Genetic diagnosis by polymerase chain reaction and electrospray ionization mass spectrometry: Detection of five base deletion from blood DNA of a familial adenomatous polyposis patient

Journal of the American Society for Mass Spectrometry

Volumn 8, Issue 7, 1997, Pages 737-742

  Naito, Yasuhiro ^a   Ishikawa, Keiichiro ^b   Koga, Yoshinori ^b   Tsuneyoshi, Toshihiro ^c   Terunuma, Hideya ^d   Arakawa, Ryuichi ^e  

^a HAMAMATSU UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (Japan)

^b NATL INST OF MAT AND CHEM RES   (Japan)

^c SHIZUOKA INSTITUTE OF SCIENCE AND TECHNOLOGY   (Japan)

^d Suruga Nishi Hospital   (Japan)

^e OSAKA UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; RESTRICTION ENDONUCLEASE;

ADENOMATOUS POLYP; ARTICLE; BASE PAIRING; CONTROLLED STUDY; DNA DETERMINATION; GENE DELETION; GENETIC ANALYSIS; HUMAN; HUMAN TISSUE; MASS SPECTROMETRY; POLYMERASE CHAIN REACTION;

EID: 0031194993     PISSN: 10440305     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1016/S1044-0305(97)00083-4     Document Type: Article

References (42)

1. 1. Saiki, R. K.; Scharf, S.; Faloona, F.; Mullis, K. B.; Horn, G. T.; Erlich, H. A.; Arnheim, N. Science 1985, 230, 1350-1354.
2. 2. Kiko, H.; Niggemann, E.; Ruger, W. Mol. Genet. 1979, 172, 303-312.
3. 3. Pourzand, C.; Cerutti, P. Mutat. Res. 1993, 288, 113-121.
4. 4. Saiki, R. K.; Bugawan, T. L.; Horn, G. T.; Mullis, K. B.; Erlich, H. A. Nature 1986, 324, 163-166.
5. 5. Chamberlain, J. S.; Gibbs, R. A.; Ranier, J. E.; Nguyen, P. N.; Caskey, C. T. Nucleic Acids Res. 1988, 16, 11141-11156.
6. 6. Wu, D. Y.; Ugozzoli, L.; Pal, B. K.; Wallace, R. B. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989, 86, 2757-2760.
7. 7. Orita, M.; Iwahana, H.; Kanazawa, H.; Hayashi, K.; Sekiya, T. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989, 86, 2766-2770.
8. 8. Soto, D.; Sukumar, S. PCR Methods Appl. 1992, 2, 96-98.
9. 9. Sanger, F.; Nicklen, S.; Coulson, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1977, 74, 5463-5467.
10. 10. Maxam, A. M.; Gilbert, W. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1977, 74, 560-564.
11. 11. Kahn, P. Science 1995, 270, 369-370.
12. 12. Smith, L. M. Science 1993, 262, 530-532.
13. 13. Collins, F.; Galas, D. Science 1993, 262, 43-46.
14. 14. Bleicher, K.; Bayer, E. Biol. Mass Spectrom. 1994, 23, 320-322.
15. 15. Yamashita, M.; Fenn, J. B. J. Phys. Chem. 1984, 88, 4451-4471.
16. 16. Whitehouse, C. M.; Dreyer, R. N.; Yamashita, M.; Fenn, J. B. Anal. Chem. 1985, 57, 675-686.
17. 17. Fenn, J. B.; Mann, M.; Meng, C. K.; Wong, S. K.; Whitehouse, C. M. Science 1989, 246, 64-71.
18. 18. Fenn, J. B.; Mann, M.; Meng, C. K.; Wong, S. K. Mass Spectrom. Rev. 1990, 9, 37-70.
19. 19. Kowalak, J. A.; Pomerantz, S. C.; Crain, P. F.; McCloskey, J. A. Nucleic Acids Res. 1993, 21, 4577-4585.
20. 20. McLuckey, S. A.; Goeringer, D. E. Anal. Chem. 1995, 67, 2493-2497.
21. 21. Karas, M.; Backmann, D.; Bahr, U.; Hillenkamp, F. Int. J. Mass Spectrom. Ion Proc. 1987, 78, 53-68.
22. 22. Hillenkamp, F.; Karas, M. Anal. Chem. 1988, 60, 2301-2303.
23. 23. Nordhoff, E.; Ingendoh, A.; Cramer, R.; Overberg, A.; Stahl, B.; Karas, M.; Hillenkamp, F.; Crain, P. F. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1992, 6, 771-776.
24. 24. Nordhoff, E.; Karas, M.; Cramer, R.; Hahner, S.; Hillenkamp, F.; Kirpekar, F.; Lezius, A.; Muth, J.; Meier, C.; Engels, J. W. J. Mass Spectrom. 1995, 30, 99-112.
25. 25. Castro, J. A.; Koster, C.; Wilkins, C. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1992, 6, 239-241.
26. 26. Pieles, U.; Zurcher, W.; Schar, M.; Moser, H. E. Nucleic Acids Res. 1993, 22, 3191-3196.
27. 27. Juhasz, P.; Roskey, M. T.; Smirnov, I. P.; Haff, L. A.; Vestal, M. L.; Martin, S. A. Anal. Chem. 1996, 68, 941-946.
28. 28. Poiter, N.; Dorsselaer, A. V.; Cordier, Y.; Roch, O.; Bischoff, R. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 3895-3903.
29. 29. Little, D. P.; Thannhauser, T. W.; McLafferty, F. W. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995, 92, 2318-2322.
30. 30. Wunschel, D. S.; Fox, K. F.; Fox, A.; Bruce, J. E.; Muddiman, D. C.; Smith, R. D. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1996, 10, 29-35.
31. 31. Muddiman, D. C.; Wunschel, D. S.; Liu, G.; Pasa-Tolic, L.; Fox, K. F.; Fox, A.; Anderson, G. A.; Smith, R. D. Anal. Chem. 1996, 68, 3705-3712.
32. 32. Clark, J. M. Nucleic Acids Res. 1988, 16, 9677-9686.
33. 33. Naito, Y.; Ishikawa, K.; Koga, Y.; Tsuneyoshi, T.; Terunuma, H.; Arakawa, R. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1995, 9, 1484-1486.
34. 34. Kinzler, K. W.; Nilbert, M. G.; Su, L. K.; Vogelstein, B.; Bryan, T. M.; Levy, D. B.; Smith, K. J.; Preisinger, A. C.; Hedge, P.; McKechnie, D. Science 1991, 253, 661-665.
35. 35. Nishisho, I.; Nakamura, Y.; Miyoshi, Y.; Miki, Y.; Ando, H.; Horii, A.; Koyama, K.; Utsunomiya, J.; Baba, S.; Hedge, P. Science 1991, 253, 665-669.
36. 36. Groden, J.; Thliveris, A.; Samowitz, W.; Carlson, M.; Gelbert, L.; Albertsen, H.; Joslyn, G.; Stevens, J.; Spirio, L.; Robertson, M. Cell 1991, 66, 589-600.
37. 37. Joslyn, G.; Carlson, M.; Thliveris, A.; Albertsen, H.; Gelbert, L.; Samowitz, W.; Groden, J.; Stevens, J.; Spirio, L.; Robertson, M. Cell 1991, 66, 601-613.
38. 38. Bell, G. I.; Karam, J. H.; Rutter, W. J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1981, 78, 5759-5763.
39. 39. Ando, H.; Miyoshi, Y.; Nagase, H.; Baba, S.; Nakamura, Y. Gastroenterology 1993, 204, 989-993.
40. 40. Davis, L. G.; Dibner, M. D.; Battey, J. F. In Basic Methods in Molecular Biology; Elsevier: New York, 1986; p 320.
41. 41. Doktycz, M. J.; Hurst, G. B.; Habibi-Goudarzi, S.; McLuckey, S. A.; Tang, K.; Chen, C. H.; Uziel, M.; Jacobson, K. B.; Woychik, R. P.; Buchanan, M. V. Anal. Biochem. 1995, 230, 205-214.
42. 42. Chang, L. Y.; Tang, K.; Schell, M.; Ringelberg, C.; Matteson, K. J.; Allman, S. L.; Chen, C. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1995, 9, 772-774.