Mutating a conserved motif of the HIV-1 reverse transcriptase palm subdomain alters primer utilization

Biochemistry

Volumn 36, Issue 19, 1997, Pages 5758-5768

  Ghosh, Madhumita ^a   Williams, Jennifer ^a   Powell, Michael D ^b   Levin, Judith G ^b   Le Grice, Stuart F J ^a  

^a CASE WESTERN RESERVE UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

^b EUNICE KENNEDY SHRIVER NATIONAL INSTITUTE OF CHILD HEALTH AND HUMAN DEVELOPMENT   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

RNA DIRECTED DNA POLYMERASE;

ARTICLE; DNA SYNTHESIS; ENZYME ACTIVITY; ENZYME STRUCTURE; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1; PRIORITY JOURNAL; STRUCTURE ANALYSIS;

CONSERVED SEQUENCE; DNA PRIMERS; DNA REPLICATION; HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE; MUTAGENESIS, SITE-DIRECTED; NUCLEIC ACID CONFORMATION; NUCLEIC ACID HETERODUPLEXES; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; RIBONUCLEASE H, CALF THYMUS; TEMPLATES, GENETIC;

EID: 0030924328     PISSN: 00062960     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/bi963045e     Document Type: Article

References (48)

1. Arts, E. J., Ghosh, M., Ehresmann, B., & Le Grice, S. F. J. (1996a) J. Biol. Chem. 271, 9054-9061.
2. Arts, E. J., Stetor, S., Li, X., Rausch, J. W., Howard, K. J., Ehresmann, B., North, T. W., Wohrl, B. M., Goody, R. S., Wainberg, M. A., & Le Grice, S. F. J. (1996b) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93, 10063-10068.
3. Beard, W. A., Stahl, S. J., Kim, H.-R., Bebenek, K., Kumar, A., Strub, M.-P., Becerra, S. P., Kunkel, T. A., & Wilson, S. H. (1994) J. Biol. Chem. 269, 28091-28097.
4. Bebenek, K., Beard, W. A., Casas-Finet, J. R., Kim, H.-R., Darden, T. A., Wilson, S.H., & Kunkel, T. A. (1995) J. Biol. Chem. 270, 19516-19523.
5. Ben-Artzi, H., Shemesh, J., Zeelon, E., Amit, B., Kleiman, L., Gorecki, M., & Panet, A. (1996) Biochemistry 35,10549-10577.
6. Boyer, P. A., Tantillo, C., Jacobo-Molina, A., Nanni, R. G., Ding, J., Arnold, E., & Hughes, S. H. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 4882-4886.
7. Champoux, J. J. (1993) in Reverse Transcriptase (Skalka, A. M., Goff, S. P., Eds.) pp 103-117, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY.
8. Cirino, N. M., Cameron, C. E., Smith, J. S., Rausch, J. W., Roth, M. J., Benkovic, S. J., & Le-Grice, S. F. J. (1995) Biochemistry 34, 9936-9943.
9. Deng, W. P., & Nickoloff, J. A. (1992) Anal. Biochem. 200, 81-88.
10. DeStefano, J. J., Mallaber, L. M., Fay, P. J., & Bambara, R. A. (1993) Nucleic Acids Res. 21, 4330-4338.
11. Federoff, O. Y., Salazar, M., & Reid, B. R. (1993) J. Mol. Biol. 233, 509-523.
12. Furfine, E. S., & Reardon, J. E. (1991) J. Biol. Chem. 266, 406-412.
13. Ghosh, M., Howard, K. J., Cameron, C. E. Benkovic, S. J., Hughes, S. H., & Le Grice, S. F. J. (1995) J. Biol. Chem. 271, 8553-8562.
14. Ghosh, M., Jacques, P. S., Rodgers, D., Ottmann, M., Darlix, J.-L., & Le Grice, S. F. J. (1996) Biochemistry 35, 8553-8562.
15. Gopalakrishnan, V., Peliska, J. A., & Benkovic, S. J. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89, 10763-10767.
16. Guo, J., Wu, W., Yuan, Z. Y., Post, K., Crouch, R. J., & Levin, J. G. (1995) Biochemistry 34, 5018-5029.
17. Howard, K. J., Frank, K. B., Sim, I. S., & Le Grice, S. F. J. (1991) J. Biol. Chem. 266, 23003-23009.
18. Isel, C., Lanchy, J.M., Le Grice, S. F. J., Ehresmann, C., Ehresmann, B., & Marquet, R. (1996) EMBO J. 15, 917-924.
19. Jacobo-Molina, A., Ding, J., Nanni, R. G., Clark, A., Jr., Lu, X., Tantillo, C., Williams, R. L., Kamer, G., Ferris, A. L., Clark, P., & et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90, 6320-6324.
20. Jacques, P. S., Wöhrl, B. M., Ottmann, M., Darlix, J. L., & Le Grice, S. F. J. (1994) J. Biol. Chem. 269, 26472-26478.
21. Kohlstaedt, L. A., Wang, J., Friedman, J. M., Rice, P. A., & Steitz, T. A. (1992) Science 256, 1783-1799.
22. Lanchy, J.-M., Ehresmann, C., Le Grice, S. F. J., Ehresmann, B., & Marquet, R. (1996) EMBO J. 15, 7178-7187.
23. Lederer, H., Schatz, O., May, R., Crespi, H., Darlix, J. L., Le-Grice, S. F. J., & Heumann, H. (1992) EMBO J. 11, 1131-1139.
24. Le Grice, S. F. J. (1995) Protein Pept. Lett. 2, 381-390.
25. Le Grice, S. F. J., Naas, T., Wohlgensinger, B., & Schatz, O. (1991) EMBO J. 10, 3905-3911.
26. Le Grice, S. F. J., Cameron, C. E., & Benkovic, S. J. (1995) Methods Enzymol. 262, 130-147.
27. Marquet, R., Isel, C., Ehresmann, C., & Ehresmann, B. (1995) Biochimie 77, 113-124.
28. Minnick, D. T., Astatke, M., Joyce, K. M., & Kunkel, T. A. (1996) J. Biol. Chem. 271, 24954-24961.
29. Palaniappan, C., Fuentes, G. M., Rodriguez-Rodriguez, L., Fay, P. J., & Bambara, R. A. (1996) J. Biol. Chem. 271, 2063-2070.
30. Palaniappan, C., Wisniewski, M., Jacques, P. S., Le Grice, S. F. J., Fay, P. J., & Bambara, R. A. (1997) J. Biol. Chem. 272, 11157-11164.
31. Peliska, J. A., & Benkovic, S. J. (1992) Science 258, 1112-1118.
32. Post, K., Guo, J., Kalman, E., Uchida, T., Crouch, R. J., & Levin, J. G. (1993) Biochemistry 32, 5508-5517.
33. Powell, M. D., & Levin, J. G. (1996) J. Virol. 70, 5288-5296.
34. Powell, M. D., Ghosh, M., Jacques, P. S., Howard, K. J., Le Grice, S. F. J., & Levin, J. G. (1997) J. Biol. Chem. 272, 13262-13269.
35. Pullen, K. A., Rattray, A. J., & Champoux, J. J. (1993) J. Biol. Chem. 268, 6221-6227.
36. Rausch, J. R., Wöhrl, B. M., & Le Grice, S. F. J. (1996) J. Mol. Biol. 257, 500-511.
37. Ren, J., Esnouf, R., Hopkins, A., Ross, C., Jones, Y., Stammers, D., & Stuart, D. (1995) Nat. Struct. Biol. 2, 293-302.
38. Rodgers, D. W., Gamblin, S. J., Harris, B. A., Ray, S., Culp, J. S., Hellmig, B., Woolf, D. J., Debouck, C., & Harrison, S. C. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92, 1222-1226.
39. Schatz, O., Mous, J., & Le Grice, S. F. J. (1990) EMBO J. 9, 1171-1176.
40. Smerdon, S. J., Jäger, J., Wang, J., Kohlstaedt, L. A., Chirino, A. J., Friedman, J. M., Rice, P. A., & Steitz, T. A. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91, 3911-3915.
41. Stammers, D. K., Somers, D. O., Ross, C. K., Kirby, I., Ray, P. H., Wilson, J. E., Norman, M., Ren, J. S., Esnouf, R. M., Garman, E. F., Jones, E. Y., & Stuart, D. I. (1994) J. Mol. Biol. 242, 586-588.
42. Telesnitsky, A., & Goff, S. P. (1993) in Reverse Transcriptase (Skalka, A. M. & Goff, S. P., Eds.) pp 49-81, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY.
43. Unge, T., Knight, S., Bhikhabbai, R., Lövgren, S., Dauter, Z., Wilson, K., & Strandberg, B. (1994) Structure 2, 953-961.
44. Wöhrl, B. M., & Moelling, K. (1990) Biochemistry 29, 10141-10147.
45. Wöhrl, B. M., Howard, K. J., Jacques, P. S., & Le Grice, S. F. J. (1994) J Biol. Chem. 269, 8541-8548.
46. Wöhrl, B. M., Georgiadis, M., Telesnitsky, A., Hendrickson, W. A., & Le Grice, S.F. J. (1995a) Science 267, 96-99.
47. Wöhrl, B. M., Tantillo, C., Arnold, E., & Le Grice, S. F. J. (1995b) Biochemistry 34, 5343-5350.
48. Xiong, Y., & Eickbush, T. H. (1990) EMBO J. 9, 3353-3362.