Fluoride binding in hemoproteins: The importance of the distal cavity structure

Biochemistry

Volumn 36, Issue 29, 1997, Pages 8947-8953

  Neri, Francesca ^a   Kok, Donne ^a   Miller, Mark A ^b   Smulevich, Giulietta ^a  

^a UNIVERSITY OF FLORENCE   (Italy)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FLUORIDE ION; HEMOPROTEIN; MYOGLOBIN; PEROXIDASE;

ABSORPTION SPECTROPHOTOMETRY; ARTICLE; HYDROGEN BOND; LIGAND BINDING; MOLECULAR INTERACTION; PRIORITY JOURNAL; RAMAN SPECTROMETRY; SITE DIRECTED MUTAGENESIS;

BINDING SITES; COPRINUS; CYTOCHROME-C PEROXIDASE; FLUORIDES; HEMEPROTEINS; HORSERADISH PEROXIDASE; METMYOGLOBIN; PROTEIN BINDING; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN;

EID: 0030759664     PISSN: 00062960     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/bi970248+     Document Type: Article

References (59)

1. Aime, S., Fasano, M., Paoletti, S., Cutruzzola, F., Desideri, A., Bolognesi, M., Rizzi, M., & Ascenzi, P. (1996) Biophys. J. 70, 482.
2. Allentoff, A. J., Bolton, J. L., Wilks, A., Thompson, J. A., & Ortiz de Montellano, P. R. (1992) J. Am. Chem. Soc. 114, 9744.
3. Al-Mustafa, J., & Kincaid, J. (1994) Biochemistry 33, 2191.
4. Antonini, E., & Brunori, M. (1971) in Hemoglobin and myoglobin in their reaction with ligands, pp 1-12, 40-54, 219-285, Elsevier North-Holland Publishing Co., Amsterdam and London.
5. Asher, S. A., Adams, M. L., & Schuster, T. M. (1981) Biochemistry 20, 3339.
6. Beetlestone, J., & George, P. (1964) Biochemistry 3, 707.
7. Bolognesi, M., Coda, A., Frigerio, F., & Gatti, G. (1990) J. Mol. Biol. 213, 621.
8. Choi, S., Spiro, T. G., Langry, K. G., Smith, K. M., Budd, D. L., & LaMar, G. N. (1982) J. Am. Chem. Soc. 104, 4345.
9. Dalbøge, H., Jensen, E. B., & Welinder, K. G. (1992) Patent application No. WO 92/16634.
10. Dawson, J. H. (1988) Science 240, 433.
11. DeLauder, S. F., Mauro, J. M., Poulos, T. L., Williams, J. C., & Schwarz, F. P. (1994) Biochem. J. 302, 437.
12. Edwards, S. L., & Poulos, T. L. (1990) J. Biol. Chem. 265, 2588.
13. Edwards, S. L., Raag, R., Wariishi, H., Gold, M. H., & Poulos, T. L. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90, 750.
14. Erman, J. E. (1974) Biochemistry 13, 34.
15. Erman, J. E., Vitello, L. B., Miller, M. A., Shaw, A., Brown, K. A., & Kraut, J. (1993) Biochemistry 32, 9798.
16. Feis, A., Paoli, M., Marzocchi, M. P., & Smulevich, G. (1994) Biochemistry 33, 4577.
17. Finzel, B. C., Poulos, T. L., & Kraut, J. (1984) J. Biol. Chem. 259, 13027.
18. Fishel, L. A., Villafranca, J. E., Mauro, J. M., & Kraut, J. (1987) Biochemistry 26, 351.
19. Fülöp, V., Phizackerley, R. P., Soltis, S. M., Clifton, I. J., Wakatsuki, S., Erman, J., & Edwards, S. L. (1994) Structure 2, 24.
20. Hashimoto, S., Teraoka, J., Inubishi, T., Yonetani, T., & Kitagawa, T. (1986) J. Biol. Chem. 261, 11110.
21. Holzbaur, I. E., English, A. M., & Ismail, A. A. (1996) J. Am. Chem. Soc. 118, 3354.
22. Howes, B. D., Rodriguez-Lopez, N. J., Smith, A. T., & Smulevich, G. (1997) Biochemistry 36, 1532.
23. Hu, S., Smith, K. M., & Spiro, T. G. (1996) J. Am. Chem. Soc. 118, 12638.
24. Ikeda-Saito, M., Hori, H., Andersson, L. A., Prince, R. C., Pickering, I. J., George, G. N., Sanders, C. R., II, Lutz, R. S., McKelvey, E. J., & Mattera, R. (1992) J. Biol. Chem. 267, 22843.
25. Kunishima, N., Fukuyama, K., Matsubara, H., Hatanaka, H., Shibano, Y., & Amachi (1994) J. Mol. Biol. 235, 331.
26. Kunishima, N., Amada, F., Fukuyama, K., Kawamoto, M., Matsunaga, T., & Matsubara, H. (1996) FEBS Lett. 378, 291.
27. Miller, M. A., Shaw, A., & Kraut, J. (1994) Nat. Struct. Biol. 1, 524.
28. Palanappian, V., & Terner, J. (1989) J. Biol. Chem. 264, 16046.
29. Patterson, W. R., & Poulos, T. L. (1995) Biochemistry 34, 4331.
30. Petersen, J. F. W. (1995) Ph.D. Thesis, University of Copenhagen, Denmark.
31. Petersen, J. F. W., Kodziola, A., & Larsen, S. (1994) FEBS Lett. 399, 291.
32. Piontek, K., Glumoff, T., & Winterhalter, K. (1993) FEBS Lett. 315, 119.
33. Poulos, T. L., & Kraut, J. (1980) J. Biol. Chem. 255, 8199.
34. Poulos, T. L., & Fenna, R. E. (1994) in Metal Ions in Biological Systems (Siegel, H., Ed.) pp 25-75, Marcel Dekker, New York.
35. Poulos, T. L., Edwards, S. L., Wariishi, H., & Gold, M. H. (1993) J. Mol. Biol. 268, 4429.
36. Schuller, D. J., Ban, N., van Huytee, R. B., McPherson, A., & Poulos, T. L. (1996) Structure 4, 311.
37. Sievers, G., Österlund, K., & Ellfolk, N. (1979) Biochim. Biophys. Acta 581, 1.
38. Sitter, A. J., Reczeck, C. M., & Terner, J. (1985) J. Biol. Chem. 260, 7515.
39. Smulevich, G., Mauro, J. M., Fishel, L. A., English, A. M., Kraut, J., & Spiro, T. G. (1988a) Biochemistry 27, 5477.
40. Smulevich, G., Mauro, J. M., Fishel, L. A., English, A. M., Kraut, J., & Spiro, T. G. (1988b) Biochemistry 27, 5486.
41. Smulevich, G., English, A. M., Mantini, A. R., & Marzocchi, M. P. (1991a) Biochemistry 30, 772.
42. Smulevich, G., Miller, M. A., Kraut, J., & Spiro, T. G. (1991b) Biochemistry 30, 9546.
43. Smulevich, G., Feis, A., Focardi, C., Tams, J., & Welinder, K. G. (1994a) Biochemistry 33, 15425.
44. Smulevich, G., Paoli, M., Burke, J. F., Sanders, S. A., Thorneley, R. N. F., & Smith, A. T. (1994b) Biochemistry 33, 7398.
45. Smulevich, G., Neri, F., Willemsen, O., Choudhury, K., Marzocchi, M. P., & Poulos, T. L. (1995) Biochemistry 34, 13485.
46. Smulevich, G., Hu, S., Rodgers, K. R., Goodin, D. B., Smith, K. M., & Spiro, T. G. (1996a) Biospectroscopy 2, 365.
47. Smulevich, G., Neri, F., Marzocchi, M. P., & Welinder, K. G. (1996b) Biochemistry 35, 10576.
48. Smulevich, G., Paoli, M., De Sanctis, G., Mantini, A. R., Ascoli, F., & Coletta, M. (1997) Biochemistry 36, 640.
49. Spiro, T. G., & Li, X.-Y. (1988) in Biological Application of Raman Spectroscopy (Spiro, T. G., Ed.) Vol. 3, pp 1-37, Wiley Interscience, New York.
50. Sundaramoorthy, M., Kishi, K., Gold, M. H., & Poulos, T. L. (1994) J. Mol. Biol. 238, 845.
51. Tamura, M. (1971) Biochim. Biophys. Acta 243, 249.
52. Veitch, N. C., Gao, Y., & Welinder, K. G. (1996) Biochemistry 35, 14370.
53. Vitello, L. D., Erman, J. E., Miller, M. A., Wang, J., & Kraut, J. (1993) Biochemistry 32, 9807.
54. Wang, J., Mauro, J. M., Edwards, S. L., Oatley, S. J., Fishel, L. A., Ashford, V. A., Xuong, N., & Kraut, J. (1990) Biochemistry 29, 7160.
55. Welinder, K. G. (1992) Curr. Opin. Struct. Biol. 2, 388.
56. Welinder, K. G., & Gajhede, M. (1993) in Plant peroxidases: Biochemistry and Physiology (Welinder, K. G., Rasmussen, S. K., Penel, C., & Greppin, H., Eds.) pp 35-42, University of Geneva, Switzerland.
57. Welinder, K. G., Mauro, M., & Norskov-Lauritsen, L. (1992) Biochem. Soc. Trans. 20, 337.
58. Yonetani, T., & Schleyer, H. L. (1967) J. Biol. Chem. 242, 1974.
59. Yonetani, T., Wilson, B. F., & Seamonds, B. (1966) J. Biol. Chem. 241, 5347.