Solution structure of an N-capping peptide from the N-terminal leucine- repeat region of hepatitis delta antigen

Archives of Biochemistry and Biophysics

Volumn 377, Issue 2, 2000, Pages 219-227

  Lou, Yuan Chao ^a   Lin, I Jin ^a   Pai, Ming Tao ^a   Cheng, Jya Wei ^a  

^a NATIONAL TSING HUA UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

Capping box; CD; HDAg; HDV; NMR; RNA binding; Solution structure

Indexed keywords

COAT PROTEIN; VIRUS RNA;

ALPHA CHAIN; AMINO ACID SEQUENCE; ANTIGEN EXPRESSION; ARTICLE; HEPATITIS DELTA VIRUS; NONHUMAN; OLIGOMERIZATION; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN DOMAIN; PROTEIN STABILITY; PROTEIN STRUCTURE; PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; RNA BINDING; VIRUS GENOME;

EID: 0034657876     PISSN: 00039861     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1006/abbi.2000.1797     Document Type: Article

References (56)

1. Lai M. M. C. Annu. Rev. Biochem. 64:1995;259-286.
2. Kos A., Dijkema R., Arnberg A. C., van der Merde P. H., Schellekens H. Nature. 323:1986;558-560.
3. Makino S., Chang M. F., Shieh C. K., Kamahora T., Vannier D. M., Govindarajan S., Lai M. M. C. Nature. 329:1987;343-346.
4. Wang K. S., Choo Q. L., Weiner A. J., Ou J. H., Najarian R. C., Thayer R. M., Mullenbach G. T., Denniston K. J., Gerin J. L., Houghton M. Nature. 323:1986;508-514.
5. Kuo M. Y. P., Sharmeen L., Dinter-Gottlieb G., Taylor J. J. Virol. 62:1988;4439-4444.
6. Sharmeen L., Kuo M. Y. P., Dinter-Gottlieb G., Taylor J. J. Virol. 62:1988;2674-2679.
7. Sharmeen L., Kuo M. Y. P., Taylor J. J. Virol. 63:1989;1428-1430.
8. Wu H. N., Lai M. M. C. Mol. Cell. Biol. 10:1990;5575-5579.
9. Wu H. N., Wang Y. J., Hung C. F., Lee H. J., Lai M. M. C. J. Mol. Biol. 223:1992;233-245.
10. Bergmann K. F., Gerin J. L. J. Infect. Dis. 154:1986;702-705.
11. Bonino F., Heermann K. H., Rizzetto M., Gerlich W. H. J. Virol. 58:1986;945-950.
12. Pohl C., Baroudy M., Bergmann K. F., Cote P. J., Purcell R. H., Hoofnagle J., Gerin J. L. J. Infect. Dis. 156:1987;622-629.
13. Zyzik E., Ponzetto A., Frozani B., Hele C., Heermann K., Gerlich W. H. Robinson W., Kolike K., Will H. Hepadnaviruses. 1987;565-577 A. R. Liss, New York.
14. Chang M. F., Baker S. C., Soe L. H., Kamahora T., Keck J. G., Makino S., Govindarajan S., Lai M. M. C. J. Virol. 62:1988;2403-2410.
15. Chao M., Hsieh S. Y., Taylor J. J. Virol. 65:1991;4057-4062.
16. Hwang S., Lee C. Z., Lai M. M. C. Virology. 190:1992;413-422.
17. Lin J. H., Chang M. F., Baker S. C., Govindarajan S., Lai M. M. C. J. Virol. 64:1990;4051-4058.
18. Kuo M. Y. P., Chao M., Taylor J. J. Virol. 63:1989;1945-1950.
19. Chao M. S. Y., Hsieh S. Y., Taylor J. J. Virol. 64:1990;5066-5069.
20. Chang F. L., Chen P. J., Tu S. J., Wang C. J., Chen D. S. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88:1991;8490-8494.
21. Ryu W. S., Bayer M., Taylor J. J. Virol. 66:1992;2310-2315.
22. Xia Y. P., Yeh C. T., Ou J. H., Lai M. M. C. J. Virol. 66:1992;914-921.
23. Gowans E. J., Baroudy B. M., Negro F., Ponzetto A., Purcell R. H., Gerin J. L. Virology. 167:1988;274-278.
24. Lee C. Z., Lin J. H., Chao M., McKnight K., Lai M. M. J. Virol. 67:1993;2221-2227.
25. Chang M. F., Sun C. Y., Chen C. J., Chang S. C. J. Virol. 67:1993;2529-2536.
26. Rozzelle J. E. Jr., Wang J. G., Wagner D. S., Erickson B. W., Lemon S. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92:1995;382-386.
27. Zuccola H. J., Rozzelle J. E., Lemon S. M., Erickson B. W., Hogle J. M. Structure. 6:1998;821-830.
28. Huang Z. S., Wu H. N. J. Biol. Chem. 273:1998;26455-26461.
29. Cheng J. W., Lin I. J., Lou Y. C., Pai M. T., Wu H. N. J. Biomol. NMR. 12:1998;183-188.
30. Lin I. J., Lou Y. C., Pai M. T., Wu H. N., Cheng J. W. Proteins. 37:1999;121-129.
31. Harper E. T., Rose G. D. Biochemistry. 32:1993;7605-7609.
32. Lyu P. C., Wemmer D. E., Zhou H. X., Pinker R. J., Kallenbach N. R. Biochemistry. 32:1993;421-425.
33. King D. S., Fields C. G., Fields G. B. Int. J. Pept. Protein Res. 36:1990;255-266.
34. Chen Y. J., Lin S. J., Tzeng S. Y., Patel H., Lyu P. C., Cheng J. W. Proteins. 26:1996;465-471.
35. Cheng J. W., Cheng C. C., Lyu P. C., Chen S. T., Lin T. H. Int. J. Pept. Protein Res. 47:1996;117-122.
36. Marion D., Wuthrich K. Biochem. Biophys. Res. Commun. 113:1983;967-974.
37. Drobny G., Pines A., Sinton S., Weitkamp D. P., Wemmer D. E. Faraday Symp. Chem. Soc. 13:1979;49-55.
38. Rance M., Sorensen O. W., Bodenhausen G., Wagner G., Ernst R. R., Wuthrich K. Biochem. Biophys. Res. Commun. 117:1983;479-485.
39. Bax A., Davis D. G. J. Magn. Reson. 65:1985;355-360.
40. Wishart D. S., Sykes B. D., Richards F. M. J. Mol. Biol. 222:1991;311-333.
41. Szyperski T., Guntert P., Otting G., Wuthrich K. J. Magn. Reson. 99:1992;552-560.
42. Millhauser G. L., Stenland C. J., Bolin K. A., van de Ven F. J. M. J. Biomol. NMR. 7:1996;331-334.
43. Kim Y., Prestegard J. H. J. Magn. Reson. 84:1989;9-13.
44. Cai M., Liu J., Gong Y., Krishnamoorthi R. J. Magn. Reson., Ser. B. 107:1995;172-178.
45. Laskowski R. A., MacArthur M. W., Moss D. S., Thornton J. M. J. Appl. Crystallogr. 26:1993;283-291.
46. Lyu P. C., Liff M. I., Marky L. A., Kallenbach N. R. Science. 250:1990;669-673.
47. Wuthrich K. NMR of Proteins and Nucleic Acids. 1986;Wiley, New York.
48. Gronenborn A. M., Clore G. M. J. Biomol. NMR. 4:1994;455-458.
49. Wishart D. S., Sykes B. D. J. Biomol. NMR. 4:1994;171-180.
50. Richardson J. S., Richardson D. C. Science. 240:1988;1648-1652.
51. Presta L. G., Rose G. D. Science. 240:1988;1632-1641.
52. Bell J. A., Becktel W. J., Sauer U., Baase W. A., Matthews B. W. Biochemistry. 31:1992;3590-3596.
53. Thapar R., Nicholson E. M., Rajagopol P., Waygood E. B., Scholtz J. M., Klevit R. E. Biochemistry. 35:1996;11268-11277.
54. Lu M., Shu W., Ji H., Spek E., Wang L., Kallenbach N. R. J. Mol. Biol. 288:1999;743-752.
55. Forood B., Reddy H. K., Nambiar K. P. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90:1993;838-842.
56. Reymond M. T., Huo S., Duggan B., Wright P. E., Dyson H. J. Biochemistry. 36:1997;5234-5244.