Studies of molecular motors using caged compounds

Methods in Enzymology

Volumn 291, Issue , 1998, Pages 307-348

  Dantzig, Jody A ^a   Higuchi, Hideo ^a   Goldman, Yale E ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADENOSINE TRIPHOSPHATE; F ACTIN;

AMINO TERMINAL SEQUENCE; ARTICLE; CELL MOTILITY; CRYSTALLIZATION; CYTOSKELETON; ENERGY TRANSFER; ENZYME ACTIVITY; MICROTUBULE; MUSCLE CONTRACTION; MUSCLE FIBRIL; POLYMERIZATION; PRIORITY JOURNAL;

EID: 0031776739     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(98)91021-7     Document Type: Article

References (97)

1. J. H. Kaplan, B. Forbush III, and J. F. Hoffman, Biochemistry 17, 1929 (1978).
2. Y. E. Goldman, M. G. Hibberd, J. A. McCray, and D. R. Trentham, Nature 300, 701 (1982).
3. M. S. Mooseker and R. E. Cheney, Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 11, 633 (1995)
4. L. S. B. Goldstein, Annu. Rev. Genet. 27, 319 (1993).
5. E. L. F. Holzbaur and R. B. Vallee, Annu. Rev. Cell Biol. 10, 339 (1994).
6. I. R. Gibbons, Cell Struct. Funct. 21, 331 (1996).
7. T. D. Pollard, S. Almo, S. Quirk, V. Vinson, and E. E. Lattman, Annu. Rev. Cell Biol. 10, 207 (1994).
8. R. B. Vallee, Cell Motil. Cytoskel. 15, 204 (1990).
9. W. Kabsch, H. G. Mannherz, D. Suck, E. F. Pai, and K. C. Holmes, Nature 347, 37 (1990).
10. I. Rayment, W. R. Rypniewski, K. Schmidt-Base, R. Smith, D. R. Tomchick, M. M. Benning, D. A. Winkelmann, G. Wesenberg, and H. M. Holden, Science 261, 50 (1993).
11. F. J. Kull, E. P. Sablin, R. Lau, R. J. Fletterick, and R. D. Vale, Nature 380, 550 (1996).
12. E. P. Sablin, F. J. Kull, R. Cooke, R. D. Vale, and R. J. Fletterick, Nature 380, 555 (1996).
13. K. Fritz-Wolf, T. Schnyder, T. Wallimann, and W. Kabsch, Nature 381, 341 (1996).
14. J. P. Abrahams, A. G. W. Leslie, R. Lutter, and J. E. Walker, Nature 370, 621 (1994).
15. J. P. Noel, H. E. Hamm, and P. B. Sigler, Nature 366, 654 (1993).
16. H. Berchtold, L. Reshetnikova, C. O. A. Reiser, N. K. Schirmer, M. Sprinzl, and R. Hilgenfeld, Nature 365, 126 (1993).
17. E. F. Pai, U. Krengel, G A. Petsko, R. S. Goody, W. Kabsch, and A. Wittinghofer, EMBO J. 9, 2351 (1990).
18. R. W. Lymn and E. W. Taylor, Biochemistry 10, 4617 (1971).
19. E. Eisenberg and L. E. Greene, Annu. Rev. Physiol. 42, 293 (1980).
20. M. G. Hibberd, J. A. Dantzig, D. R. Trentham, and Y. E. Goldman, Science 228, 1317 (1985).
21. J. A. Dantzig, Y. E. Goldman, N. C. Millar, J. Lacktis, and E. Homsher, J. Physiol. 451, 247 (1992).
22. R. Cooke and E. Pate, Biophys. J. 48, 789 (1985).
23. D. D. Hackney, Nature 377, 448 (1995).
24. L. Romberg and R. D. Vale, Nature 361, 168 (1993).
25. I. M.-T. C. Crevel, A. Lockhart, and R. A. Cross, J. Mol. Biol. 257, 66 (1996).
26. D. D. Hackney, Annu. Rev. Physiol. 58, 731 (1996).
27. Y. E. Goldman, Annu. Rev. Physiol. 49, 637 (1987).
28. Z. Lu, R. L. Moss, and J. W. Walker, J. Gen. Physiol. 101, 867 (1993).
29. N. C. Millar and E. Homsher, J. Biol. Chem. 265, 20234 (1990).
30. T. D. Lenart, T. St. C. Allen, R. J. Barsotti, G. C. R. Ellis-Davies, J. H. Kaplan, C. Franzini-Armstrong, and Y. E. Goldman, in "Mechanism of Myofilament Sliding in Muscle Contraction" (H. Sugi and G. H. Pollack, eds.), p. 475. Plenum Press, New York, 1993.
31. C. C. Ashley, I. P. Mulligan, and T. J. Lea, Quart. Rev. Biophys. 24, 1 (1991).
32. Y. E. Goldman, M. G. Hibberd, and D. R. Trentham, J. Physiol. 354, 577 (1984).
33. R. L. Moss, J. Muscle Res. Cell Motil. 3, 295 (1982).
34. L. C. Yu and B. Brenner, Biophys. J. 55, 441 (1989).
35. Y. E. Goldman and R. M. Simmons, J. Physiol. 350, 497 (1984).
36. M. Yamakawa and Y. E. Goldman, J. Gen. Physiol. 98, 657 (1991).
37. H. Martin and R. J. Barsotti, Biophys. J. 66, 1115 (1994).
38. K. Horiuti, A. V. Somlyo, Y. E. Goldman, and A. P. Somlyo, J. Gen. Physiol. 94, 769 (1989).
39. A. V. Somlyo, Y. E. Goldman, T. Fujimori, M. Bond, D. R. Trentham, and A. P. Somlyo, J. Gen. Physiol. 91, 165 (1988).
40. T. Kitazawa, S. Kobayashi, K. Horiuti, A. V. Somlyo, and A. P. Somlyo, J. Biol. Chem. 264, 5339 (1989).
41. B. Brenner, Biophys. J. 41, 99 (1983).
42. Y. Zhao and M. Kawai, Am. J. Physiol. 266, C437 (1994).
43. R. L. Moss, J. Physiol. 292, 111 (1979).
44. Y. Luo, R. Cooke, and E. Pate, Am. J. Physiol. 265, C279 (1993).
45. P. B. Chase and M. J. Kushmerick, Biophys. J. 53, 935 (1988).
46. J. A. McCray and D. R. Trentham, Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 18, 239 (1989).
47. 46a S. R. Adams, J. P. Y. Kao, G. Grynkiewicz, A. Minta, and R. Y. Tsien, J. Am. Chem. Soc. 110, 3212 (1988).
48. G. Rapp and K. Güth, Pflügers Arch. 411, 200 (1988).
49. G. Rapp, Methods Enzymol. 291 [11] (1998) (this volume).
50. 48a J. E. T. Corrie, G. P. Reid, D. R. Trentham, M. B. Hursthouse, and M. A. Mazid, J. Chem. Soc. Perkin Trans. I, 1015 (1992).
51. H. Thirlwell, J. A. Sleep, and M. A. Ferenczi, J. Muscle Res. Cell Motil. 16, 131 (1995).
52. R. S. Givens, P. S. Athey, B. Matuszewski, L. W. Kueper III, J. Xue, and T. Fister, J. Am. Chem. Soc. 115, 6001 (1993).
53. J. E. T. Corrie and D. R. Trentham, J. Chem. Soc. Perkin Trans. I, 2409 (1992).
54. H. Thirlwell, J. E. T. Corrie, G. P. Reid, D. R. Trentham, and M. A. Ferenczi, Biophys. J. 67, 2436 (1994).
55. S. Marston, Biochim. Biophys. Acta 305, 397 (1973).
56. J. A. Dantzig, M. G. Hibberd, D. R. Trentham, and Y. E. Goldman, J. Physiol. 432, 639 (1991).
57. M. Schoenberg and E. Eisenberg, J. Gen. Physiol. 89, 905 (1987).
58. J. W. Walker, G. P. Reid, J. A. McCray, and D. R. Trentham, J. Am. Chem. Soc. 110, 7170 (1988).
59. 56a J. W. Walker, G. P. Reid, and D. R. Trentham, Methods Enzymol. 172, 289 (1989).
60. A. Fabiato and F. Fabiato, J. Physiol. (Paris) 75, 463 (1979).
61. Commercially available software for determining solution constituents: Max Chelator version 4.61 supplied by C. Patton, Hopkins Marine Station, Stanford University, Pacific Grove, California.
62. A. E. Martell and R. M. Smith, "Critical Stability Constants." Plenum Press, New York, 1974.
63. M. A. W. Andrews, D. W. Maughan, T. M. Nosek, and R. E. Godt, J. Gen. Physiol. 98, 1105 (1991).
64. D. G. Moisescu, Nature 262, 610 (1976).
65. 61a A. Barth, J. E. T. Corrie, M. J. Gradwell, Y. Maeda, W. Mäntele, T. Meier, and D. R. Trentham, J. Am. Chem. Soc. 119, 4149 (1997).
66. H. Martin and R. J. Barsotti, Biophys. J. 67, 1933 (1994).
67. J. W. Tanner, D. D. Thomas, and Y. E. Goldman, J. Mol. Biol. 223, 185 (1992).
68. H. Higuchi, T. Yanagida, and Y. E. Goldman, Biophys. J. 69, 1000 (1995).
69. T. Sakoda and K. Horiuti, J. Muscle Res. Cell Motil. 13, 464 (1992).
70. Y. E. Goldman, M. G. Hibberd, and D. R. Trentham, J. Physiol. 354, 605 (1984).
71. E. J. Potma and G. J. M. Stienen, J. Physiol. 496, 1 (1996).
72. Z.-H. He, R. K. Chillingworth, M. Brune, J. E. T. Corrie, D. R. Trentham, M. R. Webb, and M. A. Ferenczi, J. Physiol. 501, 125 (1997).
73. M. G. Hibberd, M. R. Webb, Y. E. Goldman, and D. R. Trentham, J. Biol. Chem. 260, 3496 (1985).
74. M. A. Ferenczi, E. Homsher, and D. R. Trentham, J. Physiol. 352, 575 (1984).
75. A. Ishijima, H. Kojima, H. Higuchi, Y. Harada, T. Funatsu, and T. Yanagida, Biophys. J. 70, 383 (1996).
76. C. S. Cook, H. Higuchi, and Y. E. Goldman, Biophys. J. 70, A291 (1996).
77. I. Matsubara, Y. E. Goldman, and R. M. Simmons, J. Mol. Biol. 173, 15 (1984).
78. H. Higuchi and Y. E. Goldman, Biophys. J. 69, 1491 (1995).
79. S. J. Kron, Y. Y. Toyoshima, T. Q. P. Uyeda, and J. Spudich, Methods Enzymol. 196, 399 (1991).
80. Y. Harada, K. Sakurada, T. Aoki, D. D. Thomas, and T. Yanagida, J. Mol. Biol. 216, 49 (1990).
81. A. Ishijima, T. Doi, K. Sakurada, and T. Yanagida, Nature 352, 301 (1991).
82. A. Ishijima, Y. Harada, H. Kojima, T. Funatsu, H. Higuchi, and T. Yanagida, Biochem. Biophys. Res. Commun. 199, 1057 (1994).
83. K. Svoboda, C. F. Schmidt, B. J. Schnapp, and S. M. Block, Nature 365, 721 (1993).
84. J. T. Finer, R. M. Simmons, and J. A. Spudich, Nature 368, 113 (1994).
85. H. Higuchi, E. Muto, Y. Inoue, and T. Yanagida, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94, 4395 (1997).
86. P. B. Conibear and C. R. Bagshaw, FEBS Lett. 380, 13 (1996).
87. C. L. Berger, E. C. Svensson, and D. D. Thomas, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 8753 (1989).
88. E. M. Ostap, H. D. White, and D. D. Thomas, Biochemistry 32, 6712 (1993).
89. B. J. Schnapp and T. S. Reese, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 1548 (1989).
90. A. Hyman, D. Drechsel, D. Kellogg, S. Salser, K. Sawin, P. Steffen, L. Wordeman, and T. Mitchison, Methods Enzymol. 196, 478 (1991).
91. G. C. R. Ellis-Davies, J. H. Kaplan, and R. J. Barsotti, Biophys. J. 70, 1006 (1996).
92. S. Györke and M. Fill, Science 260, 807 (1993).
93. G. D. Lamb, M. W. Fryer, and D. G. Stephenson, Science 263, 986 (1994).
94. K. A. P. Edman, J. Physiol. 291, 143 (1979).
95. M. A. Ferenczi, Y. E. Goldman, and R. M. Simmons, J. Physiol. 350, 519 (1984).
96. E. Pate, M. Lin, K. Franks-Skiba, and R. Cooke, Am. J. Physiol. 262, C1039 (1992).
97. D. G. Moisescu and R. Thieleczek, Biochim. Biophys. Acta 546, 64 (1979).