Intracellular expression and function of antisense catalytic RNAs

Methods in Enzymology

Volumn 313, Issue , 2000, Pages 401-420

  Castanotto, Daniela ^a   Scherr, Michaela ^a   Rossi, John J ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPLEMENTARY RNA; RIBOZYME;

ARTICLE; ENZYME ACTIVE SITE; ENZYME ANALYSIS; ENZYME STRUCTURE; GENE TARGETING; GENE TECHNOLOGY; HUMAN; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROMOTER REGION; PROTEIN EXPRESSION; STRUCTURE ANALYSIS;

EID: 0033991459     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(00)13025-3     Document Type: Article

References (78)

1. R. E. Christoffersen and J. J. Marr, J. Med Chem. 38, 2023 (1995).
2. J. J. Rossi, Trends Genet. 14, 295 (1998).
3. J. Ohkawa, N. Yuyama, Y. Takebe, S. Nishikawa, and K. Taira, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90, 11302 (1993).
4. J. Ohkawa, N. Yuyama, Y. Takebe, S. Nisikawa, M. Homann, G. Sczakiel, and K. Taira, Nucleic Acids Sym. Ser. 29, 121 (1993).
5. C. J. Chen, A. C. Banerjea, G. G. Harmison, K. Haglund, and M. Schubert, Nucleic Acids Res. 20, 4581 (1992).
6. E. Bertrand, D. Castanotto, C. Zhou, C. Carbonnelle, N. S. Lee, P. Good, S. Chatterjee, T. Grange, R. Pictet, D. Kohn, D. Engelke, and J. J. Rossi, RNA 3, 75 (1997).
7. B. A. Sullenger and T. R. Cech, Science 262, 1566 (1993).
8. A. Lieber and M. Strauss, Mol. Cell Biol. 15, 540 (1995).
9. A. Lieber, M. Rohde, and M. Strauss, Methods Mol. Biol. 74, 45 (1997).
10. J. J. Rossi, Curr. Biol. 4, 469 (1994).
11. J. J. Rossi, Curr. Opin. Biotechnol. 3, 3 (1992).
12. D. Castanotto, J. J. Rossi, and J. O. Deshler, Crit. Rev. Eukaryot. Gene Expr. 2, 331 (1992).
13. B. J. Saville and R. A. Collins, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 8826 (1991).
14. T. Rastogi and R. A. Collins, J. Mol. Biol. 277, 215 (1998).
15. T.-R. Cech, Annu. Rev. Biochem. 59, 543 (1990).
16. D. Herschlagand and T. R. Cech, Biochemistry 29, 10159 (1990).
17. B. L. Golden, A. R. Gooding, E. R. Podell, and T. R. Cech, Science 282, 259 (1998).
18. D. Herschlag and T. R. Cech, Nature 344, 405 (1990).
19. J. T. Jones, S. W. Lee, and B. A. Sullenger, Nature Med, 2, 643 (1996).
20. J. T. Jones, S. W. Lee, and B. A. Sullenger, Methods Mol. Biol. 74, 341 (1997).
21. N. Lan, R. P. Howrey, S. W. Lee, C. A. Smith, and B. A. Sullenger, Science 280, 1593 (1998).
22. S. Altman, Biotechnology 13, 327 (1995).
23. Y. Yuan and S. Altman, EMBO J. 14, 159 (1995).
24. A. C. Forster and S. Altman, Science 249, 783 (1990).
25. F. Liu and S. Altman, Genes Dev. 9, 471 (1995).
26. Y. Li and S. Altman, Nucleic Acids Res. 24, 835 (1996).
27. Y. Yuan, E. S. Hwang, and S. Altman, Proc. Natl, Acad. Sci. U.S.A. 89, 8006 (1992).
28. W. G. Scott and A. Klug, Trends Biochem. Sci. 21, 220 (1996).
29. H. W. Pley, K. M. Flaherty, and D. B. McKay, Nature 372, 111 (1994).
30. A. Hampel, Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 58, 1 (1998).
31. T. Tuschl, J. B. Thomson, and F. Eckstein, Curr. Opin. Struct. Biol. 5, 296 (1995).
32. N. G. Walter, E. Albinson, and J. M. Burke, Nucleic Acids Symp. Ser. 36, 175 (1997).
33. F. Walter, A. I. H. Murchie, and D. M. J. Lilley, Biochemistry 37, 17629 (1980).
34. A. Berzal-Herranz and J. M. Burke, Methods Mol. Biol. 74, 349 (1997).
35. S. Joseph and J. M. Burke, J. Biol. Chem. 268, 24515 (1993).
36. A. R. Ferre-D'Amare, K. Zhou, and J. A. Doudna, Nature 395, 567 (1998).
37. T. B. Campbell, C. K. McDonald, and M. Hagen, Nucleic Acids Res. 25, 4985 (1997).
38. K. R. Birikh, Y. A. Berlin, H. Soreq, and F. Eckstein, RNA 3, 429 (1997).
39. M. Scherr and J. J. Rossi, Nucleic Acids Res. 26, 5079 (1998).
40. P. A. Weil, J. Segall, B. Harris, S. Y. Ng, and R. G. Roeder, J. Biol. Chem. 254, 6163 (1979).
41. A. Michienzi, S. Prislei, and I. Bozzoni, Proc. Nad. Acad. Sci. U.S.A. 93, 7219 (1996).
42. P. D. Good, A. J. Krikos, S. X. Li, E. Bertrand, N. S. Lee, L. Giver, A. Ellington, J. A. Zaia, J. J. Rossi, and D. R. Engelke, Gene Ther. 4, 45 (1997).
43. R. Singh, S. Gupta, and R. Reddy, Mol. Cell Biol. 10, 939 (1990).
44. I. W. Mattaj, N. A. Dathan, H. D. Parry, P. Carbon, and A. Krol, Cell 55, 435 (1988).
45. S. Prislei, S. B. Buonomo, A. Michienzi, and I. Bozzoni, RNA 3, 677 (1997).
46. L. Cagnon, M. Cucchiarini, J. C. Lefebvre, and A. Doglio, J. Acquir. Immune Defic. Syndr. Hum. Retrovirol. 9, 349 (1995).
47. M. Cotton and M. L. Birnstiel, EMBO J. 8, 3861 (1989).
48. N. Yuyama, J. Ohkawa, Y. Inokuchi, M. Shirai, A. Sato, S. Nishikawa, and K. Taira, Biochem. Biophys. Res. Commun. 186, 1271 (1992).
49. J. D. Thompson, D. F. Ayers, T. A. Malmstrom, T. L. McKenzie, L. Ganousis, B. M. Chowrira, L. Couture, and D. T. Stinchomb, Nucleic Acids Res. 23, 2259 (1995).
50. R. Kellum and P. Schedl, Cell 64, 941 (1991).
51. R. R. Roseman, V. Pirrotta, and P. K. Geyer, EMBO J. 12, 435 (1993).
52. P. K. Geyer and V. G. Corces, Genes Dev. 6, 1865 (1992).
53. X. P. Zhong and M. S. Krangel, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94, 5219 (1997).
54. J. H. Chung, M. Whiteley, and G. Felsenfeld, Cell 74, 505 (1993).
55. D. Klehr, K. Maass, and J. Bode, Biochemistry 30, 1264 (1991).
56. M. Kalos and R. E. Fournier, Mol. Cell Biol. 15, 198 (1995).
57. L. Poljak, C. Seum, T. Mattioni, and U. K. Laemmli, Nucleic Acids Res. 22, 4386 (1994).
58. M. Agarwal, T. W. Austin, F. Morel, J. Chen, E. Bohnlein, and I. Plavec, J. Virol. 72, 3720 (1998).
59. Y. Shimizu. Y. Oka, H. Ogawa, T. Kishimoto, and H. Sugiyama, Immunol. Invest. 21, 183 (1992).
60. M. Szyf, G. Tanigawa, and P. L. McCarthy, Jr., Mol. Cell Biol. 10, 4396 (1990).
61. G. M. Arndt and G. H. Rank, Genome 40, 785 (1997).
62. Y. Oleynikov and R. H. Singer, Trends Cell Biol. 8, 381 (1998).
63. R. A. Morgan and W. F. Anderson, Annu. Rev. Biochem. 62, 191 (1993).
64. B. K. Pal, L. Scherer, L. Zelby, E. Bertrand, and J. J. Rossi, J. Virol. 72, 8349 (1998).
65. P. A. Hantzopoulos, B. A. Sullenger, G. Ungers, and E. Gilboa, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 3519 (1989).
66. B. A. Sullenger, T. C. Lee, C. A. Smith, G. E. Ungersand, and E. Gilboa, Mol. Cell Biol. 10, 6512 (1990).
67. P. M. Challita, D. Skelton, A. el-Khoueiry, X. J. Yu, K. Weinberg, and D. B. Kohn, J. Virol. 69, 748 (1995).
68. W. J. Krall, D. C. Skelton, X. J. Yu, I., Riviere, P. Lehn, R. C. Mulligan, and D. B. Kohn, Gene Ther. 3, 37 (1996).
69. P. B. Robbins, X. J. Yu, D. M. Skelton, K. A. Pepper, R. M. Wasserman, L. Zhu, and D. B. Kohn, J. Virol. 71, 9466 (1997).
70. C. M. Gorman, P. W. Rigby, and D. P. Lane, Cell 42, 519 (1985).
71. D. D. Bowtell, S. Cory, G. R. Johnson, and T. J. Gonda, J. Virol. 62, 2464 (1988).
72. F. Grignani, T. Kinsella, A. Mencarelli, M. Valtieri, D. Riganelli, L. Lanfrancone, C. Peschle, G. P. Nolan, and P. G. Pelicci, Cancer Res. 58, 14 (1998).
73. C. M. Lynch and A. D. Miller, J. Virol. 65, 3887 (1991).
74. R. W. Malone, P. L. Felgner, and I. M. Verma, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 6077 (1989).
75. N. Duzgunes and P. L. Feigner, Methods Enzymol 221, 303 (1993).
76. P. L. Felgner, Y. J. Tsai, L. Sukhu, C. J. Wheeler, M. Manthorpe, J. Marshall, and S. H. Cheng, Ann. N.Y. Acad. Sci. 772, 126 (1995).
77. D. E. Ruffner, G. D. Stormo, and O. C. Uhlenbeck, Biochemistry 29, 10695 (1990).
78. A. Berzal-Herranz, S. Joseph, B. M. Chowrira, S. E. Butcher, and J. M. Burke, EMBO J. 12, 2567 (1993).