Strong, specific, reversible binding ligands for transfer RNA: Comparison by fluorescence and NMR spectroscopies with distamycin binding for a new structural class of ligand

Nucleosides and Nucleotides

Volumn 17, Issue 9-11, 1998, Pages 1651-1665

  Bichenkova, Elena V ^a   Sadat Ebrahimi, Seyed E ^a   Wilton, Amanda N ^a   O'Toole, Niamh ^a   Marks, Debora S ^a   Douglas, Kenneth T ^a  

^a UNIVERSITY OF MANCHESTER   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DISTAMYCIN A; TRANSFER RNA;

ANTIVIRAL ACTIVITY; CONFERENCE PAPER; DRUG TARGETING; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS INFECTION; LIGAND BINDING; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; RNA SEQUENCE;

EID: 0031759525     PISSN: 07328311     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1080/07328319808004698     Document Type: Conference Paper

References (41)

1. Mitsuya, H.; Yarchoan, R.; Broder, S. Science 1990 249, 1533-1543.
2. Carter, B. J.; de Vroom, E.; Long, E. C.; van der Marel, G. A.; van Boom, J. H.; Hecht, S. M. Proc. Nat. Acad. Sci. (U. S. A.) 1990 87, 9373-9377.
3. Tanious, F. A.; Veal, J. M.; Buczak, H.; Ratmeyer, L. S.; Wilson, W. D. Biochemistry 1992 31, 3103-3112.
4. Wallis, M. G.; von Ahsen, U.; Schroeder, R.; Famulok, M. Chemistry and Biology 1995 2, 543-552.
5. Famulok, M.; Huttenhofer, A. Biochemistry 1996 35, 4265-4270.
6. Wang, Y.; Rando, R. R. Chemistry and Biology 1995 2, 281-290.
7. Ratmeyer, L.; Zapp, M. L.; Green, M. R.; Vinayak, R.; Kumar, A.; Boykin, D. W.; Wilson, W. D. Biochemistry 1996 35, 13689-13696.
8. Peterson, R. D.; Feigon, J. J. Mol. Biol. 1996 264, 863-877.
9. Zimmer, C.; Reinert, K. E.; Luck, G.; Wahnert, U.; Lober, G.; Thrum, H.J. Mol. Biol. 1971 58, 329-348.
10. Pilch, D. S.; Kirolos, M. A.; Liu, X.; Plum, E.; Breslauer, K. J. Biochemistry 1995 34, 9962-9976.
11. Wilson, W. D.; Ratmeyer, L.; Zhao, M.; Srekowski, L.; Boykin, D. Biochemistry 1993 32, 4098-4104.
12. Ciesiolka, J.; Wrzesinski, J.; Gornicki, P.; Podkowinski, J.; Krzyzosiak, J. Eur. J. Biochem. 1989 186, 71-77.
13. Kazagov, S.; Altman, S. Proc. Nat. Acad. Sci. (U. S. A.) 1992 89, 7939-7943.
14. Chow, C. S.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1990 112, 2839-2841.
15. Celander, D. W.; Nussbaum, J. M. Biochemistry 1996 35, 12061-12069.
16. Murakawa, G. J.; Chen, C. B.; Kuwabara, M. D.; Nierlich, D. P.; Sigman, D. S. Nucl. Acids Res. 1989 17, 5361-5375.
17. Kean, J. M.; White, S. A.; Draper, D. E. Biochemistry 1985 24, 5062-5070.
18. Brown, R S.; Hingerty, B. E.; Dewan, J. C.; Klug, A. Nature (London) 1983 303, 543-545.
19. Dange, V.; Van Atta, R. B.; Hecht, S. M. Science 1990 248, 585-588.
20. Baindur, S. R.; Douglas, K. T. Biochim. Biophys. Acta 1987 923, 66-73.
21. Hutlin, T.; Naslund, P. H. Chem.-Biol. Interact. 1974 8, 315-328.
22. Borisova, O. F.; Potapov, A. P.; Surovaya, A. N.; Trubitsin, S. N.; Vol'kenshtein, M. V. Mol. Biol. (USA) 1974 7, 411-417.
23. Surovaya, A. N.; Trubitsin, S. N. Mol. Biol. (USA) 1974 7, 403-410.
24. Urbanke, C.; Romer, R.; Maass, G. Eur. J. Biochem. 1973 33, 511-516.
25. Heitner, H. I.; Lippard, S. J.; Sunshine, H. R. J. Am. Chem. Soc. 1972 94, 8936-8937.
26. Pal, B. C.; Shugart, L. R.; Sham, K. R.; Stulberg, M. P. Arch. Biochem. Biophys. 1972 150, 86-90.
27. Baindur, S. R.; Douglas, K. T. J. Chem. Soc. Chem. Commun. 1985, 1398-1399.
28. Bunni, M. A.; Douglas, K. T. Biochem. J. 1984 217, 383-390.
29. Bunni, M. A.; Baindur, S. R.; Douglas, K. T.; Drake, A. F. Biochim. Biophys. Acta 1987 923, 421-430.
30. Heerschap, A.; Walters, J. A.; Hilbers, C. W. Nucl. Acids Res. 1986 14, 983-998.
31. Frydman, L.; Rossamando, P. C.; Frydman, V.; Fernandez, C. O.; Frydman, B.; Samejima, K. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992 89, 9186-9190.
32. Foster, N.; Singhal, A. K.; Smith, M. W.; Narcos, N. G.; Schray, K. J. Biochim. Biophys. Acta 1988 950, 118-131.
33. Birdsall, W. J.; Andersen, Jr.; Foster, N. Biochim. Biophys. Acta 1989 1007, 176-183.
34. Rubin, J.; Sundaralingam, M. J. Biomol. Struct. Dynamics 1984 2, 165-174.
35. Zakrzrewska, K.; Pullman, B. J. Biomol. Struct. Dyn. 1984 2, 737-743.
36. Sadat-Ebrahimi, S. E.; Wilton, A. N.; Douglas, K. T. J. Chem. Soc. Chem. Commun. 1997, 385-386.
37. Sadat-Ebrahimi, S. E.; Wilton, A. N.; Douglas, K. T. J. Biomol. Struct. Dyn. 1997 14, 923-924.
38. Totsuka, R.; Aizawa, Y.; Uesugi, M.; Okuno, Y.; Matsumoto, T.; Sugiura, Y. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1995 208, 168-173.
39. Ebrahimi, S. E. S.; Bibby, M. C.; Fox, K. R.; Douglas, K. T. Anti-Cancer Drug Design 1995 10, 463-479.
40. Heerschap, A.; Walters, J. A. L. I.; Hilbers, C. W. Nucl. Acids Res. 1986 14, 983-998.
41. Westhof, E.; Sundaralingam, M. Biochemistry 1986 25, 4868-4876.