Accurate characterization of the tyrosine hydroxylase forensic allele 9.3 through development of electrospray ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry

Rapid Communications in Mass Spectrometry

Volumn 13, Issue 10, 1999, Pages 954-962

  Hannis, James C ^a   Muddiman, David C ^a  

^a VIRGINIA COMMONWEALTH UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALLELE; MASS SPECTROMETRY; POLYMERASE CHAIN REACTION; SHORT TANDEM REPEAT SEQUENCE; TYROSINE 3 MONOOXYGENASE;

AMINO ACIDS; CODES (SYMBOLS); CYCLOTRONS; DESORPTION; DNA; DNA SEQUENCES; ELECTRON CYCLOTRON RESONANCE; FORENSIC SCIENCE; GENE ENCODING; MASS SPECTROMETRY; POLYMERASE CHAIN REACTION;

FOURIER TRANSFORM ION CYCLOTRON RESONANCE MASS SPECTROMETRY; FOURIER-TRANSFORM ION CYCLOTRON RESONANCE MASS SPECTROMETRY; HUMAN GENES; MASS MEASUREMENTS; MODELLING SYSTEMS; PRECISE DETERMINATIONS; REPEAT SEQUENCES; SHORT TANDEM REPEATS; TYROSINE HYDROXYLASE; VARIABLE NUMBER;

ELECTROSPRAY IONIZATION;

EID: 0032909644     PISSN: 09514198     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(SICI)1097-0231(19990530)13:10<954::AID-RCM593>3.0.CO;2-R     Document Type: Article

References (64)

1. H. D. C. R. Group, Cell 72, 971 (1993).
2. H. G. Harley, J. D. Brook, S. A. Rundle, S. Crow, W. Reardon, A. J. Buckler and P. S. Harper, Nature 355 (1992).
3. A. Edwards, A. Civitello, H. A. Hammond and T. C. Caskey, Am. J. Hum. Genet. 49, 746 (1991).
4. H. Li, L. Schmidt, M. H. Wei, T. Hustad, M. I. Lerman, B. Zbar and K. Tory, Hum. Mol. Genet. 2, 1327 (1993).
5. M. Karas and F. Hillenkamp, Anal. Chem. 60, 2299 (1988).
6. J. B. Fenn, M. Mann, C. K. Meng, S. F. Wong and C. M. Whitehouse, Science 246, 64 (1989).
7. C. Liu, D. C. Muddiman and R. D. Smith, J. Mass Spectrom. 32, 425 (1997).
8. J. C. Hannis and D. C. Muddiman, Rapid Commun. Mass Spectrom. 13, 323 (1999).
9. J. T. Stults and J. C. Marsters, Rapid Commun. Mass Spectrom. 5, 359 (1991).
10. P. A. Limbach, P. F. Crain and J. A. McCloskey, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 6, 27 (1995).
11. D. P. Little, R. A. Chorush, J. P. Speir, M. W. Senko, N. L. Kelleher and F. W. McLafferty, J. Am. Chem. Soc. 116, 4893 (1994).
12. X. H. Cheng, D. C. Gale, H. R. Udseth and R. D. Smith, Anal. Chem. 67, 586 (1995).
13. D. C. Muddiman, D. S. Wunschel, C. L. Liu, L. Pasatolic, K. F. Fox, A. Fox, G. A. Anderson and R. D. Smith, Anal. Chem. 68, 3705 (1996).
14. K. Tang, D. Fu, S. Kotter, R. J. Cotter, C. R. Cantor and H. Koster, Nucleic Acids Res. 23, 3126 (1995).
15. H. Koster, K. Tang, D. J. Fu, A. Braun, D. V. D. Boom, C. L. Smith, R. J. Cotter and C. R. Cantor, Nat. Biotechnol. 14, 1123 (1996).
16. P. L. Ross and P. Belgrader, Anal. Chem. 69, 3966 (1997).
17. M. Greig and R. H. Griffey, Rapid Commun. Mass Spectrom. 9, 97 (1995).
18. D. C. Muddiman, X. H. Cheng, H. R. Udseth and R. D. Smith, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 7, 697 (1996).
19. R. D. Smith, K. J. Lightwahl, B. E. Winger and J. A. Loo, Org. Mass Spectrom. 27, 811 (1992).
20. B. Ganem, Y.-T. Li and J. D. Henion, J. Am. Chem. Soc. 113, 6294 (1991).
21. D. S. Wunschel, D. C. Muddiman, K. Fox, A. Fox and R. D. Smith, Anal. Chem. 70, 1203 (1997).
22. D. J. Aaserud, N. L. Kelleher, D. P. Little and F. W. McLafferty, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 7, 1266 (1996).
23. J. Bai, Y. H. Lin, X. L. Liang, Y. D. Zhu and D. M. Lubman, Rapid Commun. Mass Spectrom. 9, 1172 (1995).
24. G. B. Hurst, M. J. Doktycz, A. A. Vass and M. V. Buchanan, Rapid Commun. Mass Spectrom. 10, 377 (1996).
25. Y. H. Liu, J. Bai, X. O. Liang, D. M. Lubman and P. J. Venta, Anal. Chem. 67, 3482 (1995).
26. L. Y. Ch'ang, K. Tang, M. Schell, C. Ringelberg, K. J. Matteson, S. L. Allman and C. H. Chen, Rapid Commun. Mass Spectrom. 9, 772 (1995).
27. Y.-H. Liu, J. Bai, Y. Zhu, X. Liang, D. Siemieniak, P. J. Venta and D. M. Lubman, Rapid Commun. Mass Spectrom. 9, 735 (1995).
28. Y. Wada, Nippon Iyo Masu Supekutoru Gakkai Koenshu 21, 89 (1996).
29. P. Krishna, S. Prabhakar and M. Vairamani, J. Mass Spectrom. 32, 124 (1997).
30. L. A. Haff and I. P. Smirnov, Genome Res. 7, 378 (1997).
31. G. B. Hurst, K. Weaver, M. J. Doktycz, M. V. Buchanan, A. M. Costello and M. E. Lidstrom, Anal. Chem. 70, 2693 (1998).
32. C. Jurinke, B. Zollner, H.-H. Feucht, D. Van Den Boom, A. Jacob, S. Polywka, R. Laufs and H. Koster, Genet. Anal.: Biomol. Eng. 14, 97 (1998).
33. C. Jurinke, D. van den Boom and H. Koster, Rapid Commun. Mass Spectrom. 12, 50 (1998).
34. J. R. Srinivasan, Y.-h. Liu, P. J. Venta, D. Siemieniak, A. A. Killeen, Y. Zhu and D. M. Lubman, Rapid Commun. Mass Spectrom. 11, 1144 (1997).
35. J. R. Srinivasan, M. T. Kachman, A. A. Killeen, N. Akel, D. Siemieniak and D. M. Lubman, Rapid Commun. Mass Spectrom. 12, 1045 (1998).
36. L. M. Smith, Science 262, 530 (1993).
37. M. C. Fitzgerald, L. Zhu and L. M. Smith, Rapid Commun. Mass Spectrom. 7, 895 (1993).
38. K. Schneider and B. T. Chait, Nucleic Acids Res. 23, 1570 (1995).
39. F. Kirpekar, E. Nordhoff, L. K. Larsen, K. Kristiansen, P. Roepstorff and F. Hillenkamp, Nucleic Acid Res. 26, 2554 (1998).
40. K. K. Murray, J. Mass Spectrom. 31, 1203 (1996).
41. T. A. Shaler, Y. P. Tan, J. N. Wickham, K. J. Wu and C. H. Becker, Rapid Commun. Mass Spectrom. 9, 942 (1995).
42. M. T. Roskey, P. Juhasz, I. P. Smirnov, E. J. Takach, S. A. Martin and L. A. Haff, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 4724 (1996).
43. N. I. Taranenko, V. V. Golovlev, S. L. Allman, N. V. Taranenko, C. H. Chen, J. Hong and L. Y. Chang, Rapid Commun. Mass Spectrom. 12, 413 (1998).
44. Y. Wada, J. Mass. Spectrom. 33, 187 (1998).
45. D. S. Wunschel, K. F. Fox, A. Fox, J. E. Bruce, D. C. Muddiman and R. D. Smith, Rapid Commun. Mass Spectrom. 10, 29 (1996).
46. Y. Naito, K. Ishikawa, Y. Koga, T. Tsuneyoshi and H. Terunuma, Rapid Commun. Mass Spectrom. 9, 1484 (1995).
47. Y. Naito, K. Ishikawa, Y. Koga, T. Tsuneyoshi, H. Terunuma and R. Arakawa, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 8, 737 (1997).
48. T. Tsuneyoshi, K. Ishikawa, Y. Koga, Y. Naito, S. Baba, H. Terunuma, R. Arakawa and D. J. Prockop, Rapid Commun. Mass Spectrom. 11, 719 (1997).
49. A. Edwards, H. A. Hammond, L. Jin, T. C. Caskey and R. Chakraborty, Genomics 12, 241 (1992).
50. J. M. Clark, Nucleic Acids Res. 16, 9677 (1988).
51. J. Sambrook, E. F. Fritsch and T. Maniatis, Molecular Cloning, Vol. 3, Cold Spring Harbor Laboratory, Plainview, NY (1989).
52. J. C. Hannis and D. C. Muddiman, Rapid Commun. Mass Spectrom. 12, 443 (1998).
53. S. K. Chowdhury, V. Katta and B. T. Chait, Rapid. Commun. Mass Spectrom. 4, 81 (1990).
54. S. A. Hofstadler, J. E. Bruce, A. L. Rockwood, G. A. Anderson, B. E. Winger and R. D. Smith, Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 132, 109 (1994).
55. D. C. Muddiman and G. A. Anderson, DNA-2LS, Virginia Commonwealth University and Pacific Northwest National Laboratory (1996).
56. D. C. Muddiman, G. A. Anderson, S. A. Hofstadler and R. D. Smith, Anal. Chem. 69, 1543 (1997).
57. S. F. Wong, C. K. Meng and J. B. Fenn, J. Phys. Chem. 92, 546 (1988).
58. D. W. Mitchell and R. D. Smith, J. Mass Spectrom. 31, 771 (1996).
59. S. A. Hofstadler and D. A. Laude, Anal. Chem. 65, 312 (1993).
60. M. Meldgaard and N. Morling, Electrophoresis 18, 1928 (1997).
61. A. L. Rockwood, M. Busman, H. R. Udseth and R. D. Smith, Rapid Commun. Mass Spectrom. 5, 582 (1991).
62. D. R. Goodlett, R. R. O. Loo, J. A. Loo, J. H. Wahl, H. R. Udseth and R. D. Smith, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 5, 614 (1994).
63. J. A. Loo, C. G. Edmonds, H. R. Udseth and R. D. Smith, Anal. Chim. Acta 241, 167 (1990).
64. W. Bar, B. Brinkmann, P. Lincoln, W. R. Mayr and U. Rossi, Int. J. Leg. Med. 107, 159 (1994).