Roughness of the globular protein surface

Biofizika

Volumn 42, Issue 6, 1997, Pages 1206-1207

  Serdyuk, I N ^a   Galzitskaya, O V ^a   Timchenko, A A ^a  

^a INSTITUTE OF PROTEIN RESEARCH   (Russian Federation)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PROTEIN;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY;

MODELS, MOLECULAR; PROTEINS;

EID: 0031263169     PISSN: 00063029     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (81)

1. Miller S., Janin J., Lesk A. M., Chothia C. // J. Mol. Biol. 1987. V.196. P.641.
2. Tunion I., Silla E., Parcual-Ahuir J.L. // Protein Eng. 1992. V.5(8). P.715.
3. Shrake A., Rupley J.A. // J. Mol. Biol. 1973. V.79. P.351.
4. Chothia C. // J. Mol. Biol. 1976. V.105. P.1.
5. Teller D.C. // Nature (London). 1976. V.260. P.729.
6. Miller S., Lesk A.M., Janin J., Chothia C. // Nature (London). 1987. V.328. P.834.
7. Fushman D. // J. Biomol. Struct. & Dynamics. 1990. V.7(6). P.1333.
8. Serdyuk I.N., Zaccai G., Spirin A.S. // FEBS Lett. 1978. V.94. P.349.
9. Squire P.G., Himmel M.E. // Arch. Biochem. Biophys. 1979. V.196(l). P.165.
10. Adman E.T., Sieker L.C., Jeusen L.H. // J. Biol. Chem. 1973. V.248. P.3987.
11. Weber E., Papamokos E., Bode W. et al. // J. Mol. Biol. 1981. V.149. P.109.
12. Low B.W., Preston H.S., Sato A. et. al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1976. V.73. P.2991.
13. Walkinshow M., Saenger W., Maelike A. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1980. V.77. P.2400.
14. Mc Person A., Jurnak F., Wang A.H. et. at. // J. Mol. Biol. 1979. V.134. P.379.
15. Pletnev V.Z., Kuzin A.P., Trakhanov S.D. et al. // Biopolymers. 1981. V.20. P.679.
16. Colman P.M., Freeman H.C., Guss J.M. et al. // Nature (London). 1978. V.272. P.319.
17. Mitsui Y., Satow Y., Watanabe Y., Iitaka Y. // J. Mol. Biol. 1979. V.131. P.697.
18. Kretsinger R.H., Nockolds C.E. // J. Biol. Chem. 1973. V.248. P.3313.
19. Soderberg B.O., Holmgren A., Branden C.I. // J. Mol. Biol. 1974. V.90. P.143.
20. Methews F., Bethge P., Czerwinsci E. // J. Mol. Biol. 1979. V.254. P.1699.
21. Epp O., Colman P., Fehlhammer H. et al. // Eur. J. Biochem. 1974. V.45. P.513.
22. Dickerson R.E., Takano T., Eisenberg D. et al. // J. Biol. Chem. 1971. V.246. P.1511.
23. Salemme F.R., Freer S.T., Xuong N.G.H. et al. // J. Biol. Chem. 1973. V.248. P.3910.
24. Kartha G., Bello J., Harker D. // Nature (London). 1967. V.213. P.862.
25. Chipman D., Sharon N. // Science. 1969. V.165. P.454.
26. Brandhuber B., Boone T., Kenney W.C., McKay D.B. // J. Biol. Chem. 1987. V.262. P.12306.
27. Ludwig M.L., Andersen R.D., Apgar P.A. et al. // Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1971. V.36. P.369.
28. Matthews B.W., Remington S.J. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1974. V.71. P.4178.
29. Olson G., Andersen L., Lindqvist O. et al. // FEBS Lett. 1982. V.145. P.317.
30. Watson M.C. // Progress in Stereochemistry / Eds. B.J. Aylett et al. N.Y., Butterworts, Lond. 1957. P.299.
31. Dideberg O., Charlier P., Dupont L. et al. // FEBS Lett. 1980. V.117. P.212.
32. Sarma R., Harada Sh., Tanaka N. et al. // J. Biochem. 1979. V.86. P.1765.
33. Delbaere L.T., Brayer G.D., James M.N. // Can. J. Biochem. 1979. V.57. P.135.
34. Holden H., Rypniewski W.R., Law J.H., Rayment I. // EMBO J. 1987. V.6. P.1565.
35. Ringe D., Petsco G.A., Yamakura F. et al. // Proc. Natl. Acad. USA. 1983. V.80. P.3879.
36. Drenth J., Jansonius J.N., Koekoek R., Wolthers B.G. // The Enzymes. 1971. V. 8. Ch. 13.
37. Heinmann U., Pal G.P., Hilgenfeld R., Saenger W. // J. Mol. Biol. 1982. V.161. P.591.
38. Blow D.M. // The Enzymes 3 (third edition). 1971. V.3. P.185.
39. Kraut J., Sieker L.C., High D.F., Freer S.T. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1962. V.48. P.1417.
40. Reeke G.N., Beeker J.W. // Science. 1986. V.234. P.1108.
41. Shotton D.M., Watson H.C. // Nature (London). 1970. V.225. P.811.
42. Drenth J., Hol W.G., Jansonius J.M., Koekoek R. // Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1972. V.36. P.107.
43. Kannan K.K., Liljas A., Wara I. et al. // Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1971. V.36. P.221.
44. Lee B., Yang H. Yu., Henry G.M., Seymour J.P. // J. Biol. Chem. 1975. V.250. P.6228.
45. Hsu I.-N., Hoffmann T., Nyburg S.C., James M.N.G. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1976. V.72. P.363.
46. Parker M., Blake, Colin C.F. // J. Mol. Biol. 1988. V.199. P.649.
47. Ploegman J.H., Drent G., Kalk K.H., Hol W.G.J. // J. Mol. Biol. 1978. V.123. P.557.
48. Mowbray S.L., Petsko G.A. // J. Biol. Chem. 1983. V.258. P.7991.
49. Gilliland G.L., Quiocho F.A. // J. Mol. Biol. 1981. V.146. P.341.
50. Lipscomb W.H., Coppola W.J.C., Hartsuck J.A. et al. // J. Mol. Biol. 1966. V.19. P.423.
51. Pflugrath J.W., Quiocho F. // J. Mol. Biol. 1988. V.200. P.163.
52. Colman P.M., Jansonius J.N., Matthew B.W. // J. Mol. Biol. 1972. V.70. P.701.
53. Schmid M.F., Herriott J.K. // J. Mol. Biol. 1976. V.103. P.175.
54. Subramanian E., Swan I.D.A., Liu M. et al. // Proc. Natt. Acad. Sci. USA. 1977. V.74. P.556.
55. Jenkins J.A., Blundell T.L., Tickle I.J., Ungaretti L. // J. Mol. Biol. 1975. V.99. P.583.
56. Subramanian E., Swan I.D.A., Davies David R. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1976. V.68. P.875.
57. Saper M.A., Quiocho F.A. // J. Biol. Chem. 1983. V.258. P.11057.
58. Anderson B.A., Baker H., Dodson E. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1987. V.84. P.1769.
59. Wierenga R.K., de Jong R.J., Kalk K.H. et al. // J. Mol. Biol. 1979. V.131. P.55.
60. Ford G., Eichele G., Jansonius J.N. // J. Mol. Biol. 1979. V.133. P.161.
61. Irvin M., Nyborg J., Reid B.R., Blow D. // J. Mol. Biol. 1976. V.105. P.577.
62. Blake C.C.F., Evans P.R., Scopes R.K. // Nature New Biol. 1972. V.235. P.195.
63. Borisov V., Borisova S., Kachalova G. et al. // J. Mol. Biol. 1978. V.125. P.275.
64. Stec B., Lebioda L. // J. Mol. Biol. 1990. V.211. P.235.
65. Segal D.M., Padlan E.A., Cohen G.H. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1974. V.71. P.4298.
66. Zappe H.A., Krohne-Ehrich G., Schulz G.E. // J. Mol. Biol. 1977. V.113. P.141.
67. Matsuura Y., Kusunoki M., Date W. et al. // J. Biochem. 1979. V.86. P.1773.
68. Hata Y., Matsuura Y., Tanaka N. et al. // J. Biochem. 1979. V.86. P.1821.
69. Bjorkman P.J., Saper M.A., Samraoni B. et al. // Nature (London). 1987. V.329. P.506.
70. Messerscmidt A., Rossi A., Ladenstein R., Huber R.// J. Mol. Biol. 1989. V.206. P.513.
71. Zelwer G., Rislek J.L., Brunie S. // J. Mol. Biol. 1982. V.155. P.63.
72. Pavlov M.Yu., Fedorov B.A. // Biopolymers. 1983. V.22(6). P.1507.
73. Rudnick J., Gaspari G. // J. Phys. 1986. A19. L191.
74. Connoly M.L. // J. Appl. Cryst. 1983. V.16. P.548.
75. Hudson D.J. // Lectures on elementary statistics and probability. Geneva, 1964.
76. Svergun D.I. // Agta Cryst. 1994. Sect. A50. P.391.
77. Konig S., Svergun D.I., Koch M.H.S. et al. // Eur. Biophys. J. 1993. V.22. P.185.
78. Timchenko A.A., Galzitskaya O.V., Serdyuk I.N. // Proteins. 1997. V.28. P.194.