Structure as basis for understanding interfacial properties of lipases

Methods in Enzymology

Volumn 284, Issue , 1997, Pages 3-27

  Cycler, Miroslaw ^a   Schrag, Joseph D ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIAL ENZYME; TRIACYLGLYCEROL LIPASE;

ARTICLE; ENZYME ACTIVITY; ENZYME ANALYSIS; ENZYME BINDING; ENZYME CONFORMATION; ENZYME STRUCTURE; ENZYME SUBSTRATE; HUMAN; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; STRUCTURE ANALYSIS;

BACTERIA (MICROORGANISMS);

EID: 0030768420     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(97)84003-7     Document Type: Article

References (59)

1. L. Sarda and P. Desnuelle, Biochim. Biophys. Acta 30, 513 (1958).
2. P. Desnuelle, L. Sarda, and G. Ailhard, Biochim. Biphys. Acta 37, 570 (1960).
3. B. Borgström and H. L. Brockman, "Lipases." Elsevier, Amsterdam, 1984.
4. S. Ransac, F. Carrière, E. Rogalska, R. Verger, F. Marguet, G. Buono, E. P. Mclo, J. M. S. Cabral, M. P. Egloff, H. van Tilbeurgh, and C. Cambillau, "Molecular Dynamics of Biomembranes" (J. A. F. Op den Kamp, ed.), Vol. H96, pp. 265-304. NATO ASI series. Springer-Verlag, Berlin, 1996.
5. C. Martinez, P. De Geus, M. Lauwereys, G. Matthyssens, and C. Cambillau, Nature (London) 356, 615 (1992).
6. E. Lesuisse, K. Schanck, and C. Colson, Eur. J. Biochem. 216, 155 (1993).
7. A. Hjorth, F. Carrière, C. Cudrey, H. Wöldike, E. Boel, D. M. Lawson, F. Ferrato, C. Cambillau, G. G. Dodson, L. Thim, and R. Verger, Biochemistry 32, 4702 (1993).
8. L. Brady, A. M. Brzozowski, Z. S. Derewenda, E. Dodson, G. Dodson, S. Tolley, J. P. Turkenburg, L. Christiansen, B. Huge-Jensen, L. Norskov, L. Thim, and U. Menge, Nature (London) 343, 767 (1990).
9. F. K. Winkler, A. D'Arcy, and W. Hunziker, Nature (London) 343, 771 (1990).
10. J. D. Schrag, Y. G. Li, S. Wu, and M. Cygler, Nature (London) 351, 761 (1991).
11. D. M. Blow, Nature (London) 343, 694 (1990).
12. D. L. Ollis, E. Cheah, M. Cygler, B. Dijkstra, F. Frolow, S. M. Franken, M. Harel, S. J. Remington, I. Silman, J. Schrag, J. L. Sussman, K. H. G. Verschueren, and A. Goldman, Protein Eng. 5, 197 (1992).
13. M. Cygler, J. D. Schrag, and F. Ergan, Biotechnol. Genet. Eng. Rev. 10, 143 (1992).
14. J. D. Schrag and M. Cygler, Methods Enzymol 284, [4], 1997 (this volume).
15. A. M. Brzozowski, U. Derewenda, Z. S. Derewenda, G. G. Dodson, D. M. Lawson, J. P. Turkenburg, F. Bjorkling, B. Huge-Jensen, S. A. Patkar, and L. Thim, Nature (London) 351, 491 (1991).
16. U. Derewenda, A. M. Brzozowski, D. M. Lawson, and Z. S. Derewenda, Biochemistry 31, 1532 (1992).
17. H. van Tilbeurgh, M. P. Egloff, C. Martinez, N. Rugani, R. Verger, and C. Cambillau, Nature (London) 362, 814 (1993).
18. P. Grochulski, Y. Li, J. D. Schrag, F. Bouthillier, P. Smith, D. Harrison, B. Rubin, and M. Cygler, J. Biol. Chem. 268, 12843 (1993).
19. P. Grochulski, Y. Li, J. D. Schrag, and M. Cygler, Protein Sci. 3, 82 (1994).
20. P. Grochulski, F. Bouthillier, R. J. Kazlauskas, A. N. Serreqi, J. D. Schrag, E. Ziomek, and M. Cygler, Biochemistry 33, 3494 (1994).
21. J. D. Schrag, Y. Li, M. Cygler, D. Lang, T. Burgdorf, H.-J. Hecht, D. Schomburg, T. Rydel, J. Oliver, L. Strickland, M. Dunaway, S. Larson, and A. McPherson, Structure 5, 187 (1997).
22. M. E. Noble, A. Cleasby, L. N. Johnson, M. R. Egmond, and L. G. Frenken, FEBS Lett. 331, 123 (1993).
23. D. Lang, B. Hoffmann, L. Haalck, H.-J. Hecht, F. Spener, R. D. Schmid, and D. Schomburg, J. Mol. Biol. 259, 704 (1996).
24. J. Uppenberg, M. T. Hansen, S. Patkar, and T. A. Jones, Structure 2, 293 (1994).
25. U. Derewenda, L. Swenson, R. Green, Y. Wei, G. G. Dodson, S. Yamaguchi, M. J. Haas, and Z. S. Derewenda, Nat. Struct. Biol. 1, 36 (1994).
26. D. Ghosh, Z. Wawrzak, V. Z. Pletnev, N. Li, R. Kaiser, W. Pangborn, H. Jörnvall, M. Erman, and W. L. Duax, Structure 3, 279 (1995).
27. R. Sarma, J. Dauberman, A. J. Poulose, J. Van Beilen, S. Power, B. Shew, G. Gray, S. Norton, and R. Bott, in "Lipases: Structure, Mechanism and Genetic Engineering." (L. Alberghina, R. D. Schmid, and R. Verger, eds.) Vol. 16, pp. 71-76. GBF Monographs, CEC-GBF International Workshop, Braunschweig, September 13-15. VCH Verlagsge-sellschaft mbH, Weinheim, Federal Republic of Germany, 1991.
28. J. S. Richardson, Adv. Protein Chem. 34, 167 (1981).
29. J. D. Schrag, F. K. Winkler, and M. Cygler, J. Biol. Chem. 267, 4300 (1992).
30. T. Arakawa and S. Timasheff, Biochemistry 24, 6756 (1985).
31. D. M. Blow, J. J. Birktoft, and B. S. Hartley, Nature (London) 221, 337 (1969).
32. J. D. Robertus, J. Kraut, R. A. Alden, and J. J. Birktoft, Biochemistry 11, 4293 (1972).
33. J. D. Schrag and M. Cygler, J. Mol. Biol. 230, 575 (1993).
34. M. L. Mannesse, R. C. Cox, B. C. Koops, H. M. Verheij, G. H. de Haas, M. R. Egmond, H. T. van der Hijden, and J. de Vlieg, Biochemistry 34, 6400 (1995).
35. J. Uppenberg, N. Ohrner, M. Norin, K. Huit, G. J. Kleywegt, S. Patkar, V. Waagen, T. Anthonsen, and T. A. Jones, Biochemistry 34, 16838 (1995).
36. M. Martinelle, M. Holmquist, and K. Huit, Biochim. Biophys. Acta 1258, 272 (1995).
37. K. Gulomova, E. Ziomek, J. D. Schrag, K. Davranov, and M. Cygler, Lipids 31, 379 (1996).
38. U. Derewenda, L. Swenson, Y. Wei, R. Green, P. M. Kobos, R. Joerger, M. J. Haas, and Z. S. Derewenda, J. Lipid Res. 35, 524 (1994).
39. M. Holmquist, M. Martinelle, P. Berglund, I. G. Clausen, S. Patkar, A. Svendsen, and K. Huit, J. Protein Chem. 12, 749 (1993).
40. M. Holmquist, I. G. Clausen, S. Patkar, A. Svendsen, and K. Huit, J. Protein Chem. 14, 217 (1995).
41. R. D. Joerger and M. J. Haas, Lipids 29, 377 (1994).
42. J. Gilbert, Enzyme Microb. Technol. 15, 634 (1993).
43. M. Cygler, EC BRIDGE Lipase T-Project, International Workshop, Bendor Island, France, September 14-17, 1994. [Abstracts]
44. H. van Tilbeurgh, L. Sarda, R. Verger, and C. Cambillau, Nature (London) 359, 159 (1992).
45. M. P. Egloff, F. Marguet, G. Buono, R. Verger, C. Cambillau, and H. van Tilbeurgh, Biochemistry 34, 2751 (1995).
46. M. C. Komaromy and M. C. Schotz, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84, 1526 (1987).
47. K. A. Dugi, H. L. Dichek, G. D. Talley, H. B. Brewer, Jr., and S. Santamarina-Fojo, J. Biol. Chem. 267, 25086 (1992).
48. M. L. Jennens and M. E. Lowe, J. Biol. Chem. 269, 25470 (1994).
49. K. A. Dugi, H. L. Dichek, and S. Santamarina-Fojo, J. Biol. Chem. 270, 25396 (1995).
50. S. Loughi, M. Mannesse, H. M. Verheij, G. H. de Haas, M. Egmond, E. Knoops-Mouthuy, and C. Cambillan, Prot. Sci. 6, 275 (1997).
51. A. Louwrier, G. J. Drtina, and A. M. Klibanov, Biotech. Bioeng. 50, 1 (1996).
52. E. Rogalska, C. Cudrey, F. Ferrato, and R. Verger, Chirality 5, 24 (1993).
53. E. Rogalska, S. Nury, I. Douchet, and R. Verger, Chirality 7, 505 (1995).
54. D. H. G. Crout and M. Christen, in "Modern Synthetic Methods" (R. Scheffold, ed.), Vol. 5, pp. 1-114. Springer-Verlag, Berlin, 1989.
55. R. J. Kazlauskas, Trends Biotechnol. 12, 464 (1994).
56. M. Cygler, P. Grochulski, R. J. Kazlauskas, J. D. Schrag, F. Bouthillier, B. Rubin, A. N. Serreqi, and A. K. Gupta, J. Am. Chem. Soc. 116, 3180 (1994).
57. M. Norin, F. Haeffner, A. Achour, T. Norin, and K. Huit, Protein Sci. 3, 1493 (1994).
58. M. Holmquist, F. Haeffner, T. Norin, and K. Huit, Protein Sci. 5, 83 (1996).
59. J. Zuegg, H. Hönig, J. D. Schrag, and M. Cygler, J. Mol. Catalysis, 3, (Section B), 83 (1997).