Very stable ribonucleotide substrate radical relevant for class I ribonucleotide reductase

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 104, Issue 31, 2000, Pages 7502-7509

  Himo, Fahmi ^a   Siegbahn, Per E M ^a  

^a STOCKHOLM UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FREE RADICALS; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR STRUCTURE; NUCLEIC ACIDS;

DEOXYRIBONUCLEOTIDE; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE;

ENZYMES;

EID: 0034248628     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp000752f     Document Type: Article

References (29)

1. Voet, D.; Voet, J. G. Biochemistry; John Wiley and Sons: New York, 1995.
2. Stubbe, J.; van der Donk, W. A. Chem. Rev. 1998, 98, 705-762.
3. Sjöberg, B. M. Structure 1994, 2,793-796.
4. Sjöberg, B.-M. Struct. Bonding 1997, 88, 139-173.
5. Gräslund, A.; Sahlin M.Annu. Rev. Biophys. Biomol. Stmct. 1996, 25, 259-286.
6. Reichard, P. Science 1993, 260, 1773-1777.
7. Siegbahn, P. E. M.; Blomberg, M. R. A.; Crabtree, R. H. Theor. Chem. Acc. 1997, 97, 289-300.
8. Siegbahn, P. E. M.; Eriksson, L.; Himo, F.; Pavlov, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 10622-10629.
9. Nordlund, P.; Sjöberg, B.-M.; Eklund, H. Nature 1990, 345, 593-598.
10. Uhlin, U.; Eklund, H. Nature 1994, 370, 533-539.
11. Eriksson, M.; Uhlin, U.; Ramaswamy, S.; Ekberg, M.; Regnström, K.; Sjöberg, B.-M.; Eklund, H. Structure 1997, 5, 1077-1092.
12. Stubbe, J. Biol. Chem. 1990, 265, 5330.
13. Mao, S. S.; Holler, T. P.; Yu, G. X.; Bollinger, J. M.; Booker, S.; Johnston, M. I.; Stubbe, J. Biochemistry 1992, 31, 9733-9743.
14. Siegbahn, P. E. M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 720, 8417-8429.
15. Zipse, H. J. Am. Chem. Soc. 1995, 777, 11798-11806.
16. Stubbe, J. Adv. Enzymol. Relat. Areas Mol Biol. 1990, 63, 349-417.
17. Beckwith, A. L. J.; Crich, D.; Duggan, P. J.; Yao, Q. Chem. Rev. 1997, 97, 3273-3312.
18. Lenz, R.; Giese, B. J. Am. Chem. Soc. 1997, 779, 2784-2794.
19. Robins, M. J.; Guo, Z.; Samano, M. C.; Wnuk, S. F. J. Am. Chem. Soc. 1999, 727, 1425-1433.
20. Persson, A. L.; Eriksson, M.; Katterle, B.; Pötsch, S.; Sahlin, M.; Sjöberg, B.-M. J. Biol. Chem. 1997, 272, 31533-31541.
21. Persson, A. L.; Sahlin, M.; Sjöberg, B.-M. J. Biol. Chem. 1998, 273, 31016-31020.
22. Lawrence, C. C.; Obias, H.; Stubbe, J.; Bennati, M.; Bar, G.; Griffin, R. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 8979-8984.
23. Becke, A. D. Phys. Rev. 1988, A38, 3098.
24. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993 98, 1372, 5648.
25. Bauschlicher, C. W., Jr.; Ricca, A.; Partridge, H.; Langhoff, S. R. In Recent Advances in Density Functional Methods;, Chong, D. P., Ed.; World Scientific Publishing Company: Singapore, 1997; Part II, p 165.
26. Wiberg, K. A.; Keith, T. A.; Frisch, M. J.; Murcko, M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 9072.
27. Prabhakar, R.; Blomberg, M. R. A.; Siegbahn, P. E. M. Theor. Chem. Acc., submitted.
28. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Keith, T.; Petersson, G. A.; Montgomery, J. A.; Raghavachari, K.; Al-Laham, M. A.; Zakrzewski, V. G.; Ortiz, J. V.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Peng, C. Y.; Ayala, P. Y.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Replogle, E. S.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Binkley, J. S.; Defrees, D. J.; Baker, J.; Stewart, J. P.; HeadGordon, M.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 94, Revision B.2; Gaussian Inc.: Pittsburgh, PA, 1995.
29. Froese, D. J.; Humbel, S.; Svensson, M.; Morokuma, K. J. Phys. Chem. 1997, 707, 227.