Interactions of tris(phenanthroline)ruthenium(II) enantiomers with DNA: Effects on helix flexibility studied by the electrophoretic behavior of reptating DNA in agarose gel

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 104, Issue 15, 2000, Pages 3651-3659

  Gisselfält, Katrin ^a   Lincoln, Per ^a   Nordén, Bengt ^a   Jonsson, Mats ^a  

^a CHALMERS UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING ENERGY; CARRIER MOBILITY; ELECTROPHORESIS; GELS;

AGAROSE GEL; ENANTIOMERS; HELIX FLEXIBILITY; TRISPHENANTHROLINE RUTHENIUM;

DNA;

EID: 0033732392     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp993369n     Document Type: Article

References (40)

1. Nordén, B.; Lincoln, P.; Åkerman, B.; Tuite, E. In Metal Ions in Biological Systems; Sigel, A., Sigel, H., Eds.; Marcel Dekker: New York 1996; pp 177-250.
2. Coury, J. E.; Anderson, J. R.; McFail-lsom, L.; .Williams, L. D.; ' Bottomley, L. A. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 3792.
3. Lincoln, P.; Nordén, B. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 9583.
4. Barton, J. K. J. Biomol. Struct. Dyn. 1983, 1, 621.
5. Barton, J. K.; Danishefsky, A. T.; Goldberg, J. M. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 2172.
6. Rehmann, J. P.; Barton, J. K. Biochemistry 1990, 29, 1701.
7. Eriksson, M.; Leijon, M.; Hjort, C.; Nordén, B.; Gräslund, A. Biochemistry 1994, 5031.
8. Hjort, C.; Nordén, B.; Rodger, A. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 1971.
9. Satyanarayana, S.; Dabrowiak, J. C.; Chaires, J. B. Biochemistry 1993, 32, 2, 2573.
10. Diekmann, S. Methods Enzymol. 1992, 272, 30.
11. Zimm, B.. H.; Levene, S. D. Q. Rev. Biophys.1992, 25, 171.
12. Slater, G. W.; Rousseau, J.; Noolandi, J.; Turmel, C.; Lalande, M. Biopolymers 1988, 27, 509.
13. Gisselfält, K. Åkerman, B.; Jonsson, M., Electrophoresis 1997, 18, 663.
14. Dwyer, F. P.; Gyarfas, E. C. J. Proc. R. Soc. NSW 1949, 170.
15. Hjort, C.; Lincoln, P.; Nordén, B. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 3488.
16. Larsson, A.; Åkerman, B.; Jonsson, M. J. Phys. Chem. 1996, 100, 3252.
17. Jonsson, M.; Åkerman, B.; Nordén, B. Biopolymers 1988, 27, 381.
18. Serwer, P. Electrophoresis 1983, 4, 375.
19. Nordén, B.; Kubista, M.; Kurucsev, T. Q. Rev. Biophys. 1992, 25, 51.
20. Åkerman, B.; Jonsson, M. J. Phys. Chem. 1990, 94, 3828.
21. Holzwarth, G.; McKee, C. B.; Steiger, S.; Crater, G. Nucl. Acids Res. 1987, 75, 10031.
22. Åkerman, B.; Jonsson, M.; Nordén, B.; Lalande, M. Biopolymers 1989. 28, 1541.
23. Sturm, J.; Weill, G. 'Phys. Rev. Lett. 1989, 62, 1484.
24. Keiner, L. E.; Holzwarth, G. J. Chem. Phys. 1992, 97, 4476.
25. Mayer, P.; Sturm, J.; Weill, G. Biopolymers 1993, 33, 1347.
26. Mayer, P.; Sturm, J.; Weill, G. Biopolymers 1993, 33, 1359.
27. Smith, S. B.; Aldridge, P. K.; Callis, J. B. Science 1989, 243, 203.
28. Schwanz, D. C; Koval, M. Nature 1989, 338, 520.
29. Gurrieri, S.; Rizzarelli, E.; Beach, D.; Bustamante, C. Biochemistry 1990, 29, 3396.
30. Oana, H.; Masubuchi, Y.; Matsumoto, M.; Doi, M.; Matsuzawa, Y.; Yoshikawa, K. Macromolecules 1994, 27, 6061.
31. Howard, T. D.; Holzwarth, B., Biophys. J. 1992, 63, 1487.
32. Larsson, A.; Åkerman, B. Macromolecules 1995, 28, 4441.
33. Carlsson, C.; Larsson, A.; Jonsson, M. Electrophoresis 1996, 17, 642.
34. Åkerman, B. Electrophoresis 1996, 17, 1027.
35. Haq, I.; Lincoln, P.; Suh, D.; Nordén, B.; Chowhry, B. Z.; Chaires, J. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4788.
36. Lincoln, P.; Broo, A.; Nordén, B. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2644.
37. Magnúsdóttir, S.; Åkerman, B.; Jonsson, M. J. Phys. Chem. 1994, 98, 2624.
38. Satyanarayana, S.; Dabrowiak, J. C.; Chaires, J. B. Biochemistry 1992, 31, 9319.
39. Hervet, H.; Bean, C. P. Biopolymers 1987, 26, 727.
40. Nordén, B.; Elvingsson, C.; Jonsson, M. Åkerman, B. Q. Rev. Biophys. 1991, 24, 103.