Protein electric field effects on the CO stretch frequency of carbonmonoxycytochromes c as a function of carbonyl tilting and bending investigated with a continuum electrostatic approach

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 101, Issue 38, 1997, Pages 7364-7367

  Laberge, Monique ^a   Sharp, Kim A ^a   Vanderkooi, Jane M ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CARBON MONOXIDE; CHEMICAL BONDS; COMPUTATIONAL METHODS; ELECTRIC FIELD EFFECTS; ELECTROSTATICS; FINITE DIFFERENCE METHOD; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR ORIENTATION; MOLECULAR STRUCTURE;

CARBONMONOXYCYTOCHROMES; POISSON BOLTZMANN CALCULATIONS; STARK FREQUENCY SHIFTS;

PROTEINS;

EID: 0031237323     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9706846     Document Type: Article

References (37)

1. Antosiewicz, J.; McCammon, J. A.; Gilson, M. K. J. Mol. Biol. 1994, 238, 415-436.
2. Antosiewicz, J.; Porschke, D. Biophys. J. 1995, 68, 655-664.
3. Augspurger, J. D.; Dykstra, C. E.; Oldfield, E. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 2447-2451.
4. Bernstein, F. C.; Koetzle, T. F.; Williams, G. J. B.; Meyer Jr, E. F.; Brice, M. D.; Rodgers, J. R.; Kennard, O.; Shimanouchi, T.; Tasumi, M. Eur. J. Biochem. 1977, 80, 319-324.
5. Beroza, P.; Fredkin, D. R.; Okamura, M. Y.; Feher, G. Biophys. J. 1995, 68, 2233-2250.
6. Bushnell, G. W.; Louie, G. V.; Brayer, G. D. J. Mol. Biol. 1990, 214, 585-595.
7. Case, D. A.; Karplus, M. J. Mol. Biol. 1978, 213, 697-701.
8. Chattopadyay, A.; Boxer, S. G. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 1449-1450.
9. Collman, J. P.; Brauman, J. I.; Halbert, T. R.; Suslick, K. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1976, 73, 3333-3337.
10. Ghosh, A.; Bocian, D. F. J. Phys. Chem. 1996, 100, 6363-6367.
11. Gilson, M. K.; Honig, B. Biopolymers 1986, 25, 2097-2119.
12. Gilson, M. K.; Sharp, K. A.; Honig, B. J. Comput. Chem. 1987, 9, 327-335.
13. Gunner, M. R.; Honig, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 9151-9155.
14. Harvey, S. C. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1989, 5, 78-92.
15. Hu, S.; Vogel, K. M.; Spiro, T. G. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11187-11188.
16. Ivanov, D.; Sage, J. T.; Keim, M.; Powell, J. R.; Asher, S. A.; Champion, P. M. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 4139-4140.
17. Jewsbury, P.; Yamamoto, S.; Minato, T.; Saito, M.; Kitagawa, T. J. Phys. Chem. 1995, 99, 12677-12685.
18. Kushkuley, B.; Stavrov, S. S. Biophys. J. 1996, 70, 1214-1229.
19. Laberge, M.; Sharp, K.; Vanderkooi, J. M. Biophys. J. 1996, 70, A223.
20. Laberge, M.; Vanderkooi, J. M.; Sharp, K. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 10793-10801.
21. Lancaster, C. R.; Michel, H.; Honig, B.; Gunner, M. R. Biophys. J. 1996, 70, 2469-2492.
22. Li, T.; Quillin, M. L.; Phillips, G. N. J.; Olson, J. S. Biochemistry 1994, 33, 1433-1446.
23. Lim, M.; Jackson, J. A.; Anfinrud, P. A. Science 1995, 269, 962-966.
24. Lockhart, D. J.; Boxer, S. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 107-111.
25. Loesche, M.; Feher, G.; Okamura, M. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1987, 84, 7537-7541.
26. Louie, G. V.; Brayer, G. D. J. Mol. Biol. 1990, 214, 527-555.
27. Maiti, S.; Walker, B. R.; Cowen, R.; Pippenger, R.; Moser, C. C.; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 10360-10364.
28. Merzbacher, E. Quantum Mechanics; Wiley: New York, 1961.
29. Middendorf, T. R.; Mazzola, L. T.; Lao, K.; Steffen, A.; Boxer, S. G. Biochim. Biophys. Acta 1993, 1143, 223-234.
30. Nicholls, A.; Honig, B. J. Comput. Chem. 1991, 12, 435-445.
31. Oldfield, E.; Guo, K.; Augspurger, J. D.; Dykstra, C. E. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 7537-7541.
32. Park, K. D.; Guo, K.; Adebodun, F.; Chiu, M. L.; Sugar, S. G.; Oldfield, E. Biochemistry 1991, 30, 2333-2347.
33. Quillin, M. L.; Arduini, R. M.; Oison, J. S.; Phillips Jr., G. N. J. Mol. Biol. 1993, 234, 140-155.
34. Ray, G. B.; Li, X.-Y.; Ibers, J. A.; Sessler, J. L.; Spiro, T. G. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 162-176.
35. Sharp, K.; Honig, B. Annu. Rev. Biophys. Chem. 1990, 19, 301-332.
36. Springer, B. S.; Sugar, S. G.; Olson, J. S.; Phillips, G. N., Jr. Chem. Rev. 1994, 94, 699-714.
37. Steffen, M. A.; Lao, K.; Boxer, S. G. Science 1994, 264, 810-816.