Quantitative competitive RNA PCR for quantitation of virion-associated HIV-1 RNA

Methods: A Companion to Methods in Enzymology

Volumn 12, Issue 4, 1997, Pages 294-299

  Brichacek, Beda ^a   Stevenson, Mario ^a  

^a UNIVERSITY OF MASSACHUSETTS MEDICAL SCHOOL   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

VIRUS RNA;

ARTICLE; BINDING COMPETITION; BLOOD LEVEL; HUMAN; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1; NONHUMAN; OPPORTUNISTIC INFECTION; POLYMERASE CHAIN REACTION; PRIORITY JOURNAL; QUANTITATIVE ASSAY; SEROPREVALENCE; STANDARD; VACCINATION; VIRION; VIRUS PARTICLE;

HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1;

EID: 0031214431     PISSN: 10462023     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1006/meth.1997.0482     Document Type: Article

References (31)

1. de Wolf F., Lange J. M. A., Houweling J. T. M., Coutinho R. A., Schellekens P. T., van der Noordaa J., Goudsmit J. J. Infect. Dis. 158:1988;615-622.
2. Ho D. D., Moudgil T., Alam M. N. Engl. J. Med. 321:1989;1621-1625.
3. Coombs R. W., Collier A. C., Allain J.-P., Nikora B., Leuther M., Gjerset G. F., Corey L. N. Engl. J. Med. 321:1989;1626-1631.
4. Venet A., Lu W., Beldjord K., Andrieu J.-M. AIDS. 5:1991;283-288.
5. Piatak M. Jr., Saag M. S., Yang L. C., Clark S. J., Kappas J. C., Luk K.-C., Hahn B. H., Shaw G. M., Lifson J. D. Science. 259:1993;1749-1754.
6. Aoki-Sei S., Archoan R. Y., Kageyama S., Hoekzema, Pluda J. M., Wyvill K. M., Broder S., Mitsuya H. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 8:1992;1263-1270.
7. Verhofstede C., Reniers S., Wanzeele F., Plum J. AIDS. 8:1994;1421-1427.
8. Tetali S., Abrams E., Bakshi S., Paul M., Oyaizu N., Pahwa S. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 12:1996;669-675.
9. Wei X., Ghosh S. K., Taylor M. E., Johnson V. A., Emini E. A., Deutsch P., Lifson J. D., Bonhoeffer S., Nowak M. A., Hahn B. H., Saag M. S., Shaw G. M. Nature. 373:1995;117-122.
10. Ho D. D., Neumann A. U., Perelson A. S., Chen W., Leonard J. M., Markowitz M. Nature. 373:1995;123-126.
11. Kovacs J. A., Baseler M., Dewar R. J., Vogel S., Davey R. T., Falloon J., Polis M. A., Walker R. E., Stevens R., Salzman N. P., Metalf J. A., Masur H., Lane H. C. N. Engl. J. Med. 332:1995;567-575.
12. O'Brien W. A., Grovit-Ferbas K., Namazi A., Wang H. J., Park J., Yeramian C., Mao S. H., Zack J. A. Blood. 86:1995;1082-1089.
13. Staprans S. I., Hamilton B. L., Follansbee S. E., Elbeik T., Barbosa B., Grant R. M., Feinberg M. B. J. Exp. Med. 182:1995;1727-1737.
14. Brichacek B., Swindells S., Janoff E. N., Pirruccello S., Stevenson M. J. Infect. Dis. 174:1996;1191-1199.
15. Stanley S. K., Ostrowski M. A., Justement J. S., Gantt K., Hedayati S., Mannix M., Roche K., Schwartzentruber D. J., Fox C. H., Fauci A. S. N. Engl. J. Med. 334:1996;1222-1230.
16. Furtado M. R., Kingsley L. A., Wolinsky S. M. J. Virol. 69:1995;2092-2100.
17. Patterson B. K., Till M., Otto P., Goolsby C., Furtado M. R., McBride L. J., Wolinsky S. M. Science. 260:1993;976-979.
18. Seshamma T., Bagasra O., Trono D., Baltimore D., Pomerantz R. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89:1992;10663-10667.
19. Seshamma T., Bagasra O., Oakes J. W., Pomerantz R. J. J. Virol. Methods. 40:1992;331-345.
20. Pomerantz R., Trono D., Feinberg M., Baltimore D. Cell. 62:1990;1271-1276.
21. Mullis K. G., Faloona F. A. Methods Enzymol. 155:1987;263-273.
22. Innis M. A., Gelfand D. H. PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications. 1990;Academic Press, San Diego. p. 3-12.
23. Noonan K. E., Beck C., Holymayer T. A., Chin J. E., Wunder J. S., Andrulis I. L., Gadzar A. F., Willman C. L., Griffity B., Von Hoff D. D., Roninson I. B. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87:1990;7160-7164.
24. Dickover R. E., Donovan R. M., Goldstein E., Dandekar S., Bush C. E., Carlson J. R. J. Clin. Microbiol. 18:1990;2130-2134.
25. Becker-André M., Hahlbrock K. Nucleic Acids Res. 17:1989;9437.
26. Gilliland G., Perrin S., Blanchard K., Bunn H. F. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87:1990;2725-2729.
27. Gilliland G., Perrin S., Bunn H. R. Innis M. A., Gelfand D. H., Sninsky J. J., White T. J. PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications. 1990;60-69 Academic Press, San Diego.
28. Piatak M. Jr., Luk K. C., Williams B., Lifson J. D. BioTechniques. 14:1993;70-81.
29. Stevenson M., Haggerty S., Lamonica C. A., Meier C. M., Welch S.-K., Wasiak A. J. J. Virol. 64:1990;2421-2425.
30. Ratner L., Haseltine W., Patarca R., Livak K. J., Starcich B., Josephs S. F., Doran E. R., Rafalski J. A., Whitehorn E. A., Baumeister K., Ivanoff L., Petteway S. R., Pearson M. L., Lautenberger J. A., Papas T. S., Ghrayeb J., Chang N. T., Gallo R. C., Wong-Staal F. Nature. 313:1985;277-284.
31. Sambrook J., Fritsch E. F., Maniatis T. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 1989;Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor.