Evolutionary aspects of protein structure and folding

Molecular Biology

Volumn 35, Issue 2, 2001, Pages 233-239

  Berezovsky, I N ^a   Trifonov, E N ^a  

^a WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE   (Israel)

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Folding mechanism; Protein evolution

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EID: 0035263736     PISSN: 00268933     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1023/A:1010491518368     Document Type: Article

References (38)

1. Zamyatnin, A.A., Protein Seq. Data Anal., 1991, vol. 4, pp. 53-56.
2. Douglass, J., Civelli, O., and Herbert, E., Annu. Rev. Biochem., 1984, vol. 53, pp. 665-715.
3. Trifonov, E.N., Gene, 2000 (in press).
4. Trifonov, E.N., J. Mol. Biol., 1987, vol. 194, pp. 643-652.
5. Lagunez-Otero, J. and Trifonov, E.N., J. Biomol. Struct. and Dyn., 1992, vol. 10, pp. 455-464.
6. Trifonov, E.N. and Bettecken, T., Gene, 1997, vol. 205, pp. 1-6.
7. Miller, S.L., Science, 1953, vol. 117, pp. 528-529.
8. Eck, R.V. and Dayhoff, M.O., Science, 1966, vol. 152, pp. 363-366.
9. Eigen, M. and Schuster, P., Naturwissenschaften, 1978, vol. 65, pp. 341-369.
10. CRC Handbook of Biochemistry and Molecular Biology, 3rd ed., vol. I, Fasman, G.D., Ed., Cleveland: CRC, 1976.
11. Brant, D.A. and Flory, P.J., J. Amer. Chem. Soc., 1965, vol. 87, pp. 2788-2791.
12. Schimmel, P.R. and Flory, P.J., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1967, vol. 58, pp. 52-59.
13. Shimada, J. and Yamakawa, H., Macromolecules, 1984, vol. 17, pp. 689-698.
14. Gilbert, W., Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol., 1987, vol. 52, pp. 901-905.
15. Roy, S.W., Nosaka, M., de Souza, S.J., and Gilbert, W., Gene, 1999, vol. 238, pp. 85-91.
16. Berezovsky, I.N., Grosberg, A.Y., and Trifonov, E.N., FEBS Lett., 2000, vol. 466, pp. 283-286.
17. Hobohm, U. and Sander, C., Protein Science, 1994, vol. 3, pp. 522-524.
18. Kyte, J. and Doolittle, R.F., J. Mol. Biol., 1982, vol. 157, pp. 105-132.
19. Martin, A.C.R., Toda, K., Stirk, H.J., and Thornton, J.M., Prot. Engn., 1995, vol. 8, pp. 1093-1101.
20. Kwasigroch, J.-M., Chomilier, J., and Mornon, J.-P., J. Mol. Biol., 1996, vol. 259, pp. 655-672.
21. Oliva, B., Bates, P.A., Querol, E., Aviles X., and Sternberg, M.J.E., J. Mol. Biol., 1997, vol. 266, pp. 814-830.
22. Berezovsky, I.N., Namiot, V.A., Tumanyan, V.G., and Esipova, N.G., J. Biomol. Struct. Dyn., 1999, vol. 17, pp. 133-155.
23. Burley, S.K., Almo, S.C., Bonanno, J.B., et al., Nature Genetics, 1999, vol. 23, pp. 151-157.
24. Svedberg, T., Nature, 1929, vol. 123, p. 871.
25. Svedberg, T., Nature, 1937, vol. 139, pp. 1051-1062.
26. Savageau, M.A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1986, vol. 83, pp. 1198-1202.
27. Berman, A.L., Kolker, E., and Trifonov, E.N., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1994, vol. 91, pp. 4044-4047.
28. Shore, D., Langowski, J., and Baldwin, R.L., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1981, vol. 78, pp. 4833-4837.
29. Olovnikov, A.M., Doklady Biochem. (Moscow), 1971, vol. 201, pp. 394-397.
30. Trifonov, E.N., J. Mol. Evol., 1995, vol. 40, pp. 337-342.
31. Kolker, E. and Trifonov, E.N., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1995, vol. 92, pp. 557-560.
32. Trifonov, E.N., J. Biomol. Struct. Dyn., 1997, vol. 14, pp. 449-457.
33. Matthews, B.W., Jansonius, J.N., Colman, P. M., et al., Nature New Biol., 1972, vol. 238, pp. 37-40.
34. Jacobson, R.H., Zhang, X.-J., DuBose, R.F., and Matthews, B.W., Nature, 1994, vol. 369, pp. 761-766.
35. Doolittle, R.F., Annu. Rev. Biochem., 1995, vol. 64, pp. 287-314.
36. Varenne, S., Bucs, J., Eloubes, R., and Lazdunski, C., J. Mol. Biol., 1984, vol. 180, pp. 549-576.
37. Makhoul, C. and Trifonov, E.N., J. Biomol. Struct. Dyn., 1997, vol. 14, pp. 787-788.
38. Trifonov, E.N., Denisov, D.A., and Makhoul, C., Math. Modelling Sci. Computing, 1998, vol. 9, pp. 24-29.