A density functional study of the receptor-ligand interaction: Stabilization energy in ammonium salt-aromatic interactions

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 102, Issue 3, 1998, Pages 646-648

  Inoue, Yoshihisa ^a   Sugio, Shigetoshi ^a   Andzelm, Jan ^b   Nakamura, Norifumi ^a  

^a Green Cross Company   (South Korea)

^b ACCELRYS INC   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMMONIUM COMPOUNDS; BENZENE; HYDROGEN BONDS; MOLECULAR STRUCTURE; PROTEINS; SALTS;

AMMONIUM FORMATE; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; LIGANDS; MOLECULAR ORBITALS;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 0031646510     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp972661x     Document Type: Article

References (21)

1. Perutz, M. F.; Fermi, G.; Abraham, D. J.; Poyart, C.; Bureaux, E. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 1064-1078.
2. Burley, S. K.; Petsko, G. A. FEBS Lett. 1986, 203, 139-143.
3. Levitt, M.; Perutz, M. F. J. Mol. Biol. 1988, 201, 751-754.
4. Waksman, G.; Kominos, D.; Robertson, S. C.; Pant, N.; Baltimore, D.; Birge, R. B.; Cowburn, D.; Hanafusa, H.; Mayer, B. J.; Overduin, M.; Resh, M. D.; Rios, C. D.; Silverman, L.; Kuriyan J. Nature 1992, 358, 646-653.
5. Rodham, D. A.; Suzuki, S.; Suenram, R. D.; Lovas, F. J.; Dasgupta, S.; Goddard III, W. A.; Blake, G. A. Nature 1993, 362, 735-737.
6. Kim, K. S.; Lee, J. Y.; Lee, S. J.; Ha, T. K.; Kim, D. H. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 7399-7400. Lee, J. Y.; Lee, S. J.; Choi, H. S.; Cho, S. J.; Kim, K. S.; Ha, T. K. Chem. Phys. Lett. 1995, 232, 67-71.
7. Kim, K. S.; Lee, J. Y.; Lee, S. J.; Ha, T. K.; Kim, D. H. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 7399-7400. Lee, J. Y.; Lee, S. J.; Choi, H. S.; Cho, S. J.; Kim, K. S.; Ha, T. K. Chem. Phys. Lett. 1995, 232, 67-71.
8. Flocco, M. M.; Mowbray, S. L. J. Mol. Biol. 1994, 235, 709-717. Mitchell, J. B. O.; Nandi, C. L.; McDonald, I. K.; Thornton, J. M.; Price, S. L. J. Mol. Biol. 1994, 923, 315-331.
9. Flocco, M. M.; Mowbray, S. L. J. Mol. Biol. 1994, 235, 709-717. Mitchell, J. B. O.; Nandi, C. L.; McDonald, I. K.; Thornton, J. M.; Price, S. L. J. Mol. Biol. 1994, 923, 315-331.
10. Dougherty, D. A. Science 1996, 271, 163-168.
11. Deakyne, C. A.; Meot-Ner, M. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 474-479.
12. Density Functional Methods in Chemistry; Labanowski, J., Andzelm, J., Eds.; Springer-Verlag: New York, 1991.
13. Molecular Simulations Inc., San Diego, CA.
14. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1988, 88, 2547-2553.
15. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. 1988, B37, 786-789.
16. Paliwal, S. G.; Wilcox, C. S. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 4497-4498. Nishio, M.; Umezawa, Y.; Hirota, M.; Takeuchi, Y. Tetrahedron 1995, 51, 8665-8701.
17. Paliwal, S. G.; Wilcox, C. S. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 4497-4498. Nishio, M.; Umezawa, Y.; Hirota, M.; Takeuchi, Y. Tetrahedron 1995, 51, 8665-8701.
18. Mecozzi, S.; West, A. P., Jr.; Dougherty, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2307-2308.
19. Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4177-4178.
20. Joesten, M. D.; Schaad, L. J. Hydrogen Bonding; Dekker: New York, 1974.
21. Yamano, Y.; Ohyama, K.; Kikyo, M.; Sano, T.; Nakagomi, Y.; Inoue, Y.; Nakamura, N.; Morishima, I.; Guo, D.-F.; Hamakubo, T.; Inagami, T. J. Biol. Chem. 1995, 270, 14024-14030.