NMR assignment and secondary structure determination of an octameric 110 kDA protein using TROSY in triple resonance experiments

Journal of the American Chemical Society

Volumn 122, Issue 31, 2000, Pages 7543-7548

  Salzmann, Michael ^a,b,c   Pervushin, Konstantin ^a   Wider, Gerhard ^a   Senn, Hans ^b   Wüthrich, Kurt ^a  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

^b F HOFFMANN LA ROCHE LTD   (Switzerland)

^c Bruker AG   (Switzerland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CARBON 13; DEUTERIUM; FRUCTOSE BISPHOSPHATE ALDOLASE; NEOPTERIN; NITROGEN 15; PROTEIN;

ARTICLE; NONHUMAN; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT; PROTEIN FOLDING; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; STAPHYLOCOCCUS AUREUS;

EID: 0034625918     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja0003268     Document Type: Article

References (37)

1. Abbreviations: 3D, three-dimensional; CRINEPT, cross correlated relaxation-enhanced polarization transfer; ct, constant-time: DHNA, 7,8-dihydroneopterin aldolase; NMR, nuclear magnetic resonance; NOE, nuclear Overhauser effect; rf, radio frequency; NOESY, NOE spectroscopy; TROSY, transverse relaxation-optimized spectroscopy.
2. Wüthrich, K.; Wider, G.; Wagner, G.; Braun, W. J. Mol. Biol. 1982, 155, 311-319.
3. Wüthrich, K. NMR of Proteins and Nucleic Acids; Wiley: New York, 1986.
4. Shuker, S. B.; Hajduk, P. J.; Meadows, R. P.; Fesik, S. W. Science 1996, 274, 1531-1534.
5. Spera, S.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 5490-5492. Wishart, D. S.; Sykes, B. D.; Richards, F. M. J. Mol. Biol. 1991, 222, 311-333. Luginbühl, P.; Szyperski, T.; Wüthrich, K. J. Magn. Reson. B 1995, 109, 229-233.
6. Spera, S.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 5490-5492. Wishart, D. S.; Sykes, B. D.; Richards, F. M. J. Mol. Biol. 1991, 222, 311-333. Luginbühl, P.; Szyperski, T.; Wüthrich, K. J. Magn. Reson. B 1995, 109, 229-233.
7. Spera, S.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 5490-5492. Wishart, D. S.; Sykes, B. D.; Richards, F. M. J. Mol. Biol. 1991, 222, 311-333. Luginbühl, P.; Szyperski, T.; Wüthrich, K. J. Magn. Reson. B 1995, 109, 229-233.
8. Wider, G. Prog. NMR Spectrosc. 1998, 32, 193-275.
9. Otting, G.; Liepinsh, E.; Wüthrich, K. Science 1991, 254, 974-980.
10. Pervushin, K.; Riek, R.; Wider, G.; Wüthrich, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 12366-12371.
11. Wüthrich, K. Nature Struct. Biol. 1998, 5, 492-495.
12. Riek, R.; Wider, G.; Pervushin, K.; Wüthrich, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 4918-4923.
13. Salzmann, M.; Pervushin, K.; Wider, G.; Senn, H.; Wüthrich K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 13585-13590.
14. Salzmann, M.; Wider, G.; Pervushin, K.; Senn, H.; Wüthrich K. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 844-848.
15. Salzmann, M.; Pervushin, K.; Wider, G.; Senn, H.; Wüthrich, K. J. Biomol. NMR 1999, 14, 85-88.
16. Salzmann, M.; Wider, G.; Pervushin, K.; Wüthrich, K. J. Biomol. NMR 1999, 15, 182-185.
17. Hennig, M.; D'Arcy, A.; Hampele, I. C., Page, M. G. P.; Oefner, C.; Dale, G. E. Nature Struct. Biol. 1998, 5, 357-362.
18. Pervushin, K.; Wider, G.; Riek, R.; Wüthrich, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 9607-9612. Zhu, G.; Kong, X. M.; Sze, K. H. J. Biomol. NMR 1999, 13, 77-81.
19. Pervushin, K.; Wider, G.; Riek, R.; Wüthrich, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 9607-9612. Zhu, G.; Kong, X. M.; Sze, K. H. J. Biomol. NMR 1999, 13, 77-81.
20. DeMarco, A.; Wüthrich, K. J. Magn. Reson. 1976, 24, 201-204.
21. Güntert, P.; Dötsch, V.; Wider, G.; Wüthrich, K. J. Biomol. NMR 1992, 2, 619-629.
22. Bartels, C.; Xia, T.; Billeter, M.; Güntert, P.; Wüthrich, K. J. Biomol. NMR 1995, 5, 1-10.
23. Bax, A.; Grzesiek, S. Acc. Chem. Res. 1993, 26, 131-138.
24. Grzesiek, S.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1992, 96, 432-440.
25. Grzesiek, S.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 12593-12594.
26. Piotto, M.; Saudek, V.; Sklenar, V. J. J. Biomol. NMR 1992, 2, 661-665.
27. McCoy, M. A.; Mueller, L. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 2108-2112.
28. Gardner, K. H.; Zhang, X.; Gehring, K.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 11738-11748.
29. Dubs, A.; Wagner, G.; Wüthrich, K. Biochim. Biophys. Acta 1979, 577, 177-194. Wagner, G.; Anil-Kumar; Wüthrich, K. Eur. J. Biochem. 1981, 114, 375-384.
30. Dubs, A.; Wagner, G.; Wüthrich, K. Biochim. Biophys. Acta 1979, 577, 177-194. Wagner, G.; Anil-Kumar; Wüthrich, K. Eur. J. Biochem. 1981, 114, 375-384.
31. Richarz, R.; Wüthrich, K. Biopolymers 1978, 17, 2133-2141. Wishart, D. S.; Sykes, B. D. J. Biomol. NMR 1994, 4, 171-180.
32. Richarz, R.; Wüthrich, K. Biopolymers 1978, 17, 2133-2141. Wishart, D. S.; Sykes, B. D. J. Biomol. NMR 1994, 4, 171-180.
33. Metzler, W. J.; Constantine, K. L.; Friedrichs, M. S.; Bell, A. J.; Ernst, E. G.; Lavoie, T. B.; Mueller, L. Biochemistry 1993, 32, 13818-13829.
34. Yamazaki, T.; Otomo, T.; Oda, N.; Kyogoku, Y.; Uegaki, K.; Ito, N.; Ishino, Y.; Nakamura, H. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5591-5592. Otomo, T.; Teruya, K.; Uegaki, K.; Yamazaki, T.; Kyogoku, Y. J. Biomol. NMR 1999, 14, 105-114.
35. Yamazaki, T.; Otomo, T.; Oda, N.; Kyogoku, Y.; Uegaki, K.; Ito, N.; Ishino, Y.; Nakamura, H. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5591-5592. Otomo, T.; Teruya, K.; Uegaki, K.; Yamazaki, T.; Kyogoku, Y. J. Biomol. NMR 1999, 14, 105-114.
36. Wang, J.; Hinck, A. P.; Loh, S. N.; LeMaster, D. M.; Markley, J. L. Biochemistry 1992, 31, 921-936. Chen, Y.; Reizer, J.; Saier, H.; Fairbrother, W.J.; Wright, P. Biochemisty 1993, 32, 32-37.
37. Wang, J.; Hinck, A. P.; Loh, S. N.; LeMaster, D. M.; Markley, J. L. Biochemistry 1992, 31, 921-936. Chen, Y.; Reizer, J.; Saier, H.; Fairbrother, W.J.; Wright, P. Biochemisty 1993, 32, 32-37.