Stretching single molecules along unbinding and unfolding pathways with the scanning force microscope

Chemistry - A European Journal

Volumn 6, Issue 23, 2000, Pages 4249-4255

  Samorì, Bruno ^a  

^a UNIVERSITY OF BOLOGNA   (Italy)

Author keywords

Mechanochemistry; Protein folding; Scanning probe microscopy; Single molecule chemistry

Indexed keywords

DNA;

ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CONFORMATION; KINETICS; MOLECULAR DYNAMICS; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN FOLDING; SCANNING ELECTRON MICROSCOPE; THERMODYNAMICS;

DNA; MICROSCOPY, ATOMIC FORCE; MOLECULAR CONFORMATION; NUCLEIC ACID CONFORMATION; THERMODYNAMICS;

EID: 0034407202     PISSN: 09476539     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/1521-3765(20001201)6:23<4249::AID-CHEM4249>3.3.CO;2-P     Document Type: Short Survey

References (51)

1. B. Samorì, Angew. Chem. 1998, 110, 2318-2321; Angew. Chem. Int. Ed. 1998, 110, 2198-2200, and references cited therein.
2. B. Samorì, Angew. Chem. 1998, 110, 2318-2321; Angew. Chem. Int. Ed. 1998, 110, 2198-2200, and references cited therein.
3. S. B. Smith, L. Finzi, C. Bustamante, Science 1992, 258, 1122-1126.
4. C. Bustamante, D. Keller, Phys. Today 1995, Dec., 32-38.
5. H. Takano, J. R. Kenseth, S. Wong, J. C. O'Brien, M. D. Porter, Chem. Rev. 1999, 99, 2485-2490.
6. M. B. Viani, T. E. Schaffer, A. Chand, M. Rief, H. E. Gaub, P. K. Hansma, J. Appl. Phys. 1999, 86, 2258-2262.
7. M. Grandbois, M. Beyer, M. Rief, H. Clausen-Schaumann, H. E. Gaub, Science 1999, 283, 1727-1730.
8. M. Rief, H. Clausen-Schamann, H. E. Gaub, Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 346-349.
9. M. Conti, G. Falini, B. Samorì, Angew. Chem. 2000, 112, 221-224; Angew. Chem. Int. Ed. 2000, 39, 215-218.
10. M. Conti, G. Falini, B. Samorì, Angew. Chem. 2000, 112, 221-224; Angew. Chem. Int. Ed. 2000, 39, 215-218.
11. B. L. Smith, T. E. Schaffer, M. Viani, J. B. Thompson, N. A. Frederick, J. Kindt, A. Belcher, G. D. Stucky, D. E. Morse, P. K. Hansma, Nature 1999, 399, 761-763.
12. G. Yang, C. Cecconi, W. A. Baase, I. R. Vetter, W. A. Breyer, J. A. Haack, B. W. Matthews, F. W. Dahlquist, C. Bustamante, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 1-6.
13. A. F. Oberhauser, P. E. Marszalek, H. P. Erickson, J. M. Fernandez, Nature 1998, 393, 181-185.
14. M. Rief, F. Oesterhelt, B. Heymann, H. E. Gaub, Science 1997, 275, 1295-1297.
15. P. E. Marszalek, Y.-P. Pang, H. Li, J. El Yazal, A. F. Oberhausen, J. M. Fernandez, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 7894-7898.
16. M. Rief, M. Gautel, F. Oesterhelt, J. M. Fernandez, H. E. Gaub, Science 1997, 276, 1109-1112.
17. a) E. L. Florin, V. T. Moy, H. E. Gaub, Science 1994, 264, 415-417;
18. b) V. T. Moy, E. L. Florin, H. E. Gaub, Science 1994, 266, 257-259;
19. c) G. U. Lee, L. A. Chris, R. J. Colton, Science 1994, 266, 771-773.
20. a) D. J. Muller, W. Baumeister, A. Engel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 13170-13174;
21. b) F. Oesterhelt, D. Oesterhelt, M. Pfeiffer, A. Engel, H. E. Gaub, D. J. Muller, Science 2000, 288, 143-146.
22. A. Raab, W. Han, D. Badt, S. J. Smith-Gill, S. M. Lindsay, H. Schindler, P. Hinterdorfer, Nat. Biotechnol. 1999, 17, 902-905.
23. P. Hinterdorfer, W. Baumgartner, H. J. Gruber, K. Schilcher, H. Schindler, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 3477-3481.
24. E. Evans, K. Ritchie, Biophys. J. 1999, 76, 2439-2447.
25. C. Bustamante, C. Rivetti, D. J. Keller, Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 709-716.
26. D. J. Muller, D. Fotiadis, S. Scheuring, S. A. Muller, A. Engel, Biophys. J. 1999, 76, 1101-1111.
27. C. Duschl, A. F. Sevin-Landais, H. Vogel, Biopys. J. 1996, 70, 1985-1995.
28. A. Noy, D. V. Vezenov, J. F. Kayyem, T. J. Meade, C. M. Lieber, Chem. Biol. 1997, 4, 519-527.
29. P. Samorì, J. Diebel, H. Lẅe, J. P. Rabe, Langmuir 1999, 15, 2592-2594, and references cited therein.
30. G. I. Bell, Science 1978, 200, 618-627.
31. E. Evans, K. Ritchie, Biophys. J. 1997, 72, 1541-1555.
32. R. Merkel, P. Nassoy, A. Leung, K. Ritchie, E. Evans, Nature 1999, 397, 50-53.
33. K. L. Sebastian, Phys. Rev. E 2000, 62, 1128-1132.
34. a) M. Balsera, S. Stepaniants, S. Israilev, Y. Oono, K. Schultzen, Biophys. J. 1997, 73, 1281-1287;
35. b) S. Izrailev, S. Stepaniants, M. Balsera, Y. Oono, K. Schulten, Biophys. J. 1997, 72, 1568-1581;
36. c) J. Gullingsrud, R. Braun, K. Schulten, J. Comput. Phys. 1999, 151, 190-211.
37. M. Rief, J. M. Fernandez, H. E. Gaub, Phys. Rev. Lett. 1998, 81, 4764-4767.
38. 3.
39. 3.
40. Y. Cui, C. Bustamante, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 127-132.
41. H. Li, F. Oberhauser, S. B. Fowler, J. Clarke, J. M. Fernandez, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 6527-6531.
42. F. Schwesinger, R. Ros, T. Strunz, D. Anselmetti, H-J. Guntherodt, A. Honegger, L. Jermutus, L. Tiefenauer, A. Plückthun, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 9972-9977.
43. P. Hinterdorfer, K. Schilcher, W. Baumgartner, H. J. Gruber, H. Schindler, Nanobiology 1998, 4, 177-188.
44. M. Carrion-Vazquez, A. F. Oberhauser, S. B. Fowler, P. E. Marszalek, S. E. Broedel, J. Clarke, J. M. Fernandez, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 3694-3699.
45. T. Strunz, K. Oroszlan, R Scafer, H. J. Guntherodt, Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999, 96, 11277-11282.
46. A. F. Oberhauser, P. E. Marszalek, M. Carrion-Vazquez, J. M. Fernandez, Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 1025-1028.
47. T. T. Perkin, D. E. Smith, S. Chu, Science 1997, 276, 2016-2021.
48. C. Bustamante, M. Guthold, X. Zhu, G. Yang, J. Biol. Chem. 1999, 24, 16665-16668.
49. W. E. Moerner, M. Orrit, Science 1999, 283, 1670-1675.
50. S. Weiss, Science 1999, 283, 1676-1683.
51. D. Keller, C. Bustamante, Biophys. J. 2000, 78, 541-556.