An investigation into the application of the Wagner parsimony method in synecology

Biological Journal of the Linnean Society

Volumn 65, Issue 2, 1998, Pages 165-189

  Nel, André ^a   Nel, Jacques ^a   Masselot, Gérard ^b   Thomas, Alain ^b  

^a MUSÉUM NATIONAL D'HISTOIRE NATURELLE   (France)

^b UNIVERSITÉ DE TOULOUSE   (France)

Author keywords

Cladistics; Cladochronology; Community ecology; Phenetics

Indexed keywords

ANALYTICAL METHOD; AUTECOLOGY;

EID: 0031729006     PISSN: 00244066     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1006/bijl.1998.0228     Document Type: Article

References (50)

1. Armitage PD, Moss D, Wright JF, Furse MT. 1983. The performance of a new biological water quality score system based on macroinvertebrates over a wide range of unpolluted running-water sites. Water Research 17: 333-347.
2. Baltanás A. 1992. On the use of some methods for the estimation of species richness. Oikos 65: 484-492.
3. Bellan-Santini D. 1995. Faune d'invertébrés du peuplement à Caulerpa taxifolia. Données préliminaires pour les côtes de Provence (Méditerranée nord-occidentale). Biologie Marine Méditerranéenne 2: 635-643.
4. Bellan-Santini D, Arnaud P, Bellan G. 1996. Affinités entre peuplements méditerranéens benthiques avec et sans Caulerpa taxifolia. In: Ribera MA, Ballesteros E, Boudouresque CF, Gomez A, Gravez V, eds. Second International Workshop on Caulerpa taxifolia. Publ. Univ. Barcelona, 387-390.
5. Bellan-Santini D, Dauvin J-C, Bellan G. 1994. Analyse de données en écologie benthique: utilisation de la méthode de l'analyse de parcimonie. Oceanologica Acta 17: 331-340.
6. Bennington JB, Bambach RK. 1996. Statistical testing for paleocommunity recurrence: are similar fossil assemblages ever the same? Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology 127: 107-133.
7. Braun-Blanquet J, Roussine N, Nègre R. 1951. Les groupements végétaux de la France méditerranéenne. Montpellier: CNRS.
8. Bryant HN, Russell AP. 1992. The role of phylogenetic analysis in the inference of unpreserved attributes of extinct taxa. Philosophical Transactions of the Royal Society, London 337: 405-418.
9. Chandler J. 1970. A biological approach to water quality management. Journal of Water Pollution Control Federation 69: 415-421.
10. Chwala E, Waringer J. 1996. Associations patterns and habitat selection of dragonflies (Insecta: Odonata) at different types of Danubian backwaters at Vienna, Austria. Archiv für Hydrobiology, Supplement 115: 45-60.
11. Crisci JV. 1982. Parsimony in evolutionary theory: law or methodological prescription? Journal of Theoretical Biology 97: 35-41.
12. Darlu P, Tassy P. 1993. Reconstruction phylogénétique: concepts et méthodes. Paris: Collection Biologie Théorique, Masson.
13. De Pinna MCC. 1991. Concepts and tests of homology in the cladistic paradigm. Cladistics 7: 367-394.
14. Defaut B. 1987. Recherches biocénotiques et bioclimatiques sur les Orthoptères en région ouestpaléarctique. Thèse de Doctorat d'Etat, University Paul Sabatier, Toulouse, France, 522 pp.
15. Defaut B. 1997. L'entomocénotique et le diagnostic de l'état de santé des milieux. Matériaux Entomocénotiques, Revue de l'association pour la caractérisation et l'étude des entomocénoses (ASCETE), 2: 55-61.
16. Farris JS. 1970. Methods for computing Wagner trees. Systematic Zoology 19: 83-92.
17. Farris JS. 1983. The logical basis of phylogenetic analysis. In: Platnik NI, Funck VA, eds. Advances in cladistics Vol. 2. New York: The New York Botanical Garden, 3-23.
18. Farris JS. 1989a. The retention index and homoplasy excess. Systematic Zoology 38: 406-407.
19. Farris JS. 1989b. The retention index and the rescaled consistency index. Cladistics 5: 417-419.
20. Grandcolas P, Deleporte P, Desutter-Grandcolas L. 1994. Why to use phylogeny in evolutionary ecology? Acta Ecologica 15: 661-673.
21. Guinochet M, Vilmorin R de, Mangenot G. 1973. Flore de France Vol. 1. Centre national de la Recherche scientifique.
22. Hennig W. 1965. Phylogenetic systematic Annual Review of Entomology 10: 97-116.
23. Jackson DA. 1993. Multivariate analysis of benthic invertebrate communities: the implication of choosing particular data standardizations, measures of association, and ordination methods. Hydrobiologia 268: 9-26.
24. Kluge G, Farris JS. 1969. Quantitative phyletics and the evolution of anurans. Systematic Zoology 18: 1-32.
25. Lambshead PJD. 1983. Freeliving marine nematodes as pollution monitoring organisms in the Clyde Estuary. Unpublished Ph.D. Thesis, Brunel University, London, 156 pp.
26. Lambshead PJD, Paterson GLJ. 1986. Ecological cladistics - an investigation of numerical cladistics as a method for analysing ecological data. Journal of Natural History 20: 895-909.
27. Lauga J, Joachim J. 1987. L'échantillonnage des populations d'oiseaux par la méthode des E.F.P.: intérêt d'une étude mathématique de la courbe de richesse cumulée. Acta Œcologica 8: 117-124.
28. Martinez J-N. 1995. Biochronologie et méthodes de parcimonie. Bulletin de la Société Géologique de France 166: 517-526.
29. Martinez J-N. 1997. Biochronogrammes: un usage plus rationnel de la méthode biochronologique des lignées évolutives. Geobios, M.S. 20: 347-355.
30. Maslin TP. 1952. Morphological criteria of phyletic relationships. Systematic Zoology 1: 49-70.
31. Masselot G, Nel A, Thomas A, Nel J. 1997. Parcimonie de Wagner et Biomonitoring de Cours d'eau. Annales de la Société Entomologique de France (N.S.) 33: 237-258.
32. Molinier R. 1981. Catalogue des plantes vasculaires des Bouches-du-Rhône. Marseille, Imprimerie municipale.
33. Neff NA. 1986. A rational basis for a priori character weighting. Systematic Zoology 35: 110-123.
34. Nel A. 1997. The probabilistic inference of unknown data in phylogenetic analysis. In: Grandcolas P, ed. The origin of biodiversity in insects: phylogenetic tests of evolutionary scenarios. Mémoires du Muséum national d'Histoire naturelle, Paris 173: 305-327.
35. Nel J. 1991-92 Sur la plasticité écologique et la biologie de quelques Lépidoptères (Rhopalocera) du sud-est méditerranéen de la France.Linneana Belgica 13(4): 159-220; 13 (5): 239-270; 13 (6): 287-338.
36. Nel J. 1991-92 Sur la plasticité écologique et la biologie de quelques Lépidoptères (Rhopalocera) du sud-est méditerranéen de la France.Linneana Belgica 13(4): 159-220; 13 (5): 239-270; 13 (6): 287-338.
37. Nel J. 1991-92 Sur la plasticité écologique et la biologie de quelques Lépidoptères (Rhopalocera) du sud-est méditerranéen de la France.Linneana Belgica 13(4): 159-220; 13 (5): 239-270; 13 (6): 287-338.
38. Nel J. 1997. Méthodes phénétiques et cladistiques en biogéographie historique. Le peuplement en Lépidoptères entre Cassis et Fréjus (France) (Papilionoidea, Hesperoidea, Pterophoroidea, Gelechioidea). Unpublished Thesis, University of Reims-Champagne-Ardennes, 1400 pp.
39. Patterson C. 1983. Scopes and methods in biogeography. In: Sims RW, Price JH, Whalley PES, eds. Evolution, time and space: the emergence of the biosphere. Systematics Association Special Volume 23. London and New York: Academic Press, 1-28.
40. Penny D. 1982. Towards a basis for classification: the incompleteness of distance measures, incompatibility analysis and phonetic classification. Journal of Theoretical Biology 96: 129-142.
41. Platnick NI, Griswold CE, Coddington JA. 1991. On missing entries in cladistic analysis. Cladistics 7: 337-343.
42. Salen-Picard C, Bellan G, Bellan-Santini D, Arlhac D, Marquet R. 1997. Changements à long terme dans une communauté benthique d'un golfe méditerranéen (golfe de Fos). Oceanologica Acta 20: 299-310.
43. Swofford DL. 1993. PAUP, version 3.1.1. Users manual. Illinois Natural History Survey (Champaign).
44. Touffet J. 1982. Dictionnaire essentiel d'écologie. Rennes: Les Dictionnaires Ouest-France.
45. Verneaux J, Galmiche P, Janier F, Monnot A. 1982. Une nouvelle méthode pratique d'évaluation de la qualité des eaux courantes. Un indice biologique de qualité générale (IBG). Annales Scientifiques de l'Université, Besançon (Biologie Animale), (4), 3: 11-21.
46. Verneaux J, Tuffery G. 1967. Une méthode zoologique pratique de détermination de la qualité biologique des eaux courantes. Indices biotiques. Annales Scientifiques de l'Université, Besançon, (Zoologie), 3: 79-90.
47. Wanntorp H-E, Brooks DR, Nilsson T, Nylin S, Ronquist F, Stearns SC, Wedell N. 1990. Phylogenetic approaches in ecology. Oikos 57: 119-132.
48. Wheeler QD. 1986. Character weighting and cladistic analysis. Systematic Zoology 35: 102-109.
49. Woodiwiss FS. 1964. The biological system of stream classification used by the Trent River Board. Chemical Industry 14: 443-447.
50. Zherikhin VV. 1994. [Evolutionary biocenology: the problem of model choice]. In: Rozanov AY, Semikhatov MA, eds. Ekosistemnye perestroiki i evolutsiya biosfery [Ecosystem restructures and the evolution of biosphere]. 1. Nedra Press, Moscow, 13-20 (in Russian).