A comparison of functional and structural consequences of the tyrosine B10 and glutamine E7 motifs in two invertebrate hemoglobins (Ascaris suum and Lucina pectinata)

Biochemistry

Volumn 36, Issue 42, 1997, Pages 13110-13121

  Peterson, Eric S ^a   Huang, Shuocai ^a   Wang, Jiaqian ^a   Miller, Lisa M ^a   Vidugiris, Gediminas ^a,b   Kloek, Andrew P ^c   Goldberg, Daniel E ^c   Chance, Mark R ^a   Wittenberg, Jonathan B ^a   Friedman, Joel M ^a  

^a ALBERT EINSTEIN COLLEGE OF MEDICINE   (United States)

^b UNIVERSITY OF WISCONSIN MADISON   (United States)

^c WASHINGTON UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GLUTAMINE; HEMOGLOBIN; HISTIDINE; LEUCINE; MYOGLOBIN; OXYGEN; TYROSINE;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; ASCARIS SUUM; CLAM; HEMOGLOBIN DETERMINATION; HYDROGEN BOND; INFRARED SPECTROSCOPY; LIGAND BINDING; NONHUMAN; OXYGEN AFFINITY; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN CONFORMATION; RAMAN SPECTROMETRY;

AMINO ACID SUBSTITUTION; ANIMALS; ASCARIS SUUM; BINDING SITES; BIVALVIA; CARBON MONOXIDE; CARBOXYHEMOGLOBIN; GLUTAMIC ACID; HEME; HEMOGLOBINS; KINETICS; OXYHEMOGLOBINS; PROTEIN CONFORMATION; SPECTROSCOPY, FOURIER TRANSFORM INFRARED; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN; THERMODYNAMICS; TYROSINE;

ASCARIS; ASCARIS SUUM; BIVALVIA; INVERTEBRATA; LUCINA; LUCINA PECTINATA; VERTEBRATA;

EID: 0030681291     PISSN: 00062960     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/bi971156n     Document Type: Article

References (72)

1. Ahmed, A. M., Campbell, B. F., Caruso, D., Chance, M. R., Chavez, M. D., Courtney, S. H., Friedman, J. M., Iben, I. E. T., Ondrias, M. R., & Yang M. (1991) Chem. Phys. 158, 329-351.
2. Alpert, B., Mohsni, E., Lindqvist, J., & Tfibel, F. (1979) Chem. Phys. Lett. 64, 11-16.
3. Antonini, E., & Brunori, M. (1971) in Hemoglobins and Myoglobins in their Reactions with Ligands, Am Elsevier Co., New York.
4. Argade, P. V., Sassaroli, M., Rousseau, D. L., Inubushi, T., Ikeda-Saito, M., & Lapidot, A. (1984) J. Am. Chem. Soc. 106, 6593-6596.
5. Asher, S. (1993) Anal. Chem. 65, 59-65.
6. Asher, S. A., Johnson, C. R., & Murtaugh, J. (1983) Rev. Sci. Instrum. 54, 1657.
7. Austin, J. C., Rodgers, K. R., & Spiro, T. G. (1993) Methods Enzymol. 226, 374-396.
8. Balasubramanian, S., Lambright, D. G., Marden, M. C., & Boxer, S. G. (1993) Biochemistry 32, 2202-2212.
9. Braunstein, D., Ansari, A., Berendzen, J., Cowen, B. R., Egeberg, K. D., Frauenfelder, H., Hong, M. K., Ormos, P., Sauke, T. B., Scholl, R., Schulte, A., Sligar, S. G., Springer, B. A., Steinback, P. J., & Young, R. D. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85, 8497-8501.
10. Carlson, M. L., Regan, R., Elber, R., Li, H., Phillips, G. N., Jr., Olson, J. S., & Gibson, Q. H. (1994) Biochemistry 33, 10597-10606.
11. Carver, T. E., Brantley, R. E., Jr., Singleton, E. W., Arduini, R. M., Quillin, M. L., Phillips, G. N., Jr., & Olson, J. S. (1992) J. Biol. Chem. 267, 14443-14450.
12. Chance, M. R., Courtney, S. H., Chavez, M. D., Ondrias, M. R., & Friedman, J. M. (1990) Biochemistry 29, 5537-5545.
13. Davenport, H. E. (1949) Proc. R. Soc. London, Ser. B 136, 225-270.
14. De Baere, I., Liu, L., Moens, L., Van Beeumen, J. V., Gielens, C., Richelle, J., Trotman, C., Finch, J., Gerstein, M., & Perutz, M. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89, 4638-4642.
15. De Baere, L. Perutz, M., Kiger, L., Marden, M. C., & Poyart, C. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91, 1594-1597.
16. Duddell, D. A., Morris, R. J., & Richards, J. T. (1979) J. Chem. Soc., Chem. Commun., 75-76.
17. Findsen, E. W., Scott, T. W., Chance, M. R., Friedman, J. M., & Ondrias, M. R. (1985) J. Am. Chem. Soc. 107, 3355-3357.
18. Fodor, S. P. A., Rava, R., Copeland, R. A., & Spiro, T. G. (1986) J. Raman Spectrosc. 17, 471.
19. Friedman, J. M. (1985) Science 228, 1273-1280.
20. Friedman, J. M. (1994) Methods Enzymol. 232, 205-231.
21. Friedman, J. M. & Lyons, K. B. (1980) Nature 284,570-572.
22. Friedman, J. M., Rousseau, D. L., Ondrias, M. R., & Stepnoski, R. A. (1982) Science 218, 1244-1246.
23. Friedman, J. M., Scott, T. W., Fisanick, G. J., Simon, S. R., Findsen, E. W., Ondrias, M. R., & MacDonald, V. W. (1985) Science 229, 187-190.
24. Friedman, J. M., Campbell, B. F., & Noble, R. W. (1990) Biophys. Chem. 37, 43-59.
25. Gelin, B. R., & Karplus, M. (1977) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 74, 801-805.
26. Gibson, Q. H., Regan, R., Elber, R., Olson, J. S., & Carver, T. E. (1992) J. Biol. Chem. 267, 22022-22034.
27. Gibson, Q. H., Regan, R., Olson, J. S., Carver, T. E., Dixon, B., Pohajdak, B., Sharma, P. K., & Vinogradov, S. N. (1993) J. Biol. Chem. 268, 16993-16998.
28. Harutyunyan, E. H., Safonova, T. N., Kuranova, I. P., Popov, A. N., Teplyakov, A. V., Obmolova, G. V., Rusakov, A. A., Vainshtein, B. K., Dodson, G. G., Wilson, J. C., & Perutz, M. F. (1995) J. Mol. Biol 251, 104-115.
29. Hildebrandt, P. G., Copleand, R. A., Spiro, T. G., Otlewski, J., Laskowski, M., Jr, & Prendergast, F. G. (1988) Biochemistry 27, 5426.
30. Hockenhull-Johnson, J. D., Stern, M. S., Martin, P., Dass, C., Desidero, D. M., Wittenberg, J. B., Vinogradov, S. N., & Walz, D. A. (1991) J. Protein Chem. 10, 609-622.
31. Hu, S., Morris, I. K., Singh, J. P., Smith, K. M., & Spiro, T. G. (1993) J. Am. Chem. Soc. 115, 12446-12458.
32. Hu, S., Smith, K. M., & Spiro, T. G. (1997) J. Am. Chem. Soc. (in press).
33. Huang, S., Huang, J., Klock, A. P., Goldberg, D. E., & Friedman, J. M. (1996) J. Biol. Chem. 271, 958-962.
34. Jayaraman, V., & Spiro, T. G. (1996) Biospectroscopy 2, 311-316.
35. Jayaraman, V., Rodgers, K. R., Mukerji, I., & Spiro, T. G. (1995) Science 269, 1843-1848.
36. Johnson, C. R., Ludwig, M., O'Donnell, S., & Asher, S. A. (1984) J. Am. Chem. Soc. 106, 5008.
37. Johnson, C. R., Ludwig, M., & Asher, S. A. (1986) J. Am.Chem. Soc. 108, 905.
38. Kitagawa, T. (1988) in Biological Application of Raman Spectroscopy (Spiro, T. G., Ed.) Vol. III, pp 97-131, Wiley and Sons, New York.
39. Kitagawa, T. (1992) Prog. Biophys. Mol. Biol. 58, 1-18.
40. Kloek, A. P., Yang, J., Mathews, F. S., & Goldberg, D. (1993) J. Biol. Chem. 268, 17669-17671.
41. Kloek, A. P., Yang, J., Mathews, F. S., Frieden, C., & Goldberg, D. E. (1994) J Biol. Chem. 269, 2377-2379.
42. Kraus, D. W., & Wittenberg, J. B. (1990) J. Biol. Chem. 265, 1604-16053.
43. Kraus, D. W., & Wittenberg, J. B., Lu., J. F., & Peisach, J. (1990) J. Biol. Chem. 265, 16054-16059.
44. Li, T., Quillin, L., Phillips, G. N., Jr., & Olson, J. S. (1994) Biochemistry 33,1 433-1446.
45. Matsukawa, S., Mawatari, K., Yoneyama, Y., & Kitagawa, T. (1984) J. Am. Chem. Soc. 107, 1108-1116.
46. Miller, L. M., Patel, M., & Chance, M. R. (1996) J. Am. Chem. Soc. 118, 4511-4517.
47. Nagai, K., Luisi, B., Shih, D., Miyazaki, G., Imai, K., Poyart, C., De Young, A., Kwiatkowsky, L., Noble, R. W., Lin, S. H., & Yu, N. T. (1987) Nature 329, 858-860.
48. Okazaki, T., & Wittenberg, J. B. (1965) Biochim. Biophys. Acta. 111, 503-511.
49. Peisach, J., & Mims, W. B. (1977) Biochemistry 16, 2795-2799.
50. Perutz, M. F. (1989) Q. Rev. Biophys. 22, 139-236.
51. Perutz, M. F., Fermi, G., Luisi, B., Shaanan, B., & Liddington, R. C. (1987) Acc. Chem. Res. 20, 309.
52. Perutz, M. F., Staden, R., Moens, L., & De Baere, I. (1993) Curr. Biol. 3, 249-251.
53. Phillips, S. E. V., & Schoenborn, B. P. (1981) Nature 292, 81-82.
54. Rodgers, K. R., Su, C., Subramaniam, S., & Spiro, T. G. (1992) J. Am. Chem. Soc. 114, 3697-3709.
55. Rohlfs, R. J., Mathews, A. J., Carver, T. E., Olson, J. S., Springer, B. A., Egeberg, K. D., & Sligar, S. G. (1990) J. Biol. Chem. 265, 3168-3176.
56. Rousseau, D. L., & Friedman, J. M. (1988) in Biological Application of Raman Spectroscopy (Spiro, T. G., Ed.) Vol. III, pp 133-215, Wiley and Sons, New York.
57. Rousseau, D., Song, S., Friedman, J. M., Boffi, A., & Chiancone, E. (1993) J. Biol. Chem. 268, 5719-5723.
58. Scott, T. W., & Friedman, J. M. (1984) J. Am. Chem. Soc. 106, 5677-5687.
59. Sherman, D. R., Kloek, A. P., Krishnan, B. R., Guinn, B., & Goldberg, D. E. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89, 11696-11700.
60. Shiro, Y., Iizuka, T., Marubayashi, K., Ogura, T., Kitagawa, T., Balasubramanian, S., & Boxer, S. G. (1994) Biochemistry 33, 14986-14992.
61. Smerdon, S. J., Krzywda, S., & Wilkinson, A. J. (1993) Biochemistry 32, 5132-5138.
62. Spiro, T. G. (1988) in Biological Application of Raman Spectroscopy (Spiro, T. G., Ed.) Vol. III, pp 1-37, Wiley and Sons, New York.
63. Spiro, T. G., Smulevich, G., & Su, C. (1990) Biochemistry 29, 4497-4508.
64. Springer, B. A., Sligar, S. G., Olson, J. S., & Phillips, G. N., Jr., (1994) Chem. Rev. 94, 699-714.
65. Šrajer, V., Reinisch, L., & Champion, P. M. (1988) J. Am. Chem. Soc. 110, 6656-6670.
66. Stavrov, S. S. (1993) Biophys. J. 65, 1942-1950.
67. Stavrov, S. S. (1996) Biophys. J. 70, 1214-1223.
68. Stavrov, S. S. (1997) Biophys. J. 72 (in press).
69. Valentine, J. S., Sheridan, R. P., Allen, L. C., & Kahn, P. C. (1979) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 76, 1009-1013.
70. Wells, A. V., Sage, J. T., Morikis, D., Champion, P. M., Chiu, M. L., & Sligar, S. G. (1991) J. Am. Chem. Soc. 113, 9655-9660.
71. Wittenberg, B. A., Okazaki, T., & Wittenberg, J. B. (1965) Biochim. Biophys. Acta 111, 485-495.
72. Yang, J., Kloek, A. P., Goldberg, D. E., & Mathews, F. S. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92, 4224-4228.