Tuning of an electrospray ionization source for maximum peptide-ion transmission into a mass spectrometer

Analytical Chemistry

Volumn 72, Issue 4, 2000, Pages 777-790

  Geromanos, Scott ^a   Freckleton, Gordon ^a   Tempst, Paul ^a  

^a MEMORIAL SLOAN KETTERING CANCER CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ARTICLE; ELECTRIC POTENTIAL; ION TRANSPORT; IONIZATION; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETER; QUALITY CONTROL; SIGNAL TRANSDUCTION;

AMINO ACID SEQUENCE; BETA-GALACTOSIDASE; CALIBRATION; ESCHERICHIA COLI; IONS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PEPTIDE FRAGMENTS; PEPTIDES; SIGNAL PROCESSING, COMPUTER-ASSISTED; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION;

EID: 0034652201     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac991071n     Document Type: Article

References (73)

1. Alberts, B. Cell 1998, 92, 291-294.
2. Zhang, L.; Zhou, W.; Velculescu, V. E.; Kern, S. E.; Hruban, R. H.; Hamilton, S. R.; Vogelstein, B.; Kinzler, K. W. Science 1997, 276, 1268-1272.
3. DeRisi, J. L.; Iyer, V. R.; Brown, P. O. Science 1997, 278, 680-686.
4. Gerhold, D.; Rushmore, T.; Caskey, C. T. Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 168-173.
5. Gygi, S. P.; Rochon, Y.; Franza, B. R.; Aebersold, R. Mol. Cell. Biol. 1999, 19, 1720-1730.
6. Oda, Y.; Huang, K.; Cross, F. R.; Cowburn, D.; Chait B. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 6591-6596.
7. Mann, M. Trends Biochem. Sci. 1996, 21, 494-495.
8. Roepsdorff, P. Curr. Biol. 1997, 8, 6-13.
9. Yates III, J. R. J. Mass Spectrom. 1998, 33, 1-19.
10. Haynes, P. A.; Gygi, S. P.; Figeys, D.; Aebersold, R. Electrophoresis 1998, 19, 1862-1871.
11. Henzel, W. J.; Billeci, T. M.; Stults, J. T.; Wong, S. C.; Grimley, C.; Watanabe, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 5011-5015.
12. Mann, M.; Højrup, P.; Roepstorff, P. Biol. Mass Spectrom. 1993, 22, 338-345.
13. Pappin, D. J. C.; Højrup, P.; Bleasby, A. J. Curr. Biol. 1993, 3, 327-332.
14. Jensen, O. N.; Podtelejnikov, A.; Mann. M. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1996, 10, 1371-1378.
15. Clauser, K. R.; Baker, P.; Burlingame, A. L. Anal. Chem. 1999, 71, 2871-2882.
16. Shevchenko, A.; Jensen, O. N.; Podtelejnikov, A. V.; Sagliocco, F.; Wilm, M.; Vorm, O.; Mortensen, P.; Shevchenko, A.; Boucherie, H.; Mann, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 14440-14445.
17. Ono, M.; Bolland, S.; Tempsl, P.; Ravetch, J. V. Nature 1996, 383, 263-266.
18. Neubauer, G.; King, A., Rappsilber, J.; Calvio, C.; Watson, M.; Ajuh, P.; Sleeman, J.; Lamond, A.; Mann, M. Nat. Genet. 1998, 20, 46-50.
19. Eng. J. K.; McConnack, A. L.; Yates, J. R., III. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994, 5, 976-989.
20. Mann, M.; Wilm, M. Anal. Chem. 1994, 66, 4390-4399.
21. Fenyo, D.; Zhang, W., Chait, B. T.; Beavis, R. C. Anal. Chem. 1996, 68, 721A-726A.
22. DeWit, J. S.; Parker, C. E.; Torner, K. B.; Jorgenson, J. W. Anal. Chem. 1987, 59, 2400-2404.
23. Emmett, M. R.; Caprioli, R. M. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994, 5, 605-613
24. Davis, M. T.; Stahl, D. C.; Hefta, S. A.; Lee, T. D. Anal. Chem. 1995, 67, 4549-4556.
25. Davis, M. T.; Lee, T. D. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1998, 3, 194-201.
26. Ikonomou, M. G.; Blades, M. G.; Kebarle, P. Anal. Chem. 1990, 14, 1579-1583.
27. Wahl, J. H.; Goodlett, D. R.; Udseth, H. R.; Smith, R. D. Anal. Chem. 1992, 64, 3194-3196.
28. Figeys, D.; Ducret, A.; van Oostveen, I.; Aebersold, R. Anal. Chem. 1996, 68, 1822-1828.
29. Figeys, D.; Ducret, A.; Yates, J. R., III; Aebersold, R. Nat. Biotechnol. 1996, 14, 1579-1583.
30. Anden, P. E.; Emmett, M. R.; Caprioli, R. M J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994, 5, 867-869.
31. Wilm, M. S.; Mann, M. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1994, 136, 167-180.
32. Wilm, M. S.; Mann, M. Anal. Chem. 1996, 68, 1-8.
33. Valaskovic, G. A.; Kelleher, N. L.; Little, D. P.; Aaserad, D. J.; McLafferty, F. W. Anal Chem. 1995, 67, 3802-3805.
34. Valaskovic, G. A.; McLafferty, F. W J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1996, 7, 1270-1272.
35. Hannis, J. C.; Muddiman, D. C. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1998, 12, 443-448.
36. Geromanos, S.; Philip, J.; Freckleton, G.; Tempst, P. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1998, 12, 551-556.
37. Ramsey, R. S.; Ramsey, J. M. Anal. Chem. 1997, 69, 1174-1178.
38. Figeys, D.; Ning, Y.; Aebersold, R. Anal. Chem. 1997, 69, 3153-3160.
39. Xue, Q.; Dunayevskiy, Y. M.; Foret, F.; Karger, B. L. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1997, 11, 1253-1256.
40. Xue, Q.; Foret, F.; Dunayevskiy, Y. M.; Zavracky, P. M.; McGruer, N. E.; Karger, B. L. Anal. Chem. 1997, 69, 426-430.
41. Gatlin, C. L.; Kleemann, G. R.; Hays, L. G.; Link, A. J.; Yates, J. R., III. Anal. Biochem. 1998, 263, 93-101.
42. Xu, N.; Lin, Y.; Hofstadler, S. A.; Matson, D.; Call, C. J.; Smith, R. D. Anal. Chem. 1998, 70, 3553-3556.
43. Figeys, D.; Aebersold, R. Anal. Chem. 1998, 70, 3721-3727.
44. Figeys, D.; Gygi, S. P.; McKinnon, G.; Aebersold, R. Anal. Chem. 1998, 70, 3728-3734.
45. Lazar, I. M.; Ramsey, R. S., Sundberg, S.; Ramsey J. M. Anal. Chem. 1999, 71, 3627-3631.
46. McCormack, A. L.; Schieltz, D. M.; Goode, B.; Yang, S.; Barnes, G.; Drubin, D.; Yates, J. R., III. Anal. Chem. 1997, 69, 767-776.
47. Erdjument-Bromage, H.; Lui, M.; Lacomis, L.; Grewal, A.; Annan, R. S.; McNulty, D. E.; Carr, S. A.; Tempst, P. J. Chromatogr. A 1998, 826, 167-181.
48. Posewitz, M. C.; Tempst, P. Anal. Chem. 1999, 71, 2883-2892.
49. Lingner, J.; Hughes, T. R.; Shevchenko, A.; Mann, M.; Lundblad, V.; Cech, T. R. Science 1997, 276, 561-567.
50. Zachariae, W.; Shevchenko, A.; Andrews, P. D.; Ciosk, R.; Galova, M.; Stark, M. J. R.; Mann, M.; Nasmyth, K. Science 1998, 279, 1216-1219.
51. Yaron, A.; Hatzubai, Y. A.; Davis, M.; Amit, S.; Manning, A. M.; Andersen, J. S.; Mann, M.; Mercurio, F.; Ben-Neriah, Y. Nature 1998, 396, 590-594.
52. Betts, J. C.; Blackslock, W. P.; Ward, M. A.; Anderton, B. H. J. Biol. Chem. 1997, 272, 12922-12927.
53. Webb, Y.; Zhou, X.; Ngo, L.; Cornish, V.; Stahl, J.; Erdjument-Bromage, H.; Tempst, P.; Rifkind, R. A.; Marks, P. A.; Breslow, R.; Richon, V. M. J. Biol. Chem. 1999, 274, 14280-14287.
54. Straight, A. F.; Shou, W.; Dowd, G. J.; Turck, C. W.; Deshaies, R. J.; Johnson, A. D.; Moazed, D. Cell 1999, 97, 245-256.
55. Dole, M.; Mach, L. L.; Hines, R. L.; Mobley, R. C.; Ferguson, L. P.; Alice, M. B. J. Chem. Phys. 1968, 49, 2240-2249.
56. Thomson, B. A.; Iribarne, J. V. J. Chem. Phys. 1979, 71, 4451-4463.
57. Yamashita, M.; Fenn, J. J. Chem. Phys. 1984, 88, 4451-59.
58. Aleksandrov, M. L.; Gall, L. N.; Krasnow, N. V.; Nikolayev, V. I.; Pavlenko, V. A.; Shkurov, V. A. Dokl. Phys. Chem. 1985, 277, 572-76.
59. Meng, C. K.; Mann, M.; Fenn, J. B. Z. Phys. D 1988, 10, 361-368.
60. Fenn, J. B.; Mann, M.; Meng, C. K.; Wong, S. F.; Whitehouse, C. M. Science 1989, 246, 64-71.
61. Schmelzeisen-Redeker, G.; Bütfering, L.; Röllgen, F. W. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1989, 90, 139-150.
62. Smith, R. D.; Loo, J. A.; Edmonds, C. G.; Baringa, C. J.; Udseth, H. R. Anal. Chem. 1990, 62, 882-899.
63. Sakairi, M.; Yergey, A. L.; Siu, K. W. M.; LeBlanc, J. C. Y.; Guevremont, R.; Berman, S. S. Anal. Chem. 1991, 63, 1488-1490.
64. Fenn, J. B. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1993, 4, 524-535.
65. Tang, L.; Kebarle, P. 1993, 65, 3654-3668.
66. Winger, B. E.; Light-Wahl, K. J.; Ogorzalek Loo, R. R.; Udseth, H. R.; Smith, R. D. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1993, 4, 536-545.
67. Wang, G.; Cole, R. B. Anal. Chem. 1995, 67, 2892-2900.
68. Fernandez de la Mora, F.; Loscertales, I. G. J. Fluid Mech. 1992, 243, 561-574.
69. Kabarle, P.; Tang, L. Anal. Chem. 1993, 65, 972A-986A.
70. Juraschek, R.; Dülcks, T.; Karas, M. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1999, 10, 300-308.
71. Kriger, M. S.; Cook, K. D.; Ramsey, R. S. Anal. Chem. 1995, 67, 385-389.
72. Valaskovic, G. A.; McLafferty, F. W. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1996, 10, 825-828.
73. Kelly, J. F.; Ramaley, L.; Thibault, P. Anal. Chem. 1997, 69, 51-60.