The distal glutamic acid as an acid-base catalyst in the distal site of houseradish peroxidase

Biochemical and Biophysical Research Communications

Volumn 227, Issue 2, 1996, Pages 393-399

  Tanaka, Motomasa ^a   Ishimori, Koichiro ^a   Morishima, Isao ^a  

^a KYOTO UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CARBOXYL GROUP; GLUTAMIC ACID; GUAIACOL; HORSERADISH PEROXIDASE; HYDROGEN PEROXIDE; MUTANT PROTEIN;

AMINO ACID SUBSTITUTION; ARTICLE; CATALYST; ENZYME ACTIVITY; ENZYME KINETICS; ENZYME STRUCTURE; OXIDATION; PRIORITY JOURNAL; STRUCTURE ACTIVITY RELATION;

ARMORACIA RUSTICANA;

EID: 0030583560     PISSN: 0006291X     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1006/bbrc.1996.1518     Document Type: Article

References (24)

1. 1. (a) Finzel, B. C., Poulos, T. L., and Kraut, J. (1984) J. Biol. Chem. 259, 13027-13036. (b) Edwards, S. L., Raag, R., Wariishi, H., Gold, M. H., and Poulos, T. L. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 750-754. (c) Poulos, T. L., Edwards, S. L., Wariishi, H., and Gold, M. H. (1993) J. Biol. Chem. 268, 4429-4440. (d) Kunishrma, N., Fukuyama, K., Matsubara, H., Hatanaka, H., Shibano, Y., and Amachi, T. (1994) J. Mol. Biol. 235, 331-344. (e) Perterson, J. F. W., Kadziola, A., and Larsen, S. (1994) FEBS Lett. 339, 291-296. (f) Schuller, D. J., Ban, N., Huystee, R. B., McPherson, A., and Poulos, T. L. (1996) Structure 4, 311-321.
2. 1. (a) Finzel, B. C., Poulos, T. L., and Kraut, J. (1984) J. Biol. Chem. 259, 13027-13036. (b) Edwards, S. L., Raag, R., Wariishi, H., Gold, M. H., and Poulos, T. L. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 750-754. (c) Poulos, T. L., Edwards, S. L., Wariishi, H., and Gold, M. H. (1993) J. Biol. Chem. 268, 4429-4440. (d) Kunishrma, N., Fukuyama, K., Matsubara, H., Hatanaka, H., Shibano, Y., and Amachi, T. (1994) J. Mol. Biol. 235, 331-344. (e) Perterson, J. F. W., Kadziola, A., and Larsen, S. (1994) FEBS Lett. 339, 291-296. (f) Schuller, D. J., Ban, N., Huystee, R. B., McPherson, A., and Poulos, T. L. (1996) Structure 4, 311-321.
3. 1. (a) Finzel, B. C., Poulos, T. L., and Kraut, J. (1984) J. Biol. Chem. 259, 13027-13036. (b) Edwards, S. L., Raag, R., Wariishi, H., Gold, M. H., and Poulos, T. L. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 750-754. (c) Poulos, T. L., Edwards, S. L., Wariishi, H., and Gold, M. H. (1993) J. Biol. Chem. 268, 4429-4440. (d) Kunishrma, N., Fukuyama, K., Matsubara, H., Hatanaka, H., Shibano, Y., and Amachi, T. (1994) J. Mol. Biol. 235, 331-344. (e) Perterson, J. F. W., Kadziola, A., and Larsen, S. (1994) FEBS Lett. 339, 291-296. (f) Schuller, D. J., Ban, N., Huystee, R. B., McPherson, A., and Poulos, T. L. (1996) Structure 4, 311-321.
4. 1. (a) Finzel, B. C., Poulos, T. L., and Kraut, J. (1984) J. Biol. Chem. 259, 13027-13036. (b) Edwards, S. L., Raag, R., Wariishi, H., Gold, M. H., and Poulos, T. L. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 750-754. (c) Poulos, T. L., Edwards, S. L., Wariishi, H., and Gold, M. H. (1993) J. Biol. Chem. 268, 4429-4440. (d) Kunishrma, N., Fukuyama, K., Matsubara, H., Hatanaka, H., Shibano, Y., and Amachi, T. (1994) J. Mol. Biol. 235, 331-344. (e) Perterson, J. F. W., Kadziola, A., and Larsen, S. (1994) FEBS Lett. 339, 291-296. (f) Schuller, D. J., Ban, N., Huystee, R. B., McPherson, A., and Poulos, T. L. (1996) Structure 4, 311-321.
5. 1. (a) Finzel, B. C., Poulos, T. L., and Kraut, J. (1984) J. Biol. Chem. 259, 13027-13036. (b) Edwards, S. L., Raag, R., Wariishi, H., Gold, M. H., and Poulos, T. L. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 750-754. (c) Poulos, T. L., Edwards, S. L., Wariishi, H., and Gold, M. H. (1993) J. Biol. Chem. 268, 4429-4440. (d) Kunishrma, N., Fukuyama, K., Matsubara, H., Hatanaka, H., Shibano, Y., and Amachi, T. (1994) J. Mol. Biol. 235, 331-344. (e) Perterson, J. F. W., Kadziola, A., and Larsen, S. (1994) FEBS Lett. 339, 291-296. (f) Schuller, D. J., Ban, N., Huystee, R. B., McPherson, A., and Poulos, T. L. (1996) Structure 4, 311-321.
6. 1. (a) Finzel, B. C., Poulos, T. L., and Kraut, J. (1984) J. Biol. Chem. 259, 13027-13036. (b) Edwards, S. L., Raag, R., Wariishi, H., Gold, M. H., and Poulos, T. L. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 750-754. (c) Poulos, T. L., Edwards, S. L., Wariishi, H., and Gold, M. H. (1993) J. Biol. Chem. 268, 4429-4440. (d) Kunishrma, N., Fukuyama, K., Matsubara, H., Hatanaka, H., Shibano, Y., and Amachi, T. (1994) J. Mol. Biol. 235, 331-344. (e) Perterson, J. F. W., Kadziola, A., and Larsen, S. (1994) FEBS Lett. 339, 291-296. (f) Schuller, D. J., Ban, N., Huystee, R. B., McPherson, A., and Poulos, T. L. (1996) Structure 4, 311-321.
7. 2. (a) Erman, J. E., Vitello, L. B., Miller, M. A., and Kraut, J. (1992) J. Am. Chem. Soc. 114, 6592-6593. (b) Erman, J. E., Vitello, L. B., Miller, M. A., Shaw, A., Brown, K. A., and Kraut, J. (1993) Biochemistry 32, 9798-9806. (c) Newmyer, S. L., and Ortiz de Montellano, P. R. (1995) J. Biol Chem. 270, 19430-19438. (d) Rodriguez-Lopez, J. N., Smith, A. T., and Thorneley, R. N. F. (1996) J. Bioinorg. Chem. 1, 136-142.
8. 2. (a) Erman, J. E., Vitello, L. B., Miller, M. A., and Kraut, J. (1992) J. Am. Chem. Soc. 114, 6592-6593. (b) Erman, J. E., Vitello, L. B., Miller, M. A., Shaw, A., Brown, K. A., and Kraut, J. (1993) Biochemistry 32, 9798-9806. (c) Newmyer, S. L., and Ortiz de Montellano, P. R. (1995) J. Biol Chem. 270, 19430-19438. (d) Rodriguez-Lopez, J. N., Smith, A. T., and Thorneley, R. N. F. (1996) J. Bioinorg. Chem. 1, 136-142.
9. 2. (a) Erman, J. E., Vitello, L. B., Miller, M. A., and Kraut, J. (1992) J. Am. Chem. Soc. 114, 6592-6593. (b) Erman, J. E., Vitello, L. B., Miller, M. A., Shaw, A., Brown, K. A., and Kraut, J. (1993) Biochemistry 32, 9798-9806. (c) Newmyer, S. L., and Ortiz de Montellano, P. R. (1995) J. Biol Chem. 270, 19430-19438. (d) Rodriguez-Lopez, J. N., Smith, A. T., and Thorneley, R. N. F. (1996) J. Bioinorg. Chem. 1, 136-142.
10. 2. (a) Erman, J. E., Vitello, L. B., Miller, M. A., and Kraut, J. (1992) J. Am. Chem. Soc. 114, 6592-6593. (b) Erman, J. E., Vitello, L. B., Miller, M. A., Shaw, A., Brown, K. A., and Kraut, J. (1993) Biochemistry 32, 9798-9806. (c) Newmyer, S. L., and Ortiz de Montellano, P. R. (1995) J. Biol Chem. 270, 19430-19438. (d) Rodriguez-Lopez, J. N., Smith, A. T., and Thorneley, R. N. F. (1996) J. Bioinorg. Chem. 1, 136-142.
11. 3. (a) Poulos, T. L., and Kraut, J. (1980) J. Biol. Chem. 255, 8199-8205. (b) Dunfold, H. B. (1991) in Peroxidases in Chemistry and Biology, (Everse, J. E., Everse, K. E., and Grisham, M. B., Eds.) Voll. II, pp. 1-24, CRC Press, Boca Raton.
12. 3. (a) Poulos, T. L., and Kraut, J. (1980) J. Biol. Chem. 255, 8199-8205. (b) Dunfold, H. B. (1991) in Peroxidases in Chemistry and Biology, (Everse, J. E., Everse, K. E., and Grisham, M. B., Eds.) Voll. II, pp. 1-24, CRC Press, Boca Raton.
13. 4. Sundaramoorthy, M., Terner, J., and Poulos, T. L. (1995) Structure 3, 1367-1377.
14. 5. Nagano, S., Tanaka, M., Watanabe, Y., and Morishima, I. (1995) Biochem. Biophys. Res. Commun. 207, 417-423.
15. 6. Nagano, S., Tanaka, M., Ishimori, K., Watanabe, Y., and Morishima, I. Biochemistry in press.
16. 7. Farhangrazi, Z. S., Copeland, B. R., Nakayama, T., Amachi, T., Yamazaki, I., and Powers, L. S. (1994) Biochemistry 33, 5647-5652.
17. 8. (a) La Mar, G. N., de Ropp, J. S., Smith, K. M., and Langry, K. C. (1980) J. Biol. Chem. 255, 6646-6652. (b) Veitch, N. C., Williams, R. J. P., Bray, R. C., Burke, J. F., Sanders, S. A., Thorneley, R. N. F., and Smith, A. T. (1992) Eur. J. Biochem. 207, 521-531.
18. 8. (a) La Mar, G. N., de Ropp, J. S., Smith, K. M., and Langry, K. C. (1980) J. Biol. Chem. 255, 6646-6652. (b) Veitch, N. C., Williams, R. J. P., Bray, R. C., Burke, J. F., Sanders, S. A., Thorneley, R. N. F., and Smith, A. T. (1992) Eur. J. Biochem. 207, 521-531.
19. 9. La Mar, G. N., de Ropp, J. S., Smith, K. M., and Langry, K. C. (1981) J. Biol. Chem. 256, 237-243.
20. 10. Alam, S. L., Satterlee, J. D., Mauro, J. M., Poulos, T. L., and Erman, J. E. (1995) Biochemistry 34, 15496-15503.
21. 11. Loach, P. A., and Calvin, M. (1963) Biochemistry 2, 361-371.
22. 12. Smith, A. T., Sanders, S. A., Thorneley, R. N. F., Burke, J. F., and Bray, R. R. C. (1992) Eur. J. Biochem. 207, 507-519.
23. 13. Hasinoff, B. B., and Dunfold, H. B. (1970) Biochemistry 9, 4930-4939.
24. 14. Tanaka, M., Nagano, S., Watanabe, Y., Ishimori, K., and Morishima, I. manuscript in preparation.