M., Matsushima, K., Edwards, B. F. P., Clore, G. M., Gronenborn, A. M. & Wlodawer, A. (1991). Proc. Natl Acsd. Sci. USA, 88, 502-506.
3. Behnke, C. A., Yee, V. C., Trong, I. L., Pedersen, L. C., Stenkamp, R. E., Kim, S.-S., Reeck, G. R. & Teller, D. C. (1998). Biochemistry, 37, 15277-15288.
4. Braun, W., Epp, O., Wüthrich, K. & Huber, R. (1989). J. Mol. Biol. 206, 669-676.
5. Brotherton, D. H., Dhanaraj, V., Wick, S., Brizuela, L., Domaille, P. J., Volyanik, E., Xu, X., Parisini, E., Smith, B. O., Archer, S. J., Serrano, M., Brenner, S. L., Blundell, T. L. & Laue, E. D. (1998). Nature (London), 395, 244-250.
6. Brünger, A. T., Campbell, R. L., Clore, G. M., Gronenborn, A. M., Karplus, M., Petsko, G. A. & Teeter, M. M. (1987). Science, 235, 1049-1053.
7. Chang, G. & Lewis, M. (1997). Acta Cryst. D53, 279-289.
8. Chen, Y. W. & Clore, G. M. (2000). Acta Cryst. D56, 1535-1540.
9. Chen, Y. W., Dodson, E. J. & Kleywegt, G. J. (2000). Structure, 8, R213-R220.
10. Chirgadze, D. Y., Hepple, J. P., Zhou, H., Byrd, R. A., Blundell, T. L. & Gherardi, E. (1999). Nature Struct. Biol. 6, 72-79.
11. Collaborative Computational Project, Number 4 (1994). Acta Cryst. D50, 760-763.
12. Dennis, C. A., Videler, H., Pauptit, R. A., Wallis, R., James, R., Moore, G. R. & Kleanthous, C. (1998). Biochem. J. 333, 183-191.
13. Glykos, N. M. & Kokkinidis, M. (2000). Acta Cryst. D56, 169-174.
14. Glykos, N. M. & Kokkinidis, M. (2001). Acta Cryst. D57, 1462-1473.
15. Gourinath, S., Srinivasan, A. & Singh, T. P. (1999). Acta Cryst. D55, 25-30.
16. Hoedemaeker, F. J., Siegal, G., Roe, S. M., Driscoll, P. C. & Abrahams, J. P. (1999). J. Mol. Biol. 292, 763-770.
17. Hoh, F., Yang, Y.-S., Guignard, L., Padilla, A., Stern, M.-H., Lhoste, J. M. & van Tilbeurgh, H. (1998). Structure, 6, 147-155.
18. Hoover, D. M., Shaw, J., Gryczynski, Z., Proudfoot, A. E. I., Wells, T. & Lubkowski, J. (2000). Protein Peptide Lett. 7, 73-82.
19. Hyvönen, M., Macias, M. J., Nilges, M., Oschkinat, H., Saraste, M. & Wilmanns, M. (1995). EMBO J. 14, 4676-4685.
20. Janes, R. W., Peapus, D. H. & Wallace, B. A. (1994). Nature Struct. Biol. 1, 311-319.
21. Kissinger, C. R., Gehlhaar, D. K. & Fogel, D. B. (1999). Acta Cryst. D55, 484-491.
22. Kissinger, C. R., Gehlhaar, D. K., Smith, B. A. & Bouzida, D. (2001). Acta Cryst. D57, 1475-1479.
23. Kleywegt, G. J. (1996a). CCP4/ESF-EACBM Newsl. Protein Crystallogr. 32, 32-36.
24. Kleywegt, G. J. (1996b). Acta Cryst. D52, 842-857.
25. Kleywegt, G. J., Bergfors, T., Senn, H., Le Motte, P., Gsell, B., Shudo, K. & Jones, T. A. (1994). Structure, 2, 1241-1258.
26. Kuszewski, J., Gronenborn, A. M. & Clore, G. M. (1999). J. Am. Chem. Soc. 121, 2337-2338.
27. Leahy, D. J., Axel, R. & Hendrickson, W. A. (1992). Cell, 68, 1145-1162.
28. Lubkowski, J., Bujacz, G., Boqué, L., Domaille, P. J., Handel, T. M. & Wlodawer, A. (1997). Nature Struct. Biol. 4, 64-69.
29. Miller, M., Lubkowski, J., Rao, J. K. M., Danishefsky, A. T., Omichinski, J. G., Sakaguchi, K., Sakamoto, H., Appella, E., Gronenborn, A. M. & Clore, G. M. (1996). FEBS Lett. 399, 166-170.
30. Mittl, P. R. E., Chène, P. & Grütter, M. G. (1998). Acta Cryst. D54, 86-89.
31. Müller, T., Oehlenschläger, F. & Buehner, M. (1995). J. Mol. Biol. 247, 360-372.
32. Navaza, J. (1994). Acta Cryst. A50, 157-163.
33. Navaza, J. & Saludjian, P. (1997). Methods Enzymol. 276, 581-594.
34. Pauptit, R. A., Dennis, C. A., Derbyshire, D. J., Breeze, A. L., Weston, S. A., Rowsell, S. & Murshudov, G. N. (2001). Acta Cryst. D57, 1397-1404.
35. Read, R. (2001). Acta Cryst. D57, 1373-1382.
36. Sheriff, S., Klei, H. E. & Davis, M. E. (1999). J. Appl. Cryst. 32, 98-101.
37. Strobl, S., Maskos, K., Wiegand, G., Huber, R., Gomis-Rüth, F. X. & Glockshuber, R. (1998). Structure, 6, 911-921.
38. Sutcliffe, M. J. (1993). Protein Sci. 2, 936-944.
39. Vagin, A. & Teplyakov, A. (2000). Acta Cryst. D56, 1622-1624.
40. Wang, J.-H., Smolyar, A., Tan, K., Liu, J.-H., Kim, M., Sun, Z. Y., Wagner, G. & Reinherz, E. L. (1999). Cell, 97, 791-803.
41. Wang, W. K., Bycroft, M., Foster, N. W., Buckle, A. M., Fersht, A. R. & Chen, Y. W. (2001). Acta Cryst. D57, 545-551.
42. Wang, W. K., Proctor, M. R., Buckle, A. M., Bycroft, M. & Chen, Y. W. (2000). Acta Cryst. D56, 769-771.
43. Weiss, M. S., Anderson, D. H., Raffioni, S., Bradshaw, R. A., Ortenzi, C., Luporini, P. & Eisenberg, D. (1995). Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92, 10172-10176.
44. Wenk, M., Baumgartner, R., Holak, T. A., Huber, R., Jaenicke, R. & Mayr, E.-M. (1999). J. Mol. Biol. 286, 1533-1545.
45. Wilmanns, M. & Nilges, M. (1996). Acta Cryst. D52, 973-982.
46. Wong, K. B., Wang, W. K., Proctor, M. R., Bycroft, M. & Chen, Y. W. (2001). Acta Cryst. D57, 865-866.
47. Yang, F., Bewley, C. A., Louis, J. M., Gustafson, K. R., Boyd, M. R., Gronenborn, A. M., Clore, G. M. & Wlodawer, A. (1999). J. Mol. Biol. 288, 403-412.
48. Zhu, Z., Dumas, J. J., Lietzke, S. E. & Lambright, D. G. (2001). Biochemistry, 40, 3027-3036.