Homology modeling of the AMPA receptor: A quantitative predictive tool for the design of novel antagonists

Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters

Volumn 7, Issue 11, 1997, Pages 1437-1442

  Hesson, David P ^a   Sturgess, Michael A ^a  

^a Symphony Pharmaceuticals   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMPA RECEPTOR; AMPA RECEPTOR ANTAGONIST;

ARTICLE; BINDING AFFINITY; BINDING SITE; DRUG DESIGN; MODEL; PROTEIN DOMAIN; QUANTITATIVE STRUCTURE ACTIVITY RELATION; SEQUENCE HOMOLOGY; TOPOGRAPHY;

EID: 0030992720     PISSN: 0960894X     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1016/S0960-894X(97)00239-4     Document Type: Article

References (24)

1. Monaghan, D. T.; Bridges, R. J.; Cotman, C. W. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 1989, 29, 365.
2. Gill, R.; Lodge, D. Neuropharmacology 1994, 33, 1529: Sheardown, M. J.; Neilson, E. O.; Hansen, A. J.; Jacobsen, P.; Honore, T. Science 1990, 247, 571.
3. Gill, R.; Lodge, D. Neuropharmacology 1994, 33, 1529: Sheardown, M. J.; Neilson, E. O.; Hansen, A. J.; Jacobsen, P.; Honore, T. Science 1990, 247, 571.
4. Yamaguchi, S. I.; Donevan, S. D.; Rogawski, M. A. Epilepsy Res. 1993, 15, 179.
5. Stem-Bach, Y; Bettler, B.; Hartley, M.; Sheppard, P. O.; O'Hara, P. J.; Heinemann, S. F. Neuron 1994, 13, 1345.
6. Mano, L.; Larned, Y.; Teichberg, V. I. J. Biol. Chem. 1996, 271, 15299.
7. Sutcliffe, M. J.; Wo, Z. G.; Oswald, R. E. Biophysical J. 1996, 70, 1575.
8. Paas, Y.; Eisenstein, M.; Medevielle, R; Teichberg, V. L; Devillers-Thiery, A. Neuron 1996, 17, 979.
9. Laube, B.; Hirai, H.; Sturgess, M.; Betz, H.; Kuhse, J. Neuron 1997, 18, 1.
10. Greer, J. Methods in Enzymol. 1991, 202A, 239.
11. See, for example: Ajay; Murcko, M. A. J. Med. Chem. 1995, 26, 4953.
12. Holloway, M. K.; Wai, J. M.; Halgren, T. A.; Fitzgerald, P. M. D.; Vacca, J. P.; Dorsey, B. D.; Levin, R. B.; Thompson, W. J.; Chen, L. J.; deSolms, S. J.; Gaffin, N.; Ghosh, A. K.; Giuliani, E. A.; Graham, S. L.; Guare, J. P.; Hungate, R. W.; Lyle, T. A.; Sanders, W. M.; Tucker, T. J.; Wiggins, M.; Wiscount, C. M.; Woltersdorf, O. W.; Young, S. D.; Darke, P. L.; Zugay, J. A. J. Med. Chem. 1995, 38, 305.
13. Oh, B.-H.; Pandit, J.; Kang, C.-H; Nikaido, K.; Gokcen, S.; Ames, G. F.-L.; Kim, S.-H. J. Biol. Chem. 1993, 268, 11348.
14. Holley, L. H.; Karplus, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 152. Garnier, J.; Osguthorpe, D. J.; Robson, B. J. Mol. Biol. 1978, 120, 97.
15. Holley, L. H.; Karplus, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 152. Garnier, J.; Osguthorpe, D. J.; Robson, B. J. Mol. Biol. 1978, 120, 97.
16. Bigge, C. F.; Malone, T. C.; Boxer, P. A.; Nelson, C. B.; Ortwine, D. F.; Schelkun, R. M.; Retz, D. M.; Lescosky, L. J.; Borosky, S. A.; Vartanian, M. G.; Schwarz, R. D.; Campbell, G. W.; Robichaud, L. J.; Watjen, F. J. Med. Chem. 1995, 38, 3720.
17. Johansen, T. H.; Drejer, J.; Watjen, F.; Nielsen, E. O. Eur. J. Pharmacol.-Mol. Pharmacol. Sect. 1993, 246, 195. Ohmuri, J.; Sakamoto, S.; Kubota, H.; Shimizu-Sasamata, M.; Okada, M.; Kawasaki, S.; Hidaka, K. Togami, J.; Furuya, T.; Murase, K. J. Med. Chem. 1994, 37, 467. Watjen, F; Drejer, J. "AMPA antagonists and a method of treatment therewith" WO 9426747. Watjen, F.; Bigge, C. F.; Jensen, L. H.; Boxer, P. A.; Lescosky, L. J.; Neilsen, E. O.; Malone, T. C.; Campbell, G. W.; Coughenour, L. L.; Rock, D. M.; Drejer, J.; Marcoux, F. W. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1994, 4, 371. Arnold, M. B.; Augenstein, N. K. Bertsch, C. F.; Hansen, M. M.; Harkness, A. R.; Huff, B. E.; Lunn, W. H. W.; Martinelli, M. J.; Ornstein, P. L.; Schoepp, D. D. Eur. Pat. 93306745.6
18. Johansen, T. H.; Drejer, J.; Watjen, F.; Nielsen, E. O. Eur. J. Pharmacol.-Mol. Pharmacol. Sect. 1993, 246, 195. Ohmuri, J.; Sakamoto, S.; Kubota, H.; Shimizu-Sasamata, M.; Okada, M.; Kawasaki, S.; Hidaka, K. Togami, J.; Furuya, T.; Murase, K. J. Med. Chem. 1994, 37, 467. Watjen, F; Drejer, J. "AMPA antagonists and a method of treatment therewith" WO 9426747. Watjen, F.; Bigge, C. F.; Jensen, L. H.; Boxer, P. A.; Lescosky, L. J.; Neilsen, E. O.; Malone, T. C.; Campbell, G. W.; Coughenour, L. L.; Rock, D. M.; Drejer, J.; Marcoux, F. W. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1994, 4, 371. Arnold, M. B.; Augenstein, N. K. Bertsch, C. F.; Hansen, M. M.; Harkness, A. R.; Huff, B. E.; Lunn, W. H. W.; Martinelli, M. J.; Ornstein, P. L.; Schoepp, D. D. Eur. Pat. 93306745.6
19. Johansen, T. H.; Drejer, J.; Watjen, F.; Nielsen, E. O. Eur. J. Pharmacol.-Mol. Pharmacol. Sect. 1993, 246, 195. Ohmuri, J.; Sakamoto, S.; Kubota, H.; Shimizu-Sasamata, M.; Okada, M.; Kawasaki, S.; Hidaka, K. Togami, J.; Furuya, T.; Murase, K. J. Med. Chem. 1994, 37, 467. Watjen, F; Drejer, J. "AMPA antagonists and a method of treatment therewith" WO 9426747. Watjen, F.; Bigge, C. F.; Jensen, L. H.; Boxer, P. A.; Lescosky, L. J.; Neilsen, E. O.; Malone, T. C.; Campbell, G. W.; Coughenour, L. L.; Rock, D. M.; Drejer, J.; Marcoux, F. W. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1994, 4, 371. Arnold, M. B.; Augenstein, N. K. Bertsch, C. F.; Hansen, M. M.; Harkness, A. R.; Huff, B. E.; Lunn, W. H. W.; Martinelli, M. J.; Ornstein, P. L.; Schoepp, D. D. Eur. Pat. 93306745.6
20. Johansen, T. H.; Drejer, J.; Watjen, F.; Nielsen, E. O. Eur. J. Pharmacol.-Mol. Pharmacol. Sect. 1993, 246, 195. Ohmuri, J.; Sakamoto, S.; Kubota, H.; Shimizu-Sasamata, M.; Okada, M.; Kawasaki, S.; Hidaka, K. Togami, J.; Furuya, T.; Murase, K. J. Med. Chem. 1994, 37, 467. Watjen, F; Drejer, J. "AMPA antagonists and a method of treatment therewith" WO 9426747. Watjen, F.; Bigge, C. F.; Jensen, L. H.; Boxer, P. A.; Lescosky, L. J.; Neilsen, E. O.; Malone, T. C.; Campbell, G. W.; Coughenour, L. L.; Rock, D. M.; Drejer, J.; Marcoux, F. W. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1994, 4, 371. Arnold, M. B.; Augenstein, N. K. Bertsch, C. F.; Hansen, M. M.; Harkness, A. R.; Huff, B. E.; Lunn, W. H. W.; Martinelli, M. J.; Ornstein, P. L.; Schoepp, D. D. Eur. Pat. 93306745.6
21. Johansen, T. H.; Drejer, J.; Watjen, F.; Nielsen, E. O. Eur. J. Pharmacol.-Mol. Pharmacol. Sect. 1993, 246, 195. Ohmuri, J.; Sakamoto, S.; Kubota, H.; Shimizu-Sasamata, M.; Okada, M.; Kawasaki, S.; Hidaka, K. Togami, J.; Furuya, T.; Murase, K. J. Med. Chem. 1994, 37, 467. Watjen, F; Drejer, J. "AMPA antagonists and a method of treatment therewith" WO 9426747. Watjen, F.; Bigge, C. F.; Jensen, L. H.; Boxer, P. A.; Lescosky, L. J.; Neilsen, E. O.; Malone, T. C.; Campbell, G. W.; Coughenour, L. L.; Rock, D. M.; Drejer, J.; Marcoux, F. W. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1994, 4, 371. Arnold, M. B.; Augenstein, N. K. Bertsch, C. F.; Hansen, M. M.; Harkness, A. R.; Huff, B. E.; Lunn, W. H. W.; Martinelli, M. J.; Ornstein, P. L.; Schoepp, D. D. Eur. Pat. 93306745.6
22. Uchino, S.; Sakimura, K.; Nagahari, K.; Mishina, M. FEBS Lett. 1992, 308, 253. Li, F.; Owens, N.; Verdoorn, T. A. Mol. Pharmacol. 1995, 47, 148.
23. Uchino, S.; Sakimura, K.; Nagahari, K.; Mishina, M. FEBS Lett. 1992, 308, 253. Li, F.; Owens, N.; Verdoorn, T. A. Mol. Pharmacol. 1995, 47, 148.
24. Rotatable bonds were those conformationally restricted by interactions with the receptor surface.