Protein phosphatases - A phylogenetic perspective

Chemical Reviews

Volumn 101, Issue 8, 2001, Pages 2291-2312

  Kennelly, Peter J ^a  

^a VIRGINIA POLYTECHNIC INSTITUTE AND STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PROTEIN PHOSPHORYLATION;

HORMONES; MACROMOLECULES; MICROORGANISMS; RNA;

PROTEINS;

PHOSPHOPROTEIN PHOSPHATASE;

AMINO ACID SEQUENCE; CHEMISTRY; CLASSIFICATION; METABOLISM; MOLECULAR WEIGHT; PHYLOGENY; PROTEIN CONFORMATION; REVIEW;

AMINO ACID SEQUENCE; MOLECULAR WEIGHT; PHOSPHOPROTEIN PHOSPHATASE; PHYLOGENY; PROTEIN CONFORMATION; SUPPORT, U.S. GOV'T, NON-P.H.S.; SUPPORT, U.S. GOV'T, P.H.S.;

EID: 0035413605     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr0002543     Document Type: Review

References (283)

1. Kennelly, P.J. In Introduction to Cellular Signal Transduction; Sitaramayya, A., Ed.; Birkhauser: Boston, 1999; pp 235-263.
2. Marks, F. In Protein Phosphorylation; Marks, F., Ed.; VCH Publishers Inc.: New York, 1996; pp 1-35.
3. Fischer, E.H.; Krebs, E.G. Biochim. Biophys. Acta 1989, 1000, 297.
4. Cozzone, A.J. Annu. Rev. Microbiol. 1988, 42, 97.
5. Garnak, M.; Reeves, H.C. Science 1979, 203, 1111.
6. Wang, J.Y.J.; Koshland, D.E., Jr. J. Biol. Chem. 1978, 253, 7605.
7. Manai, M.; Cozzone, A.J. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1979, 91, 819.
8. Bourret, R.B.; Hess, J.F.; Borkovich, K.A.; Pakula, A.A.; Simon, M.I. J. Biol. Chem. 1989, 264, 7085.
9. Stock, J.B.; Ninfa, A.J.; Stock, A.M. Microbiol. Rev. 1989, 53, 450.
10. Cortay, J.-C.; Bleicher, F.; Rieul, C.; Reeves, H.C.; Cozzone, A.J. J. Bacteriol. 1988, 170, 89.
11. Klumpp, D.J.; Plank, D.W.; Bowdin, L.J.; Stueland, C.S.; Chung, T.; LaPorte, D.C. J. Bacteriol. 1988, 170, 2763.
12. Stock, A.; Koshland, D.E., Jr.; Stock, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1985, 82, 7989-7993.
13. Nixon, B.T.; Ronson, C.W.; Ausubel, F.M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1986, 83, 7850.
14. Winans, S.C.; Ebert, P.R.; Stachel, S.E.; Gordon, M.P.; Nester, E.W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1986, 83, 8278.
15. Hanks, S.K.; Quinn, A.M. Methods Enzymol. 1991, 200, 38.
16. Pomerantz, A.H.; Allfrey, V.C.; Merrifield, R.B.; Johnson, E.M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1977, 74, 4261.
17. Hess, J.F.; Bourret, R.B.; Simon, M.I. Nature 1988, 336, 139.
18. Kennelly, P.J.; Potts, M. J. Bacteriol. 1996, 178, 4759.
19. Kennelly, P.J. Front. Biosci. 1999, 4, d372.
20. Barford, D. Trends Biochem. Sci. 1996, 21, 407.
21. Denu, J.M.; Stuckey, J.A.; Saper, M.A.; Dixon, J.E. Cell 1996, 87, 361.
22. Tonks, N.K.; Neel, B.G. Cell 1996, 87, 365.
23. Fauman, E.B.; Saper, M.A. Trends Biochem. Sci. 1996, 21, 413.
24. Cohen, P.T.W. Trends Biochem. Sci. 1997, 22, 245.
25. Ramponi, G.; Stefani, M. Int. J. Biochem. Cell Biol. 1997, 29, 279.
26. Zhang, Z.-Y. Curr. Top. Cell. Regul. 1997, 35, 21.
27. Klee, C.B.; Ren, H.; Wang, X. J. Biol. Chem. 1998, 273, 13367.
28. Millward, T.A.; Zolnierowicz, S.; Hemmings, B.A. Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 186.
29. Aggen, J.B.; Nairn, A.C.; Chamberlin, R. Chem. Biol. 2000, 7, R13.
30. Nilsson, I.; Hoffmann, I. Prog. Cell Cycle Res. 2000, 4, 107.
31. Virshup, D.M. Curr. Opin. Cell Biol. 2000, 12, 180.
32. Hillis, D.M. Science 1997, 276, 218.
33. Chatton, E. Titres et Travoux Scientifics; Sete: Sottano, Italy, 1937.
34. Woese, C.R.; Fox, G.E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1977, 74, 5088.
35. Woese, C.R.; Kandler, O.; Wheelis, M.L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 4576.
36. Iwabe, N.; Kuma, K.-I.; Hasegawa, M.; Ogawa, S.; Miyata, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 9355.
37. Pennisi, E. Science 1998, 280, 672.
38. Shapiro, J.A. ASM News 1999, 65, 201.
39. Kandler, O. Syst. Appl. Microbiol. 1994, 16, 501.
40. Brown, J.R.; Doolittle, W.F. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998, 61, 456.
41. Doolittle, R.F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 2421.
42. Dootittle, W.F. Trends Genet. 1998, 14, 307.
43. Doolittle, R.F. Res. Microbiol. 2000, 151, 85.
44. Forterre, P. ASM News 1997, 63, 89.
45. Gupta, R.S. Mol. Microbiol. 1998, 29, 695.
46. Doolittle, W.F. Trends Cell Biol. 1999, 9, M5.
47. Doolittle, W.F. Science 1999, 284, 2124.
48. Ludwig, W.; Schleifer, K.-H. ASM News 1999, 65, 752.
49. Hunter, T. Methods Enzymol. 1991, 200, 3.
50. Buss, J.E.; Stull, J.T. Methods Enzymol. 1983, 99, 7.
51. Denu, J.M.; Dixon, J.E. Curr. Opin. Chem. Biol. 1998, 2, 633.
52. Millar, J.B.A.; McGowan, C.H.; Lenaers, G.; Jones, R.; Russell, P. EMBO J. 1991, 10, 4301.
53. Honda, R.; Ohba, Y.; Nagata, A.; Okayama, H.; Yasuda, H. FEBS Lett. 1993, 318, 331.
54. Guan, K.; Broyles, S.S.; Dixon, J.E. Nature 1991, 350, 359.
55. Sun, H.; Charles, C.H.; Lau, L.F.; Tonks, N.K. Cell 1993, 75, 487.
56. Alessi, D.R.; Smythe, C.; Keyse, S.M. Oncogene 1993, 8, 2015.
57. Cohen, P. Methods Enzymol. 1991, 201, 389.
58. Barton, G.J.; Cohen, P.T.W.; Barford, D. Eur. J. Biochem. 1994, 220, 225.
59. Cohen, P.T.W.; Brewis, N.D.; Hughes, V.; Mann, D.J. FEBS Lett. 1990, 268, 355.
60. Zhou, S.; Clemens, J.C.; Stone, R.L.; Dixon, J.E. J. Biol. Chem. 1994, 269, 26234.
61. King, M.M.; Huang, C.Y. J. Biol. Chem. 1984, 259, 8847.
62. Chu, Y.; Lee, E.Y.C.; Schlender, K.K. J. Biol. Chem. 1996, 271, 2574.
63. Goldberg, J.; Huang, H.-B.; Kwon, Y.-G.; Greengard, P.; Nairn, A.C.; Kuriyan, J. Nature 1995, 376, 745.
64. Egloff, M.-P.; Cohen, P.T.W.; Reinemer, P.; Barford, D. J. Mol. Biol. 1995, 254, 942.
65. Lohse, D.L.; Denu, J.M.; Dixon, J.E. Structure 1995, 3, 987.
66. Rusnak, F.; Yu, L.; Mertz, P. J. Biol. Inorg. Chem. 1996, 1, 388.
67. Pallen, C.J.; Wang, J.H. J. Biol. Chem. 1983, 258, 8550.
68. Chan, C.P.; Gallis, B.; Blumenthal, D.K.; Pallen, C.J.; Wang, J.H.; Krebs, E.G. J. Biol. Chem. 1986, 261, 9890.
69. MacKintosh, C.; Garton, A.J.; McDonnell, A.; Barford, D.; Cohen, P.T.W.; Tonks, N.K.; Cohen, P. FEBS Lett. 1996, 397, 235.
70. Ballou, L.M.; Fischer, E.H. Enzymes 1986, XVII, 311.
71. Krebs, E.G.; Beavo, J.A. Annu. Rev. Biochem. 1979, 48, 923.
72. Hubbard, M.J.; Cohen, P. Trends Biochem. Sci. 1993, 18, 172.
73. Pawson, T.; Scott, J.D. Science 1997, 278, 2075.
74. Andreev, A.V.; Kutuzov, M.A. Cell Signal. 1999, 11, 555.
75. Kennelly, P.J.; Krebs, E.G. J. Biol. Chem. 1991, 266, 15555.
76. Pinna, L.A.; Ruzzene, M. Biochim. Biophys. Acta 1996, 1314, 191.
77. Plowman, G.D.; Sudarsanam, S.; Bingham, J.; Whyte, D.; Hunter, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 13603.
78. Kennelly, P.J.; Oxenrider, K.A.; Leng, J.; Cantwell, J.S.; Zhao, N. J. Biol. Chem. 1993, 268, 6505.
79. Leng, J.; Cameron, A.J.; Buckel, S.; Kennelly, P.J. J. Bacteriol. 1995, 177, 6510.
80. Oxenrider, K.A.; Rasche, M.E.; Thorsteinsson, M.V.; Kennelly, P. J. FEBS Lett. 1993, 331, 291.
81. Solow, B.; Young, J.C.; Kennelly, P.J. J. Bacteriol. 1997, 179, 5072.
82. Mai, B.; Frey, G.; Swanson, R.V.; Mathur, E.J.; Stetter, K.O. J. Bacteriol. 1998, 180, 4030.
83. Missiakis, D.; Raina, S. EMBO J. 1997, 16, 1670.
84. Umeyama, T.; Naruoka, A.; Horinuchi, S. Gene 2000, 258, 55.
85. Shi, L.; Carmichael, W.W.; Kennelly, P.J. J. Biol. Chem. 1999, 274, 10039.
86. Carmichael, W.W. Adv. Bot. Res. 1997, 27, 211.
87. Cohen, P.T.W.; Collins, J.F.; Coulson, A.F.W.; Berndt, N.; da Cruz e Silva, O. Gene 1988, 69, 131.
88. Cohen, P.T.W.; Cohen, P. Biochem. J. 1989, 260, 931.
89. Zhuo, S.; Clemens, J.C.; Hakes, D.J.; Barford, D.; Dixon, J.E. J. Biol. Chem. 1993, 268, 17754.
90. Koonin, E.V. Mol. Microbiol. 1993, 8, 785.
91. Zhuo, S.; Clemens, J.C.; Stone, R.L.; Dixon, J.E. J. Biol. Chem. 1994, 269, 26234.
92. Nishimura, A. Trends Biochem. Sci. 1998, 23, 157.
93. Kisselev, L.L.; Justesen, J.; Wolfson, A.D.; Frolova, L.Y. FEBS Lett. 1998, 427, 157.
94. Koonin, E.V. Protein Sci. 1994, 3, 356.
95. Hiraga, A.; Kikuchi, K.; Tamura, S.; Tsuiki, S. Eur. J. Biochem. 1981, 119, 503.
96. Field, C.C.; Denu, J.M. J. Biol. Chem. 1999, 274, 20336.
97. Bork, P.; Brown, N.P.; Hegyi, H.; Schultz, J. Protein Sci. 1995, 5, 1421.
98. Das, A.K.; Helps, N.R.; Cohen, P.T.W.; Barford, D. EMBO J. 1996, 15, 6798.
99. Tamura, S.; Lynch, K.R.; Larner, J.; Fox, J.; Yasui, A.; Kikuchi, K.; Suzuki, Y.; Tsuiki, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 1796.
100. Lawson, J.E.; Niu, X.-D.; Browning, K.S.; Trong, H.L.; Yan, J.; Reed, L.J. Biochemistry 1993, 32, 8987.
101. Wenk, J.; Trompeter, H.-I.; Pettrich, K.-G.; Cohen, P.T.W.; Campbell, P.T.W.; Mieskes, G. FEBS Lett. 1992, 297, 135.
102. Hansen, D.; Pilgrim, D. Genetics 1998, 149, 1353.
103. Dick, T.; Bahri, S.M.; Cia, W. Gene 1997, 199, 139.
104. Stone, J.M.; Collinge, M.A.; Smith, R.D.; Horn, M.A.; Walker, J.C. Science 1994, 266, 793.
105. Maeda, T.; Tsai, A.Y.; Saito, H. Mol. Cell Biol. 1993, 13, 5408.
106. Burns, J.M., Jr.; Parsons, M.; Rosman, D.E.; Reed, S.G. J. Biol. Chem. 1993, 268, 17155.
107. Klumpp, S.; Hanke, C.; Donella-Deana, A.; Beyer, A.; Keilner, R.; Pinna, L.A.; Schultz, J.E. J. Biol. Chem. 1994, 269, 32774.
108. McGowan, C.H.; Cohen, P. Eur. J. Biochem. 1987, 166, 713.
109. Welihinda, A.A.; Tirasophon, W.; Green, S.R.; Kaufman, R.J. Mol. Cell. Biol. 1998, 18, 1967.
110. Leung, J.; Bouvier-Durand, M.; Morris, P.-C.; Guerrier, D.; Chefdor, F.; Giraudat, J. Science 1994, 264, 1448.
111. Meyer, K.; Leube, M.P.; Grill, E. Science 1994, 264, 1452.
112. Mamoun, C.B.; Sullivan, D.J., Jr.; Banerjee, R.; Goldberg, D.E. J. Biol. Chem. 1998, 273, 11241.
113. Gaits, F.; Shiozaki, K.; Russell, P. J. Biol. Chem. 1997, 272, 17873.
114. Tong, Y.; Quirion, R.; Shen, S.-H. J. Biol. Chem. 1998, 273, 35282.
115. Cheng, A.; Ross, K.E.; Kaldis, P.; Solomon, M.J. Genes Dev. 1999, 13, 2946.
116. Shiozaki, K.; Russell, P. Cell Mol. Biol. Res. 1994, 40, 241.
117. Duncan, L.; Alper, S.; Arigoni, F.; Losick, R.; Stragier, P. Science 1995, 270, 641.
118. Vijay, K.; Brody, M.S.; Fredlund, E.; Price, C.W. Mol. Microbiol. 2000, 35, 180.
119. Yang, X.; Kang, C.M.; Brody, M.S.; Price, C.W. Genes Dev. 1996, 10, 2265.
120. Obuchowski, M.; Madec, E.; Delattre, D.; Boel, G.; Iwanicki, A.; Foulger, D.; Seror, S.J. J. Bacteriol. 2000, 182, 5634.
121. Shi, L.; Bischoff, K.M.; Kennelly, P.J. J. Bacteriol. 1999, 181, 4761.
122. Mukhopadhyay, S.; Kapatral, V.; Xu, W.; Chakrabarty, A.M. J. Bacteriol. 1999, 181, 6615.
123. Taylor, B.L.; Zhulin, I.B. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1999, 63, 479.
124. Beuf, L.; Bedu, S.; Durand, M.-C.; Joset, F. Plant Mol. Biol. 1994, 25, 855.
125. Khorava, A.; Zhang, L.; Higgins, L.G.; Piccot, P.J. J. Bacteriol. 1998, 180, 1256.
126. Wu, L.J.; Feucht, A.; Errington, J. Genes Dev. 1998, 12, 1371.
127. Min, K.-T.; Hilditch, C.M.; Diederich, B.; Errington, J.; Yudkin, M.D. Cell 1993, 74, 735.
128. Adler, E.; Donella-Deana, A.; Arigoni, F.; Pinna, L.A.; Stragier, P. Mol. Microbiol. 1997, 23, 57.
129. Sismiero, O.; Trotot, P.; Biville, F.; Vivares, C.; Danchin, A. J. Bacteriol. 1998, 180, 3339.
130. Charboneau, H.; Tonks, N.K. Annu. Rev. Cell Biol. 1992, 8, 463.
131. Barford, D.; Jia, Z.; Tonks, N.K. Nature Struct. Biol. 1995, 2, 1043.
132. Savle, P.S.; Shelton, T.E.; Meadows, C.A.; Potts, M.; Gandour, R.D.; Kennelly, P.J. Arch. Biochem. Biophys. 2000, 376, 439.
133. Barford, D.; Das, K.; Egloff, M.P. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1998, 27, 133.
134. Guan, K.; Dixon, J.E. Science 1990, 249, 553.
135. Kaniga, K.; Uralil, J.; Bliska, J.B.; Galan, J.E. Mol. Microbiol. 1996, 21, 633.
136. Koul, A.; Choidas, A.; Treder, M.; Tyagi, A.K.; Drlica, K.; Singh, Y.; Ullrich, A. J. Bacteriol. 2000, 182, 5425.
137. Potts, M.; Sun, H.; Mockaitis, K.; Kennelly, P.J.; Reed, D.; Tonks, N.K. J. Biol. Chem. 1993, 268, 7632.
138. Black, D.S.; Bliska, J.B. EMBO J. 1997, 16, 2730.
139. Black, D.S.; Montagna, L.G.; Zitsmann, S.; Bliska, J.B. Mol. Microbiol. 1998, 29, 1263.
140. Hamid, N.; Gustavsson, A.; Andersson, K.; McGee, K.; Persson, C.; Rudd, C.E.; Fallman, M. Microb. Pathol. 1999, 27, 231.
141. Bliska, J.B.; Guan, K.; Dixon, J.E.; Falkow, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 1187.
142. Persson, C.; Nordfelth, R.; Holmstrom, A.; Hokansson, S.; Wolf-Watz, H. Mol. Microbiol. 1995, 18, 135.
143. Gaylov, E.E.; Hakansson, S.; Forsberg, A.; Wolf-Watz, H. Nature 1993, 361, 730.
144. Fu, Y.; Galan, J.E. Mol. Microbiol. 1998, 27, 359.
145. Arricau, N.; Hermant, D.; Waxin, H.; Popoff, M.Y. Res. Microbiol. 1997, 148, 21.
146. Howell, L.D.; Griffiths, C.; Slade, L.W.; Potts, M.; Kennelly, P. J. Biochemistry 1996, 35, 7566.
147. Guan, K.; Broyles, S.S.; Dixon, J.E. Nature 1991, 350, 359.
148. Mossman, K.; Ostergaard, H.; Upton, C.; McFadden, G. Virology 1995, 206, 572.
149. Hakes, D.J.; Martell, K.J.; Zhao, W.-G.; Massung, R.F.; Esposito, J.J.; Dixon, J.E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 4017.
150. Li, Z.; Que, Q.; Kutish, G.F.; Rock, D.L.; Van Etten, R.L. Virology 1996, 216, 102.
151. Ishibashi, T.; Bottaro, D.P.; Chan, A.; Miki, T.; Aaronson, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 12170.
152. Lin, K.; Lemon, B.; Traktman, P. J. Virol. 1995, 69, 7823.
153. Takagi, T.; Moore, C.R.; Diehn, F.; Buratowski, S. Cell 1997, 89, 867.
154. Sheng, Z.; Charbonneau, H. J. Biol. Chem. 1993, 268, 4728.
155. Takagi, T.; Taylor, G.S.; Kusakabe, T.; Charboneau, H.; Buratowski, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 9808.
156. Li, Y.; Miller, L.K. J. Virol. 1995, 69, 4533.
157. Deshpande, T.; Takagi, T.; Hao, L.; Buratowski, S.; Charbonneau, H. J. Biol. Chem. 1999, 274, 16590.
158. Myers, M.P.; Stolarov, J.P.; Eng, C.; Wang, S.I.; Wigler, M.H.; Parsons, R.; Tonks, N.K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 9052.
159. Maehama, T.; Dixon, J.E. J. Biol. Chem. 1998, 273, 13375.
160. Myers, M.P.; Pass, I.; Batty, I.H.; Van der Kay, J.; Stolarov, J.P.; Hemmings, B.A.; Wigler, M.H.; Downes, C.P.; Tonks, N.K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 13513.
161. Lee, J.-O.; Yang, H.; Georgescu, M.-M.; Di Cristofano, A.; Maehama, T.; Shi, Y.; Dixon, J.E.; Pandolfi, P.; Pavletich, N.P. Cell 1999, 99, 323.
162. Taylor, G.S.; Maehama, T.; Dixon, J.E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 8910.
163. We, Y.-Y.; Zhou, M.-M.; Stevis, P.; Davis, J.P.; Zhang, Z.-Y.; Van Etten, R.L. Biochemistry 1992, 31, 1712.
164. Zhang, Z.-Y.; Harms, E.; Van Etten, R.L. J. Biol. Chem. 1994, 269, 25947.
165. Davis, J.P.; Zhou, M.-M.; Van Etten, R.L. J. Biol. Chem. 1994, 269, 8734.
166. Zhang, M.; Van Etten, R.L.; Stauffacher, C.V. Biochemistry 1994, 33, 11097.
167. Su, X.-D.; Taddel, N.; Stefani, M.; Ramponi, G.; Nordlund, P. Nature 1994, 370, 575.
168. Logan, T.M.; Zhou, M.-M.; Nettesheim, D.G.; Meadows, R.P.; Van Etten, R.L.; Fesik, S.W. Biochemistry 1994, 33, 11087.
169. Bose, S.K.; Taneja, V. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1998, 250, 629.
170. Mondesert, O.; Moreno, S.; Russell, P. J. Biol. Chem. 1994, 269, 27996.
171. Ostanin, K.; Pokalsky, C.; Wang, S.; Van Etten, R.L. J. Biol. Chem. 1995, 270, 18491.
172. Cirri, P.; Chiarugi, P.; Taddei, L.; Raugei, G.; Camici, G.; Manao, G.; Ramponi, G. J. Biol. Chem. 2000, 273, 32522.
173. Chiarugi, P.; Cirri, P.; Marra, F.; Raugei, G.; Fiaschi, T.; Camici, G.; Manao, G.; Romanelli, R.G.; Ramponi, G. J. Biol. Chem. 1998, 273, 6776.
174. Chiarugi, P.; Cirri, P.; Taddei, L.; Giannoni, E.; Camici, G.; Manao, G.; Raugei, G.; Ramponi, G. J. Biol. Chem. 2000, 275, 4640.
175. Li, Y.; Strohl, W.R. J. Bacteriol. 1996, 178, 136.
176. Grangeasse, C.; Doublet, P.; Vincent, C.; Vaganay, E.; Riberty, M.; Duclos, B.; Cozzone, A.J. J. Mol. Biol. 1998, 278, 339.
177. Vincent, C.; Doublet, P.; Gangreasse, C.; Vaganay, E.; Cozzone, A.J.; Duclos, B. J. Bacteriol. 1999, 181, 3472.
178. Umeyama, T.; Tanabe, Y.; Aigle, B.D.; Horinouchi, S. FEMS Microbiol. Lett. 1996, 144, 177.
179. Ji, G.; Silver, S. J. Bacteriol. 1992, 174, 3684.
180. Rosenstein, R.; Peschel, A.; Wieland, B.; Gotz, F. J. Bacteriol. 1992, 174, 3676.
181. Takemura, K.-I.; Mizuno, M.; Sate, T.; Takeuchi, M.; Kobayashi, Y. Microbiology 1995, 141, 323.
182. Diorio, C.; Cai, J.; Marmor, J.; Shinder, R.; DuBow, M.S. J. Bacteriol. 1995, 177, 2050.
183. Liu, J.; Gladysheva, T.B.; Lee, L.; Rosen, B.P. Biochemistry 1995, 34, 13472.
184. Caselli, A.; Marzocchini, R.; Camici, G.; Manao, G.; Moneti, G.; Pieraccini, G.; Ramponi, G. J. Biol. Chem. 1998, 273, 32554.
185. Gottlin, E.B.; Xu, X.; Epstein, D.M.; Burke, S.P.; Eckstein, J.W.; Balllou, D.P.; Dixon, J.E. J. Biol. Chem. 1996, 271, 27445.
186. Fauman, E.B.; Cogswell, J.P.; Lovejoy, B.; Rocque, W.J.; Holmes, W.; Montana, V.G.; Piwnica-Worms, H.; Rink, M.J.; Saper, M.A. Cell 1998, 93, 617.
187. Bobrowicz, P.; Wysocki, R.; Owsianik, G.; Goffeau, A.; Ulaszewki, S. Yeast 1997, 13, 819.
188. Mukhopadhyay, R.; Rosen, B.P. FEMS Microbiol. Lett. 1998, 168, 127.
189. Bordo, D.; Deriu, D.; Colnaghi, R.; Carpen, A.; Pagani, S.; Bolognesi, M. J. Mol. Biol. 2000, 298, 691.
190. Westley, J.; Adler, H.; Westley, L.; Nishida, C. Fundam. Appl. Toxicol. 1983, 3, 377.
191. Dooley, T.P.; Nair, S.K.; Garcia, R.E., IV; Courtney, B.C. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1995, 216, 1101.
192. Ray, W.K.; Zeng, G.; Potters, M.B.; Mansuri, A.M.; Larson, T.J. J. Bacteriol. 2000, 182, 2277.
193. Zimmerman, P.; Laska, S.; Kletzin, A. Arch. Microbiol. 1999, 172, 76.
194. LaPorte, D.C.; Koshland, D.E., Jr. Nature 1982, 305, 286.
195. LaPorte, D.C.; Chung, T. J. Biol. Chem. 1985, 260, 15291.
196. LaPorte, D.C. J. Cell. Biochem. 1993, 51, 14.
197. Steuland, C.S.; Ikeda, T.P.; LaPorte, D.C. J. Biol. Chem. 1989, 264, 13775.
198. Miller, S.P.; Karschina, E.J.; Ikeda, T.P.; LaPorte, D.C. J. Biol. Chem. 1996, 271, 19124.
199. Miller, S.P.; Chen, R.; Karschnia, E.J.; Romfo, C.; Dean, A.; LaPorte, D.C. J. Biol. Chem. 2000, 275, 833.
200. Galinier, A.; Kravanja, M.; Engelmann, R.; Hengstenberg, W.; Kilhoffer, M.-C.; Deutscher, J.; Haiech, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 1823.
201. Kravanja, M.; Engelmann, R.; Dossonet, V.; Bluggel, M.; Meyer, M.E.; Frank, R.; Galinier, A.; Deutscher, J.; Schnell, N.; Hengstenberg, W. Mol. Microbiol. 1999, 31, 59.
202. Reizer, J.; Hoischen, C.; Titgemeyer, F.; Rivolta, C.; Rabus, R.; Stulke, J.; Karamata, D.; Saier, M.H., Jr.; Hillen, W. Mol. Microbiol. 1998, 27, 1157.
203. Dossonet, V.; Mondedero, V.; Zagorec, M.; Galinier, A.; Perez-Martinez, G.; Deutscher, J. J. Bacteriol. 2000, 182, 2582.
204. Nelson, K.; Wang, F.-S.; Boyd, E.F.; Selander, R.K. Genetics 1997, 147, 1509.
205. Roach, P.J. J. Biol. Chem. 1991, 266, 14139.
206. Cohen, P. Trends Biochem. Sci. 1992, 17, 408.
207. Bray, D. Nature 1995, 376, 307.
208. Weng, G.; Bhalla, U.S.; Iyengar, R. Science 1999, 284, 92.
209. Boyer, P.D.; DeLuca, M.; Ebner, K.E.; Hultquist, D.E.; Peter, J.B. J. Biol. Chem. 1962, 237, PC3306.
210. Zetterqvist, O. Biochim. Biophys. Acta 1966, 141, 533.
211. Fujitaki, J.M.; Smith, R.A. Methods Enzymol. 1984, 107, 23.
212. Appleby, J.L.; Parkinson, J.S.; Bourret, R.B. Cell 1996, 86, 845.
213. Mizuno, T. J. Biochem. 1998, 123, 555.
214. Goudreau, P.N.; Stock, A.M. Curr. Opin. Microbiol. 1998, 1, 160.
215. Perraud, A.-L.; Weiss, V.; Gross, R. Trends Microbiol. 1999, 7, 115.
216. Hoch, J.A. Curr. Opin. Microbiol. 2000, 3, 165.
217. Kuba, M.; Ohmori, H.; Kumon, A. Eur. J. Biochem. 1992, 208, 747.
218. Ohmori, H.; Kuba, M.; Kumon, A. J. Biol. Chem. 1993, 268, 7625.
219. Wong, C.; Faiola, B.; Wu, W.; Kennelly, P.J. Biochem. J. 1993, 296, 293.
220. Hiraishi, H.; Yokoi, F.; Kumon, A. J. Biochem. (Tokyo) 1999, 126, 368.
221. Kim, Y.; Huang, J.; Cohen, P.; Matthews, H.R. J. Biol. Chem. 1993, 268, 18513.
222. Ogino, T.; Matsubara, M.; Kate, N.; Nakamura, Y.; Mizuno, T. Mol. Microbiol. 1998, 27, 573.
223. Tsuki, M.; Ishige, K.; Mizuno, T. Mol. Microbiol. 1995, 18, 953.
224. Matsubara, M.; Mizuno, T. FEBS Lett. 2000, 470, 118.
225. Weiss, V.; Magasanik, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 8919.
226. Keener, J.; Kustu, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 4976.
227. Hess, J.F.; Oosawa, K.; Kaplan, N.; Simon, M.I. Cell 1988, 53, 79.
228. Makino, K.; Shinagawa, H.; Amemura, M.; Kawamoto, T.; Yamada, M.; Nakata, A. J. Mol. Biol. 1989, 210, 551.
229. Lukat, G.S.; Stock, A.M.; Stock, J.B. Biochemistry 1990, 29, 5436.
230. Lukat, G.S.; Lee, B.H.; Mottonen, J.M.; Stock, A.M.; Stock, J.B. J. Biol. Chem. 1991, 266, 8348.
231. Bourret, R.B.; Borkovich, K.A.; Simon, M.I. Annu. Rev. Biochem. 1991, 60, 401.
232. Sourjik, V.; Schmitt, R. Biochemistry 1998, 37, 2327.
233. Georgellis, D.; Kwon, O.; De Wulf, P.; Lin, E.C.C. J. Biol. Chem. 1998, 273, 32864.
234. Uhl, M.A.; Miller, J.F. J. Biol. Chem. 1996, 271, 33176.
235. Janiak-Spens, F.; Sparling, J.M.; Gurfinkel, M.; West, A.H. J. Bacteriol. 1999, 181, 411.
236. Janiak-Spens, F.; Sparling, D.P.; West, A.H. J. Bacteriol. 2000, 182, 6673.
237. Ninfa, A.J.; Magasanik, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1986, 83, 5909.
238. Puppe, W.; Zimmann, P.; Jung, K.; Lucassen, M.; Altendorf, K. J. Biol. Chem. 1996, 271, 25027.
239. Hsing, W.; Russo, F.D.; Bernd, K.K.; Silhavy, T.J. J. Bacteriol. 1998, 180, 4538.
240. Kamberov, E.S.; Atkinson, M.R.; Chandran, P.; Ninfa, A.J. J. Biol. Chem. 1994, 269, 28294.
241. Hsing, W.; Silhavy, T.J. J. Bacteriol. 1997, 179, 3729.
242. Jung, K.; Altendorf, K. J. Biol. Chem. 1998, 273, 17406.
243. Atkinson, M.R.; Kamberov, E.S.; Weiss, R.L.; Ninfa, A.J. J. Biol. Chem. 1994, 269, 28288.
244. Jung, K.; Altendorf, K. J. Biol. Chem. 1998, 273, 26415.
245. Zhu, Y.; Qin, L.; Yoshida, T.; Inouye, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 7808.
246. Perego, M. Trends Microbiol. 1998, 6, 366.
247. Perego, M.; Hanstein, C.; Welsh, K.M.; Djavakhishvili, T.; Glaser, P.; Hoch, J.A. Cell 1994, 79, 1047.
248. Ohlsen, K.L.; Grimsley, J.K.; Hoch, J.A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 1756.
249. Reizer, J.; Reizer, A.; Perego, M.; Saier, M.H., Jr. Microb. Comput. Gen. 1997, 2, 103.
250. Boesch, K.C.; Silversmith, R.E.; Bourret, R.B. J. Bacteriol. 2000, 182, 3544.
251. Perego, M.; Hoch, J.A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 1549.
252. Perego, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 8612.
253. Jiang, M.; Grau, R.; Perego, M. J. Bacteriol. 2000, 182, 303.
254. Sprang, S.R. Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 849.
255. Hess, J.F.; Oosawa, K.; Matsumura, P.; Simon, M.I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1987, 84, 7609.
256. Blat, Y.; Gillespie, B.; Bren, A.; Dahlquist, F.W.; Eisenbach, M. J. Mol. Biol. 1998, 284, 1191.
257. McEvoy, M.M.; Bren, A.; Eisenbach, M.; Dahlquist, F.W. J. Mol. Biol. 1999, 289, 1423.
258. Perego, M.; Herb, J.A. J. Bacteriol. 1991, 173, 2514.
259. Shi, L.; Potts, M.; Kennelly, P.J. FEMS Microbiol. Rev. 1998, 22, 229.
260. Zhang, C.-C.; Gonzalez, L.; Phalip, V. Nucleic Acids. Res. 1998, 26, 3619.
261. Kawarabayasi, Y.; Hino, Y.; Horikawa, H.; Yamazaki, S.; Haikawa, Y.; Jin-no, K.; Takahashi, M.; Sekine, M.; Babu, S.; Ankai, A.; Kosugi, H.; Hosomaya, A,; Fukui, S.; Nagai, Y.; Nishijima, K.; Nakazawa, H.; Takamiya, M.; Masuda, S.; Funahashi, T.; Tanaka, T.; Kudoh, Y.; Yamazaki, J.; Kushida, N.; Oguchi, A.; Aoki, K.-I.; Kubota, K.; Nakamura, Y.; Nomura, N.; Sako, Y.; Kikuchi, H. DNA Res. 1999, 6, 83.
262. Kawarabayasi, Y.; Sawada, M.; Horikawa, H.; Haikawa, Y.; Hino, Y.; Yamamoto, S.; Sekine, S.; Baba, S.-I.; Kosugi, H.; Hosomaya, A.; Nagai, Y.; Sakai, M.; Ogura, K.; Otsuka, R.; Nakazawa, H.; Takamiya, M.; Ohfuku, Y.; Funahashi, T.; Tanaka, T.; Kudoh, Y.; Yamazaki, J.; Kushida, N.; Oguchi, A.; Aoki, K.-L.; Yoshizawa, T.; Nakamnra, Y.; Robb, F.T.; Horikoshi, K.; Masuchi, Y.; Shizuya, H.; Kikuchi, H. DNA Res. 1998, 5, 55.
263. Deckert, G.; Warren, P.V.; Gaasterland, T.; Young, W.G.; Lenox, A.L.; Graham, D.E.; Overbeek, R.; Snead, M.A.; Keller, M.; Aujay, M.; Huber, R.; Feldman, R.A.; Short, J.M.; Olsen, G.J.; Swanson, R.V. Nature 1998, 392, 353.
264. Shigenobu, S.; Watanabe, H.; Hattori, M.; Sakaki, Y.; Ishikawa, H. Nature 2000, 407, 81.
265. Parkhill, J.; Wren, B.W.; Mungall, K.; Ketley, J.M.; Churcher, C.; Basham, D.; Chillingworth, T.; Davies, R.M.; Feltwell, T.; Holroyd, S.; Jagels, K.; Karlyshev, A.V.; Moule, S.; Pullen, M.J.; Penn, C.W.; Quail, M.A.; Rajandream, M.A.; Rutherford, K.M.; van Vliet, A.H.; Whitehead, S.; Barrell, B.G. Nature 2000, 403, 665.
266. Kalman, S.; Mitchell, W.; Marathe, R.; Lammel, C.; Fan, J.; Hyman, R.W.; Olinger, L.; Grimwood, J.; Davis, R.W.; Stephens, D.S. Nat. Genet. 1999, 21, 385.
267. Stephens, R.S.; Kalman, S.; Lammel, C.; Fan, J.; Marathe, R.; Aravind, L.; Mitchell, W.; Olinger, L.; Tatusov, R.L.; Zhao, Q.; Koonin, E.V.; Davis, R.W. Science 1998, 282, 754.
268. White, O.; Eisen, J.A.; Heidelberg, J.F.; Hickey, E.K.; Peterson, J.D.; Dodson, R.J.; Haft, D.H.; Gwinn, M.L.; Nelson, W.C.; Richardson, D.L.; Moffat, K.S.; Qin, H.; Jiang, L.; Pamphile, W.; Crosby, M.; Shen, M.; Vamatheman, J.J.; Lam, P.; Mc-Donald, L.; Utterback, T.; Zalewski, C.; Makarova, K.S.; Aravind, L.; Duly, M.J.; Minton, K.W.; Fleischmann, R.D.; Ketchum, K.A.; Nelson, K.E.; Salzberg, S.; Smith, H.O.; Ventner, J.C. Science 1999, 286, 1571.
269. Cole, S.T.; Brosch, R.; Parkhill, J.; Garnier, T.; Churcher, C.; Harris, D.; Gordon, S.V.; Eiglmeier, K.; Gas, S.; Barry, C.E., III; Tekaia, F.; Badcock, K.; Basham, D.; Brown, D.; Chillingworth, T.; Connor, R.; Davies, R.; Devlin, K.; Feltwell, T.; Gentles, S.; Hamlin, N.; Holroyd, S.; Hornsby, T.; Jagels, K.; Krogh, A.; McLean, J.; Moule, S.; Murphy, L.; Oliver, K.; Osborne, J.; Quail, M.A.; Rajandream, M.-A.; Rogers, J.; Rutter, S.; Seeger, K.; Skelton, R.; Squares, S.; Sulston, J.E.; Taylor, K.; Whitehead, S.; Barrell, B.G. Nature 1998, 393, 537.
270. Herrmann, R. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 4420.
271. Parkhill, J.; Achtman, M.; James, K.D.; Bentley, S.D.; Churcher, C.; Klee, S.R.; Morelli, G.; Basham, D.; Brown, D.; Chillingworth, T.; Davies, R.M.; Davis, P.; Devlin, K.; Feltwell, T.; Hamlin, N.; Holroyd, S.; Jagesl, K.; Leather, S.; Moule, S.; Mungall, K.; Quail, M.A.; Rajandream, M.A.; Rutherford, K.M.; Simmonds, M.; Skelton, J.; Whitehead, S.; Spratt, B.G.; Barrell, B.G. Nature 2000, 404, 502.
272. Stover, C.K.; Pham, X.Q.; Erwin, A.L.; Mizoguchi, S.D.; Warrener, P.; Hickey, J.M.; Brinkman, F.S.L.; Hufnagle, W.O.; Kowalik, D.J.; Lagrou, M.; Garber, R.L.; Goltry, L.; Toletino, E.; Westbrock-Wadman, S.; Yuan, Y.; Brody, L.L.; Coulter, S.N.; Folger, K.R.; Kas, A.; Larbug, K.; Lim, R.; Smith, K.; Spencer, D.; Wong, K.-S.; Wu, Z.; Paulsen, I.T.; Reizer, J.; Saier, M.H.; Hancock, R.E.W.; Lory, S.; Olson, M.V. Nature 2000, 406, 959.
273. Andersson, S.G.E.; Zomorodipour, A.; Andersson, J.O.; Sicheritz-Ponten, T.; Alsmark, U.C.M.; Podowski, R.M.; Naslund, A.K.; Eriksson, A.-S.; Winkler, H.H.; Kurland, C.G. Nature 1998, 396, 133.
274. Nelson, K.E.; Clayton, R.A.; Gill, S.R.; Gwinn, M.L.; Dodson, R.J.; Haft, D.H.; Hickey, E.K.; Peterson, J.D.; Nelson, W.C.; Ketchum, K.A.; McDonald, L.; Utterback, T.R.; Malek, J.A.; Linher, K.D.; Garrett, M.M.; Stewart, A.M.; Cotton, M.D.; Pratt, M.S.; Phillips, C.A.; Richardson, D.; Heidelberg, J.; Sutton, G.G.; Fleischmann, R.D.; Eisen, J.A.; White, O.; Salzberg, S.L.; Smith, H.O.; Ventner, J.C.; Fraser, C.M. Nature 1999, 399, 323.
275. Fraser, C.M.; Norris, S.J.; Weinstock, G.M.; White, O.; Sutton, G.G.; Dodson, R.; Gwinn, M.; Hickey, E.K.; Clayton, R.; Ketchum, K.A.; Sodergren, E.; Hardham, J.M.; McLeod, M.P.; Salzberg, S.; Peterson, J.; Khalak, H.; Richardson, D.; Howell, J.K.; Chidambaran, M.; Utterback, T.; McDonald, L.; Atriach, P.; Bowman, C.; Cotton, M.D.; Fujii, C.; Garland, S.; Hatch, B.; Horst, K.; Roberts, K.; Sandusky, M.; Weidman, J.; Smith, H.O.; Ventner, J.C. Science 1998, 281, 375.
276. Heidelberg, J.F.; Eisen, J.A.; Nelson, W.C.; Clayton, R.A.; Gwinn, M.L.; Dodson, R.J.; Haft, D.H.; Hickey, E.K.; Peterson, J.D.; Umayam, L.; Gill, S.R.; Nelson, K.E.; Read, T.D.; Tettelin, H.; Richardson, D.; Ermolaeva, M.D.; Vamathevan, J.; Bass, S.; Qin, H.; Dragoi, I.; Sellers, P.; McDonald, L.; Utterback, T.; Fleishmann, R.D.; Nierman, W.C.; White, O.; Salzberg, S.; Smith, H.O.; Colwell, R.R.; Mekalanos, J.J.; Ventner, J.C.; Fraser, C.M. Nature 2000, 406, 477.
277. Leonard, C.J.; Aravind, L.; Koonin, E.V. Genome Res. 1998, 8, 1038.
278. Koretke, K.K.; Warren, P.V.; Walters, S.; Lupus, A.N.; Brown, J.R. Microb. Comput. Genomics 1998, 3, 79.
279. Loomis, W.F.; Shaulsky, G.; Wang, N. J. Cell Sci. 1997, 110, 1141.
280. Fankhauser, C.; Chory, J. Curr. Biol. 1999, 9, R123.
281. Andersson, S.G.; Kurland, C.G. Trends Microbiol. 1998, 6, 263.
282. Ponting, C.P.; Aravind, L.; Schultz, J.; Bork, P.; Koonin, E.V. J. Mol. Biol. 1999, 289, 729.
283. Levitzki, A.; Gazit, A. Science 1995, 267, 1782.