Computational Binding Studies of Orthogonal Cyclosporin-Cyclophilin Pairs

Angewandte Chemie (International Edition in English)

Volumn 36, Issue 13-14, 1997, Pages 1466-1469

  Pierce, Albert C ^a   Jorgensen, William L ^a  

^a YALE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

Cyclophilin; Cyclosporin; Gene technology; Molecular recognition; Monte Carlo methods

Indexed keywords

EID: 0030815020     PISSN: 05700833     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/anie.199714661     Document Type: Article

References (25)

1. a) D. M. Spencer, T. J. Wandless, S. L. Schreiber, G. R. Crabtree, Science 1993, 262, 1019;
2. b) P. J. Belshaw, S. N. Ho, G. R. Crabtree, S. L. Schreiber, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 4604;
3. c) D. M. Spencer, P. J. Belshaw, L. Chen, S. N. Ho, F. Randazzo, G. R. Crabtree, S. L. Schreiber, Curr. Biol. 1996, 1, 839;
4. d) S. N. Ho, S. R. Biggar, D. M. Spencer, S. L. Schreiber, G. R. Crabtree, Nature 1996, 382, 822.
5. V. M. Rivera, T. Clackson, S. Natesan, R. Pollock, J. F. Amara, T. Keenan, S. R. Magari, T. Phillips, N. L. Courage, F. Cerasoli, Jr., D. A. Holt, M. Gilman, Nature Med. 1996, 2, 1028.
6. P. J. Belshaw, J. G. Schoepfer, K.-Q. Liu, K. L. Morrison, S. L. Schreiber, Angew. Chem. 1995, 107, 2313; Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1995, 34, 2129.
7. P. J. Belshaw, J. G. Schoepfer, K.-Q. Liu, K. L. Morrison, S. L. Schreiber, Angew. Chem. 1995, 107, 2313; Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1995, 34, 2129.
8. W. L. Jorgensen, Chemtracts Org. Chem. 1991, 4, 91; P. A. Kollman, Chem. Rev. 1993, 93, 2395.
9. W. L. Jorgensen, Chemtracts Org. Chem. 1991, 4, 91; P. A. Kollman, Chem. Rev. 1993, 93, 2395.
10. W. L. Jorgensen, MCPRO, Version 1.3, Yale University, New Haven, CT, 1995.
11. W. L. Jorgensen, E. M. Duffy, J. W. Essex, D. L. Severance, J. F. Blake, D. K. Jones-Hertzog, M. L. Lamb, J. Tirado-Rives, NATO ASI Ser. Ser. C 1997, in press; J. W. Essex, J. Tirado-Rives, D. L. Severance, W. L. Jorgensen, J. Phys. Chem., submitted.
12. W. L. Jorgensen, E. M. Duffy, J. W. Essex, D. L. Severance, J. F. Blake, D. K. Jones-Hertzog, M. L. Lamb, J. Tirado-Rives, NATO ASI Ser. Ser. C 1997, in press; J. W. Essex, J. Tirado-Rives, D. L. Severance, W. L. Jorgensen, J. Phys. Chem., submitted.
13. W. L. Jorgensen, J. Tirado-Rives, J. Phys. Chem. 1996, 100, 14508.
14. See for example W. L. Jorgensen, T. B. Nguyen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993, 90, 1194; E. M. Duffy, W. L. Jorgensen, J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 6337.
15. See for example W. L. Jorgensen, T. B. Nguyen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993, 90, 1194; E. M. Duffy, W. L. Jorgensen, J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 6337.
16. W. L. Jorgensen, J. Tirado-Rives, J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 1657; W. L. Jorgensen, D. L. Severance, ibid. 1990, 112, 4768.
17. W. L. Jorgensen, J. Tirado-Rives, J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 1657; W. L. Jorgensen, D. L. Severance, ibid. 1990, 112, 4768.
18. H. Ke, J. Mol. Biol. 1992, 228, 539.
19. H. Ke, D. Mayrose, P. J. Belshaw, D. G. Alberg, S. L. Schreiber, Z. Y. Chang, F. A. Etzkorn, S. N. Ho, C. T. Walsh, Structure 1994, 2, 33.
20. R. B. Knott, J. Schefer, B. P. Schoenborn, Acta Crystallogr. Sect. C 1990, 46, 1528.
21. D. Altschuh, O. Vix, B. Rees, J.-C. Thierry, Science 1992, 256, 92.
22. D. A. Pearlman, D. A. Case, J. C. Caldwell, G. L. Seibel, U. C. Singh, P. Weiner, P. A. Kollman, AMBER4.0, University of California, San Francisco, 1991.
23. W. L. Jorgensen, J. Chandrasekhar, J. D. Madura, R. W. Impey, M. L. Klein, J. Chem. Phys. 1983, 79, 126.
24. P. J. Belshaw, S. L. Schreiber, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 1805.
25. W. L. Jorgensen, D. S. Maxwell, J. Tirado-Rives, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225.