Substrate and binding specificities of bacterial polyhydroxybutyrate depolymerases

International Journal of Biological Macromolecules

Volumn 24, Issue 4, 1999, Pages 329-336

  Kasuya, Ken Ichi ^a   Ohura, Takeshi ^b   Masuda, Kozue ^a   Doi, Yoshiharu ^a,b  

^a INST OF PHYS AND CHEMICAL RESEARCH   (Japan)

^b SAITAMA UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

Catalytic domain; PHB depolymerase; Substrate binding domain

Indexed keywords

BACTERIAL ENZYME; POLY(3 HYDROXYBUTYRIC ACID); POLYESTER;

ADSORPTION; ARTICLE; BINDING AFFINITY; CHEMICAL STRUCTURE; DELFTIA ACIDOVORANS; ENZYME ACTIVE SITE; ENZYME SPECIFICITY; HYDROLYSIS; MACROMOLECULE; NONHUMAN; NUCLEOTIDE SEQUENCE; PSEUDOMONAS STUTZERI; SEQUENCE ANALYSIS;

ALCALIGENES FAECALIS; BACTERIA (MICROORGANISMS); COMAMONAS TESTOSTERONI; DELFTIA ACIDOVORANS; PISUM SATIVUM; PSEUDOMONAS; PSEUDOMONAS STUTZERI;

EID: 0033066633     PISSN: 01418130     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1016/S0141-8130(99)00046-X     Document Type: Article

References (41)

1. Doi Y. Microbial Polyesters. 1990;VCH Publishers, New York.
2. Anderson A.J., Dawes E.A. Microbiol. Rev. 54:1990;450.
3. Holmes P.A. Phys. Technol. 16:1985;32.
4. Mergaert J., Anderson C., Wouters A., Swings J., Kersters K. FEMS Microbiol. Rev. 103:1992;317.
5. Mergaert J., Weeb A., Anderson C., Wouters A., Swings J. Appl. Environ. Microbiol. 59:1993;3233.
6. Jendrossek D., Schirmer A., Schlegel H.G. Appl. Microbiol. Biotechnol. 46:1996;451.
7. Chowdhury A.A. Arch. Mikrobiol. 47:1963;167.
8. Lusty C.J., Doudoroff M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 56:1966;960.
9. Jendrossek D., Knoke I., Habibian R.B., Steinbüchel A., Schlegel H.G. J. Environ. Polym. Degrad. 1:1993;53-63.
10. Kasuya K., Doi Y., Yao T. Polym. Degad. Stab. 45:1994;379.
11. Kita K., Ishimaru K., Teraoka M., Yanase H., Kato N. Appl. Environ. Microbiol. 61:1995;1727.
12. Nakayama K., Saito T., Fukui T., Shirakura Y., Tomita K. Biochim. Biophys. Acta. 827:1985;63.
13. Shiraki M., Iwata A., Saito T. J. Environ. Polym. Degrad. 2:1993;99.
14. Behrends A., Klingbeil B., Jendrossek D. FEMS Microbiol. Lett. 143:1996;191.
15. Fukui T., Narikawa T., Miwa K., Shirakura Y., Saito T., Tomita K. Biochim. Biophys. Acta. 952:1988;164.
16. Kasuya K., Inoue Y., Tanaka T., Akehata T., Iwata T., Fukui T., Doi Y. Appl. Environ. Microbiol. 63:1997;4844.
17. Shinomiya M., Iwata T., Kasuya K., Doi Y. FEMS Microbiol. Lett. 154:1997;89.
18. Jendrossek D., Backhaus M., Andermann M. Can. J. Microbiol. 41(Suppl. 1):1995;160.
19. Jendrossek D., Frisse A., Behrends A., Andermann M., Kratzin H.D., Stanislawski T., Schlegel H.G. J. Bacteriol. 177:1995;596.
20. Shinohe T., Nojiri M., Saito T., Stanislawski T., Jendrossek D. FEMS Microbiol. Lett. 141:1997;103.
21. Jaeger K.E., Steinbüchel A., Jendrossek D. Appl. Environ. Microbiol. 61:1995;3113.
22. Jaeger K.E., Ransac S., Dijkstra B.W., Colson D., van Heuvel M., Misset O. FEMS Microbiol. Rev. 15:1994;29.
23. Schrag J.D., Li Y.G., Wu S., Cygler M. Nature. 351:1991;761.
24. Briese B.H., Schmidt B., Jendrossek D. J. Environ. Polym. Degrad. 2:1994;75.
25. Hansen C.K. FEBS Lett. 305:1992;91.
26. Kasuya K., Inoue Y., Doi Y. Int. J. Biol. Macromol. 19:1996;35.
27. Shinomiya M., Iwata T., Doi Y. Int. J. Biol. Microbiol. 22:1998;129.
28. Fukui T., Kichise T., Yoshida Y., Doi Y. Biotechnol. Lett. 19:1997;1093.
29. Doi Y., Abe C. Macromolecule. 23:1990;3705.
30. Kimura H., Yoshida Y., Doi Y. Biotechnol. Lett. 14:1992;445.
31. Baba H., Tanahashi N., Kumagai Y., Doi Y. J. Chem. Soc. Jpn. 5:1992;527.
32. Abe H., Matsubara I., Doi Y., Hori Y., Yamaguchi A. Macromolecules. 27:1994;6018.
33. Tanio T., Fukui T., Shirakura Y., Saito T., Tomita K., Kaiho T., Masamune S. Eur. J. Biochem. 124:1982;71.
34. Uefuji M., Kasuya K., Doi Y. Polym. Degad. Stab. 58:1997;275.
35. Mukai K., Yamada K., Doi Y. Polym. Degad. Stab. 43:1994;319.
36. Mukai K., Yamada K., Doi Y. Polym. Degad. Stab. 41:1993;85.
37. Shirakura Y., Fukui T., Saito T., Okamoto Y., Narikawa T., Koide K., Tomita K., Takemasa T., Masamune S. Biochim. Biophys. Acta. 880:1986;46.
38. Bradford M.M. Anal. Biochem. 72:1976;248.
39. Protein Solutions Inc. In Operator's Manual of Dynamic Light Scattering Molecular Size Detectors (DynaPro-801WIN and DynaPro-801TC).
40. Kasuya K., Inoue Y., Yamada K., Doi Y. Polym. Degrad. Stab. 48:1995;167.
41. Mukai K., Yamada K., Doi Y. Int. J. Biol. Macromol. 15:1993;361.