R-factor, free R, and complete cross-validation for dipolar coupling refinement of nmr structures

Journal of the American Chemical Society

Volumn 121, Issue 39, 1999, Pages 9008-9012

  Clore, G Marius ^a   Garrett, Daniel S ^a  

^a NATIONAL INSTITUTE OF DIABETES AND DIGESTIVE AND KIDNEY DISEASES   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ARTICLE; CRYSTAL STRUCTURE; DIPOLE; GEOMETRY; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; SPECTROSCOPY; STRUCTURE ANALYSIS;

EID: 0032879507     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja991789k     Document Type: Article

References (29)

1. Hendrickson, W. A. Methods Enzymol. 1985, 115, 252-270.
2. Wüthrich, K. NMR of Proteins; Wiley: New York, 1986. Clore, G. M.; Gronenborn, A. M. Protein. Eng. 1987, 1, 275-288.
3. Wüthrich, K. NMR of Proteins; Wiley: New York, 1986. Clore, G. M.; Gronenborn, A. M. Protein. Eng. 1987, 1, 275-288.
4. Yip. P.; Case, D. A. J. Magn. Reson. 1989, 83, 643-648. Nilges, M.; Habazettl, J.; Brünger, A. T.; Holak, T. A. J. Mol. Biol. 1991, 219, 499-510. Bonvin, A. M. J. J.; Boelens, R.; Kaptein, R. J. Biomol. NMR 1991, 1, 305-309.
5. Yip. P.; Case, D. A. J. Magn. Reson. 1989, 83, 643-648. Nilges, M.; Habazettl, J.; Brünger, A. T.; Holak, T. A. J. Mol. Biol. 1991, 219, 499-510. Bonvin, A. M. J. J.; Boelens, R.; Kaptein, R. J. Biomol. NMR 1991, 1, 305-309.
6. Yip. P.; Case, D. A. J. Magn. Reson. 1989, 83, 643-648. Nilges, M.; Habazettl, J.; Brünger, A. T.; Holak, T. A. J. Mol. Biol. 1991, 219, 499-510. Bonvin, A. M. J. J.; Boelens, R.; Kaptein, R. J. Biomol. NMR 1991, 1, 305-309.
7. James, T. L. Curr. Op. Struct. Biol. 1991, 1, 1042-1046. Gonzales, C.; Rullman, J. A. C.; Bonvin, A. J. M. M., Boelens, R.; Kaptein, R. J. Magn. Reson. 1991, 91, 659-664. James, T. L. Methods Enzymol. 1994, 239, 416-439. Withka J. M.; Srinivasan J.; Bolton, P. H. J. Magn. Reson. 1992, 98, 611-617.
8. James, T. L. Curr. Op. Struct. Biol. 1991, 1, 1042-1046. Gonzales, C.; Rullman, J. A. C.; Bonvin, A. J. M. M., Boelens, R.; Kaptein, R. J. Magn. Reson. 1991, 91, 659-664. James, T. L. Methods Enzymol. 1994, 239, 416-439. Withka J. M.; Srinivasan J.; Bolton, P. H. J. Magn. Reson. 1992, 98, 611-617.
9. James, T. L. Curr. Op. Struct. Biol. 1991, 1, 1042-1046. Gonzales, C.; Rullman, J. A. C.; Bonvin, A. J. M. M., Boelens, R.; Kaptein, R. J. Magn. Reson. 1991, 91, 659-664. James, T. L. Methods Enzymol. 1994, 239, 416-439. Withka J. M.; Srinivasan J.; Bolton, P. H. J. Magn. Reson. 1992, 98, 611-617.
10. James, T. L. Curr. Op. Struct. Biol. 1991, 1, 1042-1046. Gonzales, C.; Rullman, J. A. C.; Bonvin, A. J. M. M., Boelens, R.; Kaptein, R. J. Magn. Reson. 1991, 91, 659-664. James, T. L. Methods Enzymol. 1994, 239, 416-439. Withka J. M.; Srinivasan J.; Bolton, P. H. J. Magn. Reson. 1992, 98, 611-617.
11. Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. CRC Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 1995, 30, 351-385.
12. Tjandra, N.; Omichinski, J. G.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M.; Bax, A. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 732-738.
13. (a) Tjandra, N.; Bax, A. Science 1997, 278, 1111-1114.
14. (b) Clore, G. M.; Starich, M. R.; Gronenborn, A. M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10571-10572.
15. (c) Hansen, M. R.; Rance, M.; Pardi, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 11210-11211.
16. (a) Bewley, C. A.; Gustafson, K. R.; Boyd, M. R.; Covell, D. G.; Bax, A.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 571-578.
17. (b) Cai, M.; Huang, Y.; Zheng, R.; Wei, S.-Q., Ghuirlando, R.; Lee, M. S.; Craigie, R.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 903-909.
18. (c) Garrett, D. S.; Seok, Y.-J.; Peterkofsky, A.; Gronenborn, A. M., Clore, G. M. Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 166-173.
19. (d) Drohat, A. C.; Tjandra, N.; Baldisseri, D. M.; Weber, D. J. Protein Sci. 1999, 8, 800-809.
20. (e) Clore, G. M.; Starich, M. R.; Bewley, C. A.; Cai, M.; Kuszweski, J. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 6513-6514.
21. (a) Clore, G. M.; Gronenborn, A. M.; Tjandra, N. J. Magn. Reson. 1998, 131, 159-162.
22. (b) Ottiger, M.; Delaglio, F.; Marquardt, J. L.; Tjandra, N.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1998, 134, 365-369.
23. Clore, G. M.; Gronenborn, A. M.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1998 133, 216-221.
24. Cornilescu, G.; Marquardt, J. L.; Ottiger, M.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6836-6837.
25. Brünger, A. T. Nature 1992, 355, 472-475.
26. Brünger, A. T.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M.; Saffrich, R.; Nilges, M. Science 1993, 261, 328-331.
27. Nilges, M.; Brünger, A. T.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. Protein Eng. 1987, 2, 27-38.
28. Brünger, A. T. XPLOR: A system for X-ray crystallography and NMR; Yale University Press: New Haven, 1993. Brünger, A. T.; Adams, P. D.; Clore, G. M.; DeLano, W. L.; Gros, P.; Grosse-Kunsteleve, R. W.; Jiang, J.-S.; Kuszweski, J.; Nilges, M.; Pannu, N. S.; Read, R. J.; Rice, L. M.; Simonson, T.; Warren, G. L. Acta Crystallogr. 1998, D54, 905-921.
29. Brünger, A. T. XPLOR: A system for X-ray crystallography and NMR; Yale University Press: New Haven, 1993. Brünger, A. T.; Adams, P. D.; Clore, G. M.; DeLano, W. L.; Gros, P.; Grosse-Kunsteleve, R. W.; Jiang, J.-S.; Kuszweski, J.; Nilges, M.; Pannu, N. S.; Read, R. J.; Rice, L. M.; Simonson, T.; Warren, G. L. Acta Crystallogr. 1998, D54, 905-921.