DNA microsatellite analysis using ion-pair reversed-phase high- performance liquid chromatography

Analytical Chemistry

Volumn 72, Issue 4, 2000, Pages 858-864

  Devaney, Joseph M ^a,b   Girard, James E ^b   Marino, Michael A ^a  

^a TRANSGENOMIC INC   (United States)

^b AMERICAN UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MICROSATELLITE DNA;

ALLELE; ARTICLE; CANCER DIAGNOSIS; GEL ELECTROPHORESIS; GENE MAPPING; GENETIC DISORDER; REVERSED PHASE HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; TANDEM REPEAT;

ALLELES; CHROMATOGRAPHY, HIGH PRESSURE LIQUID; DNA; GENETIC MARKERS; HUMANS; MICROSATELLITE REPEATS; POLYMERASE CHAIN REACTION;

EID: 0034652228     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac9908896     Document Type: Article

References (54)

1. Patsalis, P C ; Sismani, C , Stylianou, S.; Ioannou, P.; Joseph, G.; Manoli, P.; Holden, J. J.; Hettinger, J. A. Am. J. Med Genet 1999, 84, 217-220.
2. Bruland, O., Almquist, E. W.; Goldberg, Y. P ; Boman, H.; Hayden, M. R.; Knappskog, P. M. Clin. Genet. 1999, 55, 198-202.
3. Thomson, J. A; Pilotti, V., Stevens, P.; Ayres, K. L.; Debenham, P. G. Forensic Sci. Int. 1999, 100, 1-16.
4. Sirchia, S. M ; Garagiola, I.; De Andreis, C. Gazzoli, I. Gramegna, M. Mol. Cell Probes 1996, 10, 155-158.
5. Shaw, S. H., Carrasquillo, M. M.; Kashuk, C.; Puffenberger, E. G.; Chakravarti, A. Genome Res. 1998, 8, 111-123.
6. Mansfield, D. C.; Brown, A. F.; Green D. K.; Carothers, A. D.; Morris, S. W., Evans, H. J. Wright, A. F. Genomics 1994, 24, 225-233.
7. Hughes, A. E. Genomics 1993, 15, 433-434.
8. Schullerus, D., von Knobloch, R.; Chudek, J.; Herbes, J. Kovacs, G. Int. J. Cancer 1999, 80, 22-24.
9. Schmitt, C.; Cire, K.; Schattenkirchner, S.; Pollok, M ; Baldamus, C. A; Krug, B.; Kirchner, T ; Wunsch, P. H.; Krieg, T.; Staak, M. Transplant. Int. 1998, 11, 382-386.
10. Noviello, C.; Courjal, F.; Theillet, C. Clin. Cancer Res 1996, 2, 1601-1606.
11. Wallin, J M.; Buoncristiani, M. R.; Lazruk, K. D.; Fildes, N.; Holt, C. L.; Walsch, P. S. J. Forensic Sci. 1998, 43, 854-870.
12. Halos, S. C.; Chu, J Y ; Ferreon, A. C.; Magno, M. M. Forensic Sci. Int. 1999, 101, 27-32.
13. Beckman, J. S., Weber, J. L. Genomics 1992, 12, 627-631.
14. Wang, Y.; Ju, J.; Carpenter, B. A; Atherton, J M.; Sensbaugh, G. F.; Mathies, R. A. Anal. Chem. 1995, 67, 1197-1203
15. Edwards, A;. Civitello, A.; Hammond, H. A.; Caskey, C. T Am. J. Hum. Genet 1991, 49, 746-756
16. Polymeropoulos, M H.; Xiao, H.; Rath, D. S., Merril, C. R. Nucleic Acids Res. 1991, 19, 4018.
17. Levison, G.; Gutman, G. A. Mol. Biol. Evol. 1987, 4, 397-401.
18. Schlotterer, C.; Tautz, D. Nucleic Acids Res. 1992, 20, 211-215.
19. Sprecher, C. J., Puers, C., Lins, A. M.; Schumm, J. W. BioTechniques 1996, 20, 266-276
20. Puers, C.; Hammond, H. A; Jin, L., Caskey, C. T.; Schumm, J W. Am. J. Hum. Genet. 1993, 53, 953-958.
21. Hammond, H. A.; Jin, L.; Zhong, Y.; Caskey, C. T.; Chakraborty, R. Am. J. Hum. Genet. 1994, 55, 175-189.
22. Bassam, B. J.; Caetano-Anolles, G.; Gresshoff, P. M. Anal. Biochem. 1991, 296, 80-83.
23. Zhu, H.; Clark, S. M.; Benson, S. C.; Rye, H. S.; Glazer, A. N.; Mathies, R. A. Anal. Chem 1994, 66, 1941-1948.
24. Lahiri, D. K.; Zhang, A.; Nurnberger, J. I. Biochem Mol. Med. 1997, 60, 70-75.
25. Lins, A. M., Micka, K. A.; Sprecher, C. J.; Taylor, J. A.; Backer, J. W.; Rabback, D. R.; Bever, R. A.; Creacy, S. D., Schumm, J. W. J. Forensic Sci 1998, 43, 1168-1180.
26. Butler, J M.; McCord, B. R.; Jung, J. M.; Lee, J. A.; Budowle, B.; Allen, R. O. Electrophoresis 1995, 16, 974-980.
27. Zhang, N.; Yeung, E. S. J. Chromatogr., A 1997, 768, 135-141.
28. Gao, Q.; Yeung, E. S. Anal. Chem. 1998, 70, 1382-1388.
29. Wenz, H.-M., Roberston, J. M.; Menchen, S.; Oaks, F.; Demorest, D. M.; Scheibler, D.; Rosenblum, B. B.; Wike, C.; Gilbert, D. A.; Efcavitch, J. W. Genome Res 1998, 8, 69-80.
30. Lazaruk, K.; Walsh, P S.; Oaks, F.; Gilbert, D ; Rosenblum, B. B.; Menchen, S.; Scheibler, D.; Wenz, H. M.; Holt, C.; Wallin J. Electrophoresis 1998, 19, 86-93
31. Wang, Y., Ju, J.; Carpenter, B. A.; Atherton, J. M.; Sensabaugh, G. F.; Mathies, R. A Anal. Chem. 1995, 67, 1197-1203.
32. Mansfield, E S.; Robertson, J. M.; Vainer, M.; Isenberg, A. R.; Frazier, R. R.; Ferguson, K.; Chow, S.; Harris, D. W.; Barker, D. L.; Gill, P. D.; Budowle, B.; McCord, B. R. Electrophoresis 1998, 19, 101-107
33. Gao, Q.; Pang, H.; Yeung, E. S. Electrophoresis 1999, 20, 1518-1526.
34. Ross, P. L.; Belgrader, P. Anal. Chem. 1997, 69, 3966-3972.
35. Taranenko, N. I.; Golovlev, V. V.; Allman, S. L.; Taranenko, N. V.; Chken, C. H.; Hong, J., Chang, L. Y. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1998, 12, 413-418.
36. Butler, J M.; Li, J.; Shaler, T. A.; Monforte, J. A.; Becker, C. H. Int. J. Legal Med 1999, 112, 45-49
37. Huber, C. G ; Oefner, P. J.; Bonn, G. K. Anal. Biochem 1993, 212, 351-358.
38. Huber, C. G.; Oefner, P. J., Bonn, G. K. Anal. Chem. 1995, 67, 7, 578-585.
39. Huber, C. G., Oefner, P. J., Preuss, E.; Bonn, G. K. Nucleic Acids Res. 1993, 21, 1061-1066.
40. Underhill, P. A., Jin, L.; Lin, A. A; Mehdi, S. Q.; Jenkins, T.; Vollrath, D.; Davis, R. W ; Cavalli-Sforza, L. L.; Oefner, P. J. Genome Res 1997, 7, 996-1005.
41. Heyward-Lester, A.; Oefner, P. J., Doris, P. A. BioTechniques 1996, 20, 250-257.
42. Marino, M. A.; Devaney, J. M.; Smith, J. K.; Girard, J. E. Electrophoresis 1998, 19, 108-118.
43. Huber, C. G.; Berti, N. Anal. Chem. 1996, 68, 2959-2965.
44. Ringo, M. C ; Evans, C. E. Anal. Chem 1997, 69, 643-649.
45. Tanaka, N.; Yoshimura, T.; Araki, M. J. Chromatogr, 1987, 406, 247-256.
46. McGuffin, V. L ; Evans, C. E. J Microcolumn Sep. 1991, 3, 513-520.
47. McGuffin, V. L.; Evans, C. E.; Chen, S. H. J Microcolumn Sep. 1993, 5, 3-10.
48. Hirabayshi, J.; Kasai, K. Anal. Biochem., 1989, 178, 336-341.
49. Ksai, K. J. Chromatogr. 1993, 618, 203-221
50. Potter, R. L ; Lewis, R. V. High Performance Liquid Chromatography Advances and Perspectives, 4th ed.; Academic Press: Orlando, 1986; Chapter 1.
51. Molnar, I.; Horváth, Cs. Clin. Chem. 1976, 22, 1497-1502.
52. Budowle, B.; Smerick, J. B.; Keys, K. M.; Moretti, T. R. J. Forensic Sci. 1997, 42, 846-849.
53. Clark, J. M. Nucleic Acids Res. 1988, 16, 9677-9686
54. Magnuson, V. L.; Ally, D. S.; Nylund, S. J.; Karanjawala, Z. E., Rayman, J. B.; Knapp, J. I.; Lowe, A. L.; Ghosh, S.; Collins, F. S. BioTechniques 1996, 21, 700-709.